MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_013205	GGC	2	6	542616	542621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510492
12502	NC_013205	GAGC	2	8	542626	542633	25 %	0 %	50 %	25 %	258510492
12503	NC_013205	GAG	2	6	542654	542659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510492
12504	NC_013205	GGT	3	9	542676	542684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510492
12505	NC_013205	GCG	2	6	542770	542775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510492
12506	NC_013205	CAC	2	6	542782	542787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510492
12507	NC_013205	ACT	2	6	542811	542816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510492
12508	NC_013205	AGG	2	6	542904	542909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510492
12509	NC_013205	GGC	2	6	542921	542926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510492
12510	NC_013205	GGA	2	6	542932	542937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510492
12511	NC_013205	GTG	2	6	542939	542944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510492
12512	NC_013205	GAC	2	6	542972	542977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510492
12513	NC_013205	GAC	2	6	542990	542995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510492
12514	NC_013205	GAG	2	6	542996	543001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510492
12515	NC_013205	GGA	2	6	543080	543085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510492
12516	NC_013205	GAC	2	6	543138	543143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510492
12517	NC_013205	CGGG	2	8	543236	543243	0 %	0 %	75 %	25 %	258510492
12518	NC_013205	TGA	2	6	543319	543324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510492
12519	NC_013205	TTGAC	2	10	543345	543354	20 %	40 %	20 %	20 %	258510492
12520	NC_013205	TGCT	2	8	543524	543531	0 %	50 %	25 %	25 %	258510492
12521	NC_013205	GA	3	6	543623	543628	50 %	0 %	50 %	0 %	258510492
12522	NC_013205	GCG	2	6	543761	543766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510492
12523	NC_013205	ACG	2	6	543842	543847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510492
12524	NC_013205	GGA	2	6	543869	543874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510492
12525	NC_013205	CGC	2	6	543883	543888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510492
12526	NC_013205	GGA	2	6	543952	543957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510492
12527	NC_013205	ACA	2	6	543978	543983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510492
12528	NC_013205	CTG	2	6	544088	544093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510492
12529	NC_013205	TCG	2	6	544096	544101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510492
12530	NC_013205	AAG	2	6	544118	544123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510492
12531	NC_013205	CTT	2	6	544141	544146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510492
12532	NC_013205	CTA	3	9	544156	544164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510492
12533	NC_013205	ACG	2	6	544181	544186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510492
12534	NC_013205	CCGA	2	8	544187	544194	25 %	0 %	25 %	50 %	258510492
12535	NC_013205	CG	4	8	544275	544282	0 %	0 %	50 %	50 %	258510492
12536	NC_013205	AAC	2	6	544307	544312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510492
12537	NC_013205	CTG	2	6	544400	544405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510492
12538	NC_013205	TTC	2	6	544490	544495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510492
12539	NC_013205	CTT	2	6	544564	544569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510492
12540	NC_013205	ACG	2	6	544574	544579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510492
12541	NC_013205	GAC	2	6	544586	544591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510492
12542	NC_013205	GGC	2	6	544801	544806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510492
12543	NC_013205	CCGAG	2	10	544888	544897	20 %	0 %	40 %	40 %	258510492
12544	NC_013205	CGT	2	6	544911	544916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510492
12545	NC_013205	CCG	2	6	544964	544969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510492
12546	NC_013205	TTC	2	6	545004	545009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510492
12547	NC_013205	GAT	2	6	545017	545022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510492
12548	NC_013205	GTGG	2	8	545050	545057	0 %	25 %	75 %	0 %	258510492
12549	NC_013205	TGC	2	6	545106	545111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510492
12550	NC_013205	CGA	2	6	545218	545223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510492
12551	NC_013205	ATC	2	6	545228	545233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510492
12552	NC_013205	ATT	2	6	545373	545378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258510492
12553	NC_013205	GAA	2	6	545400	545405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510492
12554	NC_013205	CCG	2	6	545482	545487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510492
12555	NC_013205	CGAA	2	8	545533	545540	50 %	0 %	25 %	25 %	258510492
12556	NC_013205	TGA	2	6	545607	545612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12557	NC_013205	TCA	2	6	545622	545627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510493
12558	NC_013205	CGA	2	6	545690	545695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510493
12559	NC_013205	TCG	2	6	545718	545723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510493
12560	NC_013205	GTC	2	6	545752	545757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510493
12561	NC_013205	GAC	3	9	545912	545920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510493
12562	NC_013205	GAC	2	6	546001	546006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510493
12563	NC_013205	CGA	2	6	546022	546027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510493
12564	NC_013205	TCG	2	6	546252	546257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510493
12565	NC_013205	GAC	2	6	546275	546280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510493
12566	NC_013205	CAA	2	6	546331	546336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510493
12567	NC_013205	TCG	2	6	546342	546347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510493
12568	NC_013205	GCAGGC	2	12	546355	546366	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	258510493
12569	NC_013205	GGA	2	6	546424	546429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510493
12570	NC_013205	GTG	2	6	546458	546463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510493
