MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_013205	TCGCCA	2	12	822640	822651	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	258510762
18502	NC_013205	CGA	2	6	822661	822666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510762
18503	NC_013205	CGT	3	9	822743	822751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510762
18504	NC_013205	GGCG	2	8	822800	822807	0 %	0 %	75 %	25 %	258510762
18505	NC_013205	TTCGT	2	10	822823	822832	0 %	60 %	20 %	20 %	258510762
18506	NC_013205	GAT	2	6	822965	822970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510762
18507	NC_013205	CGT	2	6	823007	823012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510762
18508	NC_013205	GCC	2	6	823089	823094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510762
18509	NC_013205	GAT	2	6	823181	823186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510762
18510	NC_013205	GGC	2	6	823187	823192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510762
18511	NC_013205	CAT	2	6	823214	823219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510762
18512	NC_013205	TGG	2	6	823258	823263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510762
18513	NC_013205	A	6	6	823271	823276	100 %	0 %	0 %	0 %	258510762
18514	NC_013205	CG	4	8	823280	823287	0 %	0 %	50 %	50 %	258510762
18515	NC_013205	TCA	2	6	823291	823296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510762
18516	NC_013205	CCG	2	6	823297	823302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510762
18517	NC_013205	ACG	2	6	823305	823310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510762
18518	NC_013205	GCC	2	6	823311	823316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510762
18519	NC_013205	GTC	2	6	823326	823331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510762
18520	NC_013205	TTC	2	6	823374	823379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510762
18521	NC_013205	ACC	2	6	823518	823523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510762
18522	NC_013205	TGG	2	6	823539	823544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510762
18523	NC_013205	CCG	2	6	823624	823629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510762
18524	NC_013205	TCA	2	6	823660	823665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510762
18525	NC_013205	TCT	2	6	823666	823671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510762
18526	NC_013205	CGT	2	6	823688	823693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510762
18527	NC_013205	CTT	2	6	823697	823702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510762
18528	NC_013205	GCC	2	6	823713	823718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510762
18529	NC_013205	GTG	3	9	823788	823796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510762
18530	NC_013205	AGG	2	6	823828	823833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510762
18531	NC_013205	CGG	2	6	823864	823869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510762
18532	NC_013205	AGG	2	6	823945	823950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510762
18533	NC_013205	CGG	2	6	823958	823963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510762
18534	NC_013205	AGG	2	6	824004	824009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18535	NC_013205	TCT	2	6	824010	824015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18536	NC_013205	CT	3	6	824030	824035	0 %	50 %	0 %	50 %	258510763
18537	NC_013205	CGT	2	6	824036	824041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510763
18538	NC_013205	CT	3	6	824048	824053	0 %	50 %	0 %	50 %	258510763
18539	NC_013205	GGC	2	6	824074	824079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510763
18540	NC_013205	GTG	2	6	824116	824121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510763
18541	NC_013205	CG	3	6	824164	824169	0 %	0 %	50 %	50 %	258510763
18542	NC_013205	ATC	2	6	824171	824176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510763
18543	NC_013205	ACG	2	6	824240	824245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510763
18544	NC_013205	TGA	2	6	824249	824254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510763
18545	NC_013205	CGA	2	6	824256	824261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510763
18546	NC_013205	GC	3	6	824265	824270	0 %	0 %	50 %	50 %	258510763
18547	NC_013205	TCCC	2	8	824459	824466	0 %	25 %	0 %	75 %	258510763
18548	NC_013205	GTG	2	6	824487	824492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510763
18549	NC_013205	CGA	2	6	824493	824498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510763
18550	NC_013205	CGC	2	6	824594	824599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510763
18551	NC_013205	TCCG	2	8	824625	824632	0 %	25 %	25 %	50 %	258510763
18552	NC_013205	GACG	2	8	824694	824701	25 %	0 %	50 %	25 %	258510763
18553	NC_013205	GC	3	6	824704	824709	0 %	0 %	50 %	50 %	258510763
18554	NC_013205	GAG	2	6	824757	824762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18555	NC_013205	TGC	2	6	824876	824881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510764
18556	NC_013205	T	6	6	824923	824928	0 %	100 %	0 %	0 %	258510764
18557	NC_013205	CAC	2	6	824997	825002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510764
18558	NC_013205	CTC	2	6	825013	825018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510764
18559	NC_013205	CGACA	2	10	825067	825076	40 %	0 %	20 %	40 %	258510764
18560	NC_013205	GCG	2	6	825083	825088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510764
18561	NC_013205	TGCACA	2	12	825134	825145	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	258510764
18562	NC_013205	TGC	2	6	825164	825169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510764
18563	NC_013205	CTT	2	6	825225	825230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510764
18564	NC_013205	CGG	2	6	825255	825260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510764
18565	NC_013205	CAA	2	6	825357	825362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510764
18566	NC_013205	GGC	2	6	825407	825412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510764
