MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Atopobium parvulum DSM 20469 chromosome

Total Repeats: 31231

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_013203	CTG	2	6	500854	500859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784238
10003	NC_013203	CTA	2	6	500932	500937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784238
10004	NC_013203	GCT	2	6	501318	501323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784238
10005	NC_013203	TTCT	2	8	501472	501479	0 %	75 %	0 %	25 %	257784238
10006	NC_013203	AAT	2	6	501549	501554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257784238
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10008	NC_013203	GAT	2	6	501594	501599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784238
10009	NC_013203	TGG	2	6	501650	501655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257784238
10010	NC_013203	CTG	2	6	501670	501675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784238
10011	NC_013203	CGTT	2	8	501692	501699	0 %	50 %	25 %	25 %	257784238
10012	NC_013203	GA	3	6	501712	501717	50 %	0 %	50 %	0 %	257784238
10013	NC_013203	TGA	2	6	501779	501784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784238
10014	NC_013203	TCT	2	6	501792	501797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784238
10015	NC_013203	AAAGA	2	10	501807	501816	80 %	0 %	20 %	0 %	257784238
10016	NC_013203	TGA	2	6	501842	501847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784238
10017	NC_013203	GAT	4	12	501867	501878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784238
10018	NC_013203	TGG	2	6	501906	501911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257784238
10019	NC_013203	AG	3	6	501989	501994	50 %	0 %	50 %	0 %	257784238
10020	NC_013203	ATTT	2	8	502071	502078	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_013203	CTA	2	6	502147	502152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784239
10022	NC_013203	CAT	2	6	502220	502225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784239
10023	NC_013203	TCG	2	6	502260	502265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784239
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10025	NC_013203	CAC	2	6	502347	502352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257784239
10026	NC_013203	CGT	2	6	502426	502431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784239
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10029	NC_013203	AGA	2	6	502580	502585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257784239
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10037	NC_013203	TAG	2	6	502919	502924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784239
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10053	NC_013203	AAGT	2	8	503461	503468	50 %	25 %	25 %	0 %	257784239
10054	NC_013203	T	6	6	503478	503483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_013203	AGA	2	6	503515	503520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_013203	GAG	2	6	503543	503548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_013203	CAG	2	6	503562	503567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257784240
10058	NC_013203	TACTT	2	10	503588	503597	20 %	60 %	0 %	20 %	257784240
10059	NC_013203	A	6	6	503609	503614	100 %	0 %	0 %	0 %	257784240
10060	NC_013203	AAG	2	6	503638	503643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257784240
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10103	NC_013203	TGCAA	2	10	505499	505508	40 %	20 %	20 %	20 %	257784242
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10109	NC_013203	TAT	2	6	505807	505812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257784242
10110	NC_013203	TTTA	2	8	505852	505859	25 %	75 %	0 %	0 %	257784242
10111	NC_013203	TTG	2	6	505909	505914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784242
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10114	NC_013203	TG	3	6	505963	505968	0 %	50 %	50 %	0 %	257784242
10115	NC_013203	GTT	2	6	505976	505981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784242
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10119	NC_013203	AGG	2	6	506147	506152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_013203	A	8	8	506179	506186	100 %	0 %	0 %	0 %	257784243
10121	NC_013203	TCA	2	6	506192	506197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784243
10122	NC_013203	CTC	2	6	506215	506220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257784243
10123	NC_013203	CGG	2	6	506353	506358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257784243
10124	NC_013203	ATC	2	6	506389	506394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784243
10125	NC_013203	TGA	2	6	506444	506449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784243
10126	NC_013203	GTT	2	6	506533	506538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784244
10127	NC_013203	AGC	2	6	506555	506560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257784244
10128	NC_013203	ACG	2	6	506626	506631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257784244
10129	NC_013203	AGTA	2	8	506666	506673	50 %	25 %	25 %	0 %	257784244
10130	NC_013203	CTG	2	6	506716	506721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784244
10131	NC_013203	GAT	2	6	506837	506842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784244
10132	NC_013203	CTG	2	6	506860	506865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784244
10133	NC_013203	ATG	2	6	506883	506888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784244
10134	NC_013203	GTC	2	6	506938	506943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784244
10135	NC_013203	TTG	2	6	506970	506975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784244
10136	NC_013203	GCG	2	6	507018	507023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257784244
10137	NC_013203	TTG	2	6	507070	507075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784244
10138	NC_013203	ATGCA	2	10	507100	507109	40 %	20 %	20 %	20 %	257784244
10139	NC_013203	TAC	2	6	507191	507196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784244
10140	NC_013203	TGG	2	6	507289	507294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257784244
10141	NC_013203	TTG	2	6	507304	507309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784244
