MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331 chromosome

Total Repeats: 56359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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39002	NC_013124	AGC	2	6	1485179	1485184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372192
39003	NC_013124	CGACG	2	10	1485229	1485238	20 %	0 %	40 %	40 %	256372192
39004	NC_013124	CGA	2	6	1485276	1485281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372192
39005	NC_013124	GCG	2	6	1485282	1485287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372192
39006	NC_013124	CCCG	2	8	1485321	1485328	0 %	0 %	25 %	75 %	256372192
39007	NC_013124	CCG	2	6	1485331	1485336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372192
39008	NC_013124	CCG	2	6	1485360	1485365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372192
39009	NC_013124	CTC	2	6	1485411	1485416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372192
39010	NC_013124	CTC	2	6	1485425	1485430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372192
39011	NC_013124	GC	3	6	1485496	1485501	0 %	0 %	50 %	50 %	256372192
39012	NC_013124	CGA	2	6	1485516	1485521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372192
39013	NC_013124	CTCG	2	8	1485565	1485572	0 %	25 %	25 %	50 %	256372192
39014	NC_013124	TGCCG	2	10	1485586	1485595	0 %	20 %	40 %	40 %	256372192
39015	NC_013124	GCG	2	6	1485603	1485608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372192
39016	NC_013124	GCC	2	6	1485648	1485653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372192
39017	NC_013124	GCC	2	6	1485663	1485668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372192
39018	NC_013124	CCG	2	6	1485784	1485789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372192
39019	NC_013124	CGG	2	6	1485794	1485799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372192
39020	NC_013124	CCT	2	6	1485807	1485812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372192
39021	NC_013124	GTG	2	6	1485817	1485822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256372192
39022	NC_013124	CCAGG	2	10	1485844	1485853	20 %	0 %	40 %	40 %	256372192
39023	NC_013124	TGC	2	6	1485879	1485884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372192
39024	NC_013124	GCG	2	6	1485919	1485924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372192
39025	NC_013124	GCCC	2	8	1485998	1486005	0 %	0 %	25 %	75 %	256372192
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39029	NC_013124	GC	3	6	1486107	1486112	0 %	0 %	50 %	50 %	256372192
39030	NC_013124	CTG	2	6	1486232	1486237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372192
39031	NC_013124	GGC	2	6	1486258	1486263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372192
39032	NC_013124	CGT	2	6	1486300	1486305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372192
39033	NC_013124	GA	3	6	1486419	1486424	50 %	0 %	50 %	0 %	256372192
39034	NC_013124	CCGA	2	8	1486427	1486434	25 %	0 %	25 %	50 %	256372192
39035	NC_013124	ACCG	2	8	1486452	1486459	25 %	0 %	25 %	50 %	256372192
39036	NC_013124	CGT	2	6	1486558	1486563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372192
39037	NC_013124	ATG	2	6	1486572	1486577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372192
39038	NC_013124	TCC	2	6	1486619	1486624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372193
39039	NC_013124	GACC	2	8	1486662	1486669	25 %	0 %	25 %	50 %	256372193
39040	NC_013124	CGA	2	6	1486712	1486717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372193
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39042	NC_013124	CGA	2	6	1486799	1486804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372193
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39051	NC_013124	GC	3	6	1487247	1487252	0 %	0 %	50 %	50 %	256372195
39052	NC_013124	CAG	2	6	1487260	1487265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372195
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39112	NC_013124	GAG	2	6	1489793	1489798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39113	NC_013124	TCAC	2	8	1489801	1489808	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39114	NC_013124	ACTC	2	8	1489816	1489823	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39115	NC_013124	CCA	2	6	1489862	1489867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39116	NC_013124	CA	4	8	1490005	1490012	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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39230	NC_013124	GCG	2	6	1495554	1495559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372203
39231	NC_013124	CGGCGA	2	12	1495578	1495589	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256372203
39232	NC_013124	GCTC	2	8	1495594	1495601	0 %	25 %	25 %	50 %	256372203
39233	NC_013124	TCCCAC	2	12	1495613	1495624	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	256372203
39234	NC_013124	ACG	2	6	1495647	1495652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372203
39235	NC_013124	GGTGTT	2	12	1495660	1495671	0 %	50 %	50 %	0 %	256372203
39236	NC_013124	GGA	2	6	1495738	1495743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372203
