MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
60001	NC_013205	CG	3	6	2677986	2677991	0 %	0 %	50 %	50 %	258512558
60002	NC_013205	CCA	2	6	2678040	2678045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512558
60003	NC_013205	TCCTC	2	10	2678075	2678084	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
60004	NC_013205	GC	3	6	2678111	2678116	0 %	0 %	50 %	50 %	258512559
60005	NC_013205	ACGG	2	8	2678117	2678124	25 %	0 %	50 %	25 %	258512559
60006	NC_013205	GCG	2	6	2678133	2678138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512559
60007	NC_013205	GGC	2	6	2678195	2678200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512559
60008	NC_013205	CGC	2	6	2678210	2678215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512559
60009	NC_013205	CGG	2	6	2678261	2678266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512559
60010	NC_013205	CGC	2	6	2678285	2678290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512559
60011	NC_013205	CGA	2	6	2678359	2678364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512559
60012	NC_013205	ACG	2	6	2678380	2678385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512559
60013	NC_013205	GAA	2	6	2678396	2678401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258512559
60014	NC_013205	CAC	2	6	2678429	2678434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512559
60015	NC_013205	GAC	3	9	2678453	2678461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512559
60016	NC_013205	GCG	2	6	2678478	2678483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512559
60017	NC_013205	CCA	2	6	2678492	2678497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512559
60018	NC_013205	CTCG	2	8	2678501	2678508	0 %	25 %	25 %	50 %	258512559
60019	NC_013205	CGCGGC	2	12	2678513	2678524	0 %	0 %	50 %	50 %	258512559
60020	NC_013205	GAG	3	9	2678525	2678533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512559
60021	NC_013205	CGG	2	6	2678539	2678544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512559
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60034	NC_013205	AGATG	2	10	2679112	2679121	40 %	20 %	40 %	0 %	258512560
60035	NC_013205	GC	3	6	2679138	2679143	0 %	0 %	50 %	50 %	258512560
60036	NC_013205	CGA	2	6	2679153	2679158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512560
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60038	NC_013205	GCCCG	2	10	2679243	2679252	0 %	0 %	40 %	60 %	258512560
60039	NC_013205	CCCG	2	8	2679273	2679280	0 %	0 %	25 %	75 %	258512560
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60043	NC_013205	GC	3	6	2679402	2679407	0 %	0 %	50 %	50 %	258512560
60044	NC_013205	AAAG	2	8	2679457	2679464	75 %	0 %	25 %	0 %	258512560
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60053	NC_013205	CGCT	2	8	2679724	2679731	0 %	25 %	25 %	50 %	258512560
60054	NC_013205	GGCGC	2	10	2679783	2679792	0 %	0 %	60 %	40 %	258512560
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60072	NC_013205	CG	3	6	2680612	2680617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60073	NC_013205	TGCGA	2	10	2680632	2680641	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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60079	NC_013205	GC	3	6	2681036	2681041	0 %	0 %	50 %	50 %	258512564
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60108	NC_013205	C	6	6	2682560	2682565	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
60109	NC_013205	CGC	2	6	2682580	2682585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60110	NC_013205	CCG	2	6	2682606	2682611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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60112	NC_013205	GC	3	6	2682628	2682633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60113	NC_013205	GAA	2	6	2682635	2682640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60114	NC_013205	CGGCGA	2	12	2682697	2682708	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	258512565
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60116	NC_013205	ATG	2	6	2682825	2682830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512565
60117	NC_013205	CG	3	6	2682833	2682838	0 %	0 %	50 %	50 %	258512565
60118	NC_013205	ACG	2	6	2682891	2682896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512565
60119	NC_013205	CTC	2	6	2682908	2682913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512565
60120	NC_013205	CGA	2	6	2682979	2682984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512565
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60122	NC_013205	TGC	2	6	2683035	2683040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512565
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60126	NC_013205	CGG	2	6	2683225	2683230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512565
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60129	NC_013205	CG	3	6	2683300	2683305	0 %	0 %	50 %	50 %	258512565
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60183	NC_013205	CCTT	2	8	2685277	2685284	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60184	NC_013205	GA	4	8	2685360	2685367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60185	NC_013205	TCG	2	6	2685437	2685442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512568
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60193	NC_013205	GGC	2	6	2685853	2685858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512569
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60224	NC_013205	CG	3	6	2687106	2687111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60225	NC_013205	GC	3	6	2687141	2687146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60226	NC_013205	CG	4	8	2687231	2687238	0 %	0 %	50 %	50 %	258512570
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60233	NC_013205	CGT	2	6	2687756	2687761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512570
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60237	NC_013205	GCGCC	2	10	2687846	2687855	0 %	0 %	40 %	60 %	258512570
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60469	NC_013205	GCG	2	6	2696787	2696792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512579
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60472	NC_013205	CGG	2	6	2696883	2696888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512579
60473	NC_013205	GCC	2	6	2696905	2696910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512579
60474	NC_013205	TCGC	2	8	2696933	2696940	0 %	25 %	25 %	50 %	258512579
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60476	NC_013205	TCG	2	6	2696992	2696997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512579
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60478	NC_013205	CG	3	6	2697062	2697067	0 %	0 %	50 %	50 %	258512579
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60484	NC_013205	CGA	3	9	2697209	2697217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512579
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60492	NC_013205	CGA	2	6	2697377	2697382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512579
60493	NC_013205	GCT	2	6	2697458	2697463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512579
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60500	NC_013205	GCA	2	6	2697751	2697756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512579

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