MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_013205	CGG	3	9	781425	781433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17502	NC_013205	GGC	2	6	781460	781465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17503	NC_013205	CCA	2	6	781487	781492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17504	NC_013205	CGA	2	6	781526	781531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510732
17505	NC_013205	TCA	2	6	781556	781561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510732
17506	NC_013205	GCC	2	6	781581	781586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510732
17507	NC_013205	AGG	2	6	781622	781627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510732
17508	NC_013205	CATC	2	8	781643	781650	25 %	25 %	0 %	50 %	258510732
17509	NC_013205	CAT	2	6	781662	781667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510732
17510	NC_013205	ACA	2	6	781670	781675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510732
17511	NC_013205	AGG	2	6	781688	781693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510732
17512	NC_013205	CGGT	2	8	781748	781755	0 %	25 %	50 %	25 %	258510732
17513	NC_013205	TCG	2	6	781785	781790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510732
17514	NC_013205	CCA	2	6	781902	781907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510732
17515	NC_013205	CGAGGT	2	12	781920	781931	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258510732
17516	NC_013205	CG	3	6	782011	782016	0 %	0 %	50 %	50 %	258510732
17517	NC_013205	CGG	2	6	782112	782117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510732
17518	NC_013205	GGC	2	6	782139	782144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510732
17519	NC_013205	GAC	2	6	782170	782175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510732
17520	NC_013205	CAT	2	6	782214	782219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510732
17521	NC_013205	CTT	2	6	782319	782324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510732
17522	NC_013205	CTG	2	6	782343	782348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510732
17523	NC_013205	GTG	2	6	782368	782373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510732
17524	NC_013205	GCTG	2	8	782402	782409	0 %	25 %	50 %	25 %	258510732
17525	NC_013205	GAG	2	6	782494	782499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510732
17526	NC_013205	GGTG	2	8	782517	782524	0 %	25 %	75 %	0 %	258510732
17527	NC_013205	GTG	2	6	782527	782532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510732
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17530	NC_013205	CGG	2	6	782613	782618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510732
17531	NC_013205	CGA	3	9	782690	782698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510732
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17533	NC_013205	CAT	2	6	782727	782732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510732
17534	NC_013205	CG	3	6	782749	782754	0 %	0 %	50 %	50 %	258510732
17535	NC_013205	GGC	2	6	782767	782772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510732
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17537	NC_013205	CGG	2	6	782832	782837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510732
17538	NC_013205	CG	3	6	782853	782858	0 %	0 %	50 %	50 %	258510732
17539	NC_013205	GAG	2	6	782998	783003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510732
17540	NC_013205	TG	3	6	783042	783047	0 %	50 %	50 %	0 %	258510732
17541	NC_013205	T	7	7	783115	783121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17542	NC_013205	GT	3	6	783122	783127	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17543	NC_013205	GGTAT	2	10	783215	783224	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
17544	NC_013205	GGA	2	6	783274	783279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17545	NC_013205	GAA	2	6	783339	783344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510733
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17549	NC_013205	AAG	2	6	783601	783606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510733
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17551	NC_013205	GCT	2	6	783754	783759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17552	NC_013205	C	6	6	783845	783850	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17553	NC_013205	AGG	2	6	783855	783860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17554	NC_013205	CGG	2	6	784054	784059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17555	NC_013205	GAC	2	6	784081	784086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510734
17556	NC_013205	GCC	2	6	784133	784138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510734
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17559	NC_013205	TG	3	6	784202	784207	0 %	50 %	50 %	0 %	258510734
17560	NC_013205	CTG	2	6	784271	784276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510734
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17565	NC_013205	CGT	2	6	784621	784626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510734
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17588	NC_013205	CAT	2	6	785254	785259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510734
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17593	NC_013205	T	6	6	785403	785408	0 %	100 %	0 %	0 %	258510735
17594	NC_013205	CG	4	8	785426	785433	0 %	0 %	50 %	50 %	258510735
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17609	NC_013205	TC	3	6	786135	786140	0 %	50 %	0 %	50 %	258510735
17610	NC_013205	AGCG	2	8	786166	786173	25 %	0 %	50 %	25 %	258510735
17611	NC_013205	CGAG	2	8	786336	786343	25 %	0 %	50 %	25 %	258510735
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17616	NC_013205	TGAC	2	8	786571	786578	25 %	25 %	25 %	25 %	258510735
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17619	NC_013205	GCCGA	2	10	786748	786757	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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17983	NC_013205	CAT	2	6	801111	801116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510746
17984	NC_013205	CG	3	6	801131	801136	0 %	0 %	50 %	50 %	258510746
17985	NC_013205	AGG	2	6	801224	801229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510746
17986	NC_013205	CGA	2	6	801282	801287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510746
17987	NC_013205	CAT	2	6	801300	801305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510746
17988	NC_013205	CGT	2	6	801312	801317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510746
17989	NC_013205	TAC	2	6	801391	801396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510746
17990	NC_013205	TGC	2	6	801398	801403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510746
17991	NC_013205	CGT	2	6	801471	801476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510746
17992	NC_013205	ACGT	2	8	801544	801551	25 %	25 %	25 %	25 %	258510746
17993	NC_013205	CGG	2	6	801552	801557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510746
17994	NC_013205	ATG	2	6	801581	801586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510746
17995	NC_013205	CGG	2	6	801607	801612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510746
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17998	NC_013205	CGA	2	6	801669	801674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510746
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