MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
57001	NC_013205	CG	3	6	2546443	2546448	0 %	0 %	50 %	50 %	258512437
57002	NC_013205	GCA	2	6	2546472	2546477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512437
57003	NC_013205	CGTG	2	8	2546496	2546503	0 %	25 %	50 %	25 %	258512437
57004	NC_013205	CCG	2	6	2546508	2546513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512437
57005	NC_013205	GAG	2	6	2546575	2546580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512437
57006	NC_013205	TC	3	6	2546673	2546678	0 %	50 %	0 %	50 %	258512437
57007	NC_013205	GAC	2	6	2546758	2546763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512437
57008	NC_013205	GCA	2	6	2546785	2546790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512437
57009	NC_013205	CCG	2	6	2546814	2546819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512437
57010	NC_013205	ACC	3	9	2546837	2546845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512437
57011	NC_013205	CCG	2	6	2546883	2546888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512437
57012	NC_013205	AGC	2	6	2546907	2546912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512437
57013	NC_013205	CGC	2	6	2546985	2546990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512437
57014	NC_013205	GC	3	6	2547014	2547019	0 %	0 %	50 %	50 %	258512437
57015	NC_013205	GC	4	8	2547026	2547033	0 %	0 %	50 %	50 %	258512437
57016	NC_013205	GCGA	2	8	2547038	2547045	25 %	0 %	50 %	25 %	258512437
57017	NC_013205	CTT	3	9	2547118	2547126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258512437
57018	NC_013205	TCG	2	6	2547140	2547145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512437
57019	NC_013205	GAC	2	6	2547205	2547210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512438
57020	NC_013205	GC	3	6	2547328	2547333	0 %	0 %	50 %	50 %	258512438
57021	NC_013205	GC	3	6	2547376	2547381	0 %	0 %	50 %	50 %	258512438
57022	NC_013205	GCC	2	6	2547404	2547409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512438
57023	NC_013205	TCG	2	6	2547422	2547427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512438
57024	NC_013205	CAT	2	6	2547451	2547456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512438
57025	NC_013205	CGA	2	6	2547468	2547473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512438
57026	NC_013205	GCC	2	6	2547476	2547481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512438
57027	NC_013205	GAA	2	6	2547498	2547503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258512438
57028	NC_013205	CA	3	6	2547506	2547511	50 %	0 %	0 %	50 %	258512438
57029	NC_013205	TCT	2	6	2547515	2547520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258512438
57030	NC_013205	CTC	2	6	2547544	2547549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512438
57031	NC_013205	GAC	2	6	2547580	2547585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512438
57032	NC_013205	CAG	2	6	2547592	2547597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512438
57033	NC_013205	CCGG	2	8	2547679	2547686	0 %	0 %	50 %	50 %	258512438
57034	NC_013205	CGC	2	6	2547702	2547707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512438
57035	NC_013205	GC	3	6	2547720	2547725	0 %	0 %	50 %	50 %	258512438
57036	NC_013205	GC	3	6	2547799	2547804	0 %	0 %	50 %	50 %	258512438
57037	NC_013205	GCG	2	6	2547924	2547929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512438
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57039	NC_013205	CCGCGC	2	12	2547951	2547962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512438
57040	NC_013205	GAG	2	6	2547979	2547984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512438
57041	NC_013205	CGG	2	6	2548099	2548104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512438
57042	NC_013205	CCCG	2	8	2548135	2548142	0 %	0 %	25 %	75 %	258512438
57043	NC_013205	GCCC	2	8	2548214	2548221	0 %	0 %	25 %	75 %	258512438
57044	NC_013205	CCG	2	6	2548255	2548260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512438
57045	NC_013205	GCT	2	6	2548301	2548306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512438
57046	NC_013205	TGA	2	6	2548308	2548313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512438
57047	NC_013205	CCGC	2	8	2548331	2548338	0 %	0 %	25 %	75 %	258512438
57048	NC_013205	GCC	2	6	2548363	2548368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512438
57049	NC_013205	GCC	2	6	2548386	2548391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512438
57050	NC_013205	CGA	2	6	2548437	2548442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512438
57051	NC_013205	CGCA	2	8	2548501	2548508	25 %	0 %	25 %	50 %	258512438
57052	NC_013205	GTC	2	6	2548534	2548539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512438
57053	NC_013205	C	7	7	2548564	2548570	0 %	0 %	0 %	100 %	258512438
57054	NC_013205	CG	4	8	2548591	2548598	0 %	0 %	50 %	50 %	258512438
57055	NC_013205	TCC	2	6	2548625	2548630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512438
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57061	NC_013205	GC	3	6	2548763	2548768	0 %	0 %	50 %	50 %	258512439
57062	NC_013205	GCC	2	6	2548824	2548829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512439
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57070	NC_013205	CGC	2	6	2549040	2549045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512439
57071	NC_013205	TGA	2	6	2549070	2549075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512439
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57076	NC_013205	CCGCG	2	10	2549290	2549299	0 %	0 %	40 %	60 %	258512439
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57078	NC_013205	GATC	2	8	2549334	2549341	25 %	25 %	25 %	25 %	258512439
57079	NC_013205	GCG	2	6	2549399	2549404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512439
57080	NC_013205	CG	4	8	2549449	2549456	0 %	0 %	50 %	50 %	258512439