39237	NC_013124	TCG	2	6	1495791	1495796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372203
39238	NC_013124	TGA	2	6	1495805	1495810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372203
39239	NC_013124	CCAT	2	8	1495862	1495869	25 %	25 %	0 %	50 %	256372203
39240	NC_013124	TCG	2	6	1495946	1495951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372203
39241	NC_013124	CGA	3	9	1495959	1495967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372203
39242	NC_013124	ATC	2	6	1496003	1496008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256372203
39243	NC_013124	CGA	2	6	1496036	1496041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372203
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39245	NC_013124	GGC	3	9	1496125	1496133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372203
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39247	NC_013124	CGT	2	6	1496205	1496210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372203
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39250	NC_013124	CGC	2	6	1496296	1496301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372203
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39253	NC_013124	CCTT	2	8	1496463	1496470	0 %	50 %	0 %	50 %	256372204
39254	NC_013124	GAC	2	6	1496485	1496490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372204
39255	NC_013124	GTC	2	6	1496574	1496579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372204
39256	NC_013124	ACCGG	2	10	1496627	1496636	20 %	0 %	40 %	40 %	256372204
39257	NC_013124	GAC	2	6	1496895	1496900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372204
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39259	NC_013124	GCG	2	6	1497020	1497025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372204
39260	NC_013124	CCGA	2	8	1497085	1497092	25 %	0 %	25 %	50 %	256372204
39261	NC_013124	TCG	2	6	1497149	1497154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372204
39262	NC_013124	CTCG	2	8	1497199	1497206	0 %	25 %	25 %	50 %	256372204
39263	NC_013124	ACC	2	6	1497211	1497216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372204
39264	NC_013124	CA	3	6	1497312	1497317	50 %	0 %	0 %	50 %	256372204
39265	NC_013124	CGA	2	6	1497354	1497359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372204
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39267	NC_013124	CGAGA	2	10	1497421	1497430	40 %	0 %	40 %	20 %	256372204
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39269	NC_013124	CGG	2	6	1497535	1497540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372204
39270	NC_013124	CAAC	2	8	1497549	1497556	50 %	0 %	0 %	50 %	256372204
39271	NC_013124	CGTCG	2	10	1497581	1497590	0 %	20 %	40 %	40 %	256372204
39272	NC_013124	GCC	2	6	1497611	1497616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372204
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39274	NC_013124	GCA	2	6	1497674	1497679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372205
39275	NC_013124	CTC	2	6	1497711	1497716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372205
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39282	NC_013124	TCG	2	6	1497970	1497975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372205
39283	NC_013124	GCGG	2	8	1497980	1497987	0 %	0 %	75 %	25 %	256372205
39284	NC_013124	AGCGC	2	10	1498004	1498013	20 %	0 %	40 %	40 %	256372205
39285	NC_013124	CGG	2	6	1498040	1498045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372205
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39287	NC_013124	ACG	2	6	1498158	1498163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372205
39288	NC_013124	GGA	2	6	1498175	1498180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372205
39289	NC_013124	CGA	2	6	1498241	1498246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372205
39290	NC_013124	GCGCA	2	10	1498266	1498275	20 %	0 %	40 %	40 %	256372205
39291	NC_013124	CGA	2	6	1498283	1498288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372205
39292	NC_013124	CCA	2	6	1498301	1498306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372205
39293	NC_013124	GCA	2	6	1498361	1498366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372205
39294	NC_013124	GTC	2	6	1498383	1498388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372205
39295	NC_013124	GC	4	8	1498422	1498429	0 %	0 %	50 %	50 %	256372205
39296	NC_013124	GCC	2	6	1498475	1498480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372205
39297	NC_013124	GCC	2	6	1498489	1498494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372205
39298	NC_013124	CGA	2	6	1498499	1498504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372205
39299	NC_013124	CGT	2	6	1498511	1498516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372205
39300	NC_013124	CGA	2	6	1498637	1498642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372205
39301	NC_013124	GCC	2	6	1498682	1498687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372205
39302	NC_013124	AGG	2	6	1498690	1498695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372205
39303	NC_013124	CTGG	2	8	1498753	1498760	0 %	25 %	50 %	25 %	256372205
