MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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63002	NC_013205	CCG	2	6	2803728	2803733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512697
63003	NC_013205	CAT	2	6	2803736	2803741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512697
63004	NC_013205	CGA	3	9	2803765	2803773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512697
63005	NC_013205	GCCC	2	8	2803777	2803784	0 %	0 %	25 %	75 %	258512697
63006	NC_013205	GC	3	6	2803791	2803796	0 %	0 %	50 %	50 %	258512697
63007	NC_013205	CGT	2	6	2803879	2803884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512697
63008	NC_013205	GATC	2	8	2803912	2803919	25 %	25 %	25 %	25 %	258512698
63009	NC_013205	GC	3	6	2804055	2804060	0 %	0 %	50 %	50 %	258512698
63010	NC_013205	CGG	2	6	2804155	2804160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512698
63011	NC_013205	TTC	2	6	2804165	2804170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258512698
63012	NC_013205	CCCG	2	8	2804180	2804187	0 %	0 %	25 %	75 %	258512698
63013	NC_013205	CGT	2	6	2804282	2804287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512698
63014	NC_013205	ACG	2	6	2804308	2804313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512698
63015	NC_013205	CGA	2	6	2804320	2804325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512698
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63017	NC_013205	GCC	2	6	2804353	2804358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512698
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63019	NC_013205	CGGA	2	8	2804422	2804429	25 %	0 %	50 %	25 %	258512698
63020	NC_013205	CGT	2	6	2804449	2804454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512698
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63022	NC_013205	GC	3	6	2804508	2804513	0 %	0 %	50 %	50 %	258512698
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63024	NC_013205	CGA	2	6	2804620	2804625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512698
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63032	NC_013205	CAC	2	6	2805092	2805097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512698
63033	NC_013205	TCC	2	6	2805141	2805146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512698
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63037	NC_013205	CGC	2	6	2805255	2805260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63038	NC_013205	CTC	2	6	2805268	2805273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63039	NC_013205	GC	3	6	2805354	2805359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63040	NC_013205	GC	4	8	2805384	2805391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63041	NC_013205	GTT	2	6	2805423	2805428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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63054	NC_013205	GCCG	2	8	2805963	2805970	0 %	0 %	50 %	50 %	258512699
63055	NC_013205	GCA	2	6	2805984	2805989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512699
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63117	NC_013205	GAC	2	6	2808216	2808221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512700
63118	NC_013205	TCA	2	6	2808224	2808229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512700
63119	NC_013205	GAT	2	6	2808237	2808242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512700
63120	NC_013205	AGC	2	6	2808361	2808366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512700
63121	NC_013205	CCG	2	6	2808376	2808381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512700
63122	NC_013205	CAT	2	6	2808405	2808410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512700
63123	NC_013205	CGT	2	6	2808506	2808511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512700
63124	NC_013205	CCT	2	6	2808536	2808541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512700
63125	NC_013205	GGT	2	6	2808578	2808583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258512700
63126	NC_013205	GAC	2	6	2808606	2808611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512700
63127	NC_013205	TCG	3	9	2808613	2808621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512700
63128	NC_013205	GGA	2	6	2808623	2808628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512700
63129	NC_013205	TGC	2	6	2808649	2808654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512700
63130	NC_013205	TGA	2	6	2808668	2808673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512700
63131	NC_013205	CGA	2	6	2808683	2808688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512700
63132	NC_013205	GCG	2	6	2808704	2808709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512700
63133	NC_013205	CGT	2	6	2808758	2808763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512700
63134	NC_013205	GTCG	2	8	2808810	2808817	0 %	25 %	50 %	25 %	258512700
63135	NC_013205	CGGAAA	2	12	2808825	2808836	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	258512700
63136	NC_013205	GTC	2	6	2808882	2808887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512700
63137	NC_013205	TTTC	2	8	2808899	2808906	0 %	75 %	0 %	25 %	258512700
63138	NC_013205	CCT	2	6	2808958	2808963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512701
63139	NC_013205	GC	3	6	2808968	2808973	0 %	0 %	50 %	50 %	258512701
63140	NC_013205	TCG	2	6	2808994	2808999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512701
63141	NC_013205	CG	3	6	2809011	2809016	0 %	0 %	50 %	50 %	258512701
63142	NC_013205	CTG	2	6	2809041	2809046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512701
63143	NC_013205	GCT	2	6	2809061	2809066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512701
63144	NC_013205	GC	3	6	2809074	2809079	0 %	0 %	50 %	50 %	258512701
63145	NC_013205	GCT	2	6	2809082	2809087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512701
