MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_013205	GGC	2	6	451741	451746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510411
10502	NC_013205	CGA	2	6	451837	451842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510411
10503	NC_013205	TGC	2	6	451855	451860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510411
10504	NC_013205	CGT	2	6	451883	451888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510411
10505	NC_013205	CCG	2	6	451945	451950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510411
10506	NC_013205	GCG	2	6	451968	451973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510411
10507	NC_013205	CGG	2	6	451982	451987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510411
10508	NC_013205	GC	3	6	452014	452019	0 %	0 %	50 %	50 %	258510411
10509	NC_013205	GAC	2	6	452061	452066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510411
10510	NC_013205	GC	3	6	452067	452072	0 %	0 %	50 %	50 %	258510411
10511	NC_013205	GTG	2	6	452094	452099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510411
10512	NC_013205	CACC	2	8	452164	452171	25 %	0 %	0 %	75 %	258510411
10513	NC_013205	TCG	3	9	452269	452277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510411
10514	NC_013205	GC	4	8	452278	452285	0 %	0 %	50 %	50 %	258510411
10515	NC_013205	CGG	2	6	452323	452328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510411
10516	NC_013205	GGA	2	6	452336	452341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510411
10517	NC_013205	CGG	2	6	452353	452358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510411
10518	NC_013205	GGTG	2	8	452363	452370	0 %	25 %	75 %	0 %	258510411
10519	NC_013205	CTC	2	6	452388	452393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510411
10520	NC_013205	GGT	2	6	452429	452434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510411
10521	NC_013205	CCT	2	6	452467	452472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510411
10522	NC_013205	CGAGC	2	10	452488	452497	20 %	0 %	40 %	40 %	258510411
10523	NC_013205	GCG	2	6	452500	452505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510411
10524	NC_013205	ATG	2	6	452565	452570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510411
10525	NC_013205	TCG	2	6	452596	452601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510411
10526	NC_013205	AGG	3	9	452617	452625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510411
10527	NC_013205	CCG	2	6	452642	452647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510411
10528	NC_013205	CGA	2	6	452684	452689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510411
10529	NC_013205	TGC	2	6	452695	452700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510411
10530	NC_013205	GC	4	8	452741	452748	0 %	0 %	50 %	50 %	258510411
10531	NC_013205	TCG	2	6	452749	452754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510411
10532	NC_013205	AGCCA	2	10	452821	452830	40 %	0 %	20 %	40 %	258510411
10533	NC_013205	GC	4	8	452915	452922	0 %	0 %	50 %	50 %	258510411
10534	NC_013205	CGAC	2	8	452995	453002	25 %	0 %	25 %	50 %	258510411
10535	NC_013205	CG	3	6	453008	453013	0 %	0 %	50 %	50 %	258510411
10536	NC_013205	CGC	2	6	453077	453082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510411
10537	NC_013205	CG	3	6	453195	453200	0 %	0 %	50 %	50 %	258510411
10538	NC_013205	GTG	2	6	453213	453218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510411
10539	NC_013205	CG	3	6	453247	453252	0 %	0 %	50 %	50 %	258510411
10540	NC_013205	TCG	2	6	453277	453282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510411
10541	NC_013205	CGC	2	6	453312	453317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510411
10542	NC_013205	CCGCG	2	10	453325	453334	0 %	0 %	40 %	60 %	258510411
10543	NC_013205	GAC	2	6	453375	453380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510411
10544	NC_013205	ATCTCG	2	12	453442	453453	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258510411
10545	NC_013205	CCG	2	6	453454	453459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510411
10546	NC_013205	GCG	2	6	453461	453466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510411
10547	NC_013205	CGC	2	6	453491	453496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510411
10548	NC_013205	GC	3	6	453500	453505	0 %	0 %	50 %	50 %	258510411
10549	NC_013205	GCCGTG	2	12	453507	453518	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	258510411
10550	NC_013205	ACG	2	6	453520	453525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510411
10551	NC_013205	GGC	2	6	453534	453539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510411
10552	NC_013205	CGGGG	2	10	453569	453578	0 %	0 %	80 %	20 %	258510411
10553	NC_013205	GCG	2	6	453580	453585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510411
10554	NC_013205	GGCT	2	8	453621	453628	0 %	25 %	50 %	25 %	258510411
10555	NC_013205	GC	3	6	453647	453652	0 %	0 %	50 %	50 %	258510411
10556	NC_013205	GCC	2	6	453657	453662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510411
10557	NC_013205	CTC	2	6	453687	453692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510411
10558	NC_013205	CG	3	6	453702	453707	0 %	0 %	50 %	50 %	258510411
10559	NC_013205	CCCGG	2	10	453716	453725	0 %	0 %	40 %	60 %	258510411
10560	NC_013205	GCGA	2	8	453771	453778	25 %	0 %	50 %	25 %	258510411
10561	NC_013205	TCGC	2	8	453792	453799	0 %	25 %	25 %	50 %	258510411
10562	NC_013205	GGA	2	6	453806	453811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510411
10563	NC_013205	CCT	2	6	453836	453841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510411
10564	NC_013205	CG	3	6	453862	453867	0 %	0 %	50 %	50 %	258510411
10565	NC_013205	GA	3	6	453887	453892	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10566	NC_013205	GGC	2	6	453919	453924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510412
10567	NC_013205	CG	3	6	453939	453944	0 %	0 %	50 %	50 %	258510412
10568	NC_013205	GGC	2	6	453982	453987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510412
10569	NC_013205	TAC	2	6	453998	454003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510412
