MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_013205	TGCG	2	8	519888	519895	0 %	25 %	50 %	25 %	258510464
12002	NC_013205	AATCTC	2	12	519929	519940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510464
12003	NC_013205	TCC	2	6	519978	519983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510464
12004	NC_013205	GAT	2	6	520019	520024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510464
12005	NC_013205	CTC	2	6	520106	520111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510465
12006	NC_013205	GGC	2	6	520112	520117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510465
12007	NC_013205	TCC	2	6	520152	520157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510465
12008	NC_013205	GCC	2	6	520236	520241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510465
12009	NC_013205	GCC	2	6	520356	520361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510465
12010	NC_013205	TCGT	2	8	520527	520534	0 %	50 %	25 %	25 %	258510465
12011	NC_013205	TCG	2	6	520536	520541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510465
12012	NC_013205	GGC	2	6	520546	520551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510465
12013	NC_013205	TCCGAC	2	12	520641	520652	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	258510465
12014	NC_013205	CGAA	2	8	520659	520666	50 %	0 %	25 %	25 %	258510465
12015	NC_013205	CTG	2	6	520673	520678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510465
12016	NC_013205	CG	3	6	520728	520733	0 %	0 %	50 %	50 %	258510465
12017	NC_013205	TG	3	6	520764	520769	0 %	50 %	50 %	0 %	258510465
12018	NC_013205	CCG	2	6	520881	520886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12019	NC_013205	CCG	2	6	520926	520931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12020	NC_013205	GTGA	2	8	520964	520971	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12021	NC_013205	CG	3	6	521031	521036	0 %	0 %	50 %	50 %	258510466
12022	NC_013205	GGC	2	6	521073	521078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510466
12023	NC_013205	TGGG	2	8	521079	521086	0 %	25 %	75 %	0 %	258510466
12024	NC_013205	AGA	2	6	521116	521121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510466
12025	NC_013205	CG	4	8	521153	521160	0 %	0 %	50 %	50 %	258510466
12026	NC_013205	GGA	2	6	521189	521194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510466
12027	NC_013205	TG	3	6	521219	521224	0 %	50 %	50 %	0 %	258510466
12028	NC_013205	CGTG	2	8	521269	521276	0 %	25 %	50 %	25 %	258510466
12029	NC_013205	GGC	2	6	521384	521389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510466
12030	NC_013205	TGC	2	6	521404	521409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510466
12031	NC_013205	CG	3	6	521419	521424	0 %	0 %	50 %	50 %	258510466
12032	NC_013205	TGG	2	6	521484	521489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510466
12033	NC_013205	GAC	2	6	521523	521528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510466
12034	NC_013205	G	6	6	521561	521566	0 %	0 %	100 %	0 %	258510466
12035	NC_013205	TGG	2	6	521604	521609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510466
12036	NC_013205	GC	3	6	521692	521697	0 %	0 %	50 %	50 %	258510466
12037	NC_013205	GTG	2	6	521700	521705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510466
12038	NC_013205	CGC	2	6	521884	521889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510466
12039	NC_013205	G	6	6	521985	521990	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12040	NC_013205	GAG	2	6	522003	522008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12041	NC_013205	TCG	2	6	522105	522110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510467
12042	NC_013205	GCGG	2	8	522148	522155	0 %	0 %	75 %	25 %	258510467
12043	NC_013205	GAA	2	6	522203	522208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510467
12044	NC_013205	GGT	2	6	522264	522269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510467
12045	NC_013205	CGT	2	6	522364	522369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510467
12046	NC_013205	CG	3	6	522397	522402	0 %	0 %	50 %	50 %	258510467
12047	NC_013205	GTC	2	6	522431	522436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510467
12048	NC_013205	GAT	2	6	522472	522477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510467
12049	NC_013205	GCC	2	6	522518	522523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12050	NC_013205	TGA	2	6	522564	522569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510468
12051	NC_013205	CGG	2	6	522597	522602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510468
12052	NC_013205	TC	3	6	522615	522620	0 %	50 %	0 %	50 %	258510468
12053	NC_013205	GAT	2	6	522700	522705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510468
12054	NC_013205	ACC	2	6	522725	522730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510468
12055	NC_013205	CGA	2	6	522738	522743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510468
12056	NC_013205	TTG	2	6	522758	522763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510468
12057	NC_013205	CGA	2	6	522765	522770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510468
12058	NC_013205	TGA	2	6	522774	522779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510468
12059	NC_013205	GTCG	2	8	522784	522791	0 %	25 %	50 %	25 %	258510468
12060	NC_013205	GGC	2	6	522817	522822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510468
