MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_013205	TGT	2	6	951525	951530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510870
21502	NC_013205	TGT	2	6	951567	951572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510870
21503	NC_013205	CGC	2	6	951588	951593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510870
21504	NC_013205	AGG	2	6	951644	951649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21505	NC_013205	CCTT	2	8	951658	951665	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21506	NC_013205	AAGA	2	8	951681	951688	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21507	NC_013205	GC	3	6	951717	951722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21508	NC_013205	GA	3	6	951745	951750	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21509	NC_013205	GAGGG	2	10	951777	951786	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
21510	NC_013205	TGC	2	6	951886	951891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510871
21511	NC_013205	TGG	2	6	951967	951972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510871
21512	NC_013205	TCG	2	6	951973	951978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510871
21513	NC_013205	CG	3	6	951988	951993	0 %	0 %	50 %	50 %	258510871
21514	NC_013205	CGG	2	6	952030	952035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510871
21515	NC_013205	TG	3	6	952044	952049	0 %	50 %	50 %	0 %	258510871
21516	NC_013205	CTG	2	6	952053	952058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510871
21517	NC_013205	GCC	2	6	952071	952076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510871
21518	NC_013205	CGC	2	6	952091	952096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510871
21519	NC_013205	TCA	2	6	952097	952102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510871
21520	NC_013205	TCG	2	6	952165	952170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510871
21521	NC_013205	CGA	2	6	952187	952192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510871
21522	NC_013205	GGT	2	6	952199	952204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510871
21523	NC_013205	TGG	2	6	952209	952214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510871
21524	NC_013205	CCG	2	6	952234	952239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510871
21525	NC_013205	GTCG	2	8	952379	952386	0 %	25 %	50 %	25 %	258510871
21526	NC_013205	GGA	2	6	952388	952393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510871
21527	NC_013205	CGA	2	6	952420	952425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510871
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21529	NC_013205	GGC	2	6	952466	952471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510871
21530	NC_013205	TGG	2	6	952569	952574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510871
21531	NC_013205	TGG	2	6	952606	952611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510871
21532	NC_013205	GC	3	6	952648	952653	0 %	0 %	50 %	50 %	258510871
21533	NC_013205	GGTCA	2	10	952659	952668	20 %	20 %	40 %	20 %	258510871
21534	NC_013205	ATC	2	6	952674	952679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510871
21535	NC_013205	CTG	2	6	952833	952838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510871
21536	NC_013205	GC	3	6	952870	952875	0 %	0 %	50 %	50 %	258510871
21537	NC_013205	CAA	2	6	952904	952909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510871
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21539	NC_013205	TGA	2	6	953007	953012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510871
21540	NC_013205	GAAAC	2	10	953017	953026	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
21541	NC_013205	GCG	2	6	953077	953082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21542	NC_013205	CGG	2	6	953090	953095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510872
21543	NC_013205	GGCG	2	8	953178	953185	0 %	0 %	75 %	25 %	258510872
21544	NC_013205	CAG	2	6	953191	953196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510872
21545	NC_013205	GAC	2	6	953203	953208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510872
21546	NC_013205	TGA	2	6	953265	953270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510872
21547	NC_013205	AG	3	6	953292	953297	50 %	0 %	50 %	0 %	258510872
21548	NC_013205	GTT	2	6	953314	953319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510872
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21551	NC_013205	GCG	2	6	953426	953431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510872
21552	NC_013205	GCG	2	6	953439	953444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510872
21553	NC_013205	TGA	2	6	953490	953495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510872
21554	NC_013205	AGCC	2	8	953502	953509	25 %	0 %	25 %	50 %	258510872
21555	NC_013205	ATG	2	6	953519	953524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510872
21556	NC_013205	A	6	6	953581	953586	100 %	0 %	0 %	0 %	258510872
21557	NC_013205	AGA	2	6	953595	953600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510872
21558	NC_013205	GTG	2	6	953612	953617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510872
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21561	NC_013205	GATC	2	8	953826	953833	25 %	25 %	25 %	25 %	258510872
21562	NC_013205	GCA	2	6	953838	953843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510872
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21568	NC_013205	GCC	2	6	953999	954004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510872
21569	NC_013205	GCGCCT	2	12	954033	954044	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	258510872
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21571	NC_013205	GAC	2	6	954127	954132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510872
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21573	NC_013205	CGAC	2	8	954215	954222	25 %	0 %	25 %	50 %	258510872
21574	NC_013205	ATG	2	6	954242	954247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510872
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21578	NC_013205	AAG	2	6	954401	954406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510872
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21587	NC_013205	GC	3	6	954698	954703	0 %	0 %	50 %	50 %	258510873
21588	NC_013205	CACGG	2	10	954711	954720	20 %	0 %	40 %	40 %	258510873
21589	NC_013205	AC	3	6	954747	954752	50 %	0 %	0 %	50 %	258510873
21590	NC_013205	GCG	2	6	954807	954812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510873
21591	NC_013205	GGA	2	6	954828	954833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510873
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21608	NC_013205	TGCG	2	8	955468	955475	0 %	25 %	50 %	25 %	258510874
21609	NC_013205	CCT	2	6	955493	955498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21610	NC_013205	TC	3	6	955523	955528	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21611	NC_013205	GAA	2	6	955609	955614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21612	NC_013205	TGC	2	6	955622	955627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21982	NC_013205	GGA	2	6	971812	971817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510893
21983	NC_013205	GC	3	6	971833	971838	0 %	0 %	50 %	50 %	258510893
21984	NC_013205	CTG	2	6	971843	971848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510893
21985	NC_013205	GGA	2	6	971863	971868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510893
21986	NC_013205	GGC	2	6	971877	971882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510893
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21989	NC_013205	GGC	2	6	971963	971968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510893
21990	NC_013205	GGC	2	6	972070	972075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510893
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21994	NC_013205	GCG	2	6	972202	972207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510893
21995	NC_013205	GGC	2	6	972234	972239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510893
21996	NC_013205	CCT	2	6	972247	972252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510893
21997	NC_013205	GCG	2	6	972287	972292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510893
21998	NC_013205	GGC	2	6	972402	972407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21999	NC_013205	GA	3	6	972463	972468	50 %	0 %	50 %	0 %	258510894
22000	NC_013205	CGT	2	6	972589	972594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510894

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