MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53501	NC_013205	CGC	2	6	2402487	2402492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512301
53502	NC_013205	TCC	2	6	2402501	2402506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512301
53503	NC_013205	GC	3	6	2402562	2402567	0 %	0 %	50 %	50 %	258512301
53504	NC_013205	GC	3	6	2402624	2402629	0 %	0 %	50 %	50 %	258512301
53505	NC_013205	GCCGC	2	10	2402661	2402670	0 %	0 %	40 %	60 %	258512301
53506	NC_013205	GCGCG	2	10	2402745	2402754	0 %	0 %	60 %	40 %	258512301
53507	NC_013205	CATC	2	8	2402865	2402872	25 %	25 %	0 %	50 %	258512301
53508	NC_013205	CAT	2	6	2402902	2402907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512301
53509	NC_013205	GCC	2	6	2402939	2402944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512301
53510	NC_013205	AG	4	8	2402947	2402954	50 %	0 %	50 %	0 %	258512301
53511	NC_013205	CCA	2	6	2402997	2403002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512301
53512	NC_013205	CGT	2	6	2403073	2403078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512301
53513	NC_013205	GATC	2	8	2403093	2403100	25 %	25 %	25 %	25 %	258512301
53514	NC_013205	AGG	2	6	2403128	2403133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512301
53515	NC_013205	AAG	2	6	2403134	2403139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258512301
53516	NC_013205	TCCG	2	8	2403281	2403288	0 %	25 %	25 %	50 %	258512301
53517	NC_013205	CGC	2	6	2403298	2403303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512301
53518	NC_013205	CGC	2	6	2403362	2403367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512301
53519	NC_013205	TCC	2	6	2403377	2403382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53520	NC_013205	CGC	2	6	2403410	2403415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53521	NC_013205	AAG	2	6	2403441	2403446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258512302
53522	NC_013205	CGC	2	6	2403478	2403483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512302
53523	NC_013205	AGGA	2	8	2403500	2403507	50 %	0 %	50 %	0 %	258512302
53524	NC_013205	ACG	2	6	2403518	2403523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512302
53525	NC_013205	GGC	2	6	2403524	2403529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512302
53526	NC_013205	GC	3	6	2403548	2403553	0 %	0 %	50 %	50 %	258512302
53527	NC_013205	CTG	2	6	2403592	2403597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512302
53528	NC_013205	ATGCG	2	10	2403674	2403683	20 %	20 %	40 %	20 %	258512302
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53531	NC_013205	CGCC	2	8	2404071	2404078	0 %	0 %	25 %	75 %	258512302
53532	NC_013205	ACG	2	6	2404166	2404171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512302
53533	NC_013205	CCTG	2	8	2404187	2404194	0 %	25 %	25 %	50 %	258512302
53534	NC_013205	CAC	2	6	2404199	2404204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512302
53535	NC_013205	CTCGG	2	10	2404220	2404229	0 %	20 %	40 %	40 %	258512302
53536	NC_013205	GC	3	6	2404234	2404239	0 %	0 %	50 %	50 %	258512302
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53538	NC_013205	AGCG	2	8	2404291	2404298	25 %	0 %	50 %	25 %	258512302
53539	NC_013205	CTC	2	6	2404329	2404334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53540	NC_013205	ATC	2	6	2404384	2404389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53541	NC_013205	TCC	2	6	2404430	2404435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53542	NC_013205	GACG	2	8	2404445	2404452	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53543	NC_013205	GCGT	2	8	2404460	2404467	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53544	NC_013205	CT	3	6	2404489	2404494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53545	NC_013205	CG	3	6	2404565	2404570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53546	NC_013205	ATC	3	9	2404586	2404594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53547	NC_013205	AGA	2	6	2404700	2404705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53548	NC_013205	TTC	2	6	2404743	2404748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53549	NC_013205	GCC	2	6	2404760	2404765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53550	NC_013205	CCGA	2	8	2404805	2404812	25 %	0 %	25 %	50 %	258512303
53551	NC_013205	GC	3	6	2404843	2404848	0 %	0 %	50 %	50 %	258512303
53552	NC_013205	GGT	2	6	2404903	2404908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258512303
53553	NC_013205	GC	3	6	2404930	2404935	0 %	0 %	50 %	50 %	258512303
53554	NC_013205	CG	3	6	2404993	2404998	0 %	0 %	50 %	50 %	258512303
53555	NC_013205	GCGTGC	2	12	2405070	2405081	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	258512303
53556	NC_013205	TCG	2	6	2405118	2405123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512303
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53558	NC_013205	GACGTG	2	12	2405150	2405161	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258512303
53559	NC_013205	AGCG	3	12	2405180	2405191	25 %	0 %	50 %	25 %	258512303
53560	NC_013205	GCT	2	6	2405194	2405199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512303
53561	NC_013205	G	6	6	2405212	2405217	0 %	0 %	100 %	0 %	258512303
53562	NC_013205	ACC	2	6	2405226	2405231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512303
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53574	NC_013205	GCC	2	6	2405684	2405689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512304
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53579	NC_013205	CGA	2	6	2405938	2405943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512304
