MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331 chromosome

Total Repeats: 56359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_013124	AGC	2	6	1584163	1584168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372289
41502	NC_013124	CGC	2	6	1584175	1584180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372289
41503	NC_013124	GCG	3	9	1584200	1584208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372289
41504	NC_013124	CCG	2	6	1584249	1584254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372289
41505	NC_013124	CG	3	6	1584253	1584258	0 %	0 %	50 %	50 %	256372289
41506	NC_013124	CGC	2	6	1584271	1584276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372289
41507	NC_013124	CATC	2	8	1584289	1584296	25 %	25 %	0 %	50 %	256372289
41508	NC_013124	CG	3	6	1584297	1584302	0 %	0 %	50 %	50 %	256372289
41509	NC_013124	CGAG	2	8	1584333	1584340	25 %	0 %	50 %	25 %	256372289
41510	NC_013124	CGC	2	6	1584379	1584384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372289
41511	NC_013124	CGC	2	6	1584418	1584423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372289
41512	NC_013124	GTC	2	6	1584427	1584432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372289
41513	NC_013124	AGC	2	6	1584448	1584453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372289
41514	NC_013124	CCGGGA	2	12	1584504	1584515	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256372289
41515	NC_013124	CCGC	2	8	1584618	1584625	0 %	0 %	25 %	75 %	256372289
41516	NC_013124	TCG	2	6	1584661	1584666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41517	NC_013124	CG	3	6	1584735	1584740	0 %	0 %	50 %	50 %	256372290
41518	NC_013124	TCC	2	6	1584786	1584791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372290
41519	NC_013124	GCGCGT	2	12	1584802	1584813	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	256372290
41520	NC_013124	CGG	2	6	1584836	1584841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372290
41521	NC_013124	CGT	2	6	1584852	1584857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372290
41522	NC_013124	CAA	2	6	1584868	1584873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256372290
41523	NC_013124	GTC	2	6	1584875	1584880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372290
41524	NC_013124	GCT	2	6	1584912	1584917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372291
41525	NC_013124	GGA	2	6	1584948	1584953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372291
41526	NC_013124	CG	3	6	1584998	1585003	0 %	0 %	50 %	50 %	256372291
41527	NC_013124	AGC	2	6	1585095	1585100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372291
41528	NC_013124	CGA	2	6	1585164	1585169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372291
41529	NC_013124	CGAC	2	8	1585199	1585206	25 %	0 %	25 %	50 %	256372291
41530	NC_013124	CGT	2	6	1585361	1585366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372291
41531	NC_013124	TCG	3	9	1585403	1585411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372291
41532	NC_013124	GCC	2	6	1585441	1585446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372291
41533	NC_013124	CAGT	2	8	1585449	1585456	25 %	25 %	25 %	25 %	256372291
41534	NC_013124	AGC	2	6	1585482	1585487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372291
41535	NC_013124	TCG	3	9	1585517	1585525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372291
41536	NC_013124	AGG	2	6	1585526	1585531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372291
41537	NC_013124	GCGAT	2	10	1585586	1585595	20 %	20 %	40 %	20 %	256372291
41538	NC_013124	CGC	2	6	1585602	1585607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372291
41539	NC_013124	AGCG	2	8	1585609	1585616	25 %	0 %	50 %	25 %	256372291
41540	NC_013124	CGT	2	6	1585629	1585634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372291
41541	NC_013124	TC	3	6	1585653	1585658	0 %	50 %	0 %	50 %	256372291
41542	NC_013124	CTC	2	6	1585825	1585830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372291
41543	NC_013124	CTG	2	6	1585860	1585865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372291
41544	NC_013124	CAG	2	6	1585887	1585892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372291
41545	NC_013124	GT	3	6	1585895	1585900	0 %	50 %	50 %	0 %	256372291
41546	NC_013124	CGAA	2	8	1586000	1586007	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41547	NC_013124	GGC	2	6	1586075	1586080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372292
41548	NC_013124	GCA	2	6	1586086	1586091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372292
41549	NC_013124	CCG	2	6	1586128	1586133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372292
41550	NC_013124	CAT	2	6	1586141	1586146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256372292
41551	NC_013124	AAC	2	6	1586158	1586163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256372292
41552	NC_013124	TCT	2	6	1586185	1586190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256372292
41553	NC_013124	AAC	2	6	1586223	1586228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256372292
41554	NC_013124	CTG	2	6	1586244	1586249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372292
41555	NC_013124	CGT	2	6	1586345	1586350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372292
41556	NC_013124	TCT	2	6	1586413	1586418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256372292
41557	NC_013124	CAA	2	6	1586438	1586443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256372292
41558	NC_013124	GGC	2	6	1586454	1586459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372292
41559	NC_013124	CTCG	2	8	1586615	1586622	0 %	25 %	25 %	50 %	256372292
41560	NC_013124	TCG	2	6	1586755	1586760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372292
41561	NC_013124	CAC	2	6	1586786	1586791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372292
41562	NC_013124	CGA	2	6	1587107	1587112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372292
41563	NC_013124	TCC	2	6	1587133	1587138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372292
41564	NC_013124	CCG	2	6	1587209	1587214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372292
41565	NC_013124	GGC	2	6	1587271	1587276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372292
41566	NC_013124	CAT	2	6	1587287	1587292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256372292
41567	NC_013124	TCG	2	6	1587360	1587365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372292
41568	NC_013124	TCGC	2	8	1587369	1587376	0 %	25 %	25 %	50 %	256372292
41569	NC_013124	GCG	2	6	1587385	1587390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372292
41570	NC_013124	TCGC	2	8	1587396	1587403	0 %	25 %	25 %	50 %	256372292
