MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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58502	NC_013205	CGC	2	6	2612357	2612362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512499
58503	NC_013205	CCA	2	6	2612388	2612393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512499
58504	NC_013205	AAG	2	6	2612416	2612421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258512499
58505	NC_013205	ATG	2	6	2612422	2612427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512499
58506	NC_013205	GCA	2	6	2612506	2612511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512499
58507	NC_013205	AGC	2	6	2612536	2612541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512499
58508	NC_013205	GGA	2	6	2612557	2612562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512499
58509	NC_013205	C	6	6	2612568	2612573	0 %	0 %	0 %	100 %	258512499
58510	NC_013205	ACC	2	6	2612586	2612591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512499
58511	NC_013205	GGT	2	6	2612612	2612617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258512499
58512	NC_013205	CGC	2	6	2612652	2612657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512499
58513	NC_013205	CT	3	6	2612703	2612708	0 %	50 %	0 %	50 %	258512499
58514	NC_013205	TGCT	2	8	2612710	2612717	0 %	50 %	25 %	25 %	258512499
58515	NC_013205	CGC	2	6	2612749	2612754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58516	NC_013205	TG	3	6	2612756	2612761	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58517	NC_013205	CCA	2	6	2612786	2612791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58518	NC_013205	CCA	2	6	2612942	2612947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512500
58519	NC_013205	CGC	2	6	2612979	2612984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512500
58520	NC_013205	CGC	2	6	2613010	2613015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512500
58521	NC_013205	GCA	2	6	2613032	2613037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512500
58522	NC_013205	CAGA	2	8	2613048	2613055	50 %	0 %	25 %	25 %	258512500
58523	NC_013205	CCCG	2	8	2613096	2613103	0 %	0 %	25 %	75 %	258512500
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58525	NC_013205	CTGT	2	8	2613160	2613167	0 %	50 %	25 %	25 %	258512500
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58536	NC_013205	CA	3	6	2613680	2613685	50 %	0 %	0 %	50 %	258512500
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58618	NC_013205	CGC	2	6	2617640	2617645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512504
58619	NC_013205	GCA	2	6	2617905	2617910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512504
58620	NC_013205	CTT	2	6	2617922	2617927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258512504
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58971	NC_013205	CGTT	2	8	2633596	2633603	0 %	50 %	25 %	25 %	258512513
58972	NC_013205	GAG	2	6	2633622	2633627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512513
58973	NC_013205	CGA	2	6	2633758	2633763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58974	NC_013205	GCG	2	6	2633768	2633773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58975	NC_013205	GTC	2	6	2633782	2633787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512514
58976	NC_013205	CGC	2	6	2633815	2633820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512514
58977	NC_013205	GCG	3	9	2633822	2633830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512514
58978	NC_013205	ACG	2	6	2633835	2633840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512514
58979	NC_013205	TCC	2	6	2633847	2633852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512514
58980	NC_013205	A	6	6	2633873	2633878	100 %	0 %	0 %	0 %	258512514
58981	NC_013205	TCG	2	6	2633967	2633972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512514
58982	NC_013205	CG	5	10	2634025	2634034	0 %	0 %	50 %	50 %	258512514
58983	NC_013205	GATG	2	8	2634101	2634108	25 %	25 %	50 %	0 %	258512514
58984	NC_013205	TTC	2	6	2634128	2634133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258512514
58985	NC_013205	GC	3	6	2634251	2634256	0 %	0 %	50 %	50 %	258512514
58986	NC_013205	TGT	2	6	2634301	2634306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258512514
58987	NC_013205	CCT	2	6	2634337	2634342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58988	NC_013205	AG	3	6	2634379	2634384	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58989	NC_013205	ACG	2	6	2634451	2634456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58990	NC_013205	AGC	2	6	2634499	2634504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58991	NC_013205	TG	3	6	2634526	2634531	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58992	NC_013205	CTATGA	2	12	2634590	2634601	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58993	NC_013205	GGA	2	6	2634612	2634617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58994	NC_013205	CGC	2	6	2634627	2634632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58995	NC_013205	GCA	2	6	2634648	2634653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58996	NC_013205	AAG	2	6	2634726	2634731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58997	NC_013205	GA	3	6	2634748	2634753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58998	NC_013205	CCA	2	6	2634767	2634772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58999	NC_013205	ATGG	2	8	2634839	2634846	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59000	NC_013205	GCG	2	6	2634863	2634868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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