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53589	NC_013205	CCG	2	6	2406300	2406305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512305
53590	NC_013205	CTG	2	6	2406322	2406327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512305
53591	NC_013205	CG	3	6	2406330	2406335	0 %	0 %	50 %	50 %	258512305
53592	NC_013205	T	6	6	2406398	2406403	0 %	100 %	0 %	0 %	258512305
53593	NC_013205	CGTCC	2	10	2406412	2406421	0 %	20 %	20 %	60 %	258512305
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53601	NC_013205	GT	3	6	2406666	2406671	0 %	50 %	50 %	0 %	258512306
53602	NC_013205	TCT	2	6	2406692	2406697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258512306
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53604	NC_013205	GC	3	6	2406733	2406738	0 %	0 %	50 %	50 %	258512306
53605	NC_013205	GACCG	2	10	2406796	2406805	20 %	0 %	40 %	40 %	258512306
53606	NC_013205	GC	4	8	2406826	2406833	0 %	0 %	50 %	50 %	258512306
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53611	NC_013205	GGC	2	6	2407001	2407006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512306
53612	NC_013205	CGTG	2	8	2407178	2407185	0 %	25 %	50 %	25 %	258512306
53613	NC_013205	GA	3	6	2407244	2407249	50 %	0 %	50 %	0 %	258512306
53614	NC_013205	GAG	2	6	2407251	2407256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512306
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53616	NC_013205	CGC	2	6	2407460	2407465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512306
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53737	NC_013205	CCT	2	6	2412511	2412516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512310
53738	NC_013205	CCT	2	6	2412535	2412540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512310
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53742	NC_013205	CG	3	6	2412745	2412750	0 %	0 %	50 %	50 %	258512310
53743	NC_013205	TCT	2	6	2412793	2412798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258512310
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53764	NC_013205	CGT	2	6	2413657	2413662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512311
53765	NC_013205	CGG	2	6	2413711	2413716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512311
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53841	NC_013205	CG	3	6	2416884	2416889	0 %	0 %	50 %	50 %	258512314
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53844	NC_013205	GCGG	2	8	2416949	2416956	0 %	0 %	75 %	25 %	258512314
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53853	NC_013205	GC	3	6	2417232	2417237	0 %	0 %	50 %	50 %	258512314
53854	NC_013205	ATCGA	2	10	2417259	2417268	40 %	20 %	20 %	20 %	258512314
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53875	NC_013205	GC	3	6	2418150	2418155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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53965	NC_013205	GCC	2	6	2421657	2421662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512318
53966	NC_013205	TCGAG	2	10	2421693	2421702	20 %	20 %	40 %	20 %	258512318
53967	NC_013205	CGAT	2	8	2421707	2421714	25 %	25 %	25 %	25 %	258512318
53968	NC_013205	AGCGTC	2	12	2421716	2421727	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258512318
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53970	NC_013205	GTC	2	6	2421802	2421807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512318
53971	NC_013205	GAT	2	6	2421853	2421858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512318
53972	NC_013205	CGCC	2	8	2421861	2421868	0 %	0 %	25 %	75 %	258512318
53973	NC_013205	GTG	2	6	2421883	2421888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258512318
53974	NC_013205	GCC	2	6	2421911	2421916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512318
53975	NC_013205	GCC	2	6	2421924	2421929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512318
53976	NC_013205	CGA	2	6	2421948	2421953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512318
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53979	NC_013205	CGA	2	6	2422035	2422040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512318
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53981	NC_013205	CGC	2	6	2422167	2422172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512318
53982	NC_013205	CTCGAA	2	12	2422177	2422188	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	258512318
53983	NC_013205	CG	4	8	2422215	2422222	0 %	0 %	50 %	50 %	258512318
53984	NC_013205	CGC	2	6	2422306	2422311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512318
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53990	NC_013205	GCA	2	6	2422497	2422502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512318
53991	NC_013205	CCG	2	6	2422509	2422514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512318
53992	NC_013205	GCCG	3	12	2422511	2422522	0 %	0 %	50 %	50 %	258512318
53993	NC_013205	TCG	2	6	2422527	2422532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512318
53994	NC_013205	TGA	2	6	2422553	2422558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512318
53995	NC_013205	GC	3	6	2422572	2422577	0 %	0 %	50 %	50 %	258512318
53996	NC_013205	TCG	2	6	2422650	2422655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512318
53997	NC_013205	CGTC	2	8	2422668	2422675	0 %	25 %	25 %	50 %	258512318
53998	NC_013205	CG	3	6	2422700	2422705	0 %	0 %	50 %	50 %	258512318
53999	NC_013205	CG	3	6	2422717	2422722	0 %	0 %	50 %	50 %	258512318
54000	NC_013205	ACG	2	6	2422728	2422733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512318

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