41571	NC_013124	CTC	2	6	1587483	1587488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372292
41572	NC_013124	GGA	2	6	1587489	1587494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372292
41573	NC_013124	GCG	2	6	1587550	1587555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372292
41574	NC_013124	GCG	2	6	1587589	1587594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372292
41575	NC_013124	CAGGAG	2	12	1587607	1587618	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	256372292
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41577	NC_013124	CGT	2	6	1587797	1587802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372292
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41580	NC_013124	CGA	2	6	1587898	1587903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372293
41581	NC_013124	CGA	2	6	1587927	1587932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372293
41582	NC_013124	GGATC	2	10	1587961	1587970	20 %	20 %	40 %	20 %	256372293
41583	NC_013124	CCT	2	6	1587985	1587990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372293
41584	NC_013124	CGA	2	6	1587991	1587996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372293
41585	NC_013124	TCC	2	6	1587999	1588004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372293
41586	NC_013124	CGAC	2	8	1588067	1588074	25 %	0 %	25 %	50 %	256372293
41587	NC_013124	CTC	2	6	1588124	1588129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372293
41588	NC_013124	GATC	2	8	1588171	1588178	25 %	25 %	25 %	25 %	256372293
41589	NC_013124	GGA	2	6	1588180	1588185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372293
41590	NC_013124	CGAGCG	2	12	1588339	1588350	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256372293
41591	NC_013124	GTC	2	6	1588365	1588370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372293
41592	NC_013124	ACG	2	6	1588422	1588427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372293
41593	NC_013124	TC	3	6	1588450	1588455	0 %	50 %	0 %	50 %	256372293
41594	NC_013124	CGG	2	6	1588505	1588510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372293
41595	NC_013124	GGT	2	6	1588543	1588548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256372293
41596	NC_013124	GAC	2	6	1588550	1588555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372293
41597	NC_013124	TCT	2	6	1588614	1588619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256372293
41598	NC_013124	TTGC	2	8	1588715	1588722	0 %	50 %	25 %	25 %	256372293
41599	NC_013124	GGAT	2	8	1588744	1588751	25 %	25 %	50 %	0 %	256372293
41600	NC_013124	AGGT	2	8	1588830	1588837	25 %	25 %	50 %	0 %	256372293
41601	NC_013124	CTCG	2	8	1588841	1588848	0 %	25 %	25 %	50 %	256372293
41602	NC_013124	G	6	6	1588896	1588901	0 %	0 %	100 %	0 %	256372293
41603	NC_013124	TGG	2	6	1588923	1588928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256372293
41604	NC_013124	CACG	2	8	1588984	1588991	25 %	0 %	25 %	50 %	256372293
41605	NC_013124	CGA	2	6	1589017	1589022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372293
41606	NC_013124	GTC	2	6	1589096	1589101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372293
41607	NC_013124	CGA	2	6	1589113	1589118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372293
41608	NC_013124	CTC	2	6	1589141	1589146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372293
41609	NC_013124	CGAG	2	8	1589178	1589185	25 %	0 %	50 %	25 %	256372293
41610	NC_013124	ACGA	2	8	1589220	1589227	50 %	0 %	25 %	25 %	256372293
41611	NC_013124	CCT	3	9	1589229	1589237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372293
41612	NC_013124	C	6	6	1589253	1589258	0 %	0 %	0 %	100 %	256372293
41613	NC_013124	GCCG	2	8	1589278	1589285	0 %	0 %	50 %	50 %	256372294
41614	NC_013124	AGCG	2	8	1589311	1589318	25 %	0 %	50 %	25 %	256372294
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41616	NC_013124	CGC	2	6	1589385	1589390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372294
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41725	NC_013124	GTCGA	2	10	1594287	1594296	20 %	20 %	40 %	20 %	256372297
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41731	NC_013124	CGG	2	6	1594611	1594616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372297
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41849	NC_013124	GC	3	6	1599114	1599119	0 %	0 %	50 %	50 %	256372300
41850	NC_013124	GGA	2	6	1599120	1599125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372300
41851	NC_013124	ACG	2	6	1599136	1599141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372300
41852	NC_013124	TGC	2	6	1599155	1599160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372300
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41861	NC_013124	GAG	2	6	1599361	1599366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372300
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41863	NC_013124	CTCG	2	8	1599385	1599392	0 %	25 %	25 %	50 %	256372300
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41877	NC_013124	TCG	2	6	1599863	1599868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372300
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41885	NC_013124	CGAT	2	8	1600124	1600131	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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41950	NC_013124	GGA	2	6	1602787	1602792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372302
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41952	NC_013124	CGG	2	6	1602980	1602985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372302
41953	NC_013124	CTC	2	6	1602986	1602991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372302
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41955	NC_013124	TCG	2	6	1603056	1603061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372302
41956	NC_013124	CTTGGC	2	12	1603103	1603114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372302
41957	NC_013124	AGC	2	6	1603116	1603121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372302
41958	NC_013124	CGA	2	6	1603129	1603134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372302
41959	NC_013124	GATG	2	8	1603162	1603169	25 %	25 %	50 %	0 %	256372302
41960	NC_013124	TCG	2	6	1603197	1603202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372302
41961	NC_013124	CAG	2	6	1603208	1603213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372302
41962	NC_013124	GC	5	10	1603229	1603238	0 %	0 %	50 %	50 %	256372302
41963	NC_013124	GC	3	6	1603290	1603295	0 %	0 %	50 %	50 %	256372302
41964	NC_013124	GAT	2	6	1603328	1603333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372302
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