MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_013205	GAA	2	6	801751	801756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510746
18003	NC_013205	CGG	2	6	801764	801769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510746
18004	NC_013205	ACG	2	6	801803	801808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510746
18005	NC_013205	GAG	2	6	801817	801822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510746
18006	NC_013205	GCGG	2	8	801845	801852	0 %	0 %	75 %	25 %	258510746
18007	NC_013205	GGC	2	6	801927	801932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510746
18008	NC_013205	CGGCG	2	10	801940	801949	0 %	0 %	60 %	40 %	258510746
18009	NC_013205	CGGA	2	8	801977	801984	25 %	0 %	50 %	25 %	258510746
18010	NC_013205	CCGG	2	8	802042	802049	0 %	0 %	50 %	50 %	258510746
18011	NC_013205	AAG	2	6	802096	802101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510746
18012	NC_013205	GCG	2	6	802141	802146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18013	NC_013205	CG	3	6	802174	802179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18014	NC_013205	ACT	2	6	802262	802267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510747
18015	NC_013205	GAG	2	6	802273	802278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510747
18016	NC_013205	GC	3	6	802360	802365	0 %	0 %	50 %	50 %	258510747
18017	NC_013205	GAC	2	6	802369	802374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510747
18018	NC_013205	ACA	2	6	802391	802396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510747
18019	NC_013205	AAG	2	6	802471	802476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510747
18020	NC_013205	ACC	2	6	802484	802489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510747
18021	NC_013205	TGGG	2	8	802551	802558	0 %	25 %	75 %	0 %	258510747
18022	NC_013205	AAG	2	6	802588	802593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510747
18023	NC_013205	GCC	2	6	802612	802617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510747
18024	NC_013205	GC	3	6	802660	802665	0 %	0 %	50 %	50 %	258510747
18025	NC_013205	GCG	2	6	802670	802675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510747
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18027	NC_013205	CG	3	6	802693	802698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18028	NC_013205	CAT	2	6	802715	802720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18029	NC_013205	ATG	2	6	802731	802736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18030	NC_013205	TAA	2	6	802769	802774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18031	NC_013205	CGG	2	6	802877	802882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18032	NC_013205	GCTC	2	8	802961	802968	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18033	NC_013205	GC	3	6	803011	803016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18034	NC_013205	GGC	2	6	803043	803048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18035	NC_013205	GCG	2	6	803162	803167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18036	NC_013205	CCA	2	6	803202	803207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18037	NC_013205	TGGAA	2	10	803216	803225	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
18038	NC_013205	ATG	2	6	803362	803367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18039	NC_013205	CGG	2	6	803416	803421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18040	NC_013205	AT	3	6	803466	803471	50 %	50 %	0 %	0 %	258510748
18041	NC_013205	GACG	2	8	803488	803495	25 %	0 %	50 %	25 %	258510748
18042	NC_013205	CGC	3	9	803592	803600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510748
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18044	NC_013205	TCG	2	6	803705	803710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510748
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18051	NC_013205	CTG	2	6	803851	803856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510748
18052	NC_013205	GCCT	2	8	803858	803865	0 %	25 %	25 %	50 %	258510748
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18055	NC_013205	GAA	2	6	803974	803979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510748
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18057	NC_013205	GC	3	6	803996	804001	0 %	0 %	50 %	50 %	258510748
18058	NC_013205	GAG	2	6	804019	804024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510748
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18092	NC_013205	GC	3	6	805699	805704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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18094	NC_013205	GT	3	6	805714	805719	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18095	NC_013205	CG	3	6	805731	805736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18096	NC_013205	GCC	2	6	805745	805750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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18102	NC_013205	GCC	2	6	806120	806125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510750
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18106	NC_013205	GATG	2	8	806170	806177	25 %	25 %	50 %	0 %	258510750
18107	NC_013205	GCG	2	6	806206	806211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510750
18108	NC_013205	AGCCG	2	10	806213	806222	20 %	0 %	40 %	40 %	258510750
18109	NC_013205	GGCG	2	8	806269	806276	0 %	0 %	75 %	25 %	258510750
18110	NC_013205	CTT	2	6	806279	806284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510750
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18115	NC_013205	GCTG	2	8	806433	806440	0 %	25 %	50 %	25 %	258510750
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18119	NC_013205	CACCGG	2	12	806599	806610	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	258510750
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18123	NC_013205	TCC	2	6	806806	806811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510750
18124	NC_013205	GGCC	2	8	806838	806845	0 %	0 %	50 %	50 %	258510750
18125	NC_013205	CT	3	6	806856	806861	0 %	50 %	0 %	50 %	258510750
18126	NC_013205	GGC	2	6	806926	806931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510750
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18131	NC_013205	GGC	2	6	807106	807111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510750
18132	NC_013205	TCG	2	6	807117	807122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510750
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18155	NC_013205	GC	3	6	808034	808039	0 %	0 %	50 %	50 %	258510751
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18165	NC_013205	CG	3	6	808340	808345	0 %	0 %	50 %	50 %	258510751
