MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24005	NC_013205	CTT	2	6	1057470	1057475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510977
24006	NC_013205	CGG	2	6	1057488	1057493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510977
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24008	NC_013205	TGC	2	6	1057502	1057507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510977
24009	NC_013205	CGG	2	6	1057509	1057514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510977
24010	NC_013205	GCC	2	6	1057527	1057532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510977
24011	NC_013205	GC	3	6	1057534	1057539	0 %	0 %	50 %	50 %	258510977
24012	NC_013205	GGC	2	6	1057552	1057557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510977
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24017	NC_013205	CGGTG	2	10	1057737	1057746	0 %	20 %	60 %	20 %	258510977
24018	NC_013205	GGA	2	6	1057782	1057787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510977
24019	NC_013205	CGCGG	2	10	1057807	1057816	0 %	0 %	60 %	40 %	258510977
24020	NC_013205	TGG	2	6	1057817	1057822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510977
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24022	NC_013205	CGCT	2	8	1057961	1057968	0 %	25 %	25 %	50 %	258510977
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24032	NC_013205	ACATT	2	10	1058583	1058592	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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24054	NC_013205	GGTG	2	8	1059587	1059594	0 %	25 %	75 %	0 %	258510980
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24117	NC_013205	GCG	2	6	1062028	1062033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510982
24118	NC_013205	CTG	2	6	1062051	1062056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510982
24119	NC_013205	GCT	2	6	1062100	1062105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510982
24120	NC_013205	GAT	2	6	1062128	1062133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510982
24121	NC_013205	CG	3	6	1062192	1062197	0 %	0 %	50 %	50 %	258510982
24122	NC_013205	ATG	2	6	1062198	1062203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510982
24123	NC_013205	CGC	2	6	1062317	1062322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510982
24124	NC_013205	CGA	2	6	1062347	1062352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510982
24125	NC_013205	AAGGGC	2	12	1062370	1062381	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	258510982
24126	NC_013205	GGC	2	6	1062389	1062394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24127	NC_013205	GAG	2	6	1062408	1062413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24128	NC_013205	TGC	2	6	1062433	1062438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510983
24129	NC_013205	GAT	2	6	1062536	1062541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510983
24130	NC_013205	GAA	2	6	1062542	1062547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510983
24131	NC_013205	GC	4	8	1062578	1062585	0 %	0 %	50 %	50 %	258510983
24132	NC_013205	GCG	2	6	1062622	1062627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510983
24133	NC_013205	GAGC	2	8	1062632	1062639	25 %	0 %	50 %	25 %	258510983
24134	NC_013205	CGA	2	6	1062647	1062652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510983
24135	NC_013205	A	7	7	1062679	1062685	100 %	0 %	0 %	0 %	258510983
24136	NC_013205	GGA	2	6	1062710	1062715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510983
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24138	NC_013205	GTC	2	6	1062801	1062806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510983
24139	NC_013205	GC	3	6	1062865	1062870	0 %	0 %	50 %	50 %	258510983
24140	NC_013205	CGT	2	6	1062911	1062916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510983
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24144	NC_013205	GCG	2	6	1062964	1062969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510983
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24149	NC_013205	CGA	2	6	1063267	1063272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510983
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24232	NC_013205	GGAT	2	8	1066707	1066714	25 %	25 %	50 %	0 %	258510989
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24234	NC_013205	GC	3	6	1066733	1066738	0 %	0 %	50 %	50 %	258510989
24235	NC_013205	GCT	2	6	1066786	1066791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510989
24236	NC_013205	GAT	2	6	1066813	1066818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510989
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24238	NC_013205	GTG	2	6	1066856	1066861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510989
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24315	NC_013205	A	6	6	1069620	1069625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24469	NC_013205	CGGAGC	2	12	1075422	1075433	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	258510998
24470	NC_013205	CATC	2	8	1075495	1075502	25 %	25 %	0 %	50 %	258510998
24471	NC_013205	CGG	2	6	1075519	1075524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510998
24472	NC_013205	GAC	2	6	1075535	1075540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510998
24473	NC_013205	GAT	2	6	1075564	1075569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510998
24474	NC_013205	TC	3	6	1075684	1075689	0 %	50 %	0 %	50 %	258510998
24475	NC_013205	TCA	2	6	1075755	1075760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510998
24476	NC_013205	GCT	2	6	1075774	1075779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510998
24477	NC_013205	GC	3	6	1075804	1075809	0 %	0 %	50 %	50 %	258510998
24478	NC_013205	GGT	2	6	1075840	1075845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510998
24479	NC_013205	CGA	2	6	1075939	1075944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510998
24480	NC_013205	T	6	6	1075963	1075968	0 %	100 %	0 %	0 %	258510998
24481	NC_013205	CGCTG	2	10	1075989	1075998	0 %	20 %	40 %	40 %	258510998
24482	NC_013205	GCG	2	6	1076043	1076048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510998
24483	NC_013205	CTG	2	6	1076069	1076074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510998
24484	NC_013205	CGA	2	6	1076112	1076117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510998
24485	NC_013205	GGA	2	6	1076149	1076154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510998
24486	NC_013205	GC	4	8	1076155	1076162	0 %	0 %	50 %	50 %	258510998
24487	NC_013205	TGG	2	6	1076199	1076204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510998
24488	NC_013205	CG	4	8	1076224	1076231	0 %	0 %	50 %	50 %	258510998
24489	NC_013205	CGGG	2	8	1076316	1076323	0 %	0 %	75 %	25 %	258510998
24490	NC_013205	AGCGG	2	10	1076337	1076346	20 %	0 %	60 %	20 %	258510998
24491	NC_013205	GTG	3	9	1076378	1076386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510998
24492	NC_013205	CGG	2	6	1076389	1076394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510998
24493	NC_013205	GGC	2	6	1076398	1076403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510998
24494	NC_013205	GA	3	6	1076424	1076429	50 %	0 %	50 %	0 %	258510998
24495	NC_013205	TCG	2	6	1076523	1076528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510998
24496	NC_013205	GCGG	2	8	1076582	1076589	0 %	0 %	75 %	25 %	258510998
24497	NC_013205	CGAT	2	8	1076632	1076639	25 %	25 %	25 %	25 %	258510998
24498	NC_013205	CGG	2	6	1076649	1076654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510998
24499	NC_013205	GGA	2	6	1076656	1076661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510998
24500	NC_013205	CG	3	6	1076675	1076680	0 %	0 %	50 %	50 %	258510998

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