57081	NC_013205	CGT	2	6	2549485	2549490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512439
57082	NC_013205	CGCGAG	2	12	2549515	2549526	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	258512439
57083	NC_013205	CG	3	6	2549538	2549543	0 %	0 %	50 %	50 %	258512439
57084	NC_013205	CCT	3	9	2549573	2549581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57085	NC_013205	TA	3	6	2549630	2549635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57086	NC_013205	CA	4	8	2549642	2549649	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57087	NC_013205	CA	3	6	2549903	2549908	50 %	0 %	0 %	50 %	258512440
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57090	NC_013205	GCCG	2	8	2549972	2549979	0 %	0 %	50 %	50 %	258512440
57091	NC_013205	CGAG	2	8	2550008	2550015	25 %	0 %	50 %	25 %	258512440
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57101	NC_013205	TCG	2	6	2550355	2550360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512440
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57105	NC_013205	GGC	2	6	2550425	2550430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512440
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57108	NC_013205	AGCC	2	8	2550667	2550674	25 %	0 %	25 %	50 %	258512440
57109	NC_013205	GC	3	6	2550693	2550698	0 %	0 %	50 %	50 %	258512440
57110	NC_013205	CGGGCG	2	12	2550793	2550804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512441
57111	NC_013205	CCGTG	2	10	2550812	2550821	0 %	20 %	40 %	40 %	258512441
57112	NC_013205	TCGC	2	8	2550889	2550896	0 %	25 %	25 %	50 %	258512441
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57114	NC_013205	GGC	2	6	2550983	2550988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512441
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57116	NC_013205	GCCC	2	8	2551073	2551080	0 %	0 %	25 %	75 %	258512441
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57118	NC_013205	ACG	2	6	2551187	2551192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512441
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57343	NC_013205	TCAGCT	3	18	2560050	2560067	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258512451
57344	NC_013205	GC	5	10	2560140	2560149	0 %	0 %	50 %	50 %	258512451
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57346	NC_013205	CT	3	6	2560274	2560279	0 %	50 %	0 %	50 %	258512451
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57350	NC_013205	CTTC	2	8	2560470	2560477	0 %	50 %	0 %	50 %	258512451
57351	NC_013205	CTC	2	6	2560567	2560572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512451
57352	NC_013205	CTT	2	6	2560582	2560587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258512451
57353	NC_013205	CAT	2	6	2560673	2560678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57354	NC_013205	TAACA	2	10	2560696	2560705	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
57355	NC_013205	CCT	2	6	2560740	2560745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57356	NC_013205	CG	3	6	2560750	2560755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57357	NC_013205	CCG	2	6	2560774	2560779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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57472	NC_013205	CGC	2	6	2565884	2565889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512455
57473	NC_013205	CGC	2	6	2565896	2565901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512455
57474	NC_013205	CCA	2	6	2565943	2565948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512455
57475	NC_013205	CTGCG	2	10	2566033	2566042	0 %	20 %	40 %	40 %	258512455
57476	NC_013205	GCC	2	6	2566054	2566059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512455
57477	NC_013205	C	6	6	2566185	2566190	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
57478	NC_013205	AGG	2	6	2566250	2566255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57479	NC_013205	TCA	2	6	2566288	2566293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512456
57480	NC_013205	TCA	2	6	2566309	2566314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512456
57481	NC_013205	GGT	2	6	2566316	2566321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258512456
57482	NC_013205	CAC	2	6	2566439	2566444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512456
57483	NC_013205	CGG	2	6	2566451	2566456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512456
57484	NC_013205	CGT	2	6	2566546	2566551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512456
57485	NC_013205	CGAG	2	8	2566649	2566656	25 %	0 %	50 %	25 %	258512456
57486	NC_013205	CTCG	2	8	2566673	2566680	0 %	25 %	25 %	50 %	258512456
57487	NC_013205	ATC	2	6	2566761	2566766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512456
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57489	NC_013205	GCC	2	6	2566834	2566839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512456
57490	NC_013205	ACG	2	6	2566846	2566851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512456
57491	NC_013205	CGGC	2	8	2566896	2566903	0 %	0 %	50 %	50 %	258512456
57492	NC_013205	GTC	2	6	2566937	2566942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512456
57493	NC_013205	AAC	2	6	2566989	2566994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258512456
57494	NC_013205	TTC	2	6	2567001	2567006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258512456
57495	NC_013205	TAT	2	6	2567016	2567021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258512456
57496	NC_013205	CTT	3	9	2567024	2567032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258512456
57497	NC_013205	ACCTGA	2	12	2567071	2567082	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	258512456
57498	NC_013205	GTCG	2	8	2567084	2567091	0 %	25 %	50 %	25 %	258512456
57499	NC_013205	TGT	2	6	2567131	2567136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258512456
57500	NC_013205	TC	3	6	2567150	2567155	0 %	50 %	0 %	50 %	258512456

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