MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_013205	TGA	2	6	595986	595991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510540
13502	NC_013205	TGT	2	6	596027	596032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510540
13503	NC_013205	TTTG	2	8	596106	596113	0 %	75 %	25 %	0 %	258510541
13504	NC_013205	TGTTCG	2	12	596124	596135	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	258510541
13505	NC_013205	GTC	2	6	596241	596246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510541
13506	NC_013205	GAA	2	6	596251	596256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510541
13507	NC_013205	TGA	2	6	596304	596309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510541
13508	NC_013205	AAG	2	6	596402	596407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510541
13509	NC_013205	AGA	2	6	596429	596434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510541
13510	NC_013205	AAC	2	6	596444	596449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510541
13511	NC_013205	TTG	2	6	596460	596465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510541
13512	NC_013205	GAAT	2	8	596496	596503	50 %	25 %	25 %	0 %	258510541
13513	NC_013205	TTCG	2	8	596535	596542	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13514	NC_013205	GTGAA	2	10	596550	596559	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13515	NC_013205	GA	3	6	596568	596573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13516	NC_013205	TGT	2	6	596597	596602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510542
13517	NC_013205	GGCGC	2	10	596671	596680	0 %	0 %	60 %	40 %	258510542
13518	NC_013205	TGT	2	6	596697	596702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510542
13519	NC_013205	TG	3	6	596715	596720	0 %	50 %	50 %	0 %	258510542
13520	NC_013205	CAT	2	6	596766	596771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510542
13521	NC_013205	TATCA	2	10	596772	596781	40 %	40 %	0 %	20 %	258510542
13522	NC_013205	GCG	2	6	596815	596820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510542
13523	NC_013205	AAG	2	6	596854	596859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510542
13524	NC_013205	TCT	3	9	596861	596869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510542
13525	NC_013205	GCT	2	6	596896	596901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510542
13526	NC_013205	ACG	2	6	596912	596917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510542
13527	NC_013205	GCT	2	6	596961	596966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510542
13528	NC_013205	CGG	2	6	597071	597076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510542
13529	NC_013205	GTC	2	6	597130	597135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510542
13530	NC_013205	GAGC	2	8	597143	597150	25 %	0 %	50 %	25 %	258510542
13531	NC_013205	TTC	2	6	597209	597214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510542
13532	NC_013205	CG	3	6	597226	597231	0 %	0 %	50 %	50 %	258510542
13533	NC_013205	CGG	2	6	597366	597371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510542
13534	NC_013205	CAAGGT	2	12	597372	597383	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	258510542
13535	NC_013205	CGT	2	6	597450	597455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510542
13536	NC_013205	GCG	2	6	597562	597567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510542
13537	NC_013205	AAC	2	6	597586	597591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510542
13538	NC_013205	TGA	2	6	597602	597607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510542
13539	NC_013205	ACG	2	6	597637	597642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510542
13540	NC_013205	GAG	2	6	597651	597656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510542
13541	NC_013205	GCT	2	6	597729	597734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510542
13542	NC_013205	GTT	2	6	597819	597824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510542
13543	NC_013205	GGCT	2	8	597847	597854	0 %	25 %	50 %	25 %	258510542
13544	NC_013205	GAG	2	6	597891	597896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13545	NC_013205	TCA	2	6	597901	597906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13546	NC_013205	GC	3	6	597977	597982	0 %	0 %	50 %	50 %	258510543
13547	NC_013205	GAG	2	6	597990	597995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510543
13548	NC_013205	CG	3	6	598044	598049	0 %	0 %	50 %	50 %	258510543
13549	NC_013205	TCA	3	9	598087	598095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510543
13550	NC_013205	TG	3	6	598149	598154	0 %	50 %	50 %	0 %	258510543
13551	NC_013205	CGC	2	6	598182	598187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510543
13552	NC_013205	GGA	2	6	598243	598248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510543
13553	NC_013205	GAG	3	9	598313	598321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510543
13554	NC_013205	CCG	2	6	598475	598480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510544
13555	NC_013205	CGT	2	6	598514	598519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510544
13556	NC_013205	CTT	2	6	598629	598634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510544
13557	NC_013205	TCAA	2	8	598699	598706	50 %	25 %	0 %	25 %	258510544
13558	NC_013205	TGGA	2	8	598800	598807	25 %	25 %	50 %	0 %	258510544
