MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
50501	NC_013205	TCA	2	6	2263985	2263990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512166
50502	NC_013205	A	6	6	2264134	2264139	100 %	0 %	0 %	0 %	258512166
50503	NC_013205	AAG	2	6	2264205	2264210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258512166
50504	NC_013205	CCGGAA	2	12	2264221	2264232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512166
50505	NC_013205	TCC	2	6	2264256	2264261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512166
50506	NC_013205	CGG	2	6	2264279	2264284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512166
50507	NC_013205	GATC	2	8	2264311	2264318	25 %	25 %	25 %	25 %	258512166
50508	NC_013205	TCT	2	6	2264340	2264345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258512166
50509	NC_013205	CAC	2	6	2264417	2264422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512166
50510	NC_013205	CGG	2	6	2264445	2264450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512166
50511	NC_013205	ACG	2	6	2264451	2264456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512166
50512	NC_013205	CGA	2	6	2264461	2264466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512166
50513	NC_013205	GTG	2	6	2264483	2264488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258512166
50514	NC_013205	CCA	2	6	2264501	2264506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512166
50515	NC_013205	GTT	2	6	2264662	2264667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258512166
50516	NC_013205	CCCT	2	8	2264717	2264724	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
50517	NC_013205	GC	3	6	2264862	2264867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50518	NC_013205	CTCG	2	8	2264873	2264880	0 %	25 %	25 %	50 %	258512167
50519	NC_013205	CAG	2	6	2264918	2264923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512167
50520	NC_013205	GAC	2	6	2264927	2264932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512167
50521	NC_013205	CCA	2	6	2264936	2264941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512167
50522	NC_013205	ACG	2	6	2265006	2265011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512167
50523	NC_013205	TCATC	2	10	2265064	2265073	20 %	40 %	0 %	40 %	258512167
50524	NC_013205	GGAT	2	8	2265083	2265090	25 %	25 %	50 %	0 %	258512168
50525	NC_013205	CCA	2	6	2265113	2265118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512168
50526	NC_013205	GCC	2	6	2265136	2265141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512168
50527	NC_013205	ACG	2	6	2265265	2265270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512168
50528	NC_013205	GC	3	6	2265295	2265300	0 %	0 %	50 %	50 %	258512168
50529	NC_013205	GAA	2	6	2265345	2265350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258512168
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50531	NC_013205	GCG	2	6	2265452	2265457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512168
50532	NC_013205	GAA	2	6	2265462	2265467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258512168
50533	NC_013205	TGA	3	9	2265536	2265544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512168
50534	NC_013205	CTT	2	6	2265600	2265605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258512168
50535	NC_013205	GATA	2	8	2265617	2265624	50 %	25 %	25 %	0 %	258512168
50536	NC_013205	CGT	2	6	2265639	2265644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512168
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50538	NC_013205	ATC	2	6	2265844	2265849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512168
50539	NC_013205	CG	3	6	2265885	2265890	0 %	0 %	50 %	50 %	258512168
50540	NC_013205	CGC	2	6	2265900	2265905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512168
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50542	NC_013205	CGT	2	6	2265933	2265938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512168
50543	NC_013205	CCGAGC	2	12	2265964	2265975	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	258512168
50544	NC_013205	AGCC	2	8	2265985	2265992	25 %	0 %	25 %	50 %	258512168
50545	NC_013205	CAT	2	6	2266065	2266070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512168
50546	NC_013205	GCA	2	6	2266115	2266120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512168
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50550	NC_013205	TCA	2	6	2266304	2266309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512168
50551	NC_013205	GC	3	6	2266331	2266336	0 %	0 %	50 %	50 %	258512168
50552	NC_013205	CAT	2	6	2266407	2266412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512168
50553	NC_013205	ACA	2	6	2266427	2266432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258512168
50554	NC_013205	GGAT	2	8	2266565	2266572	25 %	25 %	50 %	0 %	258512168
50555	NC_013205	GAT	3	9	2266659	2266667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512168
50556	NC_013205	CCT	2	6	2266712	2266717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50557	NC_013205	CGG	2	6	2266783	2266788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50558	NC_013205	GCG	3	9	2266832	2266840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50559	NC_013205	CG	3	6	2266884	2266889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50560	NC_013205	AAAG	2	8	2266917	2266924	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50561	NC_013205	CGA	3	9	2266930	2266938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50562	NC_013205	GCG	2	6	2266971	2266976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50563	NC_013205	CCG	2	6	2267143	2267148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512169
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50569	NC_013205	AAG	2	6	2267316	2267321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258512169
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50584	NC_013205	TCG	2	6	2268022	2268027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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50589	NC_013205	GAGC	2	8	2268239	2268246	25 %	0 %	50 %	25 %	258512170
50590	NC_013205	GCTC	2	8	2268316	2268323	0 %	25 %	25 %	50 %	258512170
50591	NC_013205	CGA	2	6	2268358	2268363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512170
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50601	NC_013205	CGG	2	6	2268686	2268691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512170
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50605	NC_013205	CGCC	2	8	2268749	2268756	0 %	0 %	25 %	75 %	258512170
50606	NC_013205	GCA	2	6	2268854	2268859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512170
50607	NC_013205	C	6	6	2268878	2268883	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50608	NC_013205	CGG	2	6	2268976	2268981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50609	NC_013205	TGA	2	6	2268999	2269004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512171
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50612	NC_013205	GCC	2	6	2269285	2269290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512172
50613	NC_013205	CGT	2	6	2269300	2269305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512172
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50615	NC_013205	ACG	2	6	2269410	2269415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512172
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50617	NC_013205	TCC	2	6	2269620	2269625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512173
50618	NC_013205	CG	3	6	2269692	2269697	0 %	0 %	50 %	50 %	258512173
50619	NC_013205	GA	3	6	2269751	2269756	50 %	0 %	50 %	0 %	258512173
50620	NC_013205	CG	3	6	2269767	2269772	0 %	0 %	50 %	50 %	258512173
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50629	NC_013205	GGA	2	6	2270167	2270172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50630	NC_013205	A	6	6	2270178	2270183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50631	NC_013205	GCCG	2	8	2270246	2270253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50632	NC_013205	CGG	2	6	2270263	2270268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50633	NC_013205	CCCG	2	8	2270344	2270351	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
50634	NC_013205	TGG	2	6	2270451	2270456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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50637	NC_013205	TGG	2	6	2270540	2270545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50638	NC_013205	GATT	2	8	2270626	2270633	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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50642	NC_013205	GCT	2	6	2270875	2270880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512174
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50648	NC_013205	CTG	2	6	2271202	2271207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512174
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50650	NC_013205	AC	3	6	2271298	2271303	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50651	NC_013205	T	6	6	2271333	2271338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50652	NC_013205	CG	3	6	2271367	2271372	0 %	0 %	50 %	50 %	258512175
50653	NC_013205	CGC	2	6	2271405	2271410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512175
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50693	NC_013205	TCC	2	6	2273865	2273870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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50701	NC_013205	CCG	2	6	2274332	2274337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512179
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50729	NC_013205	CGGC	2	8	2275592	2275599	0 %	0 %	50 %	50 %	258512180
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50732	NC_013205	GC	3	6	2275653	2275658	0 %	0 %	50 %	50 %	258512180
50733	NC_013205	GC	3	6	2275701	2275706	0 %	0 %	50 %	50 %	258512180
50734	NC_013205	GC	3	6	2275761	2275766	0 %	0 %	50 %	50 %	258512180
50735	NC_013205	AGC	2	6	2275790	2275795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512180
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