MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
49501	NC_013205	GA	3	6	2217209	2217214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49502	NC_013205	CG	3	6	2217228	2217233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49503	NC_013205	CCG	2	6	2217461	2217466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49504	NC_013205	CGC	2	6	2217587	2217592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512117
49505	NC_013205	GAT	2	6	2217722	2217727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512117
49506	NC_013205	GCG	2	6	2217785	2217790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512117
49507	NC_013205	TCG	2	6	2217810	2217815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512117
49508	NC_013205	GCCC	2	8	2217910	2217917	0 %	0 %	25 %	75 %	258512117
49509	NC_013205	AGCG	2	8	2217961	2217968	25 %	0 %	50 %	25 %	258512117
49510	NC_013205	CGT	2	6	2217982	2217987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512117
49511	NC_013205	GCC	2	6	2218007	2218012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512117
49512	NC_013205	CCG	2	6	2218032	2218037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512117
49513	NC_013205	TGA	2	6	2218063	2218068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512117
49514	NC_013205	GCC	2	6	2218083	2218088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512117
49515	NC_013205	CGC	2	6	2218136	2218141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512117
49516	NC_013205	CGT	2	6	2218267	2218272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512117
49517	NC_013205	CGGC	2	8	2218297	2218304	0 %	0 %	50 %	50 %	258512117
49518	NC_013205	TGG	2	6	2218332	2218337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258512117
49519	NC_013205	CGC	2	6	2218343	2218348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512117
49520	NC_013205	CCG	2	6	2218429	2218434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512117
49521	NC_013205	GGCGAT	2	12	2218436	2218447	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258512117
49522	NC_013205	GTT	2	6	2218460	2218465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258512117
49523	NC_013205	GTC	2	6	2218493	2218498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512117
49524	NC_013205	CCA	2	6	2218504	2218509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512117
49525	NC_013205	CCG	2	6	2218511	2218516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512117
49526	NC_013205	ACG	2	6	2218531	2218536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512117
49527	NC_013205	CGG	2	6	2218552	2218557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512117
49528	NC_013205	CCG	2	6	2218559	2218564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512117
49529	NC_013205	CTC	2	6	2218571	2218576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512117
49530	NC_013205	GCA	2	6	2218597	2218602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512117
49531	NC_013205	AGA	2	6	2218627	2218632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258512117
49532	NC_013205	CCA	2	6	2218684	2218689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512117
49533	NC_013205	TCGAA	2	10	2218697	2218706	40 %	20 %	20 %	20 %	258512117
49534	NC_013205	TCC	2	6	2218724	2218729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49535	NC_013205	GCG	2	6	2218829	2218834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512118
49536	NC_013205	GCG	2	6	2218863	2218868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512118
49537	NC_013205	GC	3	6	2218925	2218930	0 %	0 %	50 %	50 %	258512118
49538	NC_013205	GCC	2	6	2218971	2218976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512118
49539	NC_013205	CGC	2	6	2219025	2219030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512118
49540	NC_013205	CG	3	6	2219081	2219086	0 %	0 %	50 %	50 %	258512118
49541	NC_013205	TCCCAG	2	12	2219110	2219121	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	258512118
49542	NC_013205	GAG	2	6	2219127	2219132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512118
49543	NC_013205	TCG	2	6	2219183	2219188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512118
49544	NC_013205	CGC	2	6	2219255	2219260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512118
49545	NC_013205	CTCG	2	8	2219385	2219392	0 %	25 %	25 %	50 %	258512118
49546	NC_013205	CGC	2	6	2219439	2219444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512118
49547	NC_013205	CGG	2	6	2219481	2219486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512118
49548	NC_013205	TTG	2	6	2219548	2219553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258512118
49549	NC_013205	CAC	2	6	2219568	2219573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512118
49550	NC_013205	CGG	2	6	2219603	2219608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512118
