MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11003	NC_013205	CAG	2	6	475050	475055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510424
11004	NC_013205	TCG	2	6	475060	475065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510424
11005	NC_013205	ATC	2	6	475071	475076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510424
11006	NC_013205	TCG	2	6	475141	475146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510424
11007	NC_013205	GAA	2	6	475202	475207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510424
11008	NC_013205	GGA	2	6	475214	475219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510424
11009	NC_013205	CGGCG	2	10	475314	475323	0 %	0 %	60 %	40 %	258510424
11010	NC_013205	TGG	2	6	475336	475341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510424
11011	NC_013205	CCT	2	6	475349	475354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510424
11012	NC_013205	AAGG	2	8	475410	475417	50 %	0 %	50 %	0 %	258510424
11013	NC_013205	CG	3	6	475458	475463	0 %	0 %	50 %	50 %	258510424
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11017	NC_013205	CGC	2	6	475591	475596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510424
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11021	NC_013205	GC	3	6	475772	475777	0 %	0 %	50 %	50 %	258510424
11022	NC_013205	CGT	2	6	475816	475821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510424
11023	NC_013205	GAAG	2	8	475829	475836	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_013205	GAA	2	6	475896	475901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510425
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11026	NC_013205	TCG	2	6	475931	475936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510425
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11029	NC_013205	CGCC	2	8	476034	476041	0 %	0 %	25 %	75 %	258510425
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11115	NC_013205	GCG	2	6	479760	479765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11116	NC_013205	CCG	2	6	479773	479778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11117	NC_013205	TCC	2	6	479789	479794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510427
11118	NC_013205	GAG	2	6	479809	479814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510427
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11120	NC_013205	ACGG	2	8	479960	479967	25 %	0 %	50 %	25 %	258510427
11121	NC_013205	CGTA	2	8	479970	479977	25 %	25 %	25 %	25 %	258510427
11122	NC_013205	GC	3	6	479984	479989	0 %	0 %	50 %	50 %	258510427
11123	NC_013205	GAAG	2	8	480015	480022	50 %	0 %	50 %	0 %	258510427
11124	NC_013205	CGC	3	9	480070	480078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510427
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11126	NC_013205	GGCG	2	8	480243	480250	0 %	0 %	75 %	25 %	258510427
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11129	NC_013205	GC	3	6	480296	480301	0 %	0 %	50 %	50 %	258510427
11130	NC_013205	ACG	2	6	480341	480346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510427
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11133	NC_013205	CG	3	6	480549	480554	0 %	0 %	50 %	50 %	258510427
11134	NC_013205	GAT	2	6	480586	480591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510427
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11137	NC_013205	CG	3	6	480763	480768	0 %	0 %	50 %	50 %	258510427
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11155	NC_013205	GCAGG	2	10	481354	481363	20 %	0 %	60 %	20 %	258510427
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11160	NC_013205	CCA	2	6	481582	481587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11208	NC_013205	GGCG	2	8	483407	483414	0 %	0 %	75 %	25 %	258510428
11209	NC_013205	CGG	2	6	483415	483420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510428
11210	NC_013205	CGG	2	6	483454	483459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11211	NC_013205	TCA	2	6	483460	483465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11212	NC_013205	T	7	7	483580	483586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11213	NC_013205	ATGCT	2	10	483623	483632	20 %	40 %	20 %	20 %	258510429
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11216	NC_013205	TGG	2	6	483727	483732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510429
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11229	NC_013205	TTC	2	6	484266	484271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510430
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11232	NC_013205	GCT	2	6	484394	484399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510430
11233	NC_013205	GAC	2	6	484464	484469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510430
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11238	NC_013205	GCC	2	6	484645	484650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510430
11239	NC_013205	ATGCG	2	10	484663	484672	20 %	20 %	40 %	20 %	258510430
11240	NC_013205	CGT	2	6	484685	484690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510430
11241	NC_013205	ATC	2	6	484774	484779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510430
11242	NC_013205	CTT	2	6	484847	484852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510430
11243	NC_013205	GAA	2	6	484853	484858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510430
11244	NC_013205	GGGAA	2	10	484900	484909	40 %	0 %	60 %	0 %	258510430
11245	NC_013205	GGA	2	6	485036	485041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510430
11246	NC_013205	GTG	2	6	485057	485062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510431
11247	NC_013205	TTGC	2	8	485064	485071	0 %	50 %	25 %	25 %	258510431
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11250	NC_013205	GCG	2	6	485219	485224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510431
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11252	NC_013205	CGG	3	9	485267	485275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510431
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11256	NC_013205	GCC	3	9	485393	485401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510431
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11260	NC_013205	CG	3	6	485637	485642	0 %	0 %	50 %	50 %	258510431
11261	NC_013205	CGG	2	6	485693	485698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510431
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11264	NC_013205	CGAGC	2	10	485860	485869	20 %	0 %	40 %	40 %	258510431
11265	NC_013205	TGA	2	6	485893	485898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510431
