MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56001	NC_013205	GCA	2	6	2504334	2504339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512401
56002	NC_013205	GAG	2	6	2504343	2504348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512401
56003	NC_013205	GCC	2	6	2504409	2504414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512401
56004	NC_013205	GCG	2	6	2504420	2504425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512401
56005	NC_013205	CG	3	6	2504424	2504429	0 %	0 %	50 %	50 %	258512401
56006	NC_013205	GGT	2	6	2504474	2504479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258512401
56007	NC_013205	ACG	2	6	2504512	2504517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512401
56008	NC_013205	CG	3	6	2504528	2504533	0 %	0 %	50 %	50 %	258512401
56009	NC_013205	C	6	6	2504548	2504553	0 %	0 %	0 %	100 %	258512402
56010	NC_013205	TCA	2	6	2504595	2504600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512402
56011	NC_013205	GC	4	8	2504712	2504719	0 %	0 %	50 %	50 %	258512402
56012	NC_013205	GTA	2	6	2504720	2504725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512402
56013	NC_013205	CG	3	6	2504732	2504737	0 %	0 %	50 %	50 %	258512402
56014	NC_013205	GGCG	2	8	2504768	2504775	0 %	0 %	75 %	25 %	258512402
56015	NC_013205	CG	4	8	2504851	2504858	0 %	0 %	50 %	50 %	258512402
56016	NC_013205	GC	3	6	2504899	2504904	0 %	0 %	50 %	50 %	258512402
56017	NC_013205	CG	3	6	2504916	2504921	0 %	0 %	50 %	50 %	258512402
56018	NC_013205	GC	4	8	2504929	2504936	0 %	0 %	50 %	50 %	258512402
56019	NC_013205	GCAC	2	8	2504959	2504966	25 %	0 %	25 %	50 %	258512402
56020	NC_013205	TCG	2	6	2504991	2504996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512402
56021	NC_013205	GAC	2	6	2505125	2505130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512402
56022	NC_013205	GAC	2	6	2505138	2505143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512402
56023	NC_013205	GTC	2	6	2505152	2505157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512402
56024	NC_013205	GGC	2	6	2505164	2505169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512402
56025	NC_013205	CGG	2	6	2505184	2505189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512402
56026	NC_013205	GGC	2	6	2505203	2505208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512402
56027	NC_013205	CGT	2	6	2505235	2505240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512402
56028	NC_013205	GGCGC	2	10	2505275	2505284	0 %	0 %	60 %	40 %	258512402
56029	NC_013205	GGCG	2	8	2505287	2505294	0 %	0 %	75 %	25 %	258512402
56030	NC_013205	GCA	2	6	2505295	2505300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512402
56031	NC_013205	GTA	2	6	2505311	2505316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512402
56032	NC_013205	CG	3	6	2505334	2505339	0 %	0 %	50 %	50 %	258512402
56033	NC_013205	GCCAAA	2	12	2505363	2505374	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	258512402
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56035	NC_013205	CGC	2	6	2505402	2505407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512403
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56037	NC_013205	GGC	2	6	2505486	2505491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512403
56038	NC_013205	CGC	2	6	2505513	2505518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512403
56039	NC_013205	GCG	2	6	2505552	2505557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512403
56040	NC_013205	CCGT	2	8	2505638	2505645	0 %	25 %	25 %	50 %	258512403
56041	NC_013205	GTC	2	6	2505664	2505669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512403
56042	NC_013205	CG	4	8	2505697	2505704	0 %	0 %	50 %	50 %	258512403
56043	NC_013205	GC	5	10	2505793	2505802	0 %	0 %	50 %	50 %	258512403
56044	NC_013205	TCG	2	6	2505803	2505808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512403
56045	NC_013205	CCGA	2	8	2505838	2505845	25 %	0 %	25 %	50 %	258512403
56046	NC_013205	AGT	2	6	2505867	2505872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512403
56047	NC_013205	TCC	2	6	2505881	2505886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512403
56048	NC_013205	GGCG	2	8	2505997	2506004	0 %	0 %	75 %	25 %	258512403
56049	NC_013205	TGG	2	6	2506005	2506010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258512403
56050	NC_013205	CG	3	6	2506024	2506029	0 %	0 %	50 %	50 %	258512403
56051	NC_013205	TCC	2	6	2506037	2506042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512403
56052	NC_013205	GGC	2	6	2506057	2506062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512403
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56054	NC_013205	CGC	2	6	2506101	2506106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512403
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56062	NC_013205	GC	3	6	2506431	2506436	0 %	0 %	50 %	50 %	258512404
56063	NC_013205	GCC	2	6	2506455	2506460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512404
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56065	NC_013205	TGC	2	6	2506579	2506584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512404
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56067	NC_013205	ACC	2	6	2506654	2506659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512404
56068	NC_013205	CG	3	6	2506743	2506748	0 %	0 %	50 %	50 %	258512404
56069	NC_013205	CGG	2	6	2506824	2506829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512404
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56078	NC_013205	GC	3	6	2507188	2507193	0 %	0 %	50 %	50 %	258512404
56079	NC_013205	CATC	2	8	2507247	2507254	25 %	25 %	0 %	50 %	258512404
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56084	NC_013205	CCAC	2	8	2507508	2507515	25 %	0 %	0 %	75 %	258512404
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56093	NC_013205	TGAA	2	8	2507803	2507810	50 %	25 %	25 %	0 %	258512404
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56101	NC_013205	AGGAG	2	10	2508083	2508092	40 %	0 %	60 %	0 %	258512404
56102	NC_013205	CG	3	6	2508102	2508107	0 %	0 %	50 %	50 %	258512404
