MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_013205	T	6	6	929087	929092	0 %	100 %	0 %	0 %	258510848
21003	NC_013205	GAT	2	6	929114	929119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510848
21004	NC_013205	CGC	2	6	929133	929138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510848
21005	NC_013205	GAG	2	6	929144	929149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510848
21006	NC_013205	GGGC	2	8	929198	929205	0 %	0 %	75 %	25 %	258510848
21007	NC_013205	GATTC	2	10	929241	929250	20 %	40 %	20 %	20 %	258510848
21008	NC_013205	CTG	2	6	929257	929262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510848
21009	NC_013205	CGG	2	6	929266	929271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510848
21010	NC_013205	GGC	2	6	929302	929307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510848
21011	NC_013205	CG	3	6	929316	929321	0 %	0 %	50 %	50 %	258510848
21012	NC_013205	TCGT	2	8	929333	929340	0 %	50 %	25 %	25 %	258510848
21013	NC_013205	CGT	2	6	929368	929373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510848
21014	NC_013205	TCT	2	6	929514	929519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510848
21015	NC_013205	AGG	2	6	929532	929537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510848
21016	NC_013205	TCC	2	6	929646	929651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510848
21017	NC_013205	GCA	2	6	929664	929669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510848
21018	NC_013205	AGG	3	9	929670	929678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510848
21019	NC_013205	ACG	2	6	929703	929708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510848
21020	NC_013205	CGC	2	6	929752	929757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510848
21021	NC_013205	GC	3	6	929770	929775	0 %	0 %	50 %	50 %	258510848
21022	NC_013205	GGC	2	6	929807	929812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510848
21023	NC_013205	CGC	2	6	929818	929823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510848
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21025	NC_013205	GC	4	8	929914	929921	0 %	0 %	50 %	50 %	258510849
21026	NC_013205	GCG	2	6	929926	929931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510849
21027	NC_013205	CGA	2	6	929963	929968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510849
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21029	NC_013205	CCT	2	6	930022	930027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510849
21030	NC_013205	CG	3	6	930071	930076	0 %	0 %	50 %	50 %	258510849
21031	NC_013205	GTCC	2	8	930077	930084	0 %	25 %	25 %	50 %	258510849
21032	NC_013205	CGA	2	6	930085	930090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510849
21033	NC_013205	CG	3	6	930286	930291	0 %	0 %	50 %	50 %	258510849
21034	NC_013205	GCC	2	6	930386	930391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510849
21035	NC_013205	GAC	2	6	930392	930397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510849
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21037	NC_013205	CCG	2	6	930553	930558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510849
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21039	NC_013205	AGCCGA	2	12	930586	930597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510849
21040	NC_013205	CGC	2	6	930664	930669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510849
21041	NC_013205	A	6	6	930677	930682	100 %	0 %	0 %	0 %	258510849
21042	NC_013205	GTT	2	6	930755	930760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510849
21043	NC_013205	GGCTT	2	10	930771	930780	0 %	40 %	40 %	20 %	258510849
21044	NC_013205	GATC	2	8	930799	930806	25 %	25 %	25 %	25 %	258510849
21045	NC_013205	GC	3	6	930869	930874	0 %	0 %	50 %	50 %	258510849
21046	NC_013205	GC	3	6	930882	930887	0 %	0 %	50 %	50 %	258510849
21047	NC_013205	ACG	2	6	930888	930893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510849
21048	NC_013205	TCG	2	6	930907	930912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510849
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21050	NC_013205	GC	3	6	931123	931128	0 %	0 %	50 %	50 %	258510850
21051	NC_013205	GAC	2	6	931232	931237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510850
21052	NC_013205	GCT	2	6	931256	931261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510850
21053	NC_013205	GGC	2	6	931331	931336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510850
21054	NC_013205	TGG	2	6	931387	931392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510850
21055	NC_013205	CGT	2	6	931517	931522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510850
21056	NC_013205	GCG	2	6	931528	931533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510850
21057	NC_013205	GGCT	2	8	931606	931613	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21058	NC_013205	CGG	2	6	931782	931787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510851
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21061	NC_013205	CTG	2	6	931952	931957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510851
21062	NC_013205	ACCA	2	8	931961	931968	50 %	0 %	0 %	50 %	258510851
21063	NC_013205	CGG	2	6	931987	931992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510851
21064	NC_013205	TCA	2	6	932056	932061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510851
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21082	NC_013205	AGCGCG	2	12	933093	933104	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	258510851
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21088	NC_013205	G	6	6	933560	933565	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
21089	NC_013205	GCG	2	6	933578	933583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510852
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21091	NC_013205	GTAC	2	8	933611	933618	25 %	25 %	25 %	25 %	258510852
21092	NC_013205	TGA	2	6	933653	933658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510852
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21099	NC_013205	GC	3	6	933966	933971	0 %	0 %	50 %	50 %	258510852
21100	NC_013205	GA	3	6	934018	934023	50 %	0 %	50 %	0 %	258510852
21101	NC_013205	AAGT	2	8	934248	934255	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21102	NC_013205	G	6	6	934261	934266	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
21103	NC_013205	TGG	2	6	934338	934343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510853
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21118	NC_013205	TCT	2	6	934930	934935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510854
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21120	NC_013205	CGG	2	6	935050	935055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510854
21121	NC_013205	ACC	2	6	935062	935067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510854
21122	NC_013205	GC	3	6	935111	935116	0 %	0 %	50 %	50 %	258510854
21123	NC_013205	CGC	2	6	935138	935143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510854
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21243	NC_013205	CCG	2	6	940421	940426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510861
21244	NC_013205	CCGGC	2	10	940455	940464	0 %	0 %	40 %	60 %	258510861
21245	NC_013205	CAC	2	6	940466	940471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510861
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21247	NC_013205	CATC	2	8	940495	940502	25 %	25 %	0 %	50 %	258510861
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21250	NC_013205	CGGC	2	8	940565	940572	0 %	0 %	50 %	50 %	258510861
21251	NC_013205	CGC	2	6	940609	940614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510861
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21483	NC_013205	CAC	2	6	950924	950929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510870
21484	NC_013205	CGA	2	6	950938	950943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510870
21485	NC_013205	TC	3	6	950955	950960	0 %	50 %	0 %	50 %	258510870
21486	NC_013205	TGC	2	6	950976	950981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510870
21487	NC_013205	CCGA	2	8	951175	951182	25 %	0 %	25 %	50 %	258510870
21488	NC_013205	GCG	2	6	951210	951215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510870
21489	NC_013205	CGT	3	9	951220	951228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510870
21490	NC_013205	GGA	2	6	951280	951285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510870
21491	NC_013205	ACC	2	6	951299	951304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510870
21492	NC_013205	CGGA	2	8	951320	951327	25 %	0 %	50 %	25 %	258510870
21493	NC_013205	ATC	2	6	951345	951350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510870
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21497	NC_013205	TCA	2	6	951468	951473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510870
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