MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54501	NC_013205	CTC	2	6	2442771	2442776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54502	NC_013205	CGC	2	6	2442780	2442785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54503	NC_013205	GAG	2	6	2442812	2442817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512342
54504	NC_013205	CCCG	2	8	2442909	2442916	0 %	0 %	25 %	75 %	258512342
54505	NC_013205	CCG	2	6	2442940	2442945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512342
54506	NC_013205	TGGAT	2	10	2442968	2442977	20 %	40 %	40 %	0 %	258512342
54507	NC_013205	TCGAA	2	10	2443006	2443015	40 %	20 %	20 %	20 %	258512342
54508	NC_013205	CAC	2	6	2443112	2443117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512342
54509	NC_013205	GCC	2	6	2443157	2443162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512342
54510	NC_013205	CCG	2	6	2443170	2443175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512342
54511	NC_013205	ACC	2	6	2443185	2443190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512342
54512	NC_013205	CGA	2	6	2443198	2443203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512342
54513	NC_013205	TGG	2	6	2443206	2443211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258512342
54514	NC_013205	GAG	2	6	2443231	2443236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512342
54515	NC_013205	GTC	3	9	2443260	2443268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512342
54516	NC_013205	CG	4	8	2443317	2443324	0 %	0 %	50 %	50 %	258512342
54517	NC_013205	C	8	8	2443340	2443347	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
54518	NC_013205	GCG	2	6	2443379	2443384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54519	NC_013205	CCGC	2	8	2443407	2443414	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54520	NC_013205	GC	4	8	2443506	2443513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54521	NC_013205	ATG	2	6	2443550	2443555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54522	NC_013205	ACG	2	6	2443560	2443565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54523	NC_013205	CGG	2	6	2443574	2443579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54524	NC_013205	GAG	2	6	2443588	2443593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54525	NC_013205	CG	3	6	2443607	2443612	0 %	0 %	50 %	50 %	258512343
54526	NC_013205	CGG	2	6	2443660	2443665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512343
54527	NC_013205	GC	3	6	2443788	2443793	0 %	0 %	50 %	50 %	258512343
54528	NC_013205	CCG	2	6	2443815	2443820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512343
54529	NC_013205	GACGCT	2	12	2443828	2443839	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258512343
54530	NC_013205	GCT	2	6	2443891	2443896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512343
54531	NC_013205	GTCC	2	8	2443945	2443952	0 %	25 %	25 %	50 %	258512343
54532	NC_013205	TGGCA	2	10	2443967	2443976	20 %	20 %	40 %	20 %	258512343
54533	NC_013205	CCCG	2	8	2444029	2444036	0 %	0 %	25 %	75 %	258512343
54534	NC_013205	GAG	2	6	2444111	2444116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512343
54535	NC_013205	ATG	2	6	2444234	2444239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512343
54536	NC_013205	ATG	2	6	2444300	2444305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512343
54537	NC_013205	CGGGG	2	10	2444308	2444317	0 %	0 %	80 %	20 %	258512343
54538	NC_013205	GGCATG	2	12	2444327	2444338	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258512343
54539	NC_013205	TGC	2	6	2444391	2444396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512343
54540	NC_013205	CCTCC	2	10	2444402	2444411	0 %	20 %	0 %	80 %	258512343
54541	NC_013205	CGA	2	6	2444437	2444442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512343
54542	NC_013205	CGA	2	6	2444455	2444460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512343
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54545	NC_013205	GC	3	6	2444598	2444603	0 %	0 %	50 %	50 %	258512343
54546	NC_013205	CGT	2	6	2444611	2444616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512343
54547	NC_013205	ACG	2	6	2444694	2444699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512343
54548	NC_013205	CG	3	6	2444777	2444782	0 %	0 %	50 %	50 %	258512343
54549	NC_013205	GCC	2	6	2444831	2444836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512343
54550	NC_013205	CG	4	8	2444839	2444846	0 %	0 %	50 %	50 %	258512343
54551	NC_013205	ACA	2	6	2444934	2444939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258512343
54552	NC_013205	GCG	2	6	2445254	2445259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512343
54553	NC_013205	GCTT	2	8	2445337	2445344	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54554	NC_013205	CGC	2	6	2445375	2445380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512344
54555	NC_013205	CAC	2	6	2445411	2445416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512344
54556	NC_013205	TCG	3	9	2445424	2445432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512344
54557	NC_013205	AGC	2	6	2445454	2445459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512344
54558	NC_013205	CGG	2	6	2445503	2445508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512344
54559	NC_013205	GAG	3	9	2445525	2445533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512344
54560	NC_013205	CGA	2	6	2445578	2445583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512344
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54562	NC_013205	CG	3	6	2445633	2445638	0 %	0 %	50 %	50 %	258512344
54563	NC_013205	TTG	2	6	2445664	2445669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258512344
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54568	NC_013205	GAA	2	6	2445816	2445821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258512344
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54570	NC_013205	GAG	2	6	2445973	2445978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512345
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54573	NC_013205	CCCG	2	8	2446018	2446025	0 %	0 %	25 %	75 %	258512345
54574	NC_013205	CTC	2	6	2446045	2446050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512345
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54579	NC_013205	GC	3	6	2446297	2446302	0 %	0 %	50 %	50 %	258512346
54580	NC_013205	TGC	2	6	2446368	2446373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512346
