MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331 chromosome

Total Repeats: 56359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45501	NC_013124	AGC	2	6	1740708	1740713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372413
45502	NC_013124	TCG	2	6	1740837	1740842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372413
45503	NC_013124	ACG	3	9	1740861	1740869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372413
45504	NC_013124	CGAGGT	2	12	1740880	1740891	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	256372413
45505	NC_013124	GAG	2	6	1740922	1740927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45506	NC_013124	CTC	2	6	1740937	1740942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45507	NC_013124	GAT	2	6	1740943	1740948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45508	NC_013124	CGGCG	2	10	1740978	1740987	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
45509	NC_013124	CG	3	6	1740990	1740995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45510	NC_013124	CGT	2	6	1741008	1741013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45511	NC_013124	AC	3	6	1741081	1741086	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45512	NC_013124	CCCT	2	8	1741088	1741095	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
45513	NC_013124	G	6	6	1741153	1741158	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
45514	NC_013124	CGG	2	6	1741162	1741167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45515	NC_013124	CTG	2	6	1741168	1741173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45516	NC_013124	ACA	2	6	1741187	1741192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256372414
45517	NC_013124	CGC	2	6	1741194	1741199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372414
45518	NC_013124	AGG	2	6	1741215	1741220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372414
45519	NC_013124	GTC	2	6	1741320	1741325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372414
45520	NC_013124	TGA	2	6	1741421	1741426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372414
45521	NC_013124	GC	3	6	1741479	1741484	0 %	0 %	50 %	50 %	256372414
45522	NC_013124	GGT	2	6	1741511	1741516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256372414
45523	NC_013124	CGT	2	6	1741533	1741538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372414
45524	NC_013124	GAG	2	6	1741554	1741559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372414
45525	NC_013124	CCAG	2	8	1741584	1741591	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45526	NC_013124	GTCC	2	8	1741667	1741674	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45527	NC_013124	GGGC	2	8	1741680	1741687	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
45528	NC_013124	GGC	2	6	1741865	1741870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372415
45529	NC_013124	ACG	2	6	1741871	1741876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372415
45530	NC_013124	TCA	2	6	1741892	1741897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256372415
45531	NC_013124	CGT	3	9	1741917	1741925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372415
45532	NC_013124	TCG	2	6	1741944	1741949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372415
45533	NC_013124	TCG	2	6	1742000	1742005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372415
45534	NC_013124	CTT	2	6	1742083	1742088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256372415
45535	NC_013124	CGA	2	6	1742101	1742106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372415
45536	NC_013124	CG	3	6	1742135	1742140	0 %	0 %	50 %	50 %	256372415
45537	NC_013124	GC	3	6	1742143	1742148	0 %	0 %	50 %	50 %	256372415
45538	NC_013124	TCG	2	6	1742151	1742156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372415
45539	NC_013124	GAG	2	6	1742159	1742164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372415
45540	NC_013124	GCG	2	6	1742175	1742180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372415
45541	NC_013124	GC	3	6	1742197	1742202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45542	NC_013124	GCT	2	6	1742220	1742225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45543	NC_013124	GC	3	6	1742258	1742263	0 %	0 %	50 %	50 %	256372416
45544	NC_013124	CGG	2	6	1742302	1742307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372416
45545	NC_013124	CAC	2	6	1742399	1742404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372416
45546	NC_013124	GCC	2	6	1742437	1742442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372416
45547	NC_013124	CGA	2	6	1742508	1742513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45548	NC_013124	GAG	2	6	1742533	1742538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45549	NC_013124	GCGA	2	8	1742541	1742548	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45550	NC_013124	TCT	2	6	1742553	1742558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45551	NC_013124	TTC	2	6	1742575	1742580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45552	NC_013124	GTG	2	6	1742622	1742627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45553	NC_013124	GAC	2	6	1742634	1742639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45554	NC_013124	ACCA	2	8	1742649	1742656	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45555	NC_013124	CTCC	2	8	1742734	1742741	0 %	25 %	0 %	75 %	256372417
45556	NC_013124	AGC	2	6	1742775	1742780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372417
45557	NC_013124	GCG	2	6	1742805	1742810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372417
45558	NC_013124	TGC	2	6	1742925	1742930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372417
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45560	NC_013124	TGC	2	6	1742971	1742976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372417
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45565	NC_013124	CAGCC	2	10	1743210	1743219	20 %	0 %	20 %	60 %	256372418
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45568	NC_013124	TAC	2	6	1743293	1743298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45569	NC_013124	TGG	2	6	1743312	1743317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45570	NC_013124	GCA	2	6	1743357	1743362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45571	NC_013124	GTC	2	6	1743394	1743399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45572	NC_013124	GGT	2	6	1743437	1743442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45573	NC_013124	GGC	2	6	1743453	1743458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45574	NC_013124	AGG	2	6	1743468	1743473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45575	NC_013124	AGG	2	6	1743520	1743525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45576	NC_013124	GGC	2	6	1743585	1743590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372419
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45579	NC_013124	CGAGG	2	10	1743684	1743693	20 %	0 %	60 %	20 %	256372419
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45603	NC_013124	CGCC	2	8	1744795	1744802	0 %	0 %	25 %	75 %	256372420
45604	NC_013124	CTG	2	6	1744883	1744888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45605	NC_013124	AGG	2	6	1744930	1744935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45606	NC_013124	CCG	2	6	1744982	1744987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45607	NC_013124	GTC	2	6	1745070	1745075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372421
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45613	NC_013124	GAG	2	6	1745165	1745170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372421
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45618	NC_013124	ACG	2	6	1745512	1745517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372422
