MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56501	NC_013205	ACG	2	6	2525281	2525286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512418
56502	NC_013205	GC	3	6	2525305	2525310	0 %	0 %	50 %	50 %	258512418
56503	NC_013205	GA	3	6	2525327	2525332	50 %	0 %	50 %	0 %	258512418
56504	NC_013205	CGA	2	6	2525356	2525361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512418
56505	NC_013205	GC	3	6	2525390	2525395	0 %	0 %	50 %	50 %	258512418
56506	NC_013205	GGC	2	6	2525414	2525419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512418
56507	NC_013205	CCT	2	6	2525485	2525490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56508	NC_013205	GTG	2	6	2525514	2525519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258512419
56509	NC_013205	GAC	2	6	2525531	2525536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512419
56510	NC_013205	GAAG	2	8	2525545	2525552	50 %	0 %	50 %	0 %	258512419
56511	NC_013205	AAG	3	9	2525550	2525558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258512419
56512	NC_013205	CTC	2	6	2525612	2525617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512419
56513	NC_013205	GA	3	6	2525695	2525700	50 %	0 %	50 %	0 %	258512419
56514	NC_013205	GTG	2	6	2525739	2525744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258512419
56515	NC_013205	TAG	2	6	2525913	2525918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512419
56516	NC_013205	GCA	2	6	2525980	2525985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512419
56517	NC_013205	ATC	2	6	2525994	2525999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512419
56518	NC_013205	ATG	2	6	2526000	2526005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512419
56519	NC_013205	CG	3	6	2526039	2526044	0 %	0 %	50 %	50 %	258512419
56520	NC_013205	GACA	2	8	2526083	2526090	50 %	0 %	25 %	25 %	258512419
56521	NC_013205	GAT	2	6	2526281	2526286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512419
56522	NC_013205	CCGCG	2	10	2526315	2526324	0 %	0 %	40 %	60 %	258512419
56523	NC_013205	CTC	2	6	2526350	2526355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56524	NC_013205	CCA	2	6	2526422	2526427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512420
56525	NC_013205	CCT	2	6	2526485	2526490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512420
56526	NC_013205	CCGT	2	8	2526535	2526542	0 %	25 %	25 %	50 %	258512420
56527	NC_013205	TGA	2	6	2526578	2526583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512420
56528	NC_013205	GAA	2	6	2526600	2526605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258512420
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56531	NC_013205	ATC	3	9	2526724	2526732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512420
56532	NC_013205	GCA	2	6	2526755	2526760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512420
56533	NC_013205	CGA	2	6	2526818	2526823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512420
56534	NC_013205	TTG	2	6	2526835	2526840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258512420
56535	NC_013205	TTG	2	6	2526864	2526869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258512420
56536	NC_013205	GTA	2	6	2526915	2526920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512420
56537	NC_013205	GAG	2	6	2526960	2526965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512420
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56542	NC_013205	CGG	2	6	2527323	2527328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512420
56543	NC_013205	CGC	2	6	2527360	2527365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512421
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56546	NC_013205	TGC	2	6	2527485	2527490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512421
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56550	NC_013205	GAC	2	6	2527602	2527607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512421
56551	NC_013205	GTT	2	6	2527652	2527657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258512421
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56553	NC_013205	TGC	2	6	2527686	2527691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512421
56554	NC_013205	CTC	2	6	2527748	2527753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512421
56555	NC_013205	CGG	2	6	2527769	2527774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512421
56556	NC_013205	GAC	2	6	2527817	2527822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512421
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56559	NC_013205	AGT	2	6	2527951	2527956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512421
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56561	NC_013205	TCG	3	9	2528064	2528072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512421
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56565	NC_013205	CCTT	2	8	2528316	2528323	0 %	50 %	0 %	50 %	258512421
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56568	NC_013205	CTTC	2	8	2528500	2528507	0 %	50 %	0 %	50 %	258512421
56569	NC_013205	ACC	2	6	2528538	2528543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512421
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56574	NC_013205	CGC	2	6	2528818	2528823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512422
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56581	NC_013205	CT	3	6	2529110	2529115	0 %	50 %	0 %	50 %	258512422
56582	NC_013205	TCCATC	2	12	2529131	2529142	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	258512422
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56586	NC_013205	CAC	2	6	2529298	2529303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512422
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56588	NC_013205	CGG	2	6	2529414	2529419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512422
56589	NC_013205	GCC	2	6	2529427	2529432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512422
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56608	NC_013205	GTC	2	6	2530197	2530202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512423