10142	NC_013203	GTAA	2	8	507402	507409	50 %	25 %	25 %	0 %	257784244
10143	NC_013203	TGG	2	6	507449	507454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257784244
10144	NC_013203	GC	3	6	507467	507472	0 %	0 %	50 %	50 %	257784244
10145	NC_013203	TGA	2	6	507485	507490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784244
10146	NC_013203	TAT	2	6	507506	507511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257784244
10147	NC_013203	TGA	2	6	507521	507526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784244
10148	NC_013203	CAA	2	6	507529	507534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257784244
10149	NC_013203	TGT	2	6	507590	507595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784244
10150	NC_013203	TAT	2	6	507734	507739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257784244
10151	NC_013203	GTT	2	6	507822	507827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784244
10152	NC_013203	GCT	2	6	507908	507913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784244
10153	NC_013203	GGT	2	6	508047	508052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257784244
10154	NC_013203	AGG	2	6	508111	508116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257784244
10155	NC_013203	AC	3	6	508123	508128	50 %	0 %	0 %	50 %	257784244
10156	NC_013203	CAG	2	6	508149	508154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257784244
10157	NC_013203	CTT	2	6	508203	508208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784244
10158	NC_013203	CCA	2	6	508252	508257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257784244
10159	NC_013203	CAA	2	6	508312	508317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257784244
10160	NC_013203	TGT	2	6	508424	508429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784244
10161	NC_013203	ATG	2	6	508450	508455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784244
10162	NC_013203	TGA	2	6	508537	508542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784244
10163	NC_013203	CT	3	6	508578	508583	0 %	50 %	0 %	50 %	257784244
10164	NC_013203	TGT	2	6	508666	508671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784244
10165	NC_013203	GCC	2	6	508710	508715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257784244
10166	NC_013203	TGT	2	6	508736	508741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784244
10167	NC_013203	AGG	2	6	508873	508878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257784244
10168	NC_013203	GAA	3	9	508889	508897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257784244
10169	NC_013203	AGT	2	6	509009	509014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784244
10170	NC_013203	TCT	2	6	509022	509027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784244
10171	NC_013203	TGT	2	6	509057	509062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784244
10172	NC_013203	CAGG	2	8	509064	509071	25 %	0 %	50 %	25 %	257784244
10173	NC_013203	CTA	2	6	509080	509085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784244
10174	NC_013203	GCA	2	6	509144	509149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257784245
10175	NC_013203	CTG	2	6	509194	509199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784245
10176	NC_013203	TGT	2	6	509244	509249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784245
10177	NC_013203	AGC	2	6	509282	509287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257784245
10178	NC_013203	CT	3	6	509462	509467	0 %	50 %	0 %	50 %	257784245
10179	NC_013203	TCTTT	2	10	509507	509516	0 %	80 %	0 %	20 %	257784245
10180	NC_013203	CAA	2	6	509586	509591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257784245
10181	NC_013203	GATT	2	8	509623	509630	25 %	50 %	25 %	0 %	257784245
10182	NC_013203	CCG	2	6	509778	509783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257784245
10183	NC_013203	CTG	2	6	510000	510005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784245
10184	NC_013203	CCT	2	6	510086	510091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10185	NC_013203	CAT	2	6	510138	510143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784246
10186	NC_013203	TCA	2	6	510224	510229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784246
10187	NC_013203	AGTGTC	2	12	510283	510294	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	257784246
10188	NC_013203	GCT	2	6	510320	510325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784246
10189	NC_013203	TAC	2	6	510352	510357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784246
10190	NC_013203	AGCCAC	2	12	510393	510404	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	257784246
10191	NC_013203	TGC	2	6	510427	510432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784246
10192	NC_013203	ATG	2	6	510479	510484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784246
10193	NC_013203	TG	3	6	510515	510520	0 %	50 %	50 %	0 %	257784246
10194	NC_013203	AG	3	6	510534	510539	50 %	0 %	50 %	0 %	257784246
10195	NC_013203	CAA	2	6	510621	510626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257784246
10196	NC_013203	TGC	2	6	510631	510636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784246
10197	NC_013203	ACT	2	6	510842	510847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784246
10198	NC_013203	AAT	2	6	510946	510951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257784246
10199	NC_013203	A	6	6	511000	511005	100 %	0 %	0 %	0 %	257784246
10200	NC_013203	CAT	2	6	511075	511080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784246
10201	NC_013203	GCA	2	6	511151	511156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257784246
10202	NC_013203	CTT	2	6	511172	511177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10203	NC_013203	AGA	2	6	511184	511189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10204	NC_013203	T	6	6	511300	511305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10205	NC_013203	AGA	2	6	511372	511377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10206	NC_013203	CAGA	2	8	511380	511387	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10207	NC_013203	TAC	2	6	511434	511439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10208	NC_013203	GGTA	2	8	511468	511475	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10209	NC_013203	TTTC	2	8	511528	511535	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10210	NC_013203	CTT	2	6	511616	511621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784247
