MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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58002	NC_013205	ACCA	2	8	2591181	2591188	50 %	0 %	0 %	50 %	258512482
58003	NC_013205	GAT	2	6	2591213	2591218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512482
58004	NC_013205	GAA	2	6	2591220	2591225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258512482
58005	NC_013205	ATG	2	6	2591244	2591249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512482
58006	NC_013205	CCG	2	6	2591250	2591255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512482
58007	NC_013205	AAC	2	6	2591273	2591278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258512482
58008	NC_013205	GA	3	6	2591291	2591296	50 %	0 %	50 %	0 %	258512482
58009	NC_013205	CGATT	2	10	2591358	2591367	20 %	40 %	20 %	20 %	258512482
58010	NC_013205	AGC	2	6	2591479	2591484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512482
58011	NC_013205	TCG	2	6	2591526	2591531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512482
58012	NC_013205	TTC	3	9	2591540	2591548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258512482
58013	NC_013205	CCT	2	6	2591570	2591575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58014	NC_013205	TATTCA	2	12	2591595	2591606	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58015	NC_013205	ACC	2	6	2591744	2591749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512483
58016	NC_013205	ACC	2	6	2591764	2591769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512483
58017	NC_013205	AGC	2	6	2591770	2591775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512483
58018	NC_013205	CGG	2	6	2591846	2591851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512483
58019	NC_013205	AGAT	2	8	2591968	2591975	50 %	25 %	25 %	0 %	258512483
58020	NC_013205	CAG	2	6	2592003	2592008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512483
58021	NC_013205	TGC	2	6	2592022	2592027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512483
58022	NC_013205	CGA	2	6	2592062	2592067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512483
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58238	NC_013205	GC	3	6	2601090	2601095	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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58353	NC_013205	CGT	2	6	2605647	2605652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512493
58354	NC_013205	CGG	2	6	2605684	2605689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512493
58355	NC_013205	CGA	2	6	2605704	2605709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512493
58356	NC_013205	GA	3	6	2605716	2605721	50 %	0 %	50 %	0 %	258512493
58357	NC_013205	GTC	2	6	2605771	2605776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512493
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58360	NC_013205	CG	3	6	2605849	2605854	0 %	0 %	50 %	50 %	258512493
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58363	NC_013205	GCA	2	6	2605930	2605935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512493
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58384	NC_013205	CGG	2	6	2606770	2606775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512494
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58390	NC_013205	GC	3	6	2606882	2606887	0 %	0 %	50 %	50 %	258512494
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58392	NC_013205	CG	4	8	2606960	2606967	0 %	0 %	50 %	50 %	258512494
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58400	NC_013205	GGC	2	6	2607217	2607222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512494
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58418	NC_013205	CGGC	2	8	2607928	2607935	0 %	0 %	50 %	50 %	258512494
58419	NC_013205	CAGC	2	8	2608113	2608120	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58420	NC_013205	CCA	2	6	2608166	2608171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58421	NC_013205	ACA	2	6	2608244	2608249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58422	NC_013205	CG	3	6	2608286	2608291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58423	NC_013205	CGC	2	6	2608317	2608322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58424	NC_013205	GAG	2	6	2608343	2608348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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58430	NC_013205	GAC	2	6	2608608	2608613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512495
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58435	NC_013205	CGCTT	2	10	2608777	2608786	0 %	40 %	20 %	40 %	258512495
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58441	NC_013205	GCG	2	6	2609060	2609065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512495
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58452	NC_013205	G	6	6	2609575	2609580	0 %	0 %	100 %	0 %	258512495
58453	NC_013205	GCCT	2	8	2609592	2609599	0 %	25 %	25 %	50 %	258512496
58454	NC_013205	GAGTG	2	10	2609610	2609619	20 %	20 %	60 %	0 %	258512496
58455	NC_013205	TCG	2	6	2609628	2609633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512496
58456	NC_013205	GCG	2	6	2609635	2609640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512496
58457	NC_013205	GCT	2	6	2609743	2609748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512496
58458	NC_013205	CTG	2	6	2609792	2609797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512496
58459	NC_013205	CGC	2	6	2609808	2609813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512496
58460	NC_013205	CGC	2	6	2609842	2609847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512496
58461	NC_013205	GCC	2	6	2609855	2609860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512496
58462	NC_013205	GCC	2	6	2609901	2609906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512496
58463	NC_013205	CGCAGG	2	12	2609909	2609920	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	258512496
58464	NC_013205	GTT	2	6	2610077	2610082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58465	NC_013205	CAG	2	6	2610144	2610149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512497
58466	NC_013205	TCC	2	6	2610154	2610159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512497
58467	NC_013205	TGA	2	6	2610197	2610202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512497
58468	NC_013205	GCG	2	6	2610284	2610289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512497
58469	NC_013205	CCG	3	9	2610320	2610328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512497
58470	NC_013205	GGC	2	6	2610392	2610397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512497
58471	NC_013205	CAT	2	6	2610435	2610440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512497
58472	NC_013205	GTC	2	6	2610447	2610452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512497
58473	NC_013205	TCCG	2	8	2610519	2610526	0 %	25 %	25 %	50 %	258512497
58474	NC_013205	CTT	2	6	2610561	2610566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258512497
58475	NC_013205	CCT	3	9	2610569	2610577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512497
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58477	NC_013205	TGA	2	6	2610695	2610700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512497
58478	NC_013205	TA	3	6	2610815	2610820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58479	NC_013205	AC	3	6	2610913	2610918	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58480	NC_013205	GCC	2	6	2611019	2611024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512498
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58490	NC_013205	TG	3	6	2611728	2611733	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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58493	NC_013205	ATC	2	6	2611869	2611874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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