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56736	NC_013205	CCG	2	6	2535219	2535224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512428
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56793	NC_013205	GCGG	2	8	2537301	2537308	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
56794	NC_013205	GAGC	2	8	2537377	2537384	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56795	NC_013205	TTTA	2	8	2537407	2537414	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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56797	NC_013205	TG	4	8	2537438	2537445	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56798	NC_013205	ACC	2	6	2537476	2537481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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56824	NC_013205	CG	5	10	2538714	2538723	0 %	0 %	50 %	50 %	258512431
56825	NC_013205	CACTT	2	10	2538772	2538781	20 %	40 %	0 %	40 %	258512431
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56835	NC_013205	GCG	2	6	2539308	2539313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512432
56836	NC_013205	GAT	2	6	2539399	2539404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512432
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56839	NC_013205	TCG	2	6	2539518	2539523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512432
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56841	NC_013205	GAT	2	6	2539543	2539548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512432
56842	NC_013205	ATCTGC	2	12	2539598	2539609	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258512432
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56848	NC_013205	CGC	2	6	2540124	2540129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512432
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56851	NC_013205	GCCG	2	8	2540262	2540269	0 %	0 %	50 %	50 %	258512433
56852	NC_013205	ACG	2	6	2540333	2540338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512433
56853	NC_013205	CGG	2	6	2540343	2540348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512433
56854	NC_013205	GCGA	2	8	2540413	2540420	25 %	0 %	50 %	25 %	258512433
56855	NC_013205	ACC	2	6	2540422	2540427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512433
56856	NC_013205	TGC	2	6	2540429	2540434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512433
56857	NC_013205	ACG	2	6	2540437	2540442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512433
56858	NC_013205	CG	3	6	2540461	2540466	0 %	0 %	50 %	50 %	258512433
56859	NC_013205	CCA	2	6	2540504	2540509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512433
56860	NC_013205	CGAG	2	8	2540534	2540541	25 %	0 %	50 %	25 %	258512433
56861	NC_013205	GC	3	6	2540550	2540555	0 %	0 %	50 %	50 %	258512433
56862	NC_013205	ATC	2	6	2540590	2540595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512433
56863	NC_013205	ATCAGG	2	12	2540623	2540634	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	258512433
56864	NC_013205	GAA	3	9	2540637	2540645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258512433
56865	NC_013205	GC	3	6	2540674	2540679	0 %	0 %	50 %	50 %	258512433
56866	NC_013205	GAT	2	6	2540685	2540690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512433
56867	NC_013205	GAT	2	6	2540694	2540699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512433
56868	NC_013205	GCC	2	6	2540700	2540705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512433
56869	NC_013205	CGT	2	6	2540816	2540821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512433
56870	NC_013205	TGC	2	6	2540848	2540853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512433
56871	NC_013205	AAG	2	6	2540855	2540860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258512433
56872	NC_013205	GAT	2	6	2540922	2540927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512433
56873	NC_013205	GAT	2	6	2540931	2540936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512433
56874	NC_013205	CGC	2	6	2541031	2541036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512433
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56876	NC_013205	CCT	2	6	2541079	2541084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56877	NC_013205	ATCC	2	8	2541130	2541137	25 %	25 %	0 %	50 %	258512434
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56883	NC_013205	CGG	2	6	2541516	2541521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512434
56884	NC_013205	ACG	2	6	2541560	2541565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512434
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56905	NC_013205	GTA	2	6	2542235	2542240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512435
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56968	NC_013205	TCG	2	6	2545217	2545222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512436
56969	NC_013205	GC	3	6	2545290	2545295	0 %	0 %	50 %	50 %	258512436
56970	NC_013205	CG	3	6	2545309	2545314	0 %	0 %	50 %	50 %	258512436
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56988	NC_013205	GCA	2	6	2545851	2545856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512436
56989	NC_013205	CG	3	6	2545879	2545884	0 %	0 %	50 %	50 %	258512436
56990	NC_013205	CCG	2	6	2545979	2545984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512436
56991	NC_013205	CGC	2	6	2546079	2546084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512436
56992	NC_013205	A	6	6	2546109	2546114	100 %	0 %	0 %	0 %	258512436
56993	NC_013205	GA	3	6	2546167	2546172	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56994	NC_013205	CCA	2	6	2546229	2546234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512437
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56996	NC_013205	CGGC	2	8	2546271	2546278	0 %	0 %	50 %	50 %	258512437
56997	NC_013205	CGAG	2	8	2546300	2546307	25 %	0 %	50 %	25 %	258512437
56998	NC_013205	ATC	2	6	2546333	2546338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512437
56999	NC_013205	CCG	2	6	2546355	2546360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512437
57000	NC_013205	CG	3	6	2546359	2546364	0 %	0 %	50 %	50 %	258512437

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