MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331 chromosome

Total Repeats: 56359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_013124	CCT	2	6	1664263	1664268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372350
43502	NC_013124	TCG	2	6	1664275	1664280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372350
43503	NC_013124	GCT	2	6	1664291	1664296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372350
43504	NC_013124	CGA	2	6	1664303	1664308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372350
43505	NC_013124	CG	3	6	1664375	1664380	0 %	0 %	50 %	50 %	256372350
43506	NC_013124	TCGC	2	8	1664393	1664400	0 %	25 %	25 %	50 %	256372350
43507	NC_013124	GGT	2	6	1664408	1664413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256372350
43508	NC_013124	GCT	2	6	1664417	1664422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372350
43509	NC_013124	ACC	2	6	1664459	1664464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372350
43510	NC_013124	CAC	2	6	1664492	1664497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372350
43511	NC_013124	GTC	2	6	1664532	1664537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372350
43512	NC_013124	CG	3	6	1664646	1664651	0 %	0 %	50 %	50 %	256372350
43513	NC_013124	AAC	2	6	1664692	1664697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256372350
43514	NC_013124	TCG	2	6	1664743	1664748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372350
43515	NC_013124	ACGA	2	8	1664802	1664809	50 %	0 %	25 %	25 %	256372350
43516	NC_013124	GAC	2	6	1664813	1664818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372350
43517	NC_013124	CGA	2	6	1664834	1664839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372350
43518	NC_013124	CGT	2	6	1664887	1664892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372350
43519	NC_013124	CGC	2	6	1664893	1664898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372350
43520	NC_013124	C	6	6	1664898	1664903	0 %	0 %	0 %	100 %	256372350
43521	NC_013124	CGA	2	6	1664924	1664929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372350
43522	NC_013124	CCG	2	6	1664946	1664951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372350
43523	NC_013124	CCGCC	2	10	1664953	1664962	0 %	0 %	20 %	80 %	256372350
43524	NC_013124	CCGA	2	8	1665051	1665058	25 %	0 %	25 %	50 %	256372350
43525	NC_013124	AG	3	6	1665080	1665085	50 %	0 %	50 %	0 %	256372350
43526	NC_013124	CGT	2	6	1665128	1665133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372350
43527	NC_013124	CGC	2	6	1665191	1665196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372350
43528	NC_013124	GC	3	6	1665221	1665226	0 %	0 %	50 %	50 %	256372350
43529	NC_013124	GGC	3	9	1665248	1665256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372350
43530	NC_013124	TGC	2	6	1665292	1665297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372350
43531	NC_013124	CGG	2	6	1665361	1665366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372350
43532	NC_013124	CCCT	2	8	1665368	1665375	0 %	25 %	0 %	75 %	256372350
43533	NC_013124	GTC	2	6	1665447	1665452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372350
43534	NC_013124	CGAT	2	8	1665481	1665488	25 %	25 %	25 %	25 %	256372351
43535	NC_013124	TCCACG	2	12	1665538	1665549	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	256372351
43536	NC_013124	TCG	2	6	1665562	1665567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372351
43537	NC_013124	GTG	2	6	1665587	1665592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256372351
43538	NC_013124	TCCA	2	8	1665604	1665611	25 %	25 %	0 %	50 %	256372351
43539	NC_013124	GAG	2	6	1665612	1665617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372351
43540	NC_013124	CG	3	6	1665664	1665669	0 %	0 %	50 %	50 %	256372351
43541	NC_013124	CGA	2	6	1665725	1665730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372351
43542	NC_013124	GCC	2	6	1665764	1665769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372351
43543	NC_013124	CGT	2	6	1665860	1665865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372351
43544	NC_013124	CTC	2	6	1665866	1665871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372351
43545	NC_013124	CGAC	2	8	1665874	1665881	25 %	0 %	25 %	50 %	256372351
43546	NC_013124	ACG	2	6	1665890	1665895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372351
43547	NC_013124	TCA	2	6	1665901	1665906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256372351
43548	NC_013124	GTC	2	6	1665936	1665941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372351
43549	NC_013124	CGA	2	6	1666028	1666033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372351
43550	NC_013124	CCG	2	6	1666045	1666050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43551	NC_013124	GGAC	2	8	1666086	1666093	25 %	0 %	50 %	25 %	256372352
43552	NC_013124	GCGA	2	8	1666094	1666101	25 %	0 %	50 %	25 %	256372352
43553	NC_013124	TCGC	2	8	1666106	1666113	0 %	25 %	25 %	50 %	256372352
43554	NC_013124	AGC	2	6	1666138	1666143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372352
43555	NC_013124	AGG	2	6	1666149	1666154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372352
43556	NC_013124	CG	3	6	1666203	1666208	0 %	0 %	50 %	50 %	256372352
43557	NC_013124	GAT	2	6	1666213	1666218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372352
43558	NC_013124	GAG	2	6	1666223	1666228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372352
43559	NC_013124	ACG	2	6	1666350	1666355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372352
43560	NC_013124	GCC	2	6	1666399	1666404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372352
43561	NC_013124	GAC	2	6	1666405	1666410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372352
43562	NC_013124	GGT	2	6	1666423	1666428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256372352
43563	NC_013124	CT	4	8	1666462	1666469	0 %	50 %	0 %	50 %	256372352
43564	NC_013124	GC	3	6	1666535	1666540	0 %	0 %	50 %	50 %	256372352
