MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_013205	C	6	6	496657	496662	0 %	0 %	0 %	100 %	258510444
11502	NC_013205	TGTGG	2	10	496677	496686	0 %	40 %	60 %	0 %	258510444
11503	NC_013205	GATCTC	2	12	496690	496701	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258510444
11504	NC_013205	GTGG	2	8	496728	496735	0 %	25 %	75 %	0 %	258510444
11505	NC_013205	CAGGA	2	10	496753	496762	40 %	0 %	40 %	20 %	258510444
11506	NC_013205	GC	3	6	496785	496790	0 %	0 %	50 %	50 %	258510444
11507	NC_013205	GCA	2	6	496797	496802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510444
11508	NC_013205	GGT	3	9	496806	496814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510444
11509	NC_013205	GC	3	6	496838	496843	0 %	0 %	50 %	50 %	258510444
11510	NC_013205	TTCG	2	8	496857	496864	0 %	50 %	25 %	25 %	258510444
11511	NC_013205	GC	3	6	496875	496880	0 %	0 %	50 %	50 %	258510444
11512	NC_013205	CGG	2	6	496905	496910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510444
11513	NC_013205	GC	3	6	496933	496938	0 %	0 %	50 %	50 %	258510445
11514	NC_013205	ATG	2	6	496946	496951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510445
11515	NC_013205	GCT	2	6	496980	496985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510445
11516	NC_013205	GC	4	8	497034	497041	0 %	0 %	50 %	50 %	258510445
11517	NC_013205	TCG	2	6	497111	497116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510445
11518	NC_013205	GCC	2	6	497168	497173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510445
11519	NC_013205	TCTGCG	2	12	497175	497186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510445
11520	NC_013205	CGC	2	6	497218	497223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510445
11521	NC_013205	GCC	2	6	497306	497311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510445
11522	NC_013205	TGC	2	6	497334	497339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510445
11523	NC_013205	TCC	2	6	497443	497448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11524	NC_013205	TTC	2	6	497573	497578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11525	NC_013205	TC	4	8	497586	497593	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11526	NC_013205	GAT	2	6	497603	497608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510446
11527	NC_013205	GGC	2	6	497641	497646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510446
11528	NC_013205	CG	3	6	497693	497698	0 %	0 %	50 %	50 %	258510446
11529	NC_013205	TG	3	6	497743	497748	0 %	50 %	50 %	0 %	258510446
11530	NC_013205	CGC	2	6	497756	497761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510446
11531	NC_013205	GC	3	6	497760	497765	0 %	0 %	50 %	50 %	258510446
11532	NC_013205	GTC	2	6	497829	497834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510446
11533	NC_013205	GCGT	2	8	497911	497918	0 %	25 %	50 %	25 %	258510446
11534	NC_013205	CCA	2	6	497935	497940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510446
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11537	NC_013205	AGA	2	6	498049	498054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510446
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11539	NC_013205	CGC	2	6	498101	498106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510446
11540	NC_013205	CAC	2	6	498117	498122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510446
11541	NC_013205	CGT	2	6	498158	498163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510446
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11543	NC_013205	CCA	2	6	498283	498288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510446
11544	NC_013205	GTC	2	6	498339	498344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510446
11545	NC_013205	GC	3	6	498355	498360	0 %	0 %	50 %	50 %	258510446
11546	NC_013205	TC	3	6	498411	498416	0 %	50 %	0 %	50 %	258510446
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11549	NC_013205	GC	3	6	498549	498554	0 %	0 %	50 %	50 %	258510446
11550	NC_013205	CGG	2	6	498587	498592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510446
11551	NC_013205	GCGCC	2	10	498608	498617	0 %	0 %	40 %	60 %	258510446
11552	NC_013205	CGT	2	6	498653	498658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510446
11553	NC_013205	GGC	2	6	498704	498709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510446
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11555	NC_013205	CCA	2	6	498742	498747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510446
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11557	NC_013205	GGGCC	2	10	498758	498767	0 %	0 %	60 %	40 %	258510446
11558	NC_013205	CCG	2	6	498787	498792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510446
11559	NC_013205	CGA	2	6	498805	498810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510446
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11561	NC_013205	GC	3	6	498876	498881	0 %	0 %	50 %	50 %	258510446
11562	NC_013205	CCT	2	6	498896	498901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510446
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11572	NC_013205	TGC	2	6	499180	499185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510446
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11579	NC_013205	GCTG	2	8	499509	499516	0 %	25 %	50 %	25 %	258510446
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11587	NC_013205	CGT	2	6	499853	499858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510446
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11589	NC_013205	G	6	6	499876	499881	0 %	0 %	100 %	0 %	258510446
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11592	NC_013205	GCG	2	6	499953	499958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510447
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11602	NC_013205	GCCC	2	8	500476	500483	0 %	0 %	25 %	75 %	258510447
11603	NC_013205	CTG	2	6	500492	500497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510447
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11607	NC_013205	GC	3	6	500696	500701	0 %	0 %	50 %	50 %	258510447
11608	NC_013205	GGA	2	6	500728	500733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510447
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11611	NC_013205	GCTG	2	8	500865	500872	0 %	25 %	50 %	25 %	258510447
11612	NC_013205	GGA	2	6	500905	500910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510447
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11615	NC_013205	CG	3	6	501082	501087	0 %	0 %	50 %	50 %	258510447
11616	NC_013205	CGC	2	6	501104	501109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510447
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11619	NC_013205	GCGG	2	8	501185	501192	0 %	0 %	75 %	25 %	258510448
11620	NC_013205	CG	4	8	501267	501274	0 %	0 %	50 %	50 %	258510448
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11622	NC_013205	CA	4	8	501348	501355	50 %	0 %	0 %	50 %	258510448
11623	NC_013205	CG	3	6	501368	501373	0 %	0 %	50 %	50 %	258510448
11624	NC_013205	CCG	2	6	501387	501392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510448
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11981	NC_013205	CGGG	2	8	518806	518813	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11982	NC_013205	GGC	2	6	518859	518864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11983	NC_013205	CGC	3	9	518876	518884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11984	NC_013205	GGT	2	6	519026	519031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510464
11985	NC_013205	GCC	2	6	519041	519046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510464
11986	NC_013205	GCG	2	6	519150	519155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510464
11987	NC_013205	TCG	2	6	519258	519263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510464
11988	NC_013205	GGA	2	6	519310	519315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510464
11989	NC_013205	CG	4	8	519374	519381	0 %	0 %	50 %	50 %	258510464
11990	NC_013205	AGG	2	6	519384	519389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510464
11991	NC_013205	CGTCG	2	10	519398	519407	0 %	20 %	40 %	40 %	258510464
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11994	NC_013205	CG	3	6	519537	519542	0 %	0 %	50 %	50 %	258510464
11995	NC_013205	TCG	2	6	519612	519617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510464
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11997	NC_013205	CGT	2	6	519658	519663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510464
11998	NC_013205	CGG	2	6	519707	519712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510464
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