MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52502	NC_013205	TGT	2	6	2356593	2356598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258512257
52503	NC_013205	CGA	2	6	2356678	2356683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512257
52504	NC_013205	CTC	3	9	2356791	2356799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512258
52505	NC_013205	AGG	2	6	2356835	2356840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512258
52506	NC_013205	ACG	2	6	2356864	2356869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512258
52507	NC_013205	AG	3	6	2356942	2356947	50 %	0 %	50 %	0 %	258512258
52508	NC_013205	GAGC	2	8	2356955	2356962	25 %	0 %	50 %	25 %	258512258
52509	NC_013205	TTG	2	6	2356984	2356989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258512258
52510	NC_013205	GCA	2	6	2357048	2357053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512258
52511	NC_013205	ACGA	2	8	2357115	2357122	50 %	0 %	25 %	25 %	258512258
52512	NC_013205	CG	4	8	2357151	2357158	0 %	0 %	50 %	50 %	258512258
52513	NC_013205	CGT	2	6	2357242	2357247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512259
52514	NC_013205	ACC	2	6	2357270	2357275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512259
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52553	NC_013205	CCGT	2	8	2359269	2359276	0 %	25 %	25 %	50 %	258512260
52554	NC_013205	ACC	2	6	2359282	2359287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512260
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52735	NC_013205	GCC	2	6	2368281	2368286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512268
52736	NC_013205	CGA	2	6	2368290	2368295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512268
52737	NC_013205	GCT	2	6	2368319	2368324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512268
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52742	NC_013205	CGG	2	6	2368626	2368631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52743	NC_013205	GGA	3	9	2368649	2368657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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52820	NC_013205	CAT	2	6	2372384	2372389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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52840	NC_013205	ACTT	2	8	2373752	2373759	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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52852	NC_013205	TCA	2	6	2374380	2374385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512273
52853	NC_013205	TCA	2	6	2374431	2374436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512273
52854	NC_013205	CTGG	2	8	2374447	2374454	0 %	25 %	50 %	25 %	258512273
52855	NC_013205	TCG	2	6	2374473	2374478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512273
52856	NC_013205	AC	3	6	2374517	2374522	50 %	0 %	0 %	50 %	258512273
52857	NC_013205	CGG	2	6	2374525	2374530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512273
52858	NC_013205	GCTTCG	2	12	2374532	2374543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512273
52859	NC_013205	CGC	2	6	2374576	2374581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512273
52860	NC_013205	CGC	2	6	2374653	2374658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512273
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52863	NC_013205	CGT	2	6	2374825	2374830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512273
52864	NC_013205	CTTGCG	2	12	2374853	2374864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512273
52865	NC_013205	CTT	2	6	2374867	2374872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258512273
52866	NC_013205	TTC	2	6	2374875	2374880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258512273
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52878	NC_013205	TAC	2	6	2375342	2375347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512273
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52882	NC_013205	TGC	2	6	2375507	2375512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512273
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52885	NC_013205	GAGG	2	8	2375732	2375739	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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52896	NC_013205	CG	3	6	2376111	2376116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52897	NC_013205	GCT	2	6	2376353	2376358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512275
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52957	NC_013205	AGCGC	2	10	2379333	2379342	20 %	0 %	40 %	40 %	258512278
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52965	NC_013205	CGC	2	6	2379494	2379499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512278
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52970	NC_013205	GAG	2	6	2379712	2379717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512278
52971	NC_013205	GCG	2	6	2379751	2379756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512278
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52992	NC_013205	GGC	2	6	2380472	2380477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512278
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52995	NC_013205	ATC	2	6	2380570	2380575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512278
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52997	NC_013205	GATC	2	8	2380647	2380654	25 %	25 %	25 %	25 %	258512278
52998	NC_013205	CTG	2	6	2380671	2380676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512278
52999	NC_013205	CTA	2	6	2380758	2380763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512278
53000	NC_013205	GAG	3	9	2380780	2380788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512278

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