43565	NC_013124	GAA	2	6	1666544	1666549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256372352
43566	NC_013124	GAG	2	6	1666578	1666583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372352
43567	NC_013124	CGA	2	6	1666614	1666619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372352
43568	NC_013124	ATG	2	6	1666633	1666638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372352
43569	NC_013124	CGA	2	6	1666695	1666700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372353
43570	NC_013124	CGA	2	6	1666755	1666760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372353
43571	NC_013124	ACC	2	6	1666789	1666794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372353
43572	NC_013124	GCCC	2	8	1666803	1666810	0 %	0 %	25 %	75 %	256372353
43573	NC_013124	CCAA	2	8	1666866	1666873	50 %	0 %	0 %	50 %	256372353
43574	NC_013124	CGT	2	6	1666929	1666934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372353
43575	NC_013124	CGT	2	6	1666977	1666982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372353
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43577	NC_013124	CAGC	2	8	1667021	1667028	25 %	0 %	25 %	50 %	256372353
43578	NC_013124	CGG	2	6	1667036	1667041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372353
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43582	NC_013124	GATC	2	8	1667076	1667083	25 %	25 %	25 %	25 %	256372353
43583	NC_013124	CCG	2	6	1667150	1667155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372353
43584	NC_013124	CTC	2	6	1667233	1667238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372353
43585	NC_013124	ACGGTC	2	12	1667251	1667262	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	256372353
43586	NC_013124	CGA	2	6	1667333	1667338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372353
43587	NC_013124	CTC	2	6	1667342	1667347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372353
43588	NC_013124	GC	3	6	1667356	1667361	0 %	0 %	50 %	50 %	256372353
43589	NC_013124	GC	3	6	1667383	1667388	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43590	NC_013124	GGC	2	6	1667411	1667416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43591	NC_013124	GC	3	6	1667430	1667435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43592	NC_013124	GC	3	6	1667442	1667447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43593	NC_013124	CCA	2	6	1667453	1667458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43594	NC_013124	ACG	2	6	1667522	1667527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372354
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43596	NC_013124	GCC	2	6	1667576	1667581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372354
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43598	NC_013124	TCCG	2	8	1667638	1667645	0 %	25 %	25 %	50 %	256372354
43599	NC_013124	CGA	2	6	1667649	1667654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372354
43600	NC_013124	ACG	2	6	1667711	1667716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372354
43601	NC_013124	ATG	2	6	1667776	1667781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372354
43602	NC_013124	CGG	2	6	1667799	1667804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372354
43603	NC_013124	GCG	2	6	1667843	1667848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372354
43604	NC_013124	CGG	2	6	1667901	1667906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372354
43605	NC_013124	CTT	2	6	1667929	1667934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256372354
43606	NC_013124	TGC	2	6	1668003	1668008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43607	NC_013124	CCG	2	6	1668010	1668015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43608	NC_013124	CGA	2	6	1668030	1668035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43609	NC_013124	GCG	2	6	1668077	1668082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372355
43610	NC_013124	CG	3	6	1668127	1668132	0 %	0 %	50 %	50 %	256372355
43611	NC_013124	TGA	2	6	1668151	1668156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372355
43612	NC_013124	CCT	2	6	1668193	1668198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372355
43613	NC_013124	CGT	2	6	1668199	1668204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372355
43614	NC_013124	CGG	2	6	1668238	1668243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372355
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43616	NC_013124	GCA	2	6	1668262	1668267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372355
43617	NC_013124	CGA	2	6	1668277	1668282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372355
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43637	NC_013124	CCGC	2	8	1668936	1668943	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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43703	NC_013124	GAGC	2	8	1671555	1671562	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43704	NC_013124	CGA	3	9	1671581	1671589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372357
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43725	NC_013124	CGA	2	6	1672510	1672515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372358
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43729	NC_013124	GCC	2	6	1672703	1672708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372358
43730	NC_013124	GTC	2	6	1672722	1672727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372358
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43835	NC_013124	GCT	2	6	1676551	1676556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43837	NC_013124	CG	4	8	1676581	1676588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43838	NC_013124	CGG	2	6	1676598	1676603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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43840	NC_013124	GCC	2	6	1676645	1676650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43841	NC_013124	ACT	2	6	1676730	1676735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256372363