12571	NC_013205	CAT	3	9	546586	546594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510493
12572	NC_013205	ACCT	2	8	546601	546608	25 %	25 %	0 %	50 %	258510493
12573	NC_013205	GT	3	6	546631	546636	0 %	50 %	50 %	0 %	258510493
12574	NC_013205	TGA	2	6	546723	546728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510493
12575	NC_013205	GCG	2	6	546768	546773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510493
12576	NC_013205	CGG	2	6	546790	546795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510493
12577	NC_013205	GCG	3	9	547025	547033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510493
12578	NC_013205	CGCAG	2	10	547058	547067	20 %	0 %	40 %	40 %	258510493
12579	NC_013205	GAG	3	9	547076	547084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510493
12580	NC_013205	TGGA	2	8	547085	547092	25 %	25 %	50 %	0 %	258510493
12581	NC_013205	GCC	2	6	547096	547101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510493
12582	NC_013205	GGC	2	6	547117	547122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510493
12583	NC_013205	GGC	2	6	547165	547170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510493
12584	NC_013205	AAC	2	6	547232	547237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510493
12585	NC_013205	TGC	2	6	547347	547352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510493
12586	NC_013205	GAG	2	6	547394	547399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510493
12587	NC_013205	GGC	2	6	547408	547413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510493
12588	NC_013205	CGT	2	6	547549	547554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510494
12589	NC_013205	TCA	2	6	547578	547583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510494
12590	NC_013205	TCG	2	6	547611	547616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510494
12591	NC_013205	GGA	2	6	547621	547626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510494
12592	NC_013205	CGGG	2	8	547637	547644	0 %	0 %	75 %	25 %	258510494
12593	NC_013205	GGT	2	6	547671	547676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510494
12594	NC_013205	GAA	2	6	547700	547705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510494
12595	NC_013205	GGC	3	9	547827	547835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510495
12596	NC_013205	CGA	2	6	547887	547892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510495
12597	NC_013205	GAC	2	6	547906	547911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510495
12598	NC_013205	GCGG	2	8	547917	547924	0 %	0 %	75 %	25 %	258510495
12599	NC_013205	CTGC	2	8	547932	547939	0 %	25 %	25 %	50 %	258510495
12600	NC_013205	GGT	2	6	547953	547958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510495
12601	NC_013205	CGC	2	6	548060	548065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510495
12602	NC_013205	CG	3	6	548079	548084	0 %	0 %	50 %	50 %	258510495
12603	NC_013205	AGG	2	6	548091	548096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510495
12604	NC_013205	GAT	2	6	548102	548107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510495
12605	NC_013205	GAA	2	6	548172	548177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510496
12606	NC_013205	CCG	2	6	548187	548192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510496
12607	NC_013205	TCA	2	6	548231	548236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510496
12608	NC_013205	TTC	2	6	548314	548319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510496
12609	NC_013205	GAG	2	6	548379	548384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510496
12610	NC_013205	GC	3	6	548447	548452	0 %	0 %	50 %	50 %	258510497
12611	NC_013205	CG	4	8	548463	548470	0 %	0 %	50 %	50 %	258510497
12612	NC_013205	CGG	3	9	548472	548480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510497
12613	NC_013205	CTACGA	2	12	548533	548544	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	258510497
12614	NC_013205	GGT	2	6	548575	548580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510497
12615	NC_013205	GCG	2	6	548589	548594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510497
12616	NC_013205	CGG	2	6	548630	548635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510497
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12618	NC_013205	CGC	2	6	548670	548675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510497
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12864	NC_013205	GAT	2	6	562745	562750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12865	NC_013205	GAT	2	6	562768	562773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12866	NC_013205	ACG	2	6	562880	562885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510519
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12893	NC_013205	TCC	2	6	564205	564210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12976	NC_013205	GT	3	6	568397	568402	0 %	50 %	50 %	0 %	258510521
12977	NC_013205	ATTTTG	2	12	568522	568533	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	258510522
12978	NC_013205	A	7	7	568572	568578	100 %	0 %	0 %	0 %	258510522
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12980	NC_013205	CAT	2	6	568632	568637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510522
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12988	NC_013205	GTA	2	6	569048	569053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510522
12989	NC_013205	TATCAT	2	12	569157	569168	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	258510522
12990	NC_013205	TGA	2	6	569207	569212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510522
12991	NC_013205	CGG	2	6	569253	569258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510522
12992	NC_013205	ATG	2	6	569266	569271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510522
12993	NC_013205	TG	3	6	569436	569441	0 %	50 %	50 %	0 %	258510522
12994	NC_013205	CAC	2	6	569446	569451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510522
12995	NC_013205	GGGAGC	2	12	569463	569474	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	258510522
12996	NC_013205	TTGCGA	2	12	569492	569503	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	258510522
12997	NC_013205	GTT	2	6	569547	569552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510522
12998	NC_013205	CGG	2	6	569628	569633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510522
12999	NC_013205	TCA	2	6	569709	569714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510522
13000	NC_013205	TAT	2	6	569758	569763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258510522

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