49551	NC_013205	GAA	2	6	2219613	2219618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258512118
49552	NC_013205	GC	3	6	2219637	2219642	0 %	0 %	50 %	50 %	258512118
49553	NC_013205	CG	3	6	2219652	2219657	0 %	0 %	50 %	50 %	258512118
49554	NC_013205	CGC	2	6	2219699	2219704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512118
49555	NC_013205	CTT	2	6	2219706	2219711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258512118
49556	NC_013205	CCCG	2	8	2219742	2219749	0 %	0 %	25 %	75 %	258512118
49557	NC_013205	TCC	2	6	2219791	2219796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49558	NC_013205	CAC	2	6	2219806	2219811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512119
49559	NC_013205	CTG	2	6	2219814	2219819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512119
49560	NC_013205	CGT	2	6	2219921	2219926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512119
49561	NC_013205	CTG	2	6	2219967	2219972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512119
49562	NC_013205	CTC	2	6	2220018	2220023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512119
49563	NC_013205	CG	3	6	2220053	2220058	0 %	0 %	50 %	50 %	258512119
49564	NC_013205	TTG	2	6	2220070	2220075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258512119
49565	NC_013205	CGC	2	6	2220200	2220205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512119
49566	NC_013205	CGCAGG	2	12	2220214	2220225	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	258512119
49567	NC_013205	CG	3	6	2220356	2220361	0 %	0 %	50 %	50 %	258512119
49568	NC_013205	CTC	2	6	2220366	2220371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512119
49569	NC_013205	GAC	2	6	2220441	2220446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512119
49570	NC_013205	TTCG	2	8	2220519	2220526	0 %	50 %	25 %	25 %	258512119
49571	NC_013205	TTG	2	6	2220538	2220543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258512119
49572	NC_013205	CG	3	6	2220572	2220577	0 %	0 %	50 %	50 %	258512119
49573	NC_013205	CGG	2	6	2220611	2220616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512119
49574	NC_013205	GAG	2	6	2220621	2220626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512119
49575	NC_013205	GCC	2	6	2220660	2220665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512119
49576	NC_013205	CGA	2	6	2220866	2220871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512120
49577	NC_013205	CCG	2	6	2220941	2220946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512120
49578	NC_013205	GGC	2	6	2220992	2220997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512120
49579	NC_013205	CGG	2	6	2221006	2221011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512120
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49581	NC_013205	ACG	2	6	2221121	2221126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512120
49582	NC_013205	CGGC	2	8	2221235	2221242	0 %	0 %	50 %	50 %	258512120
49583	NC_013205	AC	3	6	2221251	2221256	50 %	0 %	0 %	50 %	258512120
49584	NC_013205	CTT	2	6	2221283	2221288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258512120
49585	NC_013205	CG	3	6	2221344	2221349	0 %	0 %	50 %	50 %	258512120
49586	NC_013205	TCG	2	6	2221360	2221365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512120
49587	NC_013205	GGC	2	6	2221367	2221372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512120
49588	NC_013205	CGG	2	6	2221444	2221449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512120
49589	NC_013205	TCC	2	6	2221468	2221473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512120
49590	NC_013205	TC	3	6	2221523	2221528	0 %	50 %	0 %	50 %	258512121
49591	NC_013205	GCG	2	6	2221601	2221606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512121
49592	NC_013205	GCC	2	6	2221624	2221629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512121
49593	NC_013205	GGAAC	2	10	2221667	2221676	40 %	0 %	40 %	20 %	258512121
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49596	NC_013205	TCC	2	6	2221726	2221731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512121
49597	NC_013205	ACC	2	6	2221765	2221770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512121
49598	NC_013205	CGGG	2	8	2221775	2221782	0 %	0 %	75 %	25 %	258512121
49599	NC_013205	CGA	2	6	2221835	2221840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512121
49600	NC_013205	GC	3	6	2221841	2221846	0 %	0 %	50 %	50 %	258512121
49601	NC_013205	GGT	2	6	2221928	2221933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258512121
49602	NC_013205	GCG	2	6	2222001	2222006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512121
49603	NC_013205	CG	3	6	2222005	2222010	0 %	0 %	50 %	50 %	258512121
49604	NC_013205	GA	3	6	2222015	2222020	50 %	0 %	50 %	0 %	258512121
49605	NC_013205	CTC	2	6	2222034	2222039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512121