63146	NC_013205	CGCC	2	8	2809094	2809101	0 %	0 %	25 %	75 %	258512701
63147	NC_013205	CGT	2	6	2809178	2809183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512701
63148	NC_013205	GCT	2	6	2809253	2809258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512701
63149	NC_013205	GAC	2	6	2809291	2809296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512701
63150	NC_013205	TTG	2	6	2809324	2809329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258512701
63151	NC_013205	TGA	2	6	2809427	2809432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512701
63152	NC_013205	GCC	2	6	2809517	2809522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512702
63153	NC_013205	CGC	2	6	2809598	2809603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512702
63154	NC_013205	CAG	2	6	2809726	2809731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512702
63155	NC_013205	CGGATG	2	12	2809757	2809768	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258512702
63156	NC_013205	CCG	4	12	2809772	2809783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512702
63157	NC_013205	TCGAC	2	10	2809788	2809797	20 %	20 %	20 %	40 %	258512702
63158	NC_013205	CGT	2	6	2809813	2809818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512702
63159	NC_013205	TGA	2	6	2809830	2809835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512702
63160	NC_013205	TCC	2	6	2809916	2809921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512702
63161	NC_013205	GAT	2	6	2809945	2809950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512702
63162	NC_013205	TTGC	2	8	2809961	2809968	0 %	50 %	25 %	25 %	258512702
63163	NC_013205	ATG	2	6	2809970	2809975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512702
63164	NC_013205	GCA	2	6	2809988	2809993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63165	NC_013205	TTTGAT	2	12	2810012	2810023	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63166	NC_013205	T	6	6	2810023	2810028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63167	NC_013205	GACTTT	2	12	2810029	2810040	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63168	NC_013205	TTA	2	6	2810049	2810054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63169	NC_013205	AGAC	2	8	2810197	2810204	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63170	NC_013205	GCCC	2	8	2810318	2810325	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
63171	NC_013205	TCGCGC	2	12	2810378	2810389	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	258512703
63172	NC_013205	GAC	2	6	2810394	2810399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512703
63173	NC_013205	GCG	2	6	2810441	2810446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512703
63174	NC_013205	GCG	2	6	2810448	2810453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512703
63175	NC_013205	CG	4	8	2810462	2810469	0 %	0 %	50 %	50 %	258512703
63176	NC_013205	CCG	2	6	2810470	2810475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512703
63177	NC_013205	ACG	2	6	2810479	2810484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512703
63178	NC_013205	AGG	2	6	2810494	2810499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512703
63179	NC_013205	CACG	2	8	2810528	2810535	25 %	0 %	25 %	50 %	258512703
63180	NC_013205	GCC	2	6	2810541	2810546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512703
63181	NC_013205	CGC	2	6	2810564	2810569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512703
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63183	NC_013205	CTG	2	6	2810702	2810707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512703
63184	NC_013205	CTG	2	6	2810754	2810759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512703
63185	NC_013205	GC	3	6	2810766	2810771	0 %	0 %	50 %	50 %	258512703
63186	NC_013205	GC	3	6	2810891	2810896	0 %	0 %	50 %	50 %	258512703
63187	NC_013205	CCA	2	6	2811022	2811027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512704
63188	NC_013205	CGC	2	6	2811127	2811132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512704
63189	NC_013205	GC	4	8	2811137	2811144	0 %	0 %	50 %	50 %	258512704
63190	NC_013205	AGC	2	6	2811159	2811164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512704
63191	NC_013205	CGC	2	6	2811205	2811210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512704
63192	NC_013205	ATG	2	6	2811249	2811254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512704
63193	NC_013205	AGG	2	6	2811259	2811264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512704
63194	NC_013205	CG	3	6	2811317	2811322	0 %	0 %	50 %	50 %	258512704
63195	NC_013205	GCC	2	6	2811323	2811328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512704
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63197	NC_013205	TCCAT	2	10	2811415	2811424	20 %	40 %	0 %	40 %	258512704
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63199	NC_013205	GGT	2	6	2811506	2811511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258512705
63200	NC_013205	GCCG	2	8	2811551	2811558	0 %	0 %	50 %	50 %	258512705
63201	NC_013205	GTA	2	6	2811599	2811604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512705
63202	NC_013205	CCA	2	6	2811626	2811631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512705
63203	NC_013205	CG	3	6	2811647	2811652	0 %	0 %	50 %	50 %	258512705
63204	NC_013205	CGC	2	6	2811674	2811679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512705
63205	NC_013205	ATC	2	6	2811687	2811692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512705
63206	NC_013205	GAG	2	6	2811710	2811715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512705
63207	NC_013205	GGC	2	6	2811716	2811721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512705
63208	NC_013205	AACC	2	8	2811722	2811729	50 %	0 %	0 %	50 %	258512705
