MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
57501	NC_013205	CTG	2	6	2567223	2567228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512456
57502	NC_013205	CGT	2	6	2567240	2567245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512456
57503	NC_013205	ACG	2	6	2567271	2567276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512456
57504	NC_013205	TCA	2	6	2567287	2567292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512456
57505	NC_013205	TTC	2	6	2567397	2567402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258512456
57506	NC_013205	GCC	2	6	2567406	2567411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512456
57507	NC_013205	TCA	2	6	2567428	2567433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512456
57508	NC_013205	GGAT	2	8	2567436	2567443	25 %	25 %	50 %	0 %	258512456
57509	NC_013205	CGTC	2	8	2567503	2567510	0 %	25 %	25 %	50 %	258512456
57510	NC_013205	CTC	2	6	2567731	2567736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57511	NC_013205	TC	3	6	2567764	2567769	0 %	50 %	0 %	50 %	258512457
57512	NC_013205	CGG	2	6	2567789	2567794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512457
57513	NC_013205	GCC	2	6	2567797	2567802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512457
57514	NC_013205	CGG	2	6	2567841	2567846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512457
57515	NC_013205	GTG	2	6	2567947	2567952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258512457
57516	NC_013205	CTC	2	6	2568073	2568078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512458
57517	NC_013205	TCG	2	6	2568110	2568115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512458
57518	NC_013205	CGG	2	6	2568168	2568173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512458
57519	NC_013205	GGT	2	6	2568234	2568239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258512458
57520	NC_013205	ACG	2	6	2568254	2568259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512458
57521	NC_013205	GAC	2	6	2568293	2568298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512458
57522	NC_013205	TGAG	2	8	2568326	2568333	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57523	NC_013205	AAC	2	6	2568373	2568378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258512459
57524	NC_013205	CGC	2	6	2568386	2568391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512459
57525	NC_013205	CAA	2	6	2568423	2568428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258512459
57526	NC_013205	CGG	2	6	2568429	2568434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512459
57527	NC_013205	CAT	2	6	2568483	2568488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512459
57528	NC_013205	CTG	2	6	2568514	2568519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512459
57529	NC_013205	AGG	2	6	2568613	2568618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57530	NC_013205	GCG	2	6	2568646	2568651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512460
57531	NC_013205	GCA	2	6	2568671	2568676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512460
57532	NC_013205	GGTCA	2	10	2568696	2568705	20 %	20 %	40 %	20 %	258512460
57533	NC_013205	TCA	2	6	2568778	2568783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512460
57534	NC_013205	ATG	2	6	2568813	2568818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512460
57535	NC_013205	GTC	2	6	2568905	2568910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57536	NC_013205	GT	3	6	2568911	2568916	0 %	50 %	50 %	0 %	258512461
57537	NC_013205	CGC	2	6	2568953	2568958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512461
57538	NC_013205	CGG	2	6	2568996	2569001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512461
57539	NC_013205	CGC	2	6	2569026	2569031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512461
57540	NC_013205	GCC	2	6	2569181	2569186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57541	NC_013205	GGC	2	6	2569193	2569198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57542	NC_013205	CAG	2	6	2569217	2569222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512462
57543	NC_013205	ACC	2	6	2569389	2569394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512462
57544	NC_013205	TTG	2	6	2569434	2569439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258512462
57545	NC_013205	GAA	2	6	2569445	2569450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258512462
57546	NC_013205	GCC	2	6	2569505	2569510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512462
57547	NC_013205	TCC	2	6	2569533	2569538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512462
57548	NC_013205	GAC	2	6	2569622	2569627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512462
57549	NC_013205	TCT	2	6	2569639	2569644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258512462
57550	NC_013205	CTT	2	6	2569675	2569680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258512462
57551	NC_013205	GAG	2	6	2569682	2569687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512462
57552	NC_013205	ATA	2	6	2569691	2569696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258512462
57553	NC_013205	TAG	2	6	2569701	2569706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512462
57554	NC_013205	CTT	2	6	2569748	2569753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258512462