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18198	NC_013205	GCGA	2	8	809620	809627	25 %	0 %	50 %	25 %	258510751
18199	NC_013205	GCT	2	6	809658	809663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510751
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18202	NC_013205	CGC	2	6	809725	809730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510751
18203	NC_013205	GC	3	6	809788	809793	0 %	0 %	50 %	50 %	258510751
18204	NC_013205	GACCG	2	10	809828	809837	20 %	0 %	40 %	40 %	258510751
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18206	NC_013205	TGT	2	6	809877	809882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18207	NC_013205	GGCGC	2	10	809883	809892	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
18208	NC_013205	CAAT	2	8	809934	809941	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18209	NC_013205	AGGTG	2	10	810080	810089	20 %	20 %	60 %	0 %	258510752
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18211	NC_013205	GGC	2	6	810119	810124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510752
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18213	NC_013205	GCA	2	6	810227	810232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510752
18214	NC_013205	GGC	2	6	810254	810259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510752
18215	NC_013205	CTT	2	6	810266	810271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510752
18216	NC_013205	GTC	2	6	810293	810298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510752
18217	NC_013205	CG	3	6	810312	810317	0 %	0 %	50 %	50 %	258510752
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18229	NC_013205	ATGC	2	8	810687	810694	25 %	25 %	25 %	25 %	258510752
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18231	NC_013205	CGG	2	6	810850	810855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510753
18232	NC_013205	GGT	2	6	810919	810924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510753
18233	NC_013205	CGA	2	6	810960	810965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510753
18234	NC_013205	GCCT	2	8	811109	811116	0 %	25 %	25 %	50 %	258510753
18235	NC_013205	CGGC	2	8	811118	811125	0 %	0 %	50 %	50 %	258510753
18236	NC_013205	CG	3	6	811144	811149	0 %	0 %	50 %	50 %	258510753
18237	NC_013205	CG	3	6	811168	811173	0 %	0 %	50 %	50 %	258510753
18238	NC_013205	GGA	2	6	811180	811185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510753
18239	NC_013205	TGA	2	6	811191	811196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510753
18240	NC_013205	GC	3	6	811234	811239	0 %	0 %	50 %	50 %	258510753
18241	NC_013205	CTG	2	6	811304	811309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510753
18242	NC_013205	CCG	2	6	811368	811373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510753
18243	NC_013205	GC	3	6	811383	811388	0 %	0 %	50 %	50 %	258510753
18244	NC_013205	CGGC	2	8	811417	811424	0 %	0 %	50 %	50 %	258510753
18245	NC_013205	CTC	2	6	811427	811432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510753
18246	NC_013205	CTC	2	6	811466	811471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510753
18247	NC_013205	CG	3	6	811490	811495	0 %	0 %	50 %	50 %	258510753
18248	NC_013205	TGG	2	6	811533	811538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510753
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18253	NC_013205	GACG	2	8	811924	811931	25 %	0 %	50 %	25 %	258510753
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18262	NC_013205	GCG	2	6	812141	812146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510753
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18266	NC_013205	ACG	2	6	812244	812249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510753
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18290	NC_013205	TCG	2	6	813319	813324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510754
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18347	NC_013205	GGTGC	2	10	816091	816100	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
18348	NC_013205	GC	3	6	816115	816120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18349	NC_013205	GAG	2	6	816203	816208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18350	NC_013205	GGAA	2	8	816286	816293	50 %	0 %	50 %	0 %	258510758
18351	NC_013205	GAG	2	6	816297	816302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510758
18352	NC_013205	CG	3	6	816330	816335	0 %	0 %	50 %	50 %	258510758
18353	NC_013205	TGC	2	6	816400	816405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510758
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18355	NC_013205	GC	3	6	816413	816418	0 %	0 %	50 %	50 %	258510758
18356	NC_013205	CGA	2	6	816419	816424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510758
18357	NC_013205	CG	3	6	816467	816472	0 %	0 %	50 %	50 %	258510758
18358	NC_013205	CGC	2	6	816497	816502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510758
18359	NC_013205	CGA	2	6	816521	816526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510758
18360	NC_013205	TGA	2	6	816604	816609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510758
18361	NC_013205	CGGA	2	8	816670	816677	25 %	0 %	50 %	25 %	258510758
18362	NC_013205	GC	3	6	816794	816799	0 %	0 %	50 %	50 %	258510758
18363	NC_013205	GGACAG	2	12	816897	816908	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	258510758
18364	NC_013205	CAT	2	6	816917	816922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510758
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18487	NC_013205	GCG	2	6	822204	822209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18488	NC_013205	AGAA	2	8	822242	822249	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18489	NC_013205	TTTG	2	8	822262	822269	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18490	NC_013205	ATAG	2	8	822338	822345	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18491	NC_013205	CCG	2	6	822367	822372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18492	NC_013205	GA	3	6	822393	822398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18493	NC_013205	TCG	2	6	822413	822418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18494	NC_013205	T	6	6	822476	822481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18495	NC_013205	ACG	2	6	822493	822498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18496	NC_013205	CGAG	2	8	822521	822528	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18497	NC_013205	GGA	2	6	822542	822547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510762
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