MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
59501	NC_013205	TCGT	2	8	2658031	2658038	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59502	NC_013205	CCTCGC	2	12	2658062	2658073	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
59503	NC_013205	CCGCA	2	10	2658094	2658103	20 %	0 %	20 %	60 %	258512535
59504	NC_013205	CCGA	2	8	2658210	2658217	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59505	NC_013205	CCA	2	6	2658228	2658233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59506	NC_013205	CCT	2	6	2658261	2658266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512536
59507	NC_013205	GCC	2	6	2658285	2658290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512536
59508	NC_013205	CGC	2	6	2658298	2658303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512536
59509	NC_013205	ACCG	2	8	2658350	2658357	25 %	0 %	25 %	50 %	258512536
59510	NC_013205	CCG	2	6	2658383	2658388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512536
59511	NC_013205	CGA	2	6	2658399	2658404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512536
59512	NC_013205	GAA	2	6	2658412	2658417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258512536
59513	NC_013205	TCT	2	6	2658458	2658463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258512536
59514	NC_013205	GCA	2	6	2658498	2658503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512536
59515	NC_013205	GCC	2	6	2658505	2658510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512536
59516	NC_013205	CAG	2	6	2658523	2658528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512536
59517	NC_013205	GGC	2	6	2658589	2658594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512536
59518	NC_013205	GCT	2	6	2658621	2658626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512536
59519	NC_013205	TCG	2	6	2658687	2658692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512536
59520	NC_013205	ACG	2	6	2658695	2658700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512536
59521	NC_013205	GC	3	6	2658723	2658728	0 %	0 %	50 %	50 %	258512536
59522	NC_013205	TCA	2	6	2658774	2658779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512536
59523	NC_013205	CG	4	8	2658860	2658867	0 %	0 %	50 %	50 %	258512536
59524	NC_013205	GAA	3	9	2658937	2658945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258512536
59525	NC_013205	C	7	7	2658979	2658985	0 %	0 %	0 %	100 %	258512536
59526	NC_013205	GC	4	8	2659038	2659045	0 %	0 %	50 %	50 %	258512536
59527	NC_013205	CCG	2	6	2659056	2659061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512536
59528	NC_013205	CGA	2	6	2659155	2659160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512536
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59530	NC_013205	CG	3	6	2659198	2659203	0 %	0 %	50 %	50 %	258512536
59531	NC_013205	CGAG	2	8	2659236	2659243	25 %	0 %	50 %	25 %	258512536
59532	NC_013205	GCTCC	2	10	2659315	2659324	0 %	20 %	20 %	60 %	258512536
59533	NC_013205	GAT	2	6	2659366	2659371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512536
59534	NC_013205	GCCG	2	8	2659381	2659388	0 %	0 %	50 %	50 %	258512536
59535	NC_013205	CAC	2	6	2659406	2659411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512536
59536	NC_013205	CCG	2	6	2659426	2659431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512536
59537	NC_013205	GC	3	6	2659449	2659454	0 %	0 %	50 %	50 %	258512537
59538	NC_013205	CCGCT	2	10	2659497	2659506	0 %	20 %	20 %	60 %	258512537
59539	NC_013205	CG	3	6	2659515	2659520	0 %	0 %	50 %	50 %	258512537
59540	NC_013205	CATCTT	2	12	2659533	2659544	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	258512537
59541	NC_013205	GCC	2	6	2659570	2659575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512537
59542	NC_013205	TCC	2	6	2659678	2659683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512537
59543	NC_013205	CGA	2	6	2659688	2659693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512537
59544	NC_013205	GC	4	8	2659739	2659746	0 %	0 %	50 %	50 %	258512537
59545	NC_013205	CGT	2	6	2659763	2659768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512537
59546	NC_013205	AGCG	2	8	2659825	2659832	25 %	0 %	50 %	25 %	258512537
59547	NC_013205	CCA	2	6	2659841	2659846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512537
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59549	NC_013205	GC	3	6	2659895	2659900	0 %	0 %	50 %	50 %	258512537
59550	NC_013205	CTC	2	6	2659953	2659958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512537
59551	NC_013205	CCCG	2	8	2660130	2660137	0 %	0 %	25 %	75 %	258512537
59552	NC_013205	GC	3	6	2660174	2660179	0 %	0 %	50 %	50 %	258512537
59553	NC_013205	AGC	2	6	2660197	2660202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512537
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59555	NC_013205	CGAG	2	8	2660306	2660313	25 %	0 %	50 %	25 %	258512537
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59557	NC_013205	CTC	2	6	2660325	2660330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512537
59558	NC_013205	CGC	2	6	2660409	2660414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512537
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59563	NC_013205	GAG	2	6	2660568	2660573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512537
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59565	NC_013205	GC	3	6	2660640	2660645	0 %	0 %	50 %	50 %	258512537
59566	NC_013205	CG	4	8	2660654	2660661	0 %	0 %	50 %	50 %	258512537
59567	NC_013205	CGCC	2	8	2660747	2660754	0 %	0 %	25 %	75 %	258512537
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59573	NC_013205	CGC	2	6	2661017	2661022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512537
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59575	NC_013205	GA	3	6	2661111	2661116	50 %	0 %	50 %	0 %	258512537
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59579	NC_013205	CG	3	6	2661196	2661201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59580	NC_013205	CG	4	8	2661205	2661212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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59585	NC_013205	GAA	2	6	2661312	2661317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258512538
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59602	NC_013205	AGG	2	6	2662118	2662123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59603	NC_013205	GCC	2	6	2662151	2662156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512539
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59608	NC_013205	GC	3	6	2662295	2662300	0 %	0 %	50 %	50 %	258512539
59609	NC_013205	GC	4	8	2662303	2662310	0 %	0 %	50 %	50 %	258512539
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59614	NC_013205	GGCGA	2	10	2662424	2662433	20 %	0 %	60 %	20 %	258512539
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59616	NC_013205	CAA	2	6	2662453	2662458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258512539
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59618	NC_013205	GGA	2	6	2662543	2662548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512539
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59730	NC_013205	TC	3	6	2666853	2666858	0 %	50 %	0 %	50 %	258512544
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