56103	NC_013205	CG	3	6	2508118	2508123	0 %	0 %	50 %	50 %	258512404
56104	NC_013205	CCA	2	6	2508137	2508142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512404
56105	NC_013205	TGA	2	6	2508176	2508181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56106	NC_013205	AGC	2	6	2508235	2508240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512405
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56108	NC_013205	GCCG	2	8	2508346	2508353	0 %	0 %	50 %	50 %	258512405
56109	NC_013205	GCG	2	6	2508362	2508367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512405
56110	NC_013205	TCG	2	6	2508379	2508384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512405
56111	NC_013205	CG	3	6	2508516	2508521	0 %	0 %	50 %	50 %	258512405
56112	NC_013205	TCC	2	6	2508559	2508564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512405
56113	NC_013205	CGTCGG	2	12	2508639	2508650	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	258512405
56114	NC_013205	CGT	2	6	2508656	2508661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512405
56115	NC_013205	CGG	2	6	2508710	2508715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512405
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56117	NC_013205	CCG	2	6	2508836	2508841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512405
56118	NC_013205	GCC	2	6	2508870	2508875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512405
56119	NC_013205	CGT	3	9	2508938	2508946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512405
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56172	NC_013205	A	6	6	2510847	2510852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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56174	NC_013205	GCCC	2	8	2510930	2510937	0 %	0 %	25 %	75 %	258512408
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56203	NC_013205	CCTC	2	8	2512013	2512020	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
56204	NC_013205	TCCG	2	8	2512023	2512030	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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56218	NC_013205	CG	4	8	2512535	2512542	0 %	0 %	50 %	50 %	258512409
56219	NC_013205	CGT	2	6	2512564	2512569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512409
56220	NC_013205	GTTC	2	8	2512600	2512607	0 %	50 %	25 %	25 %	258512409
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56224	NC_013205	GC	3	6	2512773	2512778	0 %	0 %	50 %	50 %	258512409
56225	NC_013205	CTG	2	6	2512819	2512824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512409
56226	NC_013205	TGC	2	6	2512854	2512859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512409
56227	NC_013205	GGCG	2	8	2512934	2512941	0 %	0 %	75 %	25 %	258512409
56228	NC_013205	ACG	2	6	2512947	2512952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512409
56229	NC_013205	TTGG	2	8	2513018	2513025	0 %	50 %	50 %	0 %	258512409
56230	NC_013205	TCC	2	6	2513058	2513063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512409
56231	NC_013205	GAAGCC	2	12	2513201	2513212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512409
56232	NC_013205	GC	3	6	2513243	2513248	0 %	0 %	50 %	50 %	258512409
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56234	NC_013205	GCGT	2	8	2513336	2513343	0 %	25 %	50 %	25 %	258512409
56235	NC_013205	TCGGA	2	10	2513347	2513356	20 %	20 %	40 %	20 %	258512409
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56249	NC_013205	C	6	6	2514016	2514021	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
56250	NC_013205	CAT	2	6	2514040	2514045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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56255	NC_013205	TGT	2	6	2514211	2514216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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56350	NC_013205	CG	3	6	2518417	2518422	0 %	0 %	50 %	50 %	258512413
56351	NC_013205	GAT	2	6	2518451	2518456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512413
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56353	NC_013205	CG	3	6	2518621	2518626	0 %	0 %	50 %	50 %	258512413
56354	NC_013205	CGA	2	6	2518666	2518671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512413
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56455	NC_013205	GCG	2	6	2523291	2523296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512417
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56458	NC_013205	GC	3	6	2523416	2523421	0 %	0 %	50 %	50 %	258512417
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56467	NC_013205	GAC	2	6	2523794	2523799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512417
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56469	NC_013205	TTCA	2	8	2523830	2523837	25 %	50 %	0 %	25 %	258512417
56470	NC_013205	GC	4	8	2523863	2523870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56471	NC_013205	GTC	2	6	2523883	2523888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56472	NC_013205	GCG	2	6	2523909	2523914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56473	NC_013205	TCT	2	6	2523939	2523944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56474	NC_013205	GCG	2	6	2524033	2524038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512418
56475	NC_013205	CGT	2	6	2524060	2524065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512418
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56489	NC_013205	CGT	2	6	2524624	2524629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512418
56490	NC_013205	GAC	2	6	2524634	2524639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512418
56491	NC_013205	GTC	2	6	2524766	2524771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512418
56492	NC_013205	CCA	2	6	2524835	2524840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512418
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56499	NC_013205	GCC	2	6	2525190	2525195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512418
56500	NC_013205	TG	3	6	2525205	2525210	0 %	50 %	50 %	0 %	258512418

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