MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_013205	CGA	2	6	251989	251994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510248
6002	NC_013205	CAG	2	6	252113	252118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510248
6003	NC_013205	GCGA	2	8	252140	252147	25 %	0 %	50 %	25 %	258510248
6004	NC_013205	CGA	2	6	252231	252236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510248
6005	NC_013205	GAT	2	6	252325	252330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510248
6006	NC_013205	GCG	2	6	252369	252374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510248
6007	NC_013205	CAC	2	6	252457	252462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510248
6008	NC_013205	GGC	2	6	252524	252529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510248
6009	NC_013205	CAT	2	6	252541	252546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510248
6010	NC_013205	GCA	2	6	252704	252709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510249
6011	NC_013205	GGAG	2	8	252714	252721	25 %	0 %	75 %	0 %	258510249
6012	NC_013205	GC	3	6	252741	252746	0 %	0 %	50 %	50 %	258510249
6013	NC_013205	CCG	2	6	252758	252763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510249
6014	NC_013205	TGCG	2	8	252844	252851	0 %	25 %	50 %	25 %	258510249
6015	NC_013205	GC	3	6	252935	252940	0 %	0 %	50 %	50 %	258510249
6016	NC_013205	CGA	2	6	252953	252958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510249
6017	NC_013205	ACG	2	6	252976	252981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510249
6018	NC_013205	CG	3	6	253030	253035	0 %	0 %	50 %	50 %	258510249
6019	NC_013205	TG	3	6	253089	253094	0 %	50 %	50 %	0 %	258510249
6020	NC_013205	CGC	2	6	253098	253103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510249
6021	NC_013205	GC	3	6	253122	253127	0 %	0 %	50 %	50 %	258510249
6022	NC_013205	CGG	2	6	253134	253139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510249
6023	NC_013205	GC	4	8	253223	253230	0 %	0 %	50 %	50 %	258510249
6024	NC_013205	CGA	2	6	253265	253270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510249
6025	NC_013205	CGCC	2	8	253274	253281	0 %	0 %	25 %	75 %	258510249
6026	NC_013205	GCCA	2	8	253324	253331	25 %	0 %	25 %	50 %	258510249
6027	NC_013205	GCAGG	2	10	253334	253343	20 %	0 %	60 %	20 %	258510249
6028	NC_013205	GGC	2	6	253381	253386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510249
6029	NC_013205	CGG	2	6	253400	253405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510249
6030	NC_013205	GCTG	2	8	253444	253451	0 %	25 %	50 %	25 %	258510249
6031	NC_013205	CGG	2	6	253472	253477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510249
6032	NC_013205	TCC	2	6	253483	253488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510249
6033	NC_013205	CCG	2	6	253489	253494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510249
6034	NC_013205	GCC	2	6	253560	253565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510249
6035	NC_013205	CGG	2	6	253634	253639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510249
6036	NC_013205	GGC	2	6	253676	253681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510249
6037	NC_013205	TCG	2	6	253723	253728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510249
6038	NC_013205	CG	3	6	253774	253779	0 %	0 %	50 %	50 %	258510249
6039	NC_013205	TCG	2	6	253783	253788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510249
6040	NC_013205	AGT	2	6	253789	253794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510249
6041	NC_013205	CGC	2	6	253806	253811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510249
6042	NC_013205	TCG	2	6	253831	253836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510249
6043	NC_013205	CG	3	6	253858	253863	0 %	0 %	50 %	50 %	258510249
6044	NC_013205	CGGGA	2	10	253909	253918	20 %	0 %	60 %	20 %	258510249
6045	NC_013205	ATC	2	6	253920	253925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510249
6046	NC_013205	GAGC	2	8	253952	253959	25 %	0 %	50 %	25 %	258510249
6047	NC_013205	CAC	2	6	253965	253970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510249
6048	NC_013205	CTC	2	6	254028	254033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510249
6049	NC_013205	CGC	2	6	254034	254039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510249
6050	NC_013205	GAG	2	6	254052	254057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510249
6051	NC_013205	GCCT	2	8	254103	254110	0 %	25 %	25 %	50 %	258510249
6052	NC_013205	GCGG	2	8	254111	254118	0 %	0 %	75 %	25 %	258510249
6053	NC_013205	GCCG	2	8	254130	254137	0 %	0 %	50 %	50 %	258510249
6054	NC_013205	GCCG	2	8	254217	254224	0 %	0 %	50 %	50 %	258510249
6055	NC_013205	CG	4	8	254264	254271	0 %	0 %	50 %	50 %	258510249
6056	NC_013205	CGC	2	6	254300	254305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510249
6057	NC_013205	GC	3	6	254371	254376	0 %	0 %	50 %	50 %	258510250
6058	NC_013205	GGC	2	6	254393	254398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510250
6059	NC_013205	AGA	2	6	254442	254447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510250
6060	NC_013205	GCTC	2	8	254466	254473	0 %	25 %	25 %	50 %	258510250
6061	NC_013205	GCC	2	6	254479	254484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510250
6062	NC_013205	TCA	2	6	254487	254492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510250
6063	NC_013205	CCG	2	6	254505	254510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510250
6064	NC_013205	CGT	2	6	254517	254522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510250
6065	NC_013205	CGTG	2	8	254529	254536	0 %	25 %	50 %	25 %	258510250
6066	NC_013205	GAG	2	6	254539	254544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510250
6067	NC_013205	GC	3	6	254582	254587	0 %	0 %	50 %	50 %	258510250
6068	NC_013205	GGA	2	6	254590	254595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510250
