MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_013205	GGGA	2	8	299237	299244	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_013205	GC	3	6	299352	299357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7003	NC_013205	GAAG	2	8	299425	299432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_013205	AGG	2	6	299540	299545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_013205	G	6	6	299551	299556	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_013205	CGG	2	6	299592	299597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7007	NC_013205	GA	3	6	299690	299695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_013205	GTA	2	6	299708	299713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_013205	ACC	2	6	299863	299868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7010	NC_013205	GTT	2	6	299880	299885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_013205	CCT	2	6	299951	299956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7012	NC_013205	CG	3	6	300004	300009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7013	NC_013205	GGT	2	6	300087	300092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_013205	CGT	2	6	300282	300287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7015	NC_013205	ACCG	2	8	300366	300373	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7016	NC_013205	GAAG	2	8	300488	300495	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_013205	GAC	2	6	300510	300515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7018	NC_013205	ACG	2	6	300607	300612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7019	NC_013205	GCGA	2	8	300645	300652	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7020	NC_013205	CGAG	2	8	300684	300691	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7021	NC_013205	GGGA	2	8	300786	300793	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_013205	CCT	2	6	300796	300801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7023	NC_013205	AGGT	2	8	300806	300813	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_013205	AGACG	2	10	300893	300902	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7025	NC_013205	TTC	2	6	300962	300967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7026	NC_013205	CCG	2	6	300973	300978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7027	NC_013205	CCAG	2	8	300983	300990	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7028	NC_013205	ACCT	2	8	301048	301055	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7029	NC_013205	CAG	2	6	301060	301065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7030	NC_013205	CAA	2	6	301196	301201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7031	NC_013205	ACG	2	6	301231	301236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7032	NC_013205	GAGG	2	8	301267	301274	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_013205	CCTG	2	8	301293	301300	0 %	25 %	25 %	50 %	258510284
7034	NC_013205	CG	3	6	301465	301470	0 %	0 %	50 %	50 %	258510284
7035	NC_013205	CGG	2	6	301580	301585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510284
7036	NC_013205	ACG	2	6	301634	301639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510284
7037	NC_013205	GC	3	6	301640	301645	0 %	0 %	50 %	50 %	258510284
7038	NC_013205	GGA	2	6	301695	301700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510284
7039	NC_013205	CG	3	6	301779	301784	0 %	0 %	50 %	50 %	258510284
7040	NC_013205	GC	3	6	301803	301808	0 %	0 %	50 %	50 %	258510284
7041	NC_013205	GCGG	2	8	301912	301919	0 %	0 %	75 %	25 %	258510285
7042	NC_013205	CAC	2	6	301995	302000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510285
7043	NC_013205	CGT	2	6	302033	302038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510285
7044	NC_013205	CCTG	2	8	302050	302057	0 %	25 %	25 %	50 %	258510285
7045	NC_013205	ACC	2	6	302155	302160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510285
7046	NC_013205	GCC	2	6	302211	302216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510285
7047	NC_013205	ACG	2	6	302230	302235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510285
7048	NC_013205	GCC	2	6	302282	302287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510285
7049	NC_013205	TGG	2	6	302365	302370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510285
7050	NC_013205	CTC	2	6	302385	302390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510285
7051	NC_013205	T	6	6	302463	302468	0 %	100 %	0 %	0 %	258510285
7052	NC_013205	CGA	2	6	302471	302476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510285
7053	NC_013205	ACG	2	6	302535	302540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7054	NC_013205	CGA	2	6	302544	302549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7055	NC_013205	GAAA	2	8	302773	302780	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_013205	GTG	2	6	302860	302865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_013205	GGC	2	6	302875	302880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7058	NC_013205	AGGG	2	8	302918	302925	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_013205	AGT	2	6	303090	303095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_013205	AGG	2	6	303100	303105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_013205	CCA	2	6	303217	303222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510286
7062	NC_013205	TGG	2	6	303270	303275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510286
7063	NC_013205	TTC	2	6	303302	303307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510286
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7065	NC_013205	ACG	2	6	303473	303478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510286
7066	NC_013205	GCG	2	6	303500	303505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510286
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7070	NC_013205	ACG	2	6	303620	303625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510286
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7075	NC_013205	ACG	2	6	303845	303850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510286
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7077	NC_013205	TGC	2	6	303970	303975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510286
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7080	NC_013205	TCG	2	6	304098	304103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510286
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7083	NC_013205	TTC	2	6	304202	304207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510286
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7086	NC_013205	ACT	2	6	304379	304384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510286
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7088	NC_013205	TCCGT	2	10	304466	304475	0 %	40 %	20 %	40 %	258510286
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7097	NC_013205	TGG	2	6	304998	305003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510286
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7099	NC_013205	AAC	2	6	305063	305068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510286
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7103	NC_013205	TAC	2	6	305285	305290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510286
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7105	NC_013205	TCTCGG	2	12	305416	305427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510286
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7107	NC_013205	GAAG	2	8	305624	305631	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7108	NC_013205	CCG	3	9	305804	305812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7109	NC_013205	GCGAGA	2	12	305817	305828	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7110	NC_013205	AAT	2	6	305914	305919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7111	NC_013205	GCG	2	6	306017	306022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7112	NC_013205	GA	3	6	306093	306098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_013205	GAG	2	6	306127	306132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7114	NC_013205	ACG	4	12	306283	306294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7115	NC_013205	CAG	2	6	306515	306520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510287
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7118	NC_013205	GTTG	2	8	306671	306678	0 %	50 %	50 %	0 %	258510287
7119	NC_013205	GCGA	2	8	306709	306716	25 %	0 %	50 %	25 %	258510287
7120	NC_013205	CTG	2	6	306764	306769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510287
7121	NC_013205	TTG	2	6	306773	306778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510287
7122	NC_013205	GAT	2	6	306788	306793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510287
7123	NC_013205	TCC	2	6	306872	306877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7124	NC_013205	GAT	2	6	306933	306938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7125	NC_013205	GAA	2	6	306958	306963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7126	NC_013205	TA	3	6	306969	306974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7127	NC_013205	AGA	2	6	306982	306987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7250	NC_013205	TTC	2	6	312552	312557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510291
7251	NC_013205	ATCC	2	8	312607	312614	25 %	25 %	0 %	50 %	258510291
7252	NC_013205	AG	4	8	312651	312658	50 %	0 %	50 %	0 %	258510291
7253	NC_013205	CTTG	2	8	312708	312715	0 %	50 %	25 %	25 %	258510291
7254	NC_013205	GATT	2	8	312746	312753	25 %	50 %	25 %	0 %	258510291
7255	NC_013205	AGA	2	6	312831	312836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510291
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7262	NC_013205	CT	4	8	313640	313647	0 %	50 %	0 %	50 %	258510292
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7265	NC_013205	TGT	2	6	313870	313875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510292
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7287	NC_013205	GAG	2	6	315170	315175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7500	NC_013205	CGG	2	6	325043	325048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510298

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