MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_013205	TGG	2	6	569764	569769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510522
13002	NC_013205	TGA	2	6	569793	569798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510522
13003	NC_013205	TGGGG	2	10	569918	569927	0 %	20 %	80 %	0 %	258510522
13004	NC_013205	TCG	2	6	569939	569944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510522
13005	NC_013205	CCA	2	6	569945	569950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510522
13006	NC_013205	GCGA	2	8	570020	570027	25 %	0 %	50 %	25 %	258510522
13007	NC_013205	GTG	2	6	570135	570140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510522
13008	NC_013205	AG	3	6	570152	570157	50 %	0 %	50 %	0 %	258510522
13009	NC_013205	GGCG	2	8	570237	570244	0 %	0 %	75 %	25 %	258510522
13010	NC_013205	CGA	3	9	570345	570353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510522
13011	NC_013205	ATGAA	2	10	570362	570371	60 %	20 %	20 %	0 %	258510522
13012	NC_013205	CGA	2	6	570375	570380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510522
13013	NC_013205	CAT	2	6	570381	570386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510522
13014	NC_013205	AAGCT	2	10	570395	570404	40 %	20 %	20 %	20 %	258510522
13015	NC_013205	TTC	2	6	570555	570560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510523
13016	NC_013205	AC	4	8	570563	570570	50 %	0 %	0 %	50 %	258510523
13017	NC_013205	TGG	2	6	570574	570579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510523
13018	NC_013205	ATG	2	6	570725	570730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510523
13019	NC_013205	TTGGC	2	10	570732	570741	0 %	40 %	40 %	20 %	258510523
13020	NC_013205	ATG	2	6	570774	570779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510523
13021	NC_013205	CGGT	2	8	570783	570790	0 %	25 %	50 %	25 %	258510523
13022	NC_013205	CGA	2	6	570792	570797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510523
13023	NC_013205	CTT	2	6	570823	570828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510523
13024	NC_013205	TCG	2	6	570942	570947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510523
13025	NC_013205	TGT	2	6	570973	570978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510523
13026	NC_013205	TC	3	6	571006	571011	0 %	50 %	0 %	50 %	258510523
13027	NC_013205	GTG	2	6	571016	571021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510523
13028	NC_013205	CAT	2	6	571080	571085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510524
13029	NC_013205	TGGC	2	8	571126	571133	0 %	25 %	50 %	25 %	258510524
13030	NC_013205	TCA	2	6	571163	571168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510524
13031	NC_013205	TTG	2	6	571171	571176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510524
13032	NC_013205	GTT	2	6	571209	571214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510524
13033	NC_013205	CTT	2	6	571215	571220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510524
13034	NC_013205	TCC	2	6	571245	571250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510524
13035	NC_013205	TTGCTC	2	12	571261	571272	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	258510524
13036	NC_013205	GAT	2	6	571278	571283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510524
13037	NC_013205	ATG	2	6	571303	571308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510524
13038	NC_013205	CTA	2	6	571344	571349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510524
13039	NC_013205	AAG	2	6	571470	571475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_013205	GTG	2	6	571480	571485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13041	NC_013205	TCA	2	6	571511	571516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510525
13042	NC_013205	GAA	2	6	571541	571546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510525
13043	NC_013205	GTAG	2	8	571560	571567	25 %	25 %	50 %	0 %	258510525
13044	NC_013205	CT	3	6	571581	571586	0 %	50 %	0 %	50 %	258510525
13045	NC_013205	ATC	2	6	571851	571856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510525
13046	NC_013205	CATTT	2	10	571895	571904	20 %	60 %	0 %	20 %	258510525
13047	NC_013205	TGT	2	6	571910	571915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510525
13048	NC_013205	GAG	2	6	571935	571940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510525
13049	NC_013205	GTT	2	6	572003	572008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510525
13050	NC_013205	ATG	2	6	572017	572022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510525
13051	NC_013205	GCT	2	6	572024	572029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510525
13052	NC_013205	TTGGA	2	10	572038	572047	20 %	40 %	40 %	0 %	258510525
13053	NC_013205	CAG	2	6	572089	572094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510525
13054	NC_013205	AG	3	6	572128	572133	50 %	0 %	50 %	0 %	258510525
13055	NC_013205	TTG	2	6	572170	572175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510525
13056	NC_013205	GAT	2	6	572199	572204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510525
13057	NC_013205	GAAC	2	8	572220	572227	50 %	0 %	25 %	25 %	258510525
13058	NC_013205	CT	3	6	572275	572280	0 %	50 %	0 %	50 %	258510525
