MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
61501	NC_013205	TGG	2	6	2740479	2740484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61502	NC_013205	GGA	2	6	2740628	2740633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512618
61503	NC_013205	CG	3	6	2740747	2740752	0 %	0 %	50 %	50 %	258512618
61504	NC_013205	CGAA	2	8	2740771	2740778	50 %	0 %	25 %	25 %	258512618
61505	NC_013205	TTC	2	6	2740810	2740815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258512618
61506	NC_013205	GCG	2	6	2740842	2740847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512618
61507	NC_013205	GTC	2	6	2740868	2740873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512618
61508	NC_013205	CGT	2	6	2740919	2740924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512618
61509	NC_013205	GAG	2	6	2740950	2740955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512618
61510	NC_013205	GAA	2	6	2741039	2741044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258512618
61511	NC_013205	CCG	2	6	2741056	2741061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512618
61512	NC_013205	CGA	2	6	2741068	2741073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512618
61513	NC_013205	CAG	2	6	2741118	2741123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512618
61514	NC_013205	CGG	3	9	2741134	2741142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512618
61515	NC_013205	GCT	2	6	2741211	2741216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512618
61516	NC_013205	CGG	2	6	2741245	2741250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512618
61517	NC_013205	AGC	2	6	2741255	2741260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512618
61518	NC_013205	GC	3	6	2741291	2741296	0 %	0 %	50 %	50 %	258512618
61519	NC_013205	G	7	7	2741309	2741315	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
61520	NC_013205	GTG	2	6	2741389	2741394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258512619
61521	NC_013205	TCG	2	6	2741396	2741401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512619
61522	NC_013205	ACTC	2	8	2741436	2741443	25 %	25 %	0 %	50 %	258512619
61523	NC_013205	ACA	2	6	2741453	2741458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258512619
61524	NC_013205	TGG	2	6	2741468	2741473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258512619
61525	NC_013205	CGT	2	6	2741478	2741483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512619
61526	NC_013205	TTC	2	6	2741512	2741517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258512619
61527	NC_013205	CGG	4	12	2741518	2741529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512619
61528	NC_013205	GT	3	6	2741636	2741641	0 %	50 %	50 %	0 %	258512619
61529	NC_013205	CCA	2	6	2741661	2741666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512619
61530	NC_013205	AGG	2	6	2741673	2741678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512619
61531	NC_013205	CGACAT	2	12	2741712	2741723	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	258512619
61532	NC_013205	CGC	2	6	2741724	2741729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512619
61533	NC_013205	AGG	2	6	2741738	2741743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512619
61534	NC_013205	GAC	2	6	2741775	2741780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512619
61535	NC_013205	GAT	2	6	2741959	2741964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512620
61536	NC_013205	TCG	2	6	2742000	2742005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512620
61537	NC_013205	AAG	2	6	2742039	2742044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258512620
61538	NC_013205	CTG	2	6	2742071	2742076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512620
61539	NC_013205	CGA	2	6	2742106	2742111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512620
61540	NC_013205	CGC	2	6	2742142	2742147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61541	NC_013205	CGG	2	6	2742160	2742165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61542	NC_013205	GAT	2	6	2742336	2742341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512621
61543	NC_013205	CGC	2	6	2742392	2742397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512621
61544	NC_013205	GGC	2	6	2742446	2742451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512621
61545	NC_013205	TGCC	2	8	2742461	2742468	0 %	25 %	25 %	50 %	258512621
61546	NC_013205	CGA	2	6	2742509	2742514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512621
61547	NC_013205	CTT	2	6	2742515	2742520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258512621
61548	NC_013205	GCG	2	6	2742685	2742690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61549	NC_013205	ACG	2	6	2742760	2742765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512622
61550	NC_013205	TCT	2	6	2742788	2742793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258512622
61551	NC_013205	CGCA	2	8	2742827	2742834	25 %	0 %	25 %	50 %	258512622
61552	NC_013205	GAG	2	6	2742882	2742887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512622
61553	NC_013205	CGT	2	6	2742914	2742919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512622
61554	NC_013205	CG	3	6	2743007	2743012	0 %	0 %	50 %	50 %	258512622
61555	NC_013205	CGA	2	6	2743028	2743033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512622
61556	NC_013205	G	6	6	2743058	2743063	0 %	0 %	100 %	0 %	258512622
61557	NC_013205	GTC	2	6	2743083	2743088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512622
61558	NC_013205	ACG	2	6	2743207	2743212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512622
61559	NC_013205	TGA	2	6	2743234	2743239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512622
61560	NC_013205	CGT	2	6	2743276	2743281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512623
61561	NC_013205	CCG	2	6	2743306	2743311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512623
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61563	NC_013205	CGG	2	6	2743540	2743545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512623
61564	NC_013205	CG	3	6	2743571	2743576	0 %	0 %	50 %	50 %	258512623
61565	NC_013205	GC	3	6	2743638	2743643	0 %	0 %	50 %	50 %	258512623
61566	NC_013205	GTG	2	6	2743661	2743666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258512623
