MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
61001	NC_013205	ACG	2	6	2719023	2719028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512600
61002	NC_013205	CCG	2	6	2719067	2719072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512600
61003	NC_013205	CG	3	6	2719094	2719099	0 %	0 %	50 %	50 %	258512600
61004	NC_013205	GGC	2	6	2719114	2719119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512600
61005	NC_013205	CCA	2	6	2719168	2719173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512600
61006	NC_013205	TGC	2	6	2719183	2719188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512600
61007	NC_013205	TCA	2	6	2719251	2719256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512600
61008	NC_013205	CGT	2	6	2719258	2719263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512600
61009	NC_013205	CGG	2	6	2719304	2719309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512600
61010	NC_013205	ATA	2	6	2719313	2719318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258512600
61011	NC_013205	CG	3	6	2719343	2719348	0 %	0 %	50 %	50 %	258512600
61012	NC_013205	CCCG	2	8	2719349	2719356	0 %	0 %	25 %	75 %	258512600
61013	NC_013205	CAA	2	6	2719393	2719398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258512600
61014	NC_013205	GAC	2	6	2719481	2719486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512600
61015	NC_013205	GC	3	6	2719531	2719536	0 %	0 %	50 %	50 %	258512600
61016	NC_013205	GC	3	6	2719584	2719589	0 %	0 %	50 %	50 %	258512600
61017	NC_013205	GCC	2	6	2719592	2719597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512600
61018	NC_013205	ACGCG	2	10	2719606	2719615	20 %	0 %	40 %	40 %	258512600
61019	NC_013205	CTC	2	6	2719637	2719642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512600
61020	NC_013205	CA	3	6	2719674	2719679	50 %	0 %	0 %	50 %	258512600
61021	NC_013205	TGTCCT	2	12	2719687	2719698	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	258512600
61022	NC_013205	GAT	2	6	2719717	2719722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512600
61023	NC_013205	GAG	2	6	2719820	2719825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512600
61024	NC_013205	GAA	2	6	2719826	2719831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258512600
61025	NC_013205	CAT	2	6	2719895	2719900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512600
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61027	NC_013205	ACG	2	6	2719952	2719957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512601
61028	NC_013205	CG	3	6	2719965	2719970	0 %	0 %	50 %	50 %	258512601
61029	NC_013205	CAC	2	6	2720029	2720034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512601
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61032	NC_013205	TCT	2	6	2720223	2720228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258512601
61033	NC_013205	GGCC	2	8	2720382	2720389	0 %	0 %	50 %	50 %	258512601
61034	NC_013205	TCG	2	6	2720396	2720401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512601
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61038	NC_013205	TG	3	6	2720528	2720533	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61039	NC_013205	CGCC	2	8	2720549	2720556	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
61040	NC_013205	CGT	2	6	2720569	2720574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61041	NC_013205	GA	3	6	2720600	2720605	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61042	NC_013205	CG	3	6	2720619	2720624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61043	NC_013205	GCC	2	6	2720626	2720631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61044	NC_013205	CG	3	6	2720632	2720637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61045	NC_013205	GCG	2	6	2720639	2720644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61046	NC_013205	CGG	2	6	2720652	2720657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61047	NC_013205	CGT	2	6	2720702	2720707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512602
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61059	NC_013205	TCC	2	6	2721080	2721085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61060	NC_013205	TGA	2	6	2721102	2721107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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61062	NC_013205	GCC	2	6	2721161	2721166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512603
61063	NC_013205	GC	3	6	2721216	2721221	0 %	0 %	50 %	50 %	258512603
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61071	NC_013205	CCG	2	6	2721477	2721482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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61074	NC_013205	GTATA	2	10	2721517	2721526	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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61103	NC_013205	GAG	2	6	2722473	2722478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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61231	NC_013205	CCGC	2	8	2728231	2728238	0 %	0 %	25 %	75 %	258512608
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61235	NC_013205	CAGC	2	8	2728455	2728462	25 %	0 %	25 %	50 %	258512608
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61237	NC_013205	TCC	3	9	2728609	2728617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512608
61238	NC_013205	CGGG	2	8	2728637	2728644	0 %	0 %	75 %	25 %	258512608
61239	NC_013205	ACACGG	2	12	2728670	2728681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512608
61240	NC_013205	GA	3	6	2728709	2728714	50 %	0 %	50 %	0 %	258512608
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61242	NC_013205	CGC	2	6	2728771	2728776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512608
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61244	NC_013205	CG	3	6	2728811	2728816	0 %	0 %	50 %	50 %	258512608
61245	NC_013205	CG	4	8	2728947	2728954	0 %	0 %	50 %	50 %	258512608
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61265	NC_013205	TG	3	6	2730319	2730324	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61266	NC_013205	GTC	2	6	2730373	2730378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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61268	NC_013205	GTT	2	6	2730453	2730458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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61272	NC_013205	ACTA	2	8	2730743	2730750	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61273	NC_013205	AGC	2	6	2730801	2730806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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61475	NC_013205	CCG	2	6	2739326	2739331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61476	NC_013205	GATC	2	8	2739353	2739360	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61477	NC_013205	CGG	2	6	2739427	2739432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512616
61478	NC_013205	GCGT	2	8	2739462	2739469	0 %	25 %	50 %	25 %	258512616
61479	NC_013205	CAG	2	6	2739523	2739528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512616
61480	NC_013205	GC	4	8	2739532	2739539	0 %	0 %	50 %	50 %	258512616
61481	NC_013205	CCT	2	6	2739609	2739614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61482	NC_013205	GAT	2	6	2739625	2739630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61483	NC_013205	TCT	3	9	2739691	2739699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258512617
61484	NC_013205	TCCCGC	2	12	2739703	2739714	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	258512617
61485	NC_013205	CG	3	6	2739734	2739739	0 %	0 %	50 %	50 %	258512617
61486	NC_013205	AG	3	6	2739756	2739761	50 %	0 %	50 %	0 %	258512617
61487	NC_013205	CGG	2	6	2739788	2739793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512617
61488	NC_013205	CCA	2	6	2739833	2739838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512617
61489	NC_013205	CGG	2	6	2739880	2739885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512617
61490	NC_013205	CAG	2	6	2739961	2739966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61491	NC_013205	ACGC	2	8	2740048	2740055	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61492	NC_013205	C	6	6	2740057	2740062	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
61493	NC_013205	CGA	2	6	2740079	2740084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61494	NC_013205	TCCT	2	8	2740115	2740122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61495	NC_013205	CA	3	6	2740172	2740177	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61496	NC_013205	GCA	2	6	2740306	2740311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61497	NC_013205	CA	3	6	2740341	2740346	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61498	NC_013205	ACA	2	6	2740378	2740383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61499	NC_013205	TTTC	2	8	2740418	2740425	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61500	NC_013205	CA	3	6	2740453	2740458	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

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