MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9002	NC_013205	ATCAT	2	10	389347	389356	40 %	40 %	0 %	20 %	258510348
9003	NC_013205	CAG	2	6	389385	389390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510348
9004	NC_013205	GCTG	2	8	389435	389442	0 %	25 %	50 %	25 %	258510348
9005	NC_013205	GTGC	2	8	389454	389461	0 %	25 %	50 %	25 %	258510348
9006	NC_013205	GAGG	2	8	389530	389537	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
9007	NC_013205	GCG	2	6	389574	389579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510349
9008	NC_013205	CATC	2	8	389713	389720	25 %	25 %	0 %	50 %	258510349
9009	NC_013205	CGG	2	6	389737	389742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510349
9010	NC_013205	TGA	2	6	389851	389856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510349
9011	NC_013205	CCA	2	6	389857	389862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510349
9012	NC_013205	TCA	2	6	389866	389871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510349
9013	NC_013205	TGG	2	6	389913	389918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510349
9014	NC_013205	CG	4	8	389927	389934	0 %	0 %	50 %	50 %	258510349
9015	NC_013205	GGGCGT	2	12	389942	389953	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	258510349
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9017	NC_013205	TCG	2	6	390141	390146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510349
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9019	NC_013205	CTG	2	6	390207	390212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510349
9020	NC_013205	GCTG	2	8	390238	390245	0 %	25 %	50 %	25 %	258510349
9021	NC_013205	GAA	2	6	390264	390269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510349
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9023	NC_013205	TGT	2	6	390278	390283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510349
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9025	NC_013205	GGA	2	6	390293	390298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510349
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9028	NC_013205	TCC	2	6	390418	390423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510349
9029	NC_013205	GCT	2	6	390485	390490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510349
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9037	NC_013205	TGGA	2	8	390799	390806	25 %	25 %	50 %	0 %	258510349
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9051	NC_013205	AC	3	6	391691	391696	50 %	0 %	0 %	50 %	258510350
9052	NC_013205	TGG	2	6	391702	391707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510350
9053	NC_013205	CGGAG	2	10	391708	391717	20 %	0 %	60 %	20 %	258510350
9054	NC_013205	GAG	2	6	391801	391806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510351
9055	NC_013205	GGA	2	6	391821	391826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510351
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9057	NC_013205	GCCTT	2	10	391871	391880	0 %	40 %	20 %	40 %	258510351
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9061	NC_013205	CCGC	2	8	392145	392152	0 %	0 %	25 %	75 %	258510351
9062	NC_013205	CG	3	6	392158	392163	0 %	0 %	50 %	50 %	258510351
9063	NC_013205	TGG	2	6	392197	392202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510351
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9090	NC_013205	CGA	2	6	393589	393594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510352
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9123	NC_013205	TCG	2	6	394837	394842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510353
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9241	NC_013205	GCC	2	6	400686	400691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510357
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9243	NC_013205	CTG	2	6	400742	400747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510357
9244	NC_013205	CCG	2	6	400768	400773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510357
9245	NC_013205	GCT	2	6	400810	400815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510357
9246	NC_013205	GCC	2	6	400818	400823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510357
9247	NC_013205	AGC	2	6	400835	400840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510357
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9250	NC_013205	GCC	2	6	400929	400934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510357
9251	NC_013205	TGCGCC	2	12	401037	401048	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	258510357
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9253	NC_013205	CGC	2	6	401111	401116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510357
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9255	NC_013205	CTG	2	6	401126	401131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510357
9256	NC_013205	CTG	2	6	401273	401278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510357
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9264	NC_013205	GC	3	6	401773	401778	0 %	0 %	50 %	50 %	258510357
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9351	NC_013205	GCAG	2	8	405736	405743	25 %	0 %	50 %	25 %	258510360
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9361	NC_013205	GCA	2	6	406226	406231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510360
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9486	NC_013205	CGA	3	9	411112	411120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510366
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9489	NC_013205	CGGA	2	8	411275	411282	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9490	NC_013205	CGGC	2	8	411328	411335	0 %	0 %	50 %	50 %	258510367
9491	NC_013205	TCG	2	6	411342	411347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510367
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9493	NC_013205	GAT	2	6	411397	411402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510367
9494	NC_013205	TGA	2	6	411459	411464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510367
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9500	NC_013205	C	6	6	411670	411675	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding

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