MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331 chromosome

Total Repeats: 56359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_013124	GAA	2	6	1683241	1683246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256372368
44002	NC_013124	GAT	2	6	1683280	1683285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372368
44003	NC_013124	GCA	2	6	1683306	1683311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372368
44004	NC_013124	GTA	2	6	1683379	1683384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372368
44005	NC_013124	CCA	2	6	1683432	1683437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372368
44006	NC_013124	TGA	2	6	1683438	1683443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372368
44007	NC_013124	GCT	2	6	1683444	1683449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372368
44008	NC_013124	CGT	2	6	1683459	1683464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372368
44009	NC_013124	CGGA	2	8	1683509	1683516	25 %	0 %	50 %	25 %	256372368
44010	NC_013124	CGC	2	6	1683694	1683699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44011	NC_013124	GC	3	6	1683791	1683796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44012	NC_013124	CCGAA	2	10	1683859	1683868	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
44013	NC_013124	CTC	2	6	1683871	1683876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44014	NC_013124	TCG	2	6	1683887	1683892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44015	NC_013124	GGT	2	6	1683993	1683998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44016	NC_013124	TCC	2	6	1684017	1684022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44017	NC_013124	TCA	2	6	1684163	1684168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44018	NC_013124	GGC	2	6	1684169	1684174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44019	NC_013124	TGG	2	6	1684175	1684180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44020	NC_013124	AGCC	2	8	1684251	1684258	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44021	NC_013124	TCA	2	6	1684274	1684279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44022	NC_013124	TGG	2	6	1684372	1684377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44023	NC_013124	TCG	2	6	1684450	1684455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44024	NC_013124	CGAGA	2	10	1684486	1684495	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
44025	NC_013124	CCCA	2	8	1684549	1684556	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
44026	NC_013124	GCG	2	6	1684586	1684591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44027	NC_013124	CGC	2	6	1684620	1684625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372369
44028	NC_013124	CGA	2	6	1684669	1684674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372369
44029	NC_013124	ACC	2	6	1684697	1684702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372369
44030	NC_013124	ATC	2	6	1684725	1684730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256372369
44031	NC_013124	ACC	2	6	1684857	1684862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372369
44032	NC_013124	ACG	2	6	1684928	1684933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372369
44033	NC_013124	TTC	2	6	1684950	1684955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256372369
44034	NC_013124	CTTC	2	8	1684958	1684965	0 %	50 %	0 %	50 %	256372369
44035	NC_013124	CCA	2	6	1685213	1685218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372369
44036	NC_013124	CCG	2	6	1685219	1685224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372369
44037	NC_013124	ACG	2	6	1685259	1685264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44038	NC_013124	GGC	2	6	1685278	1685283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44039	NC_013124	AG	3	6	1685346	1685351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44040	NC_013124	GAC	2	6	1685389	1685394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44041	NC_013124	CGC	2	6	1685417	1685422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44042	NC_013124	CGTCA	2	10	1685439	1685448	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
44043	NC_013124	CTC	2	6	1685508	1685513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44044	NC_013124	TCG	2	6	1685526	1685531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44045	NC_013124	CAG	2	6	1685537	1685542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44046	NC_013124	ACG	2	6	1685583	1685588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44047	NC_013124	CGG	2	6	1685633	1685638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44048	NC_013124	CCG	2	6	1685671	1685676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44049	NC_013124	GC	3	6	1685737	1685742	0 %	0 %	50 %	50 %	256372370
44050	NC_013124	CGG	2	6	1685746	1685751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372370
44051	NC_013124	CGA	2	6	1685769	1685774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372370
44052	NC_013124	TCG	2	6	1685826	1685831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372370
44053	NC_013124	CAC	2	6	1685872	1685877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372370
44054	NC_013124	CGA	2	6	1685883	1685888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372370
44055	NC_013124	CACGCG	2	12	1685977	1685988	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	256372370
44056	NC_013124	GAC	2	6	1686042	1686047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372370
44057	NC_013124	GC	3	6	1686055	1686060	0 %	0 %	50 %	50 %	256372370
44058	NC_013124	TCGG	2	8	1686116	1686123	0 %	25 %	50 %	25 %	256372370
44059	NC_013124	CCCGA	2	10	1686142	1686151	20 %	0 %	20 %	60 %	256372370
44060	NC_013124	GTA	2	6	1686190	1686195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372370
44061	NC_013124	GAG	2	6	1686220	1686225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372370
44062	NC_013124	ATC	2	6	1686301	1686306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256372370
44063	NC_013124	CGA	2	6	1686324	1686329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372370
44064	NC_013124	GC	3	6	1686332	1686337	0 %	0 %	50 %	50 %	256372370