57555	NC_013205	CTC	2	6	2569772	2569777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57556	NC_013205	CG	3	6	2569795	2569800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57557	NC_013205	CCG	2	6	2569880	2569885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512463
57558	NC_013205	CG	3	6	2569891	2569896	0 %	0 %	50 %	50 %	258512463
57559	NC_013205	TCTGC	2	10	2569902	2569911	0 %	40 %	20 %	40 %	258512463
57560	NC_013205	CGA	2	6	2569917	2569922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512463
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57562	NC_013205	GCGCT	2	10	2569981	2569990	0 %	20 %	40 %	40 %	258512463
57563	NC_013205	CCA	2	6	2570043	2570048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512463
57564	NC_013205	GCG	2	6	2570050	2570055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512463
57565	NC_013205	GTCT	2	8	2570074	2570081	0 %	50 %	25 %	25 %	258512463
57566	NC_013205	CCG	2	6	2570104	2570109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512463
57567	NC_013205	CCCG	2	8	2570136	2570143	0 %	0 %	25 %	75 %	258512463
57568	NC_013205	GC	3	6	2570153	2570158	0 %	0 %	50 %	50 %	258512463
57569	NC_013205	CCG	2	6	2570247	2570252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512463
57570	NC_013205	CG	4	8	2570271	2570278	0 %	0 %	50 %	50 %	258512463
57571	NC_013205	CTG	2	6	2570344	2570349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512463
57572	NC_013205	GAC	2	6	2570354	2570359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512463
57573	NC_013205	CGT	2	6	2570365	2570370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512463
57574	NC_013205	CGA	2	6	2570379	2570384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512463
57575	NC_013205	CTC	2	6	2570389	2570394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512463
57576	NC_013205	ACGC	2	8	2570408	2570415	25 %	0 %	25 %	50 %	258512463
57577	NC_013205	TCA	2	6	2570466	2570471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512463
57578	NC_013205	ACC	2	6	2570606	2570611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512463
57579	NC_013205	GCGAA	2	10	2570681	2570690	40 %	0 %	40 %	20 %	258512463
57580	NC_013205	TCC	2	6	2570696	2570701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512463
57581	NC_013205	TGC	2	6	2570726	2570731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512463
57582	NC_013205	CA	4	8	2570755	2570762	50 %	0 %	0 %	50 %	258512463
57583	NC_013205	TCC	3	9	2570763	2570771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57584	NC_013205	TCC	2	6	2570821	2570826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57585	NC_013205	AGA	2	6	2570971	2570976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258512464
57586	NC_013205	ACC	3	9	2570994	2571002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512464
57587	NC_013205	GCC	2	6	2571032	2571037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512464
57588	NC_013205	ACGAG	2	10	2571058	2571067	40 %	0 %	40 %	20 %	258512464
57589	NC_013205	CAG	2	6	2571077	2571082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512464
57590	NC_013205	CGG	2	6	2571105	2571110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512464
57591	NC_013205	GTA	2	6	2571149	2571154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512464
57592	NC_013205	GAT	3	9	2571173	2571181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512464
57593	NC_013205	GAT	2	6	2571185	2571190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512464
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57596	NC_013205	TGCCGG	2	12	2571556	2571567	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	258512464
57597	NC_013205	AGGGCG	2	12	2571621	2571632	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	258512464
57598	NC_013205	CAG	2	6	2571680	2571685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512464
57599	NC_013205	GC	3	6	2571791	2571796	0 %	0 %	50 %	50 %	258512464
57600	NC_013205	CGCC	2	8	2571799	2571806	0 %	0 %	25 %	75 %	258512464
57601	NC_013205	CCG	2	6	2571900	2571905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512464
57602	NC_013205	ATG	2	6	2571969	2571974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512464
57603	NC_013205	CG	3	6	2572005	2572010	0 %	0 %	50 %	50 %	258512464
57604	NC_013205	AGT	2	6	2572027	2572032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512464
57605	NC_013205	CAG	2	6	2572070	2572075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512464
57606	NC_013205	GCG	2	6	2572081	2572086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512464
57607	NC_013205	TTG	2	6	2572095	2572100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258512464
57608	NC_013205	GCCACG	2	12	2572132	2572143	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	258512464
57609	NC_013205	CGCCTC	2	12	2572163	2572174	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	258512464
57610	NC_013205	GACG	2	8	2572184	2572191	25 %	0 %	50 %	25 %	258512464
57611	NC_013205	CGA	2	6	2572228	2572233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512464
57612	NC_013205	CCG	2	6	2572269	2572274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512464
57613	NC_013205	GGC	2	6	2572379	2572384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512464
57614	NC_013205	CAGC	2	8	2572400	2572407	25 %	0 %	25 %	50 %	258512464
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57616	NC_013205	CGA	2	6	2572447	2572452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512464
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