MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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65002	NC_013205	GTG	2	6	2891000	2891005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258512789
65003	NC_013205	CG	3	6	2891024	2891029	0 %	0 %	50 %	50 %	258512789
65004	NC_013205	TGG	2	6	2891040	2891045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258512789
65005	NC_013205	CCT	2	6	2891065	2891070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65006	NC_013205	GC	3	6	2891091	2891096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65007	NC_013205	CCG	2	6	2891102	2891107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65008	NC_013205	GCC	2	6	2891164	2891169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512790
65009	NC_013205	GTC	2	6	2891190	2891195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512790
65010	NC_013205	CAT	2	6	2891214	2891219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512790
65011	NC_013205	GCC	2	6	2891245	2891250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512790
65012	NC_013205	CCT	2	6	2891264	2891269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512790
65013	NC_013205	ACG	2	6	2891302	2891307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512790
65014	NC_013205	TCT	2	6	2891315	2891320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258512790
65015	NC_013205	AGCC	2	8	2891365	2891372	25 %	0 %	25 %	50 %	258512790
65016	NC_013205	CAG	2	6	2891395	2891400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512790
65017	NC_013205	CG	3	6	2891401	2891406	0 %	0 %	50 %	50 %	258512790
65018	NC_013205	GCC	2	6	2891467	2891472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512790
65019	NC_013205	GC	3	6	2891527	2891532	0 %	0 %	50 %	50 %	258512790
65020	NC_013205	CGG	2	6	2891558	2891563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512790
65021	NC_013205	GC	3	6	2891634	2891639	0 %	0 %	50 %	50 %	258512790
65022	NC_013205	GCC	2	6	2891649	2891654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512790
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65029	NC_013205	CAT	2	6	2891958	2891963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512790
65030	NC_013205	TTTCTG	2	12	2892049	2892060	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65031	NC_013205	TC	3	6	2892182	2892187	0 %	50 %	0 %	50 %	258512791
65032	NC_013205	TCGCTC	2	12	2892195	2892206	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	258512791
65033	NC_013205	TCTCC	2	10	2892218	2892227	0 %	40 %	0 %	60 %	258512791
65034	NC_013205	CG	3	6	2892268	2892273	0 %	0 %	50 %	50 %	258512791
65035	NC_013205	GGC	2	6	2892282	2892287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512791
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65039	NC_013205	GCA	2	6	2892449	2892454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512791
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65041	NC_013205	CGCGGA	2	12	2892548	2892559	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	258512791
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65044	NC_013205	TCT	2	6	2892867	2892872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65045	NC_013205	AAG	3	9	2892998	2893006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258512792
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65049	NC_013205	GC	3	6	2893223	2893228	0 %	0 %	50 %	50 %	258512792
65050	NC_013205	CAT	2	6	2893243	2893248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512792
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65052	NC_013205	CAT	2	6	2893297	2893302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512792
65053	NC_013205	GAT	2	6	2893333	2893338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512792
65054	NC_013205	CGG	2	6	2893357	2893362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512792
65055	NC_013205	GC	3	6	2893363	2893368	0 %	0 %	50 %	50 %	258512792
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65062	NC_013205	GCGCG	2	10	2893681	2893690	0 %	0 %	60 %	40 %	258512793
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65092	NC_013205	CCCG	2	8	2894973	2894980	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
65093	NC_013205	GCCCCA	2	12	2894998	2895009	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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65104	NC_013205	GGCG	2	8	2895705	2895712	0 %	0 %	75 %	25 %	258512795
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65115	NC_013205	ACG	2	6	2896037	2896042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512795
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65235	NC_013205	CA	3	6	2901606	2901611	50 %	0 %	0 %	50 %	258512800
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65304	NC_013205	AT	3	6	2904563	2904568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65305	NC_013205	ATG	2	6	2904578	2904583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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65349	NC_013205	GGA	2	6	2906914	2906919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512806
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65469	NC_013205	GTGG	2	8	2912791	2912798	0 %	25 %	75 %	0 %	258512813
65470	NC_013205	GGGC	2	8	2912883	2912890	0 %	0 %	75 %	25 %	258512813
65471	NC_013205	GCA	3	9	2912905	2912913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512813
65472	NC_013205	TGG	2	6	2912928	2912933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258512813
65473	NC_013205	TCC	2	6	2912942	2912947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512813
65474	NC_013205	GCC	2	6	2912985	2912990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512813
65475	NC_013205	TGA	2	6	2912997	2913002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512813
65476	NC_013205	CG	4	8	2913039	2913046	0 %	0 %	50 %	50 %	258512813
65477	NC_013205	GAT	2	6	2913052	2913057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512813
65478	NC_013205	TGA	2	6	2913159	2913164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512813
65479	NC_013205	CTT	2	6	2913181	2913186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258512813
65480	NC_013205	AAG	2	6	2913209	2913214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258512813
65481	NC_013205	GCG	3	9	2913215	2913223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512813
65482	NC_013205	TCG	3	9	2913239	2913247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512813
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65486	NC_013205	AT	3	6	2913417	2913422	50 %	50 %	0 %	0 %	258512814
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65491	NC_013205	CGG	2	6	2913664	2913669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512814
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65493	NC_013205	AG	3	6	2913858	2913863	50 %	0 %	50 %	0 %	258512814
65494	NC_013205	AAGA	2	8	2913873	2913880	75 %	0 %	25 %	0 %	258512814
65495	NC_013205	GCA	2	6	2913991	2913996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512814
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65498	NC_013205	TTC	2	6	2914151	2914156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65499	NC_013205	TCC	2	6	2914172	2914177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65500	NC_013205	TGC	2	6	2914250	2914255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512815

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