12061	NC_013205	CTT	2	6	522859	522864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510468
12062	NC_013205	CCGA	2	8	522884	522891	25 %	0 %	25 %	50 %	258510468
12063	NC_013205	GAC	2	6	522913	522918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510468
12064	NC_013205	CGA	2	6	522939	522944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510468
12065	NC_013205	ACG	2	6	522990	522995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510468
12066	NC_013205	TGG	2	6	523053	523058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510468
12067	NC_013205	CTG	2	6	523066	523071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510468
12068	NC_013205	GCG	2	6	523144	523149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510468
12069	NC_013205	TCT	2	6	523185	523190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510468
12070	NC_013205	TCC	2	6	523238	523243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510468
12071	NC_013205	CTT	2	6	523285	523290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510468
12072	NC_013205	GAT	2	6	523357	523362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510468
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12075	NC_013205	CGAG	2	8	523455	523462	25 %	0 %	50 %	25 %	258510468
12076	NC_013205	GC	3	6	523464	523469	0 %	0 %	50 %	50 %	258510468
12077	NC_013205	TTC	2	6	523505	523510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510468
12078	NC_013205	GCTG	2	8	523563	523570	0 %	25 %	50 %	25 %	258510468
12079	NC_013205	TTCG	2	8	523594	523601	0 %	50 %	25 %	25 %	258510468
12080	NC_013205	GCT	2	6	523656	523661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510468
12081	NC_013205	CGC	2	6	523665	523670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510468
12082	NC_013205	GTC	2	6	523733	523738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510468
12083	NC_013205	GCC	2	6	523766	523771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510468
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12085	NC_013205	GGAA	2	8	523804	523811	50 %	0 %	50 %	0 %	258510468
12086	NC_013205	CGC	2	6	523833	523838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510468
12087	NC_013205	AGC	2	6	523985	523990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510469
12088	NC_013205	CAAG	2	8	524004	524011	50 %	0 %	25 %	25 %	258510469
12089	NC_013205	TGA	2	6	524025	524030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510469
12090	NC_013205	CTG	2	6	524032	524037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510469
12091	NC_013205	GC	3	6	524043	524048	0 %	0 %	50 %	50 %	258510469
12092	NC_013205	GGT	2	6	524061	524066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510469
12093	NC_013205	CAT	2	6	524086	524091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510469
12094	NC_013205	TGA	2	6	524118	524123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510469
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12097	NC_013205	CCGAT	2	10	524205	524214	20 %	20 %	20 %	40 %	258510469
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12099	NC_013205	GC	3	6	524267	524272	0 %	0 %	50 %	50 %	258510469
12100	NC_013205	CG	3	6	524274	524279	0 %	0 %	50 %	50 %	258510469
12101	NC_013205	TTC	2	6	524318	524323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510469
12102	NC_013205	CAC	2	6	524338	524343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510469
12103	NC_013205	GTCG	2	8	524368	524375	0 %	25 %	50 %	25 %	258510469
12104	NC_013205	TGA	2	6	524400	524405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510469
12105	NC_013205	TCG	2	6	524423	524428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510469
12106	NC_013205	GCG	2	6	524592	524597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510469
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12108	NC_013205	CGC	2	6	524683	524688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510469
12109	NC_013205	CTG	2	6	524695	524700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510469
12110	NC_013205	GCT	2	6	524715	524720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510469
12111	NC_013205	GCC	2	6	524732	524737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510469
12112	NC_013205	GAG	2	6	524742	524747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510469
12113	NC_013205	TCC	2	6	524777	524782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510469
12114	NC_013205	GCG	2	6	524885	524890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510469
12115	NC_013205	CGC	2	6	524911	524916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510469
12116	NC_013205	GC	3	6	524988	524993	0 %	0 %	50 %	50 %	258510469
12117	NC_013205	GTCG	2	8	524998	525005	0 %	25 %	50 %	25 %	258510469
12118	NC_013205	CGG	2	6	525027	525032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510469
12119	NC_013205	CACG	2	8	525076	525083	25 %	0 %	25 %	50 %	258510469
12120	NC_013205	GTC	2	6	525178	525183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510469
12121	NC_013205	CAA	2	6	525270	525275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510469
12122	NC_013205	GCG	2	6	525394	525399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510470
12123	NC_013205	AGT	2	6	525424	525429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510470
12124	NC_013205	CGA	2	6	525454	525459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510470
12125	NC_013205	CCG	2	6	525475	525480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510470