49606	NC_013205	GC	4	8	2222073	2222080	0 %	0 %	50 %	50 %	258512121
49607	NC_013205	GC	4	8	2222097	2222104	0 %	0 %	50 %	50 %	258512121
49608	NC_013205	GCA	2	6	2222111	2222116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512121
49609	NC_013205	GCCGC	2	10	2222190	2222199	0 %	0 %	40 %	60 %	258512121
49610	NC_013205	CCAG	2	8	2222249	2222256	25 %	0 %	25 %	50 %	258512121
49611	NC_013205	CG	3	6	2222293	2222298	0 %	0 %	50 %	50 %	258512121
49612	NC_013205	TCG	2	6	2222326	2222331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512121
49613	NC_013205	GGC	2	6	2222528	2222533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512122
49614	NC_013205	AGAT	2	8	2222547	2222554	50 %	25 %	25 %	0 %	258512122
49615	NC_013205	CCA	2	6	2222669	2222674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512122
49616	NC_013205	ATG	2	6	2222715	2222720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512122
49617	NC_013205	AGG	2	6	2222760	2222765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512122
49618	NC_013205	GAT	2	6	2222801	2222806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512122
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49622	NC_013205	CG	3	6	2222966	2222971	0 %	0 %	50 %	50 %	258512122
49623	NC_013205	T	6	6	2223209	2223214	0 %	100 %	0 %	0 %	258512123
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49631	NC_013205	TCA	2	6	2223468	2223473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512123
49632	NC_013205	CCCGG	2	10	2223519	2223528	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
49633	NC_013205	TCG	2	6	2223581	2223586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512124
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49640	NC_013205	CG	3	6	2223988	2223993	0 %	0 %	50 %	50 %	258512124
49641	NC_013205	GC	3	6	2224032	2224037	0 %	0 %	50 %	50 %	258512124
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49650	NC_013205	CTTC	2	8	2224433	2224440	0 %	50 %	0 %	50 %	258512125
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49854	NC_013205	GCT	2	6	2234116	2234121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512138
49855	NC_013205	GGC	2	6	2234196	2234201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512138
49856	NC_013205	ACG	2	6	2234202	2234207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512138
49857	NC_013205	ACG	2	6	2234235	2234240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512138
49858	NC_013205	TCC	2	6	2234298	2234303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512138
49859	NC_013205	TGGA	2	8	2234375	2234382	25 %	25 %	50 %	0 %	258512138
49860	NC_013205	GCG	2	6	2234427	2234432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512138
49861	NC_013205	CGC	2	6	2234437	2234442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512138
49862	NC_013205	CGACTG	2	12	2234446	2234457	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258512138
49863	NC_013205	GCC	2	6	2234458	2234463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512138
49864	NC_013205	CTG	2	6	2234467	2234472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512138
49865	NC_013205	CGA	2	6	2234528	2234533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512138
49866	NC_013205	CGAG	2	8	2234542	2234549	25 %	0 %	50 %	25 %	258512138
49867	NC_013205	GC	3	6	2234555	2234560	0 %	0 %	50 %	50 %	258512138
49868	NC_013205	AAG	2	6	2234622	2234627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258512138
49869	NC_013205	TCG	2	6	2234667	2234672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512138
49870	NC_013205	GC	3	6	2234703	2234708	0 %	0 %	50 %	50 %	258512138
49871	NC_013205	GCG	2	6	2234710	2234715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512138
49872	NC_013205	CG	3	6	2234757	2234762	0 %	0 %	50 %	50 %	258512138
49873	NC_013205	GC	3	6	2234764	2234769	0 %	0 %	50 %	50 %	258512138
49874	NC_013205	GCC	3	9	2234834	2234842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512138
49875	NC_013205	CGG	2	6	2234852	2234857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49876	NC_013205	CAC	2	6	2234891	2234896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49877	NC_013205	ACGA	2	8	2234902	2234909	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49878	NC_013205	CGC	2	6	2234941	2234946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49879	NC_013205	GC	3	6	2234945	2234950	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49880	NC_013205	CGCC	2	8	2235084	2235091	0 %	0 %	25 %	75 %	258512139
49881	NC_013205	CGGA	2	8	2235101	2235108	25 %	0 %	50 %	25 %	258512139
49882	NC_013205	CTC	2	6	2235118	2235123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512139
49883	NC_013205	CG	4	8	2235129	2235136	0 %	0 %	50 %	50 %	258512139
49884	NC_013205	ACG	2	6	2235140	2235145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512139