10570	NC_013205	TCG	2	6	454008	454013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510412
10571	NC_013205	GGC	2	6	454036	454041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510412
10572	NC_013205	CG	3	6	454112	454117	0 %	0 %	50 %	50 %	258510412
10573	NC_013205	CGC	2	6	454144	454149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510412
10574	NC_013205	GC	3	6	454226	454231	0 %	0 %	50 %	50 %	258510412
10575	NC_013205	CG	3	6	454267	454272	0 %	0 %	50 %	50 %	258510412
10576	NC_013205	GGA	2	6	454291	454296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510412
10577	NC_013205	GAC	2	6	454315	454320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510412
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10579	NC_013205	TCG	2	6	454383	454388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510412
10580	NC_013205	CG	5	10	454387	454396	0 %	0 %	50 %	50 %	258510412
10581	NC_013205	GGC	2	6	454412	454417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510412
10582	NC_013205	GGC	2	6	454494	454499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510412
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10584	NC_013205	TCCG	2	8	454616	454623	0 %	25 %	25 %	50 %	258510412
10585	NC_013205	CGC	2	6	454634	454639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510412
10586	NC_013205	CCGG	2	8	454678	454685	0 %	0 %	50 %	50 %	258510412
10587	NC_013205	CGG	4	12	454803	454814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510412
10588	NC_013205	TCA	2	6	454854	454859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510412
10589	NC_013205	GTC	2	6	454949	454954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510412
10590	NC_013205	CGT	2	6	454966	454971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510412
10591	NC_013205	CGA	2	6	454978	454983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510412
10592	NC_013205	CAC	2	6	454999	455004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510412
10593	NC_013205	GTT	2	6	455023	455028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510412
10594	NC_013205	GCGCG	2	10	455029	455038	0 %	0 %	60 %	40 %	258510412
10595	NC_013205	CCG	2	6	455072	455077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510412
10596	NC_013205	AGG	2	6	455115	455120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510412
10597	NC_013205	GC	3	6	455135	455140	0 %	0 %	50 %	50 %	258510412
10598	NC_013205	CGA	2	6	455149	455154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510412
10599	NC_013205	GC	3	6	455161	455166	0 %	0 %	50 %	50 %	258510412
10600	NC_013205	CCG	2	6	455228	455233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510412
10601	NC_013205	CGC	2	6	455270	455275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510412
10602	NC_013205	CGA	2	6	455280	455285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510412
10603	NC_013205	GATC	2	8	455290	455297	25 %	25 %	25 %	25 %	258510412
10604	NC_013205	AGG	2	6	455332	455337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510412
10605	NC_013205	CAAG	2	8	455356	455363	50 %	0 %	25 %	25 %	258510413
10606	NC_013205	GGC	2	6	455392	455397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510413
10607	NC_013205	GGC	2	6	455446	455451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510413
10608	NC_013205	GGT	2	6	455456	455461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510413
10609	NC_013205	ATCGCC	2	12	455549	455560	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	258510413
10610	NC_013205	GGC	2	6	455565	455570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510413
10611	NC_013205	TTC	2	6	455642	455647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510413
10612	NC_013205	GTG	2	6	455696	455701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510413
10613	NC_013205	GGCG	2	8	455728	455735	0 %	0 %	75 %	25 %	258510413
10614	NC_013205	GCG	2	6	455748	455753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510413
10615	NC_013205	TGG	2	6	455838	455843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510413
10616	NC_013205	CTC	2	6	455873	455878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510413
10617	NC_013205	GCG	2	6	456087	456092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510413
10618	NC_013205	TCG	2	6	456096	456101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510413
10619	NC_013205	TGC	2	6	456117	456122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510413
10620	NC_013205	GCG	2	6	456145	456150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510413
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10737	NC_013205	CGC	2	6	460571	460576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10738	NC_013205	GGC	2	6	460583	460588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10739	NC_013205	CG	3	6	460597	460602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10870	NC_013205	TCA	2	6	469233	469238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510419
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10989	NC_013205	CGA	2	6	474461	474466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510424
10990	NC_013205	GTG	2	6	474540	474545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510424
10991	NC_013205	CG	3	6	474595	474600	0 %	0 %	50 %	50 %	258510424
10992	NC_013205	CG	3	6	474630	474635	0 %	0 %	50 %	50 %	258510424
10993	NC_013205	GGA	2	6	474641	474646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510424
10994	NC_013205	GC	3	6	474662	474667	0 %	0 %	50 %	50 %	258510424
10995	NC_013205	GCT	2	6	474677	474682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510424
10996	NC_013205	AGC	2	6	474700	474705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510424
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10998	NC_013205	GCT	2	6	474812	474817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510424
10999	NC_013205	TCC	2	6	474827	474832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510424
11000	NC_013205	CGA	2	6	474851	474856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510424

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