63209	NC_013205	CAG	2	6	2811749	2811754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512705
63210	NC_013205	CAT	2	6	2811773	2811778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512705
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63212	NC_013205	GCGA	2	8	2811836	2811843	25 %	0 %	50 %	25 %	258512705
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63216	NC_013205	GCG	2	6	2812095	2812100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512706
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63219	NC_013205	GATGA	2	10	2812229	2812238	40 %	20 %	40 %	0 %	258512706
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63221	NC_013205	CCGC	2	8	2812280	2812287	0 %	0 %	25 %	75 %	258512706
63222	NC_013205	CCG	2	6	2812336	2812341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512706
63223	NC_013205	CGG	2	6	2812363	2812368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512706
63224	NC_013205	ACGA	2	8	2812401	2812408	50 %	0 %	25 %	25 %	258512706
63225	NC_013205	ACG	2	6	2812476	2812481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512706
63226	NC_013205	CAC	2	6	2812529	2812534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512706
63227	NC_013205	GGC	2	6	2812535	2812540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512706
63228	NC_013205	ACG	2	6	2812572	2812577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512706
63229	NC_013205	GGC	2	6	2812613	2812618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512706
63230	NC_013205	TCCA	2	8	2812734	2812741	25 %	25 %	0 %	50 %	258512706
63231	NC_013205	CAT	2	6	2812778	2812783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512706
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63233	NC_013205	CGC	2	6	2812840	2812845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512707
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63340	NC_013205	GTGG	2	8	2818328	2818335	0 %	25 %	75 %	0 %	258512712
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63347	NC_013205	GC	3	6	2818700	2818705	0 %	0 %	50 %	50 %	258512712
63348	NC_013205	GAG	2	6	2818706	2818711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512712
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63350	NC_013205	AC	3	6	2818766	2818771	50 %	0 %	0 %	50 %	258512712
63351	NC_013205	CG	3	6	2818785	2818790	0 %	0 %	50 %	50 %	258512712
63352	NC_013205	GAG	2	6	2818868	2818873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512712
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63354	NC_013205	TTC	2	6	2819005	2819010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258512712
63355	NC_013205	GCG	3	9	2819052	2819060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63356	NC_013205	GTC	2	6	2819132	2819137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512713
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63457	NC_013205	ACGGC	2	10	2823242	2823251	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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63468	NC_013205	CGCC	2	8	2823816	2823823	0 %	0 %	25 %	75 %	258512718
63469	NC_013205	CCG	3	9	2823857	2823865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512718
63470	NC_013205	TCG	2	6	2823869	2823874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512718
63471	NC_013205	GC	3	6	2823887	2823892	0 %	0 %	50 %	50 %	258512718
63472	NC_013205	CGG	2	6	2823946	2823951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512718
63473	NC_013205	GCG	2	6	2823952	2823957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512718
63474	NC_013205	GTC	2	6	2824003	2824008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512718
63475	NC_013205	TGC	2	6	2824025	2824030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512718
63476	NC_013205	GTA	2	6	2824042	2824047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512718
63477	NC_013205	GGAGC	2	10	2824086	2824095	20 %	0 %	60 %	20 %	258512718
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63479	NC_013205	GCG	2	6	2824147	2824152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512718
63480	NC_013205	TGA	2	6	2824236	2824241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512718
63481	NC_013205	GAT	2	6	2824285	2824290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512718
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63483	NC_013205	CCGGCG	2	12	2824386	2824397	0 %	0 %	50 %	50 %	258512718
63484	NC_013205	ACG	2	6	2824466	2824471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512718
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63488	NC_013205	CGC	2	6	2824614	2824619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512718
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63490	NC_013205	GC	3	6	2824669	2824674	0 %	0 %	50 %	50 %	258512718
63491	NC_013205	TGA	2	6	2824752	2824757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512718
63492	NC_013205	GC	3	6	2824758	2824763	0 %	0 %	50 %	50 %	258512718
63493	NC_013205	CCT	2	6	2824796	2824801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512719
63494	NC_013205	CGT	2	6	2824854	2824859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512719
63495	NC_013205	ACC	2	6	2824933	2824938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512719
63496	NC_013205	TCTCGA	2	12	2825009	2825020	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258512719
63497	NC_013205	CAG	2	6	2825103	2825108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512719
63498	NC_013205	CG	3	6	2825241	2825246	0 %	0 %	50 %	50 %	258512719
63499	NC_013205	GTC	2	6	2825271	2825276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512719
63500	NC_013205	CGTGA	2	10	2825405	2825414	20 %	20 %	40 %	20 %	258512720

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