44065	NC_013124	TCG	2	6	1686383	1686388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372370
44066	NC_013124	CGC	2	6	1686409	1686414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372370
44067	NC_013124	CAG	2	6	1686466	1686471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372370
44068	NC_013124	ACC	3	9	1686491	1686499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372370
44069	NC_013124	CAGG	2	8	1686522	1686529	25 %	0 %	50 %	25 %	256372370
44070	NC_013124	CGC	2	6	1686612	1686617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372370
44071	NC_013124	CGGCCT	2	12	1686648	1686659	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	256372370
44072	NC_013124	CGA	2	6	1686666	1686671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372370
44073	NC_013124	ACG	2	6	1686674	1686679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372370
44074	NC_013124	ATC	2	6	1686691	1686696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256372370
44075	NC_013124	CAGCG	2	10	1686706	1686715	20 %	0 %	40 %	40 %	256372370
44076	NC_013124	CGA	2	6	1686750	1686755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372370
44077	NC_013124	CGG	2	6	1686795	1686800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372370
44078	NC_013124	CCT	2	6	1686830	1686835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44079	NC_013124	CAC	2	6	1686864	1686869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372371
44080	NC_013124	GTC	2	6	1686874	1686879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372371
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44082	NC_013124	CCA	2	6	1686902	1686907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372371
44083	NC_013124	CAC	2	6	1686966	1686971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372371
44084	NC_013124	CGT	2	6	1687119	1687124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372371
44085	NC_013124	CGGA	2	8	1687146	1687153	25 %	0 %	50 %	25 %	256372371
44086	NC_013124	GA	3	6	1687160	1687165	50 %	0 %	50 %	0 %	256372371
44087	NC_013124	CGT	2	6	1687178	1687183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372371
44088	NC_013124	CGT	2	6	1687250	1687255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372371
44089	NC_013124	GCCA	2	8	1687330	1687337	25 %	0 %	25 %	50 %	256372371
44090	NC_013124	AGC	2	6	1687451	1687456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372371
44091	NC_013124	TGG	2	6	1687510	1687515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256372371
44092	NC_013124	CCGC	2	8	1687520	1687527	0 %	0 %	25 %	75 %	256372371
44093	NC_013124	GCG	2	6	1687558	1687563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372371
44094	NC_013124	GCAC	2	8	1687570	1687577	25 %	0 %	25 %	50 %	256372371
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44097	NC_013124	CG	3	6	1687649	1687654	0 %	0 %	50 %	50 %	256372371
44098	NC_013124	CG	4	8	1687679	1687686	0 %	0 %	50 %	50 %	256372371
44099	NC_013124	ACG	2	6	1687693	1687698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372371
44100	NC_013124	GAG	2	6	1687869	1687874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372371
44101	NC_013124	CCG	2	6	1687879	1687884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372371
44102	NC_013124	GGT	2	6	1687892	1687897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256372371
44103	NC_013124	TGC	2	6	1687917	1687922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372371
44104	NC_013124	C	6	6	1687949	1687954	0 %	0 %	0 %	100 %	256372371
44105	NC_013124	CGG	2	6	1688034	1688039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372371
44106	NC_013124	CCA	2	6	1688046	1688051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372371
44107	NC_013124	CGT	2	6	1688052	1688057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372371
44108	NC_013124	CGC	4	12	1688066	1688077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372371
44109	NC_013124	CG	3	6	1688111	1688116	0 %	0 %	50 %	50 %	256372371
44110	NC_013124	AGC	2	6	1688125	1688130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372371
44111	NC_013124	ACC	2	6	1688180	1688185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372371
44112	NC_013124	CGA	3	9	1688243	1688251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372371
44113	NC_013124	GCG	3	9	1688261	1688269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372371
44114	NC_013124	ACG	2	6	1688270	1688275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372371
44115	NC_013124	GGCG	2	8	1688280	1688287	0 %	0 %	75 %	25 %	256372371
44116	NC_013124	GAGC	2	8	1688291	1688298	25 %	0 %	50 %	25 %	256372371
44117	NC_013124	CGA	2	6	1688312	1688317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372371
44118	NC_013124	GTG	2	6	1688341	1688346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256372371
44119	NC_013124	ACG	2	6	1688353	1688358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372371
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44218	NC_013124	GCC	2	6	1692187	1692192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44219	NC_013124	GTG	2	6	1692277	1692282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44220	NC_013124	TCC	2	6	1692303	1692308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44221	NC_013124	GGC	2	6	1692362	1692367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44222	NC_013124	CAC	2	6	1692400	1692405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44223	NC_013124	GCTC	2	8	1692406	1692413	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44224	NC_013124	CGG	2	6	1692441	1692446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44225	NC_013124	GAC	2	6	1692547	1692552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372374
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44231	NC_013124	GTC	2	6	1692874	1692879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372374
44232	NC_013124	CGA	3	9	1692924	1692932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372374
44233	NC_013124	GTGG	2	8	1692964	1692971	0 %	25 %	75 %	0 %	256372374
44234	NC_013124	TCC	2	6	1693040	1693045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372375