49885	NC_013205	TGT	2	6	2235198	2235203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258512139
49886	NC_013205	CCT	2	6	2235255	2235260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512139
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49889	NC_013205	ACC	2	6	2235401	2235406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512139
49890	NC_013205	TCC	2	6	2235425	2235430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512139
49891	NC_013205	CGC	2	6	2235547	2235552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512139
49892	NC_013205	CGA	2	6	2235567	2235572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512139
49893	NC_013205	TCG	2	6	2235632	2235637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512139
49894	NC_013205	TTC	2	6	2235659	2235664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258512139
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49904	NC_013205	GTC	2	6	2235994	2235999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512139
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49916	NC_013205	CGC	2	6	2236485	2236490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512139
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49919	NC_013205	CG	3	6	2236518	2236523	0 %	0 %	50 %	50 %	258512139
49920	NC_013205	GAC	2	6	2236525	2236530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512139
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49922	NC_013205	GC	3	6	2236710	2236715	0 %	0 %	50 %	50 %	258512139
49923	NC_013205	GC	3	6	2236773	2236778	0 %	0 %	50 %	50 %	258512139
49924	NC_013205	TCC	2	6	2236781	2236786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512139
49925	NC_013205	CGA	2	6	2236803	2236808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512139
49926	NC_013205	CGA	2	6	2236827	2236832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512139
49927	NC_013205	CCT	2	6	2236836	2236841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512139
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49929	NC_013205	CGC	2	6	2236901	2236906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512139
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49932	NC_013205	GAC	2	6	2237007	2237012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49933	NC_013205	C	6	6	2237049	2237054	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
49934	NC_013205	CGG	2	6	2237086	2237091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49935	NC_013205	GTG	2	6	2237129	2237134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49936	NC_013205	CT	4	8	2237175	2237182	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49937	NC_013205	GC	3	6	2237259	2237264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49938	NC_013205	AGCG	2	8	2237305	2237312	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49939	NC_013205	GC	3	6	2237398	2237403	0 %	0 %	50 %	50 %	258512140
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49941	NC_013205	CGT	2	6	2237555	2237560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512140
49942	NC_013205	ACG	2	6	2237563	2237568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512140
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49945	NC_013205	CCA	2	6	2237810	2237815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512140
49946	NC_013205	ACG	2	6	2237845	2237850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512140
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49953	NC_013205	ATC	2	6	2238097	2238102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512140
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49955	NC_013205	CG	3	6	2238122	2238127	0 %	0 %	50 %	50 %	258512140
49956	NC_013205	GAC	2	6	2238153	2238158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512140
49957	NC_013205	ACG	2	6	2238178	2238183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512140
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49960	NC_013205	TCGGG	2	10	2238310	2238319	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
49961	NC_013205	CGC	2	6	2238342	2238347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49962	NC_013205	TCG	2	6	2238370	2238375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512141
49963	NC_013205	GCG	2	6	2238458	2238463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512141
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49965	NC_013205	GC	3	6	2238498	2238503	0 %	0 %	50 %	50 %	258512141
49966	NC_013205	TCG	2	6	2238511	2238516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512141
49967	NC_013205	GAG	2	6	2238540	2238545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512141
49968	NC_013205	CGC	2	6	2238552	2238557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512141
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