MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331 chromosome

Total Repeats: 56359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40502	NC_013124	CTGG	2	8	1544116	1544123	0 %	25 %	50 %	25 %	256372244
40503	NC_013124	GCA	2	6	1544126	1544131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372244
40504	NC_013124	CCA	2	6	1544135	1544140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372244
40505	NC_013124	ACG	2	6	1544146	1544151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372244
40506	NC_013124	GGC	2	6	1544153	1544158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372244
40507	NC_013124	CGT	2	6	1544173	1544178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372244
40508	NC_013124	TCG	2	6	1544181	1544186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372244
40509	NC_013124	ACC	2	6	1544189	1544194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372244
40510	NC_013124	GGCT	2	8	1544249	1544256	0 %	25 %	50 %	25 %	256372244
40511	NC_013124	CGC	2	6	1544261	1544266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372244
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40513	NC_013124	GGGCGC	2	12	1544350	1544361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372244
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40515	NC_013124	CGGC	2	8	1544433	1544440	0 %	0 %	50 %	50 %	256372244
40516	NC_013124	CCGA	2	8	1544493	1544500	25 %	0 %	25 %	50 %	256372244
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40519	NC_013124	CCGG	2	8	1544716	1544723	0 %	0 %	50 %	50 %	256372244
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40533	NC_013124	CGA	2	6	1545349	1545354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372245
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40608	NC_013124	CGA	2	6	1548218	1548223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40609	NC_013124	G	6	6	1548286	1548291	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
40610	NC_013124	GATG	2	8	1548296	1548303	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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40614	NC_013124	CCT	2	6	1548365	1548370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40615	NC_013124	ACG	2	6	1548396	1548401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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40617	NC_013124	CGA	2	6	1548489	1548494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40618	NC_013124	TCG	2	6	1548530	1548535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40619	NC_013124	TGG	3	9	1548580	1548588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40620	NC_013124	CCCA	2	8	1548598	1548605	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
40621	NC_013124	CTC	2	6	1548643	1548648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40622	NC_013124	CTC	3	9	1548654	1548662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40623	NC_013124	CCT	2	6	1548666	1548671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40624	NC_013124	GAG	3	9	1548679	1548687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40625	NC_013124	CCA	2	6	1548723	1548728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372249
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40632	NC_013124	TCG	2	6	1549173	1549178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372249
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40636	NC_013124	CTG	2	6	1549282	1549287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372249
40637	NC_013124	GGCACG	2	12	1549376	1549387	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256372249
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40646	NC_013124	CT	3	6	1550120	1550125	0 %	50 %	0 %	50 %	256372249
40647	NC_013124	GAG	2	6	1550172	1550177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372249
40648	NC_013124	AGCTG	2	10	1550242	1550251	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
40649	NC_013124	GCC	2	6	1550293	1550298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40650	NC_013124	GGA	2	6	1550305	1550310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40651	NC_013124	GTT	2	6	1550311	1550316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40652	NC_013124	GCG	2	6	1550353	1550358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40653	NC_013124	TCG	2	6	1550362	1550367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40654	NC_013124	TCTG	2	8	1550505	1550512	0 %	50 %	25 %	25 %	256372250
40655	NC_013124	CG	3	6	1550528	1550533	0 %	0 %	50 %	50 %	256372250
40656	NC_013124	CGAGA	2	10	1550537	1550546	40 %	0 %	40 %	20 %	256372250
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40658	NC_013124	CACGT	2	10	1550667	1550676	20 %	20 %	20 %	40 %	256372250
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40664	NC_013124	CGAT	2	8	1550753	1550760	25 %	25 %	25 %	25 %	256372250
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40672	NC_013124	CGC	3	9	1551041	1551049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372251
40673	NC_013124	AAT	2	6	1551085	1551090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40674	NC_013124	GGA	2	6	1551210	1551215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372252
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40676	NC_013124	AC	3	6	1551392	1551397	50 %	0 %	0 %	50 %	256372252
40677	NC_013124	ACG	2	6	1551399	1551404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372252
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40681	NC_013124	TCG	2	6	1551574	1551579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372252
40682	NC_013124	GCA	2	6	1551634	1551639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372252
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40687	NC_013124	GCG	2	6	1551739	1551744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372252
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40689	NC_013124	CGA	2	6	1552007	1552012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372252
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40692	NC_013124	CCT	2	6	1552255	1552260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40693	NC_013124	GA	3	6	1552264	1552269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40694	NC_013124	GTA	2	6	1552295	1552300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40695	NC_013124	GAC	2	6	1552400	1552405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372253
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40698	NC_013124	AGCC	2	8	1552748	1552755	25 %	0 %	25 %	50 %	256372253
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40702	NC_013124	TGA	2	6	1552915	1552920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372253
40703	NC_013124	TCG	2	6	1552995	1553000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372253
40704	NC_013124	ATCC	2	8	1553003	1553010	25 %	25 %	0 %	50 %	256372253
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40712	NC_013124	GA	3	6	1553293	1553298	50 %	0 %	50 %	0 %	256372254
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40715	NC_013124	CAG	2	6	1553324	1553329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372254
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40718	NC_013124	GC	3	6	1553441	1553446	0 %	0 %	50 %	50 %	256372254