13559	NC_013205	TGG	2	6	598893	598898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13560	NC_013205	AGG	2	6	598985	598990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13561	NC_013205	GC	3	6	599021	599026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13562	NC_013205	GGCGC	2	10	599047	599056	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13563	NC_013205	GCGG	2	8	599077	599084	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13564	NC_013205	CGA	2	6	599221	599226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510545
13565	NC_013205	ACG	2	6	599286	599291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510545
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13567	NC_013205	CT	3	6	599443	599448	0 %	50 %	0 %	50 %	258510545
13568	NC_013205	GCTGT	2	10	599652	599661	0 %	40 %	40 %	20 %	258510545
13569	NC_013205	GTA	2	6	599681	599686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510545
13570	NC_013205	GTT	2	6	599699	599704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510545
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13572	NC_013205	CGA	2	6	599848	599853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510545
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13574	NC_013205	CG	3	6	599888	599893	0 %	0 %	50 %	50 %	258510545
13575	NC_013205	GCC	2	6	599918	599923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510545
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13579	NC_013205	GAA	2	6	600223	600228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510546
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13581	NC_013205	CGG	2	6	600241	600246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510546
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13583	NC_013205	CAA	2	6	600307	600312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510546
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13585	NC_013205	GAAA	2	8	600330	600337	75 %	0 %	25 %	0 %	258510546
13586	NC_013205	TTGT	2	8	600375	600382	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13587	NC_013205	GGA	2	6	600424	600429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13588	NC_013205	GTG	2	6	600479	600484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13589	NC_013205	TCA	2	6	600512	600517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13592	NC_013205	CGC	2	6	600572	600577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13593	NC_013205	CCT	2	6	600580	600585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13594	NC_013205	TTG	2	6	600589	600594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13595	NC_013205	GAGG	2	8	600649	600656	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13596	NC_013205	CCGCG	2	10	600817	600826	0 %	0 %	40 %	60 %	258510547
13597	NC_013205	TGCG	2	8	600855	600862	0 %	25 %	50 %	25 %	258510547
13598	NC_013205	CGT	2	6	600886	600891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510547
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13603	NC_013205	CGTC	2	8	601294	601301	0 %	25 %	25 %	50 %	258510547
13604	NC_013205	GC	3	6	601303	601308	0 %	0 %	50 %	50 %	258510547
13605	NC_013205	CTCG	2	8	601329	601336	0 %	25 %	25 %	50 %	258510547
13606	NC_013205	GACG	2	8	601384	601391	25 %	0 %	50 %	25 %	258510547
13607	NC_013205	GCA	2	6	601476	601481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510547
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13609	NC_013205	GAA	2	6	601571	601576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510547
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13612	NC_013205	CAGAGC	2	12	601766	601777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510547
13613	NC_013205	TAC	2	6	601882	601887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510548
13614	NC_013205	TAGG	2	8	602005	602012	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13615	NC_013205	CAC	2	6	602013	602018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13616	NC_013205	TCGT	2	8	602109	602116	0 %	50 %	25 %	25 %	258510549
13617	NC_013205	TGT	2	6	602125	602130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510549
13618	NC_013205	GACAC	2	10	602375	602384	40 %	0 %	20 %	40 %	258510550
13619	NC_013205	GCG	2	6	602403	602408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510550
13620	NC_013205	ACT	2	6	602472	602477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510550
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13622	NC_013205	ACG	2	6	602550	602555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510550
13623	NC_013205	CGT	2	6	602596	602601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510550
13624	NC_013205	TGC	2	6	602619	602624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510550
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13747	NC_013205	GACGCC	2	12	608406	608417	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	258510559
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13749	NC_013205	CGA	2	6	608471	608476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510559
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13754	NC_013205	TCTG	2	8	608752	608759	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13755	NC_013205	GGGGT	2	10	608878	608887	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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13784	NC_013205	GGT	2	6	610559	610564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13990	NC_013205	GCAACT	2	12	621171	621182	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	258510572
13991	NC_013205	CGA	2	6	621237	621242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510572
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