54581	NC_013205	CG	4	8	2446374	2446381	0 %	0 %	50 %	50 %	258512346
54582	NC_013205	GCTCAC	2	12	2446405	2446416	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	258512346
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54587	NC_013205	GC	3	6	2446851	2446856	0 %	0 %	50 %	50 %	258512347
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54591	NC_013205	TGGC	2	8	2446960	2446967	0 %	25 %	50 %	25 %	258512347
54592	NC_013205	GC	3	6	2446992	2446997	0 %	0 %	50 %	50 %	258512347
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54598	NC_013205	CA	3	6	2447201	2447206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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54606	NC_013205	CG	3	6	2447546	2447551	0 %	0 %	50 %	50 %	258512348
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54616	NC_013205	CG	3	6	2447792	2447797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54617	NC_013205	T	6	6	2447851	2447856	0 %	100 %	0 %	0 %	258512349
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54692	NC_013205	CCT	2	6	2451088	2451093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512351
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54695	NC_013205	GGC	2	6	2451196	2451201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512351
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54710	NC_013205	CG	3	6	2451643	2451648	0 %	0 %	50 %	50 %	258512351
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54713	NC_013205	TCC	3	9	2451780	2451788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512351
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54717	NC_013205	TCG	2	6	2452033	2452038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512351
54718	NC_013205	CGCC	2	8	2452081	2452088	0 %	0 %	25 %	75 %	258512351
54719	NC_013205	GTA	2	6	2452124	2452129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512351
54720	NC_013205	AGCCGC	2	12	2452146	2452157	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	258512351
54721	NC_013205	CATG	2	8	2452234	2452241	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54722	NC_013205	TTC	2	6	2452246	2452251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54723	NC_013205	CG	3	6	2452330	2452335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54724	NC_013205	GCC	2	6	2452346	2452351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54725	NC_013205	AGG	2	6	2452423	2452428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54726	NC_013205	TGGA	2	8	2452528	2452535	25 %	25 %	50 %	0 %	258512352
54727	NC_013205	AAAAG	2	10	2452683	2452692	80 %	0 %	20 %	0 %	258512352
54728	NC_013205	GGCG	2	8	2452737	2452744	0 %	0 %	75 %	25 %	258512352
54729	NC_013205	GAG	2	6	2452756	2452761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512352
54730	NC_013205	CGT	2	6	2452866	2452871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512352
54731	NC_013205	TCC	2	6	2452898	2452903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512352
54732	NC_013205	CGAG	2	8	2452907	2452914	25 %	0 %	50 %	25 %	258512352
54733	NC_013205	AGG	2	6	2452925	2452930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512352
54734	NC_013205	GAG	2	6	2452966	2452971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512352
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54736	NC_013205	AGA	2	6	2453042	2453047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258512352
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54858	NC_013205	CGG	2	6	2457490	2457495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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54971	NC_013205	GTG	2	6	2461607	2461612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258512361
54972	NC_013205	GAT	2	6	2461648	2461653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512361
54973	NC_013205	CCA	2	6	2461689	2461694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512361
54974	NC_013205	CGC	2	6	2461728	2461733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512361
54975	NC_013205	TCG	2	6	2461739	2461744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512361
54976	NC_013205	GGT	2	6	2461749	2461754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258512361
54977	NC_013205	CCGCG	2	10	2461840	2461849	0 %	0 %	40 %	60 %	258512361
54978	NC_013205	CG	3	6	2461908	2461913	0 %	0 %	50 %	50 %	258512361
54979	NC_013205	CTG	2	6	2461948	2461953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512361
54980	NC_013205	TCC	2	6	2461961	2461966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512361
54981	NC_013205	GCC	2	6	2462011	2462016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512361
54982	NC_013205	GCC	3	9	2462089	2462097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512361
54983	NC_013205	GCA	2	6	2462103	2462108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512361
54984	NC_013205	CA	3	6	2462107	2462112	50 %	0 %	0 %	50 %	258512361
54985	NC_013205	CGC	2	6	2462115	2462120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512361
54986	NC_013205	TGA	2	6	2462124	2462129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512361
54987	NC_013205	GCGCC	2	10	2462133	2462142	0 %	0 %	40 %	60 %	258512361
54988	NC_013205	GC	4	8	2462148	2462155	0 %	0 %	50 %	50 %	258512361
54989	NC_013205	GC	3	6	2462176	2462181	0 %	0 %	50 %	50 %	258512361
54990	NC_013205	CAT	2	6	2462182	2462187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512361
54991	NC_013205	TCG	4	12	2462189	2462200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512361
54992	NC_013205	TGCGG	2	10	2462235	2462244	0 %	20 %	60 %	20 %	258512361
54993	NC_013205	CATC	2	8	2462299	2462306	25 %	25 %	0 %	50 %	258512361
54994	NC_013205	TC	3	6	2462305	2462310	0 %	50 %	0 %	50 %	258512361
54995	NC_013205	CAT	2	6	2462314	2462319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512361
54996	NC_013205	GC	3	6	2462348	2462353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54997	NC_013205	CA	3	6	2462356	2462361	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54998	NC_013205	TTA	2	6	2462437	2462442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54999	NC_013205	GCG	2	6	2462470	2462475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55000	NC_013205	ACC	2	6	2462512	2462517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512362

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