40719	NC_013124	CGT	2	6	1553492	1553497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372254
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40723	NC_013124	GCT	2	6	1553626	1553631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372254
40724	NC_013124	GTCG	2	8	1553657	1553664	0 %	25 %	50 %	25 %	256372254
40725	NC_013124	GAC	2	6	1553692	1553697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372254
40726	NC_013124	GCA	2	6	1553724	1553729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372254
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40729	NC_013124	CGA	2	6	1553866	1553871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372254
40730	NC_013124	CGC	2	6	1553879	1553884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372254
40731	NC_013124	AAC	2	6	1553930	1553935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256372254
40732	NC_013124	TGACC	2	10	1554007	1554016	20 %	20 %	20 %	40 %	256372254
40733	NC_013124	GGC	2	6	1554029	1554034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372254
40734	NC_013124	GAG	2	6	1554083	1554088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372254
40735	NC_013124	GAC	2	6	1554104	1554109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372254
40736	NC_013124	CGA	3	9	1554127	1554135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372254
40737	NC_013124	GAG	2	6	1554208	1554213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372255
40738	NC_013124	CGCCGG	2	12	1554239	1554250	0 %	0 %	50 %	50 %	256372255
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40746	NC_013124	CGG	2	6	1554744	1554749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372255
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40773	NC_013124	GCC	2	6	1555681	1555686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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40811	NC_013124	CTC	2	6	1557119	1557124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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40838	NC_013124	AGCTG	2	10	1558718	1558727	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
40839	NC_013124	GCC	2	6	1558769	1558774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40840	NC_013124	GGA	2	6	1558781	1558786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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40842	NC_013124	GGC	2	6	1558828	1558833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40843	NC_013124	AG	3	6	1558928	1558933	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40844	NC_013124	CCG	2	6	1558938	1558943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40845	NC_013124	CGA	2	6	1558950	1558955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40846	NC_013124	CGA	2	6	1559009	1559014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40847	NC_013124	GCCC	2	8	1559065	1559072	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40848	NC_013124	GATG	2	8	1559097	1559104	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40849	NC_013124	GGC	2	6	1559113	1559118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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40959	NC_013124	CG	4	8	1563205	1563212	0 %	0 %	50 %	50 %	256372265
40960	NC_013124	GC	3	6	1563271	1563276	0 %	0 %	50 %	50 %	256372265
40961	NC_013124	CTT	2	6	1563308	1563313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256372265
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40963	NC_013124	CGA	2	6	1563332	1563337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372265
40964	NC_013124	CGT	2	6	1563359	1563364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372265
40965	NC_013124	CGA	3	9	1563368	1563376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372265
40966	NC_013124	ATC	2	6	1563501	1563506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256372265
40967	NC_013124	CGC	2	6	1563515	1563520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372265
40968	NC_013124	GTC	2	6	1563617	1563622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372266
40969	NC_013124	GTC	2	6	1563701	1563706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372266
40970	NC_013124	CCGA	2	8	1563707	1563714	25 %	0 %	25 %	50 %	256372266
40971	NC_013124	CGC	2	6	1563779	1563784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372266
40972	NC_013124	CGA	2	6	1563791	1563796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372266
40973	NC_013124	TCC	2	6	1563809	1563814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372267
40974	NC_013124	GACC	2	8	1563876	1563883	25 %	0 %	25 %	50 %	256372267
40975	NC_013124	C	6	6	1563959	1563964	0 %	0 %	0 %	100 %	256372267
40976	NC_013124	ACG	2	6	1563966	1563971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372267
40977	NC_013124	GTG	2	6	1563976	1563981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256372267
40978	NC_013124	CCA	2	6	1564041	1564046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372267
40979	NC_013124	CCA	2	6	1564052	1564057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372267
40980	NC_013124	CTG	2	6	1564063	1564068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372267
40981	NC_013124	CGA	2	6	1564080	1564085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372267
40982	NC_013124	GGT	2	6	1564150	1564155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256372267
40983	NC_013124	GAT	2	6	1564234	1564239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372267
40984	NC_013124	CG	3	6	1564269	1564274	0 %	0 %	50 %	50 %	256372267
40985	NC_013124	TCG	2	6	1564286	1564291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372267
40986	NC_013124	CAC	2	6	1564354	1564359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372267
40987	NC_013124	GCA	2	6	1564389	1564394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372267
40988	NC_013124	CAC	2	6	1564510	1564515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372267
40989	NC_013124	ACG	2	6	1564637	1564642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372267
40990	NC_013124	AGC	2	6	1564664	1564669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372267
40991	NC_013124	CCGAA	2	10	1564692	1564701	40 %	0 %	20 %	40 %	256372267
40992	NC_013124	ACC	2	6	1564714	1564719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372267
40993	NC_013124	GTA	2	6	1564798	1564803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372267
40994	NC_013124	CTCG	2	8	1564849	1564856	0 %	25 %	25 %	50 %	256372267
40995	NC_013124	CGT	2	6	1564899	1564904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372267
40996	NC_013124	CTC	2	6	1564947	1564952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372268
40997	NC_013124	ACC	2	6	1564975	1564980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372268
40998	NC_013124	CGA	2	6	1564991	1564996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372268
40999	NC_013124	CGT	2	6	1565030	1565035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372268
41000	NC_013124	GCG	2	6	1565109	1565114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372268

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