13059	NC_013205	AGA	2	6	572302	572307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510525
13060	NC_013205	GGC	2	6	572357	572362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510525
13061	NC_013205	A	6	6	572444	572449	100 %	0 %	0 %	0 %	258510525
13062	NC_013205	GACG	2	8	572465	572472	25 %	0 %	50 %	25 %	258510525
13063	NC_013205	TCG	2	6	572494	572499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510525
13064	NC_013205	CGT	2	6	572552	572557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510525
13065	NC_013205	ATT	2	6	572681	572686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258510525
13066	NC_013205	TGA	2	6	572695	572700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510525
13067	NC_013205	GAT	2	6	572763	572768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510525
13068	NC_013205	TGG	2	6	572785	572790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510525
13069	NC_013205	ATG	2	6	572791	572796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510525
13070	NC_013205	CCG	2	6	572808	572813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510525
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13072	NC_013205	AGGATT	2	12	572867	572878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510525
13073	NC_013205	TGG	2	6	572909	572914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510525
13074	NC_013205	AC	3	6	572949	572954	50 %	0 %	0 %	50 %	258510525
13075	NC_013205	GAG	2	6	573056	573061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510525
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13078	NC_013205	CGT	2	6	573175	573180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510526
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13080	NC_013205	AGC	2	6	573470	573475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510526
13081	NC_013205	CTG	2	6	573510	573515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510526
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13086	NC_013205	CAA	2	6	574173	574178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510527
13087	NC_013205	GCCA	2	8	574180	574187	25 %	0 %	25 %	50 %	258510527
13088	NC_013205	AGC	2	6	574192	574197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510527
13089	NC_013205	CGT	2	6	574251	574256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510527
13090	NC_013205	CCA	2	6	574280	574285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510527
13091	NC_013205	GTC	2	6	574332	574337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510527
13092	NC_013205	GC	3	6	574548	574553	0 %	0 %	50 %	50 %	258510527
13093	NC_013205	CAC	2	6	574620	574625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510527
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13100	NC_013205	CAC	2	6	574929	574934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510527
13101	NC_013205	TCC	2	6	574999	575004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510527
13102	NC_013205	CGT	2	6	575022	575027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510527
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13107	NC_013205	TGC	2	6	575210	575215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510527
13108	NC_013205	CG	3	6	575226	575231	0 %	0 %	50 %	50 %	258510527
13109	NC_013205	GCC	2	6	575266	575271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510527
13110	NC_013205	CAG	2	6	575340	575345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510527
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13112	NC_013205	TCG	2	6	575422	575427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510527
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13114	NC_013205	TAC	2	6	575638	575643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13115	NC_013205	A	6	6	575694	575699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_013205	GCCGC	2	10	575742	575751	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13117	NC_013205	CATC	2	8	575764	575771	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13118	NC_013205	CT	3	6	575879	575884	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13119	NC_013205	TATCG	2	10	575887	575896	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13120	NC_013205	CAA	2	6	575902	575907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13121	NC_013205	CGG	2	6	575934	575939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13122	NC_013205	GC	3	6	575949	575954	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13229	NC_013205	GCGA	2	8	581830	581837	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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13245	NC_013205	ATGGA	2	10	582853	582862	40 %	20 %	40 %	0 %	258510531
13246	NC_013205	GC	3	6	582969	582974	0 %	0 %	50 %	50 %	258510531
13247	NC_013205	GA	3	6	582988	582993	50 %	0 %	50 %	0 %	258510531
13248	NC_013205	CGT	2	6	583074	583079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510531
13249	NC_013205	TCCA	2	8	583095	583102	25 %	25 %	0 %	50 %	258510531
13250	NC_013205	TCG	2	6	583104	583109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510531