45619	NC_013124	ACCA	2	8	1745524	1745531	50 %	0 %	0 %	50 %	256372422
45620	NC_013124	GGA	2	6	1745569	1745574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372422
45621	NC_013124	CCTCGA	2	12	1745648	1745659	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	256372422
45622	NC_013124	CGA	2	6	1745684	1745689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372422
45623	NC_013124	GAG	2	6	1745700	1745705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372422
45624	NC_013124	CGT	2	6	1745717	1745722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372422
45625	NC_013124	AGC	2	6	1745737	1745742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372422
45626	NC_013124	TCG	2	6	1745810	1745815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372423
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45628	NC_013124	CGCGC	2	10	1745854	1745863	0 %	0 %	40 %	60 %	256372423
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45633	NC_013124	ATCG	2	8	1746040	1746047	25 %	25 %	25 %	25 %	256372423
45634	NC_013124	CGC	2	6	1746067	1746072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372423
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45647	NC_013124	TCC	2	6	1746383	1746388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372423
45648	NC_013124	CGA	2	6	1746441	1746446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372423
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45680	NC_013124	CG	3	6	1748116	1748121	0 %	0 %	50 %	50 %	256372424
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45684	NC_013124	CTG	2	6	1748217	1748222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372424
45685	NC_013124	ACG	2	6	1748245	1748250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372424
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45687	NC_013124	GTCTT	2	10	1748358	1748367	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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45689	NC_013124	TCGA	2	8	1748423	1748430	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45690	NC_013124	CG	3	6	1748446	1748451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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45694	NC_013124	CGG	2	6	1748666	1748671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372425
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45698	NC_013124	TCG	2	6	1748832	1748837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372425
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45730	NC_013124	GCG	2	6	1750007	1750012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372427
45731	NC_013124	GCA	2	6	1750013	1750018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372427
45732	NC_013124	CAC	2	6	1750047	1750052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372427
45733	NC_013124	CGA	2	6	1750076	1750081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372427
45734	NC_013124	CG	3	6	1750082	1750087	0 %	0 %	50 %	50 %	256372427
45735	NC_013124	GCG	2	6	1750099	1750104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372427
45736	NC_013124	CGA	2	6	1750136	1750141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372427
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45738	NC_013124	CGA	2	6	1750244	1750249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372427
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45764	NC_013124	TCG	2	6	1751187	1751192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372428
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45772	NC_013124	GCG	2	6	1751442	1751447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372428
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45832	NC_013124	TC	3	6	1753343	1753348	0 %	50 %	0 %	50 %	256372430
45833	NC_013124	CGA	2	6	1753355	1753360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372430
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45839	NC_013124	C	6	6	1753536	1753541	0 %	0 %	0 %	100 %	256372430
45840	NC_013124	GC	3	6	1753552	1753557	0 %	0 %	50 %	50 %	256372430
45841	NC_013124	CGT	2	6	1753584	1753589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372430
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45845	NC_013124	GAG	2	6	1753788	1753793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372430
45846	NC_013124	GTC	2	6	1753809	1753814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372430
45847	NC_013124	GCC	2	6	1753826	1753831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372430
45848	NC_013124	GAT	2	6	1753905	1753910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372430
45849	NC_013124	CAC	2	6	1753913	1753918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372430
45850	NC_013124	GCG	2	6	1753954	1753959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372430
45851	NC_013124	GGC	3	9	1754033	1754041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372430
45852	NC_013124	GC	3	6	1754044	1754049	0 %	0 %	50 %	50 %	256372430
45853	NC_013124	TGG	2	6	1754050	1754055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256372430
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45856	NC_013124	GAA	2	6	1754200	1754205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45857	NC_013124	CTTC	2	8	1754222	1754229	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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45859	NC_013124	TCG	2	6	1754257	1754262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372431
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45870	NC_013124	CGG	2	6	1754734	1754739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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45875	NC_013124	GCA	2	6	1754950	1754955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372432
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45911	NC_013124	CCGGG	2	10	1756144	1756153	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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45921	NC_013124	TGC	2	6	1756560	1756565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372433
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45952	NC_013124	CG	3	6	1757719	1757724	0 %	0 %	50 %	50 %	256372434
45953	NC_013124	AGC	2	6	1757873	1757878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372434
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45957	NC_013124	GCC	2	6	1757950	1757955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372434
45958	NC_013124	CGAG	2	8	1757996	1758003	25 %	0 %	50 %	25 %	256372434
45959	NC_013124	GAG	2	6	1758253	1758258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372434
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45961	NC_013124	TCGG	2	8	1758280	1758287	0 %	25 %	50 %	25 %	256372434
45962	NC_013124	GC	3	6	1758362	1758367	0 %	0 %	50 %	50 %	256372434
45963	NC_013124	GC	3	6	1758418	1758423	0 %	0 %	50 %	50 %	256372434
45964	NC_013124	CTG	2	6	1758424	1758429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372434
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45982	NC_013124	GT	3	6	1759161	1759166	0 %	50 %	50 %	0 %	256372435
45983	NC_013124	CACG	2	8	1759175	1759182	25 %	0 %	25 %	50 %	256372435
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45995	NC_013124	CT	3	6	1759606	1759611	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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45998	NC_013124	GCC	2	6	1759847	1759852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45999	NC_013124	AGG	2	6	1759869	1759874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46000	NC_013124	GGTGAC	2	12	1759898	1759909	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding

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