43842	NC_013124	GCA	2	6	1676741	1676746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372363
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43845	NC_013124	CGA	3	9	1676796	1676804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372363
43846	NC_013124	GCA	2	6	1676828	1676833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372363
43847	NC_013124	GCT	2	6	1676835	1676840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372363
43848	NC_013124	GCCA	2	8	1676903	1676910	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43849	NC_013124	GC	3	6	1676982	1676987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43850	NC_013124	TCGT	2	8	1676999	1677006	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43851	NC_013124	CCGTG	2	10	1677025	1677034	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
43852	NC_013124	AGC	2	6	1677042	1677047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43853	NC_013124	CGC	2	6	1677061	1677066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43854	NC_013124	CAC	2	6	1677138	1677143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372364
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43856	NC_013124	GAG	2	6	1677234	1677239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372364
43857	NC_013124	GAG	2	6	1677273	1677278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372364
43858	NC_013124	GC	3	6	1677446	1677451	0 %	0 %	50 %	50 %	256372364
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43863	NC_013124	GTA	2	6	1677606	1677611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372364
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43872	NC_013124	CGA	2	6	1678078	1678083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372364
43873	NC_013124	ACCT	2	8	1678089	1678096	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43874	NC_013124	GC	3	6	1678145	1678150	0 %	0 %	50 %	50 %	256372365
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43878	NC_013124	GTC	2	6	1678221	1678226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372365
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43881	NC_013124	CGGC	2	8	1678412	1678419	0 %	0 %	50 %	50 %	256372365
43882	NC_013124	GGC	3	9	1678417	1678425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372365
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43925	NC_013124	GCTCGA	2	12	1680233	1680244	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	256372365
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43953	NC_013124	CGA	2	6	1681466	1681471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372365
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43955	NC_013124	GCG	2	6	1681481	1681486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372365
43956	NC_013124	GATC	2	8	1681496	1681503	25 %	25 %	25 %	25 %	256372365
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43958	NC_013124	GC	3	6	1681532	1681537	0 %	0 %	50 %	50 %	256372366
43959	NC_013124	CGA	2	6	1681560	1681565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372366
43960	NC_013124	AGG	2	6	1681599	1681604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372366
43961	NC_013124	CGA	2	6	1681641	1681646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372366
43962	NC_013124	CGGC	2	8	1681655	1681662	0 %	0 %	50 %	50 %	256372366
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43964	NC_013124	CGA	2	6	1681716	1681721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372366
43965	NC_013124	GCCC	2	8	1681749	1681756	0 %	0 %	25 %	75 %	256372366
43966	NC_013124	TCG	2	6	1681796	1681801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372366
43967	NC_013124	GCA	2	6	1681845	1681850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372366
43968	NC_013124	CGG	2	6	1681860	1681865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372366
43969	NC_013124	TCAT	2	8	1681874	1681881	25 %	50 %	0 %	25 %	256372366
43970	NC_013124	CGA	2	6	1681935	1681940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372366
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43979	NC_013124	ACCG	2	8	1682327	1682334	25 %	0 %	25 %	50 %	256372367
43980	NC_013124	GA	3	6	1682350	1682355	50 %	0 %	50 %	0 %	256372367
43981	NC_013124	CGA	2	6	1682440	1682445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372367
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43984	NC_013124	CCTCT	2	10	1682620	1682629	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
43985	NC_013124	CG	4	8	1682651	1682658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43986	NC_013124	AGC	2	6	1682663	1682668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43988	NC_013124	ACC	2	6	1682789	1682794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372368
43989	NC_013124	ACG	2	6	1682846	1682851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372368
43990	NC_013124	CG	3	6	1682850	1682855	0 %	0 %	50 %	50 %	256372368
43991	NC_013124	TCA	2	6	1682927	1682932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256372368
43992	NC_013124	CG	3	6	1682937	1682942	0 %	0 %	50 %	50 %	256372368
43993	NC_013124	CCG	2	6	1682955	1682960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372368
43994	NC_013124	GAC	2	6	1683012	1683017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372368
43995	NC_013124	ACG	2	6	1683050	1683055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372368
43996	NC_013124	GGC	2	6	1683072	1683077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372368
43997	NC_013124	CGA	2	6	1683156	1683161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372368
43998	NC_013124	GAG	2	6	1683174	1683179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372368
43999	NC_013124	CCA	2	6	1683198	1683203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372368
44000	NC_013124	GAT	2	6	1683222	1683227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372368

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