13251	NC_013205	TC	3	6	583188	583193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13252	NC_013205	CTT	2	6	583210	583215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13253	NC_013205	TAT	2	6	583282	583287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13254	NC_013205	GACA	2	8	583404	583411	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13255	NC_013205	CGAC	2	8	583463	583470	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13256	NC_013205	CAT	2	6	583529	583534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510532
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13259	NC_013205	AAAT	2	8	583672	583679	75 %	25 %	0 %	0 %	258510532
13260	NC_013205	AT	3	6	583725	583730	50 %	50 %	0 %	0 %	258510532
13261	NC_013205	CATTT	2	10	583738	583747	20 %	60 %	0 %	20 %	258510532
13262	NC_013205	GATATA	2	12	583767	583778	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	258510532
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13266	NC_013205	GTATTC	2	12	583846	583857	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	258510532
13267	NC_013205	CGA	2	6	583858	583863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510532
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13269	NC_013205	AGTC	2	8	583949	583956	25 %	25 %	25 %	25 %	258510532
13270	NC_013205	ATC	2	6	584093	584098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13271	NC_013205	TA	3	6	584119	584124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13272	NC_013205	GTA	2	6	584139	584144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13273	NC_013205	GAT	2	6	584145	584150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13274	NC_013205	GCA	2	6	584151	584156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13275	NC_013205	TAA	2	6	584381	584386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13276	NC_013205	TCA	2	6	584537	584542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510533
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13278	NC_013205	CA	3	6	584678	584683	50 %	0 %	0 %	50 %	258510533
13279	NC_013205	ATG	2	6	584720	584725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510533
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13282	NC_013205	TTG	2	6	584865	584870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510533
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13285	NC_013205	GAA	2	6	585044	585049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510533
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13305	NC_013205	AT	3	6	585924	585929	50 %	50 %	0 %	0 %	258510533
13306	NC_013205	TGCA	2	8	585975	585982	25 %	25 %	25 %	25 %	258510533
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13319	NC_013205	GA	3	6	586552	586557	50 %	0 %	50 %	0 %	258510533
13320	NC_013205	TATT	2	8	586626	586633	25 %	75 %	0 %	0 %	258510534
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13342	NC_013205	GA	3	6	588011	588016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13343	NC_013205	AT	3	6	588036	588041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13344	NC_013205	GAA	2	6	588049	588054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13345	NC_013205	CTCA	2	8	588073	588080	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13346	NC_013205	TTG	2	6	588185	588190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13347	NC_013205	GTT	2	6	588273	588278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13348	NC_013205	TA	4	8	588297	588304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13349	NC_013205	AAT	2	6	588310	588315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13350	NC_013205	AAC	2	6	588520	588525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13351	NC_013205	TA	3	6	588529	588534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13352	NC_013205	ATC	2	6	588551	588556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13355	NC_013205	ACT	2	6	588620	588625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13356	NC_013205	GGC	2	6	588627	588632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13357	NC_013205	TCTT	2	8	588741	588748	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13358	NC_013205	GGC	2	6	588929	588934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13359	NC_013205	TGG	2	6	588970	588975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13360	NC_013205	GCC	2	6	588979	588984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13361	NC_013205	GTCG	2	8	589041	589048	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13362	NC_013205	TGT	2	6	589065	589070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13363	NC_013205	CGGA	2	8	589109	589116	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13364	NC_013205	CAGG	2	8	589143	589150	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13365	NC_013205	ACGGG	2	10	589152	589161	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13366	NC_013205	AGG	2	6	589193	589198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13367	NC_013205	CTG	2	6	589215	589220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13369	NC_013205	TCC	2	6	589260	589265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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