44235	NC_013124	TGG	2	6	1693061	1693066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256372375
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44334	NC_013124	GTC	2	6	1696618	1696623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372378
44335	NC_013124	ACGCTG	2	12	1696654	1696665	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	256372378
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44341	NC_013124	GCGCC	2	10	1696875	1696884	0 %	0 %	40 %	60 %	256372378
44342	NC_013124	CTCG	2	8	1696905	1696912	0 %	25 %	25 %	50 %	256372378
44343	NC_013124	GAG	2	6	1696915	1696920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372378
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44347	NC_013124	CGC	2	6	1697019	1697024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372378
44348	NC_013124	CTG	2	6	1697065	1697070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372378
44349	NC_013124	GCG	2	6	1697171	1697176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372378
44350	NC_013124	GCC	2	6	1697179	1697184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372378
44351	NC_013124	CTC	2	6	1697200	1697205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372378
44352	NC_013124	G	6	6	1697225	1697230	0 %	0 %	100 %	0 %	256372378
44353	NC_013124	AGC	2	6	1697237	1697242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372378
44354	NC_013124	TCCA	2	8	1697245	1697252	25 %	25 %	0 %	50 %	256372378
44355	NC_013124	TCGA	2	8	1697285	1697292	25 %	25 %	25 %	25 %	256372378
44356	NC_013124	GTCC	2	8	1697294	1697301	0 %	25 %	25 %	50 %	256372378
44357	NC_013124	GCA	2	6	1697353	1697358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372379
44358	NC_013124	CGT	2	6	1697414	1697419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372379
44359	NC_013124	CG	3	6	1697448	1697453	0 %	0 %	50 %	50 %	256372379
44360	NC_013124	AGT	2	6	1697539	1697544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372379
44361	NC_013124	GTA	2	6	1697570	1697575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372379
44362	NC_013124	CAC	2	6	1697579	1697584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372379
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44364	NC_013124	CGC	2	6	1697612	1697617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372379
44365	NC_013124	TCC	2	6	1697673	1697678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44366	NC_013124	CAG	3	9	1697709	1697717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372380
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44368	NC_013124	GGCT	2	8	1697748	1697755	0 %	25 %	50 %	25 %	256372380
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44384	NC_013124	GC	3	6	1698549	1698554	0 %	0 %	50 %	50 %	256372380
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44387	NC_013124	TGC	2	6	1698612	1698617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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44389	NC_013124	GCA	2	6	1698694	1698699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372381
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44402	NC_013124	CACG	2	8	1699109	1699116	25 %	0 %	25 %	50 %	256372381
44403	NC_013124	GCA	2	6	1699124	1699129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372381
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44418	NC_013124	CGC	2	6	1699605	1699610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372381
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44423	NC_013124	CGAT	2	8	1699811	1699818	25 %	25 %	25 %	25 %	256372382
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44425	NC_013124	GC	3	6	1699980	1699985	0 %	0 %	50 %	50 %	256372382
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44429	NC_013124	CAG	2	6	1700042	1700047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372382
44430	NC_013124	GCTC	2	8	1700107	1700114	0 %	25 %	25 %	50 %	256372382
44431	NC_013124	TCG	2	6	1700160	1700165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372382
44432	NC_013124	GC	3	6	1700178	1700183	0 %	0 %	50 %	50 %	256372382
44433	NC_013124	CCAGCG	2	12	1700214	1700225	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	256372382
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44436	NC_013124	CGC	2	6	1700318	1700323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372382
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44444	NC_013124	GAC	2	6	1700624	1700629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372382
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44446	NC_013124	GC	4	8	1700702	1700709	0 %	0 %	50 %	50 %	256372382
44447	NC_013124	GCA	2	6	1700754	1700759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372382
44448	NC_013124	GCT	2	6	1700794	1700799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372382
44449	NC_013124	GCTC	2	8	1700835	1700842	0 %	25 %	25 %	50 %	256372382
44450	NC_013124	AGCG	2	8	1700843	1700850	25 %	0 %	50 %	25 %	256372382
44451	NC_013124	CTC	2	6	1700870	1700875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372382
44452	NC_013124	GACC	2	8	1700903	1700910	25 %	0 %	25 %	50 %	256372382
44453	NC_013124	ACG	2	6	1700949	1700954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372382
44454	NC_013124	AC	3	6	1701022	1701027	50 %	0 %	0 %	50 %	256372382
44455	NC_013124	AGCA	2	8	1701044	1701051	50 %	0 %	25 %	25 %	256372382
44456	NC_013124	CCG	2	6	1701061	1701066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372382
44457	NC_013124	CGACGC	2	12	1701097	1701108	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	256372382
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44459	NC_013124	GC	4	8	1701188	1701195	0 %	0 %	50 %	50 %	256372382
44460	NC_013124	AC	3	6	1701254	1701259	50 %	0 %	0 %	50 %	256372382
44461	NC_013124	CA	3	6	1701277	1701282	50 %	0 %	0 %	50 %	256372382
44462	NC_013124	GAG	2	6	1701316	1701321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372382
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44464	NC_013124	CGC	2	6	1701446	1701451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372382
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