18567	NC_013205	ACGC	2	8	825510	825517	25 %	0 %	25 %	50 %	258510765
18568	NC_013205	GAA	2	6	825519	825524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510765
18569	NC_013205	CGG	2	6	825557	825562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510765
18570	NC_013205	CGA	2	6	825591	825596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510765
18571	NC_013205	CG	4	8	825810	825817	0 %	0 %	50 %	50 %	258510765
18572	NC_013205	GCG	2	6	825825	825830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510765
18573	NC_013205	GGCG	3	12	825827	825838	0 %	0 %	75 %	25 %	258510765
18574	NC_013205	GAA	2	6	825877	825882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510765
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18576	NC_013205	GCG	2	6	825938	825943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510765
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18578	NC_013205	CGA	2	6	826032	826037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510765
18579	NC_013205	CG	3	6	826064	826069	0 %	0 %	50 %	50 %	258510765
18580	NC_013205	GCG	2	6	826149	826154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510765
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18582	NC_013205	GGC	2	6	826224	826229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510765
18583	NC_013205	GC	4	8	826240	826247	0 %	0 %	50 %	50 %	258510765
18584	NC_013205	CGT	2	6	826292	826297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510765
18585	NC_013205	GATC	2	8	826371	826378	25 %	25 %	25 %	25 %	258510765
18586	NC_013205	TCG	2	6	826379	826384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510765
18587	NC_013205	GAT	2	6	826389	826394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510765
18588	NC_013205	GGC	2	6	826401	826406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510765
18589	NC_013205	GC	3	6	826429	826434	0 %	0 %	50 %	50 %	258510765
18590	NC_013205	GT	3	6	826469	826474	0 %	50 %	50 %	0 %	258510765
18591	NC_013205	GGA	2	6	826479	826484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510765
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18593	NC_013205	GC	4	8	826544	826551	0 %	0 %	50 %	50 %	258510765
18594	NC_013205	ATC	2	6	826615	826620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510765
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18598	NC_013205	GGC	2	6	826816	826821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510765
18599	NC_013205	GGC	2	6	826850	826855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510765
18600	NC_013205	GC	3	6	826946	826951	0 %	0 %	50 %	50 %	258510765
18601	NC_013205	GAC	2	6	826996	827001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510765
18602	NC_013205	CG	3	6	827079	827084	0 %	0 %	50 %	50 %	258510765
18603	NC_013205	CCG	3	9	827114	827122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510765
18604	NC_013205	GC	3	6	827127	827132	0 %	0 %	50 %	50 %	258510765
18605	NC_013205	TG	4	8	827138	827145	0 %	50 %	50 %	0 %	258510765
18606	NC_013205	TCG	2	6	827231	827236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510765
18607	NC_013205	GTG	2	6	827245	827250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510765
18608	NC_013205	CGCC	2	8	827258	827265	0 %	0 %	25 %	75 %	258510765
18609	NC_013205	CGT	2	6	827300	827305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510765
18610	NC_013205	GTG	2	6	827329	827334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510765
18611	NC_013205	CGT	2	6	827369	827374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510765
18612	NC_013205	GC	3	6	827464	827469	0 %	0 %	50 %	50 %	258510765
18613	NC_013205	CGG	2	6	827475	827480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510765
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18615	NC_013205	TGTC	2	8	827598	827605	0 %	50 %	25 %	25 %	258510765
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18620	NC_013205	CGC	2	6	827865	827870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510765
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18862	NC_013205	GC	4	8	838336	838343	0 %	0 %	50 %	50 %	258510775
18863	NC_013205	GC	3	6	838439	838444	0 %	0 %	50 %	50 %	258510775
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18981	NC_013205	GGA	2	6	843628	843633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510779
18982	NC_013205	GTC	2	6	843656	843661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510779
18983	NC_013205	CGG	2	6	843742	843747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510779
18984	NC_013205	CCG	2	6	843776	843781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510779
18985	NC_013205	GAG	3	9	843794	843802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510779
18986	NC_013205	GTG	2	6	843857	843862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510779
18987	NC_013205	GTG	2	6	844115	844120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510779
18988	NC_013205	GC	3	6	844125	844130	0 %	0 %	50 %	50 %	258510779
18989	NC_013205	CGC	2	6	844161	844166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510779
18990	NC_013205	GC	3	6	844165	844170	0 %	0 %	50 %	50 %	258510779
18991	NC_013205	GGGC	2	8	844172	844179	0 %	0 %	75 %	25 %	258510779
18992	NC_013205	CCGCT	2	10	844268	844277	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
18993	NC_013205	GGA	2	6	844319	844324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18994	NC_013205	GA	3	6	844334	844339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18995	NC_013205	AGTGG	2	10	844369	844378	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
18996	NC_013205	CG	3	6	844407	844412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18997	NC_013205	GCG	2	6	844452	844457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18998	NC_013205	AGC	2	6	844490	844495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18999	NC_013205	GT	3	6	844555	844560	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19000	NC_013205	GAGT	2	8	844632	844639	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding

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