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11269	NC_013205	GGA	2	6	486068	486073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510431
11270	NC_013205	TTCA	2	8	486111	486118	25 %	50 %	0 %	25 %	258510431
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11272	NC_013205	GA	3	6	486216	486221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11273	NC_013205	CGT	2	6	486324	486329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510432
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11279	NC_013205	CGG	2	6	486529	486534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510432
11280	NC_013205	CGG	2	6	486593	486598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510432
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11293	NC_013205	A	7	7	487153	487159	100 %	0 %	0 %	0 %	258510432
11294	NC_013205	TCG	2	6	487181	487186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510432
11295	NC_013205	TGA	2	6	487270	487275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510433
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11298	NC_013205	GCC	2	6	487332	487337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510433
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11300	NC_013205	CAT	2	6	487415	487420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510433
11301	NC_013205	TCCG	2	8	487442	487449	0 %	25 %	25 %	50 %	258510433
11302	NC_013205	TCA	2	6	487459	487464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510433
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11304	NC_013205	CGT	2	6	487550	487555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11305	NC_013205	CGG	3	9	487649	487657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510434
11306	NC_013205	TGA	2	6	487671	487676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510434
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11317	NC_013205	CAGG	2	8	488229	488236	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11318	NC_013205	CAA	2	6	488271	488276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510435
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11326	NC_013205	GGGC	2	8	488805	488812	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11327	NC_013205	CAT	2	6	488840	488845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510436
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11330	NC_013205	GCCA	2	8	489039	489046	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11331	NC_013205	CTG	2	6	489068	489073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11332	NC_013205	GGT	2	6	489079	489084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11333	NC_013205	GAA	2	6	489143	489148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510437
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11343	NC_013205	GCT	2	6	489735	489740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510437
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11345	NC_013205	GACG	2	8	489787	489794	25 %	0 %	50 %	25 %	258510437
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11349	NC_013205	CTT	2	6	489902	489907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510437
11350	NC_013205	CGA	2	6	489940	489945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510437
11351	NC_013205	GC	4	8	489971	489978	0 %	0 %	50 %	50 %	258510437
11352	NC_013205	GT	3	6	490058	490063	0 %	50 %	50 %	0 %	258510437
11353	NC_013205	TTGGA	2	10	490088	490097	20 %	40 %	40 %	0 %	258510437
11354	NC_013205	GTGG	2	8	490177	490184	0 %	25 %	75 %	0 %	258510437
11355	NC_013205	GAG	2	6	490190	490195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510437
11356	NC_013205	CG	3	6	490249	490254	0 %	0 %	50 %	50 %	258510437
11357	NC_013205	GGT	2	6	490306	490311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11358	NC_013205	GCA	2	6	490320	490325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510438
11359	NC_013205	CAAAA	2	10	490342	490351	80 %	0 %	0 %	20 %	258510438
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11361	NC_013205	CTCG	2	8	490383	490390	0 %	25 %	25 %	50 %	258510438
11362	NC_013205	GGCCGG	2	12	490395	490406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510438
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11365	NC_013205	GAT	2	6	490470	490475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510438
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11367	NC_013205	CGG	2	6	490628	490633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510438
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11463	NC_013205	GAT	2	6	494835	494840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510441
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11473	NC_013205	CCG	2	6	495243	495248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510442
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11481	NC_013205	GTC	2	6	495833	495838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510443
11482	NC_013205	ATG	2	6	495893	495898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510443
11483	NC_013205	TGGG	2	8	495904	495911	0 %	25 %	75 %	0 %	258510443
11484	NC_013205	GC	3	6	495946	495951	0 %	0 %	50 %	50 %	258510443
11485	NC_013205	TCG	2	6	496089	496094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510443
11486	NC_013205	CCGTG	2	10	496110	496119	0 %	20 %	40 %	40 %	258510443
11487	NC_013205	TCA	2	6	496134	496139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510443
11488	NC_013205	GGT	2	6	496180	496185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510443
11489	NC_013205	GCTT	2	8	496341	496348	0 %	50 %	25 %	25 %	258510443
11490	NC_013205	CTTC	2	8	496369	496376	0 %	50 %	0 %	50 %	258510443
11491	NC_013205	CCG	2	6	496377	496382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510443
11492	NC_013205	AGGC	2	8	496383	496390	25 %	0 %	50 %	25 %	258510443
11493	NC_013205	TCA	2	6	496433	496438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510444
11494	NC_013205	CGG	3	9	496475	496483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510444
11495	NC_013205	GTG	2	6	496503	496508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510444
11496	NC_013205	GGA	2	6	496530	496535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510444
11497	NC_013205	TGGCC	2	10	496577	496586	0 %	20 %	40 %	40 %	258510444
11498	NC_013205	CTG	2	6	496612	496617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510444
11499	NC_013205	CGGA	2	8	496627	496634	25 %	0 %	50 %	25 %	258510444
11500	NC_013205	TAC	2	6	496636	496641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510444

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