6069	NC_013205	CGC	2	6	254691	254696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510250
6070	NC_013205	GC	4	8	254813	254820	0 %	0 %	50 %	50 %	258510250
6071	NC_013205	CGC	2	6	254869	254874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510250
6072	NC_013205	GGC	2	6	254876	254881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510250
6073	NC_013205	CCA	2	6	254964	254969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510250
6074	NC_013205	GAA	2	6	254977	254982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510250
6075	NC_013205	CGT	2	6	254983	254988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510250
6076	NC_013205	CGA	2	6	255009	255014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510250
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6078	NC_013205	CGC	2	6	255098	255103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510250
6079	NC_013205	TGC	2	6	255143	255148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510250
6080	NC_013205	GT	3	6	255165	255170	0 %	50 %	50 %	0 %	258510250
6081	NC_013205	TCT	2	6	255235	255240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_013205	ATATC	2	10	255251	255260	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6083	NC_013205	TCT	2	6	255307	255312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510251
6084	NC_013205	GTG	2	6	255396	255401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510251
6085	NC_013205	GC	3	6	255436	255441	0 %	0 %	50 %	50 %	258510251
6086	NC_013205	TCC	2	6	255451	255456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510251
6087	NC_013205	CGG	2	6	255491	255496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510251
6088	NC_013205	CGG	2	6	255529	255534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510251
6089	NC_013205	GC	3	6	255559	255564	0 %	0 %	50 %	50 %	258510251
6090	NC_013205	CG	3	6	255584	255589	0 %	0 %	50 %	50 %	258510251
6091	NC_013205	GCG	2	6	255607	255612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510251
6092	NC_013205	CGT	2	6	255692	255697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510251
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6094	NC_013205	GGC	2	6	255779	255784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510251
6095	NC_013205	TCG	2	6	255790	255795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510251
6096	NC_013205	GCGCG	2	10	255833	255842	0 %	0 %	60 %	40 %	258510251
6097	NC_013205	GCG	2	6	255849	255854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510251
6098	NC_013205	TCG	2	6	255893	255898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_013205	GCG	2	6	255927	255932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_013205	TCG	2	6	255938	255943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_013205	G	7	7	256011	256017	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_013205	GTC	2	6	256108	256113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510252
6103	NC_013205	TGG	2	6	256124	256129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510252
6104	NC_013205	GC	4	8	256161	256168	0 %	0 %	50 %	50 %	258510252
6105	NC_013205	TTC	2	6	256211	256216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510252
6106	NC_013205	CTCGC	2	10	256222	256231	0 %	20 %	20 %	60 %	258510252
6107	NC_013205	TCGGCA	2	12	256259	256270	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258510252
6108	NC_013205	GC	3	6	256434	256439	0 %	0 %	50 %	50 %	258510252
6109	NC_013205	CGAG	2	8	256443	256450	25 %	0 %	50 %	25 %	258510252
6110	NC_013205	ATCTCG	2	12	256475	256486	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258510252
6111	NC_013205	CG	3	6	256522	256527	0 %	0 %	50 %	50 %	258510252
6112	NC_013205	CGA	2	6	256530	256535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510252
6113	NC_013205	CGT	2	6	256682	256687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510252
6114	NC_013205	GTC	2	6	256688	256693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510252
6115	NC_013205	GT	3	6	256731	256736	0 %	50 %	50 %	0 %	258510252
6116	NC_013205	GCG	2	6	256818	256823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510252
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6118	NC_013205	CGGC	2	8	256862	256869	0 %	0 %	50 %	50 %	258510252
6119	NC_013205	GA	3	6	256922	256927	50 %	0 %	50 %	0 %	258510252
6120	NC_013205	GTG	2	6	256933	256938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510252
6121	NC_013205	TCG	2	6	256949	256954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510252
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6123	NC_013205	GGC	2	6	257000	257005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510252
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6247	NC_013205	TCG	2	6	264030	264035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510258
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6252	NC_013205	CGTG	2	8	264627	264634	0 %	25 %	50 %	25 %	258510258
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6492	NC_013205	ATG	2	6	274711	274716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510268
6493	NC_013205	CGG	2	6	274731	274736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510268
6494	NC_013205	TCA	2	6	274772	274777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510268
6495	NC_013205	AGA	2	6	274832	274837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510268
6496	NC_013205	CGG	2	6	274865	274870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510268
6497	NC_013205	CGCCAT	2	12	274908	274919	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	258510268
6498	NC_013205	CAA	2	6	275007	275012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510268
6499	NC_013205	ACA	2	6	275054	275059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510268
6500	NC_013205	TGT	2	6	275078	275083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510268

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