MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_013205	GCC	2	6	692144	692149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510645
15503	NC_013205	GCG	2	6	692151	692156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510645
15504	NC_013205	CAC	2	6	692181	692186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510645
15505	NC_013205	GC	3	6	692264	692269	0 %	0 %	50 %	50 %	258510646
15506	NC_013205	CGA	2	6	692296	692301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510646
15507	NC_013205	CG	4	8	692323	692330	0 %	0 %	50 %	50 %	258510646
15508	NC_013205	TCG	2	6	692331	692336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510646
15509	NC_013205	CGA	2	6	692344	692349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510646
15510	NC_013205	TCCTT	2	10	692361	692370	0 %	60 %	0 %	40 %	258510646
15511	NC_013205	CG	3	6	692383	692388	0 %	0 %	50 %	50 %	258510646
15512	NC_013205	GCA	2	6	692497	692502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510646
15513	NC_013205	CGG	2	6	692572	692577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510646
15514	NC_013205	GCCG	2	8	692612	692619	0 %	0 %	50 %	50 %	258510646
15515	NC_013205	TCG	2	6	692640	692645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510646
15516	NC_013205	AGC	2	6	692652	692657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510646
15517	NC_013205	GGC	2	6	692830	692835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510646
15518	NC_013205	CGA	2	6	692866	692871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510646
15519	NC_013205	CGT	2	6	692914	692919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510646
15520	NC_013205	CG	3	6	692941	692946	0 %	0 %	50 %	50 %	258510646
15521	NC_013205	CGA	2	6	692962	692967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510646
15522	NC_013205	GCG	2	6	693065	693070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510646
15523	NC_013205	CCT	2	6	693121	693126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510647
15524	NC_013205	CG	3	6	693142	693147	0 %	0 %	50 %	50 %	258510647
15525	NC_013205	GGC	2	6	693154	693159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510647
15526	NC_013205	GCC	2	6	693209	693214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510647
15527	NC_013205	GATC	2	8	693240	693247	25 %	25 %	25 %	25 %	258510647
15528	NC_013205	CAG	2	6	693292	693297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510647
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15530	NC_013205	CCAG	2	8	693375	693382	25 %	0 %	25 %	50 %	258510647
15531	NC_013205	CGC	2	6	693415	693420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510647
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15533	NC_013205	ATGG	2	8	693491	693498	25 %	25 %	50 %	0 %	258510647
15534	NC_013205	CGC	2	6	693502	693507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510647
15535	NC_013205	GAG	2	6	693649	693654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510647
15536	NC_013205	AGC	2	6	693677	693682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510647
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15540	NC_013205	CGAG	2	8	693858	693865	25 %	0 %	50 %	25 %	258510647
15541	NC_013205	AAC	2	6	693875	693880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510647
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15544	NC_013205	ACC	2	6	694053	694058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510647
15545	NC_013205	CCAT	2	8	694077	694084	25 %	25 %	0 %	50 %	258510647
15546	NC_013205	CG	3	6	694089	694094	0 %	0 %	50 %	50 %	258510647
15547	NC_013205	CCT	2	6	694099	694104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510648
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15550	NC_013205	CCA	2	6	694216	694221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510648
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15552	NC_013205	CGTG	2	8	694417	694424	0 %	25 %	50 %	25 %	258510648
15553	NC_013205	GTG	2	6	694437	694442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510648
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15555	NC_013205	TCG	2	6	694518	694523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510648
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15558	NC_013205	CGTC	2	8	694609	694616	0 %	25 %	25 %	50 %	258510648
15559	NC_013205	CG	3	6	694675	694680	0 %	0 %	50 %	50 %	258510648
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15609	NC_013205	CGA	2	6	696891	696896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510651
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15744	NC_013205	GC	3	6	702562	702567	0 %	0 %	50 %	50 %	258510657
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15864	NC_013205	CTT	2	6	707186	707191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510662
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15866	NC_013205	GTTCTG	2	12	707234	707245	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	258510662
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15983	NC_013205	GCG	2	6	712389	712394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510667
15984	NC_013205	GC	4	8	712474	712481	0 %	0 %	50 %	50 %	258510667
15985	NC_013205	CGGG	2	8	712494	712501	0 %	0 %	75 %	25 %	258510667
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15987	NC_013205	CG	3	6	712638	712643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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