10211	NC_013203	GGA	2	6	511673	511678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257784247
10212	NC_013203	GTT	2	6	511718	511723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784247
10213	NC_013203	GCA	2	6	511731	511736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257784247
10214	NC_013203	A	6	6	511786	511791	100 %	0 %	0 %	0 %	257784247
10215	NC_013203	CTT	2	6	511803	511808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784247
10216	NC_013203	TTA	2	6	511922	511927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257784247
10217	NC_013203	GCT	2	6	512135	512140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784247
10218	NC_013203	T	6	6	512173	512178	0 %	100 %	0 %	0 %	257784247
10219	NC_013203	CAG	2	6	512182	512187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257784247
10220	NC_013203	TTG	2	6	512188	512193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784247
10221	NC_013203	ATT	2	6	512202	512207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257784247
10222	NC_013203	AAG	2	6	512235	512240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257784247
10223	NC_013203	GCT	2	6	512246	512251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784247
10224	NC_013203	ACGT	2	8	512264	512271	25 %	25 %	25 %	25 %	257784247
10225	NC_013203	CTGATT	2	12	512329	512340	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	257784247
10226	NC_013203	ATA	2	6	512344	512349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257784247
10227	NC_013203	AATG	2	8	512358	512365	50 %	25 %	25 %	0 %	257784247
10228	NC_013203	TCT	2	6	512458	512463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784247
10229	NC_013203	AG	3	6	512490	512495	50 %	0 %	50 %	0 %	257784247
10230	NC_013203	ACGT	2	8	512568	512575	25 %	25 %	25 %	25 %	257784248
10231	NC_013203	T	6	6	512575	512580	0 %	100 %	0 %	0 %	257784248
10232	NC_013203	T	6	6	512650	512655	0 %	100 %	0 %	0 %	257784248
10233	NC_013203	TGAT	2	8	512671	512678	25 %	50 %	25 %	0 %	257784248
10234	NC_013203	AGC	2	6	512755	512760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257784248
10235	NC_013203	GAA	2	6	512862	512867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257784248
10236	NC_013203	TGT	2	6	513046	513051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784248
10237	NC_013203	GCA	2	6	513071	513076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257784248
10238	NC_013203	AG	3	6	513149	513154	50 %	0 %	50 %	0 %	257784248
10239	NC_013203	A	6	6	513164	513169	100 %	0 %	0 %	0 %	257784248
10240	NC_013203	CTA	2	6	513184	513189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784248
10241	NC_013203	TCAG	2	8	513215	513222	25 %	25 %	25 %	25 %	257784248
10242	NC_013203	TAC	2	6	513251	513256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784248
10243	NC_013203	TGA	2	6	513296	513301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784248
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10258	NC_013203	TGCA	2	8	513957	513964	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10259	NC_013203	TG	3	6	514068	514073	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10260	NC_013203	TCTT	2	8	514175	514182	0 %	75 %	0 %	25 %	257784250
10261	NC_013203	TCT	2	6	514191	514196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784250
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10328	NC_013203	CAG	2	6	517340	517345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257784254
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10333	NC_013203	TTGCTA	2	12	517590	517601	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	257784254
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10356	NC_013203	AGA	2	6	518299	518304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257784254
10357	NC_013203	AAT	2	6	518338	518343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10358	NC_013203	AGA	2	6	518373	518378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10359	NC_013203	TTTA	2	8	518383	518390	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10360	NC_013203	TAAT	2	8	518415	518422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10361	NC_013203	GTA	2	6	518426	518431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10480	NC_013203	TGC	2	6	524359	524364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784261
10481	NC_013203	GTT	2	6	524365	524370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784261
10482	NC_013203	TGCACT	2	12	524371	524382	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	257784261
10483	NC_013203	GTT	2	6	524416	524421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784261
10484	NC_013203	TTG	2	6	524436	524441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784261
10485	NC_013203	TG	3	6	524446	524451	0 %	50 %	50 %	0 %	257784261
10486	NC_013203	TAAC	2	8	524460	524467	50 %	25 %	0 %	25 %	257784261
10487	NC_013203	GCA	2	6	524510	524515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257784261
10488	NC_013203	TTTTGA	2	12	524547	524558	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	257784261
10489	NC_013203	GCT	2	6	524590	524595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784261
10490	NC_013203	AGAC	2	8	524684	524691	50 %	0 %	25 %	25 %	257784261
10491	NC_013203	TAT	2	6	524881	524886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257784261
10492	NC_013203	AT	3	6	524953	524958	50 %	50 %	0 %	0 %	257784261
10493	NC_013203	TGC	2	6	525034	525039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784261
10494	NC_013203	ATT	2	6	525071	525076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257784261
10495	NC_013203	GGCA	2	8	525100	525107	25 %	0 %	50 %	25 %	257784261
10496	NC_013203	CAT	2	6	525139	525144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784261
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10499	NC_013203	CTT	2	6	525346	525351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784261
10500	NC_013203	CAGA	2	8	525367	525374	50 %	0 %	25 %	25 %	257784261

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