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12127	NC_013205	TCT	2	6	525517	525522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510470
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12129	NC_013205	TCC	2	6	525720	525725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510470
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12134	NC_013205	CGC	2	6	525916	525921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510470
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12145	NC_013205	GCGT	2	8	526242	526249	0 %	25 %	50 %	25 %	258510470
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12228	NC_013205	GCGG	2	8	529854	529861	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12229	NC_013205	CGG	2	6	529918	529923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12230	NC_013205	GC	3	6	529937	529942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12231	NC_013205	CGCT	2	8	529975	529982	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12232	NC_013205	CCT	2	6	530000	530005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12233	NC_013205	TCAC	2	8	530007	530014	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12234	NC_013205	AGG	2	6	530049	530054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12235	NC_013205	CG	3	6	530093	530098	0 %	0 %	50 %	50 %	258510474
12236	NC_013205	GAG	2	6	530099	530104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510474
12237	NC_013205	TCG	2	6	530205	530210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510474
12238	NC_013205	GACG	2	8	530224	530231	25 %	0 %	50 %	25 %	258510474
12239	NC_013205	TCG	2	6	530301	530306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510474
12240	NC_013205	CG	3	6	530326	530331	0 %	0 %	50 %	50 %	258510474
12241	NC_013205	CTC	2	6	530360	530365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510474
12242	NC_013205	CGG	2	6	530380	530385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510474
12243	NC_013205	GC	3	6	530448	530453	0 %	0 %	50 %	50 %	258510474
12244	NC_013205	GAG	2	6	530483	530488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510474
12245	NC_013205	GCC	2	6	530574	530579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510474
12246	NC_013205	GAG	2	6	530591	530596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510474
12247	NC_013205	CGG	2	6	530599	530604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510474
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12288	NC_013205	ATC	2	6	532133	532138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510475
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12354	NC_013205	GACA	2	8	535779	535786	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12355	NC_013205	TG	3	6	535806	535811	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12356	NC_013205	CGC	2	6	535928	535933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510479
12357	NC_013205	A	6	6	535988	535993	100 %	0 %	0 %	0 %	258510479
12358	NC_013205	ACT	2	6	536000	536005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510479
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12360	NC_013205	GGA	2	6	536034	536039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510479
12361	NC_013205	TGAGG	2	10	536129	536138	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
12362	NC_013205	TGG	2	6	536140	536145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12364	NC_013205	GCG	2	6	536258	536263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12368	NC_013205	AGG	2	6	536407	536412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12473	NC_013205	TGT	2	6	541343	541348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12475	NC_013205	GCG	2	6	541374	541379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12477	NC_013205	ACG	2	6	541425	541430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12481	NC_013205	GA	3	6	541632	541637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12482	NC_013205	GAA	2	6	541657	541662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12483	NC_013205	ATTGGG	2	12	541702	541713	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
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12486	NC_013205	GAA	2	6	541896	541901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510491
12487	NC_013205	GA	3	6	541918	541923	50 %	0 %	50 %	0 %	258510491
12488	NC_013205	AGC	2	6	541942	541947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510491
12489	NC_013205	GAA	2	6	541964	541969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510491
12490	NC_013205	CAT	2	6	541999	542004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510491
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12493	NC_013205	TAC	2	6	542339	542344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12495	NC_013205	CT	3	6	542358	542363	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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12497	NC_013205	AAG	2	6	542375	542380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12498	NC_013205	GTG	2	6	542412	542417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12499	NC_013205	TTTC	2	8	542441	542448	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12500	NC_013205	GAG	2	6	542519	542524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510492

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