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61569	NC_013205	CGA	2	6	2743852	2743857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512623
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61573	NC_013205	CAT	2	6	2744041	2744046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512623
61574	NC_013205	GAC	2	6	2744099	2744104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512623
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61581	NC_013205	GCC	2	6	2744455	2744460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61582	NC_013205	GCG	2	6	2744465	2744470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61583	NC_013205	TTC	2	6	2744478	2744483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61584	NC_013205	CG	4	8	2744533	2744540	0 %	0 %	50 %	50 %	258512624
61585	NC_013205	CCACGC	2	12	2744704	2744715	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	258512624
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61588	NC_013205	CGC	2	6	2745323	2745328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512624
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61599	NC_013205	CGC	2	6	2745698	2745703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512624
61600	NC_013205	GAA	2	6	2745713	2745718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258512624
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61602	NC_013205	GTC	2	6	2745756	2745761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61603	NC_013205	GA	3	6	2745777	2745782	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61604	NC_013205	CAGC	2	8	2745855	2745862	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61605	NC_013205	GAC	2	6	2745867	2745872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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61607	NC_013205	CCG	2	6	2745960	2745965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512625
61608	NC_013205	GCC	2	6	2746036	2746041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512625
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61610	NC_013205	CGG	2	6	2746108	2746113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512625
61611	NC_013205	TGA	3	9	2746194	2746202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512625
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61616	NC_013205	CGA	2	6	2746377	2746382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512625
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61735	NC_013205	CGC	2	6	2750962	2750967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512628
61736	NC_013205	GA	3	6	2751102	2751107	50 %	0 %	50 %	0 %	258512628
61737	NC_013205	GATGCG	2	12	2751160	2751171	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258512628
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61743	NC_013205	TCC	2	6	2751435	2751440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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61745	NC_013205	CCG	2	6	2751531	2751536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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61747	NC_013205	GCC	3	9	2751569	2751577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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61749	NC_013205	GC	3	6	2751889	2751894	0 %	0 %	50 %	50 %	258512629
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61827	NC_013205	CGCC	2	8	2755225	2755232	0 %	0 %	25 %	75 %	258512632
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61847	NC_013205	GCAG	2	8	2756027	2756034	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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61970	NC_013205	GCC	2	6	2761627	2761632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512640
61971	NC_013205	GAT	2	6	2761664	2761669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512640
61972	NC_013205	GAC	2	6	2761740	2761745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512640
61973	NC_013205	GCGT	2	8	2761752	2761759	0 %	25 %	50 %	25 %	258512640
61974	NC_013205	GCA	2	6	2761793	2761798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512640
61975	NC_013205	GGCA	2	8	2761803	2761810	25 %	0 %	50 %	25 %	258512640
61976	NC_013205	ATCCG	2	10	2761834	2761843	20 %	20 %	20 %	40 %	258512640
61977	NC_013205	ACC	2	6	2761873	2761878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512640
61978	NC_013205	GC	4	8	2761882	2761889	0 %	0 %	50 %	50 %	258512640
61979	NC_013205	TCCG	2	8	2761903	2761910	0 %	25 %	25 %	50 %	258512640
61980	NC_013205	CGA	2	6	2761922	2761927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512640
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61984	NC_013205	CCG	2	6	2762151	2762156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512641
61985	NC_013205	GCG	2	6	2762224	2762229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512641
61986	NC_013205	CCA	2	6	2762257	2762262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512641
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61988	NC_013205	CCTTGG	2	12	2762329	2762340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512641
61989	NC_013205	GTC	2	6	2762346	2762351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512641
61990	NC_013205	TCCC	2	8	2762449	2762456	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
61991	NC_013205	TGC	2	6	2762458	2762463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61992	NC_013205	GTC	2	6	2762474	2762479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512642
61993	NC_013205	TCC	2	6	2762523	2762528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512642
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61995	NC_013205	TCT	2	6	2762565	2762570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258512642
61996	NC_013205	CG	3	6	2762609	2762614	0 %	0 %	50 %	50 %	258512642
61997	NC_013205	CTC	2	6	2762651	2762656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512642
61998	NC_013205	TCCG	2	8	2762810	2762817	0 %	25 %	25 %	50 %	258512642
61999	NC_013205	CG	3	6	2762863	2762868	0 %	0 %	50 %	50 %	258512642
62000	NC_013205	CG	3	6	2762890	2762895	0 %	0 %	50 %	50 %	258512642

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