39304	NC_013124	GTC	2	6	1498797	1498802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372205
39305	NC_013124	GTA	2	6	1498890	1498895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372205
39306	NC_013124	G	7	7	1498907	1498913	0 %	0 %	100 %	0 %	256372205
39307	NC_013124	AGC	2	6	1498917	1498922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372205
39308	NC_013124	CGA	2	6	1498925	1498930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372205
39309	NC_013124	CGA	3	9	1498940	1498948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372205
39310	NC_013124	ACC	2	6	1498969	1498974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372205
39311	NC_013124	GCA	2	6	1499000	1499005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372205
39312	NC_013124	CG	3	6	1499011	1499016	0 %	0 %	50 %	50 %	256372205
39313	NC_013124	GAT	3	9	1499022	1499030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372205
39314	NC_013124	CTCGA	2	10	1499083	1499092	20 %	20 %	20 %	40 %	256372205
39315	NC_013124	CGAC	2	8	1499108	1499115	25 %	0 %	25 %	50 %	256372205
39316	NC_013124	CTC	2	6	1499136	1499141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372205
39317	NC_013124	TC	3	6	1499363	1499368	0 %	50 %	0 %	50 %	256372205
39318	NC_013124	TGCG	2	8	1499428	1499435	0 %	25 %	50 %	25 %	256372205
39319	NC_013124	CGA	2	6	1499495	1499500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372205
39320	NC_013124	GCA	2	6	1499587	1499592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372205
39321	NC_013124	CGC	2	6	1499619	1499624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372205
39322	NC_013124	ACCG	2	8	1499656	1499663	25 %	0 %	25 %	50 %	256372205
39323	NC_013124	CGAGAC	2	12	1499675	1499686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372205
39324	NC_013124	CGA	2	6	1499708	1499713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372205
39325	NC_013124	CGA	2	6	1499722	1499727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372205
39326	NC_013124	GCTCG	2	10	1499759	1499768	0 %	20 %	40 %	40 %	256372205
39327	NC_013124	TCGA	2	8	1499772	1499779	25 %	25 %	25 %	25 %	256372205
39328	NC_013124	AGC	2	6	1499780	1499785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372205
39329	NC_013124	AGC	2	6	1499794	1499799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372205
39330	NC_013124	CTC	2	6	1499814	1499819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372205
39331	NC_013124	TCG	2	6	1499825	1499830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372205
39332	NC_013124	GAA	2	6	1499879	1499884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256372205
39333	NC_013124	CGA	2	6	1499891	1499896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372205
39334	NC_013124	CCT	2	6	1499977	1499982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39335	NC_013124	TCA	2	6	1500002	1500007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39336	NC_013124	ACG	2	6	1500027	1500032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372206
39337	NC_013124	CGA	2	6	1500044	1500049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372206
39338	NC_013124	CAA	2	6	1500112	1500117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256372206
39339	NC_013124	GGC	2	6	1500130	1500135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372206
39340	NC_013124	CTTGCC	2	12	1500148	1500159	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	256372206
39341	NC_013124	CGT	2	6	1500164	1500169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372206
39342	NC_013124	AGC	2	6	1500178	1500183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372206
39343	NC_013124	CGA	2	6	1500185	1500190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372206
39344	NC_013124	CGA	2	6	1500195	1500200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372206
39345	NC_013124	CGA	2	6	1500222	1500227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372206
39346	NC_013124	GCG	2	6	1500254	1500259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372206
39347	NC_013124	CGA	2	6	1500291	1500296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372206
39348	NC_013124	ACCC	2	8	1500306	1500313	25 %	0 %	0 %	75 %	256372206
39349	NC_013124	ATG	2	6	1500341	1500346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372206
39350	NC_013124	CGA	2	6	1500509	1500514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372206
39351	NC_013124	GA	3	6	1500513	1500518	50 %	0 %	50 %	0 %	256372206
39352	NC_013124	TGGCA	2	10	1500520	1500529	20 %	20 %	40 %	20 %	256372206
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39354	NC_013124	GAC	2	6	1500693	1500698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39355	NC_013124	CGA	2	6	1500751	1500756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372207
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39383	NC_013124	GATC	2	8	1501812	1501819	25 %	25 %	25 %	25 %	256372207
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39390	NC_013124	GCCC	2	8	1502140	1502147	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39391	NC_013124	GC	3	6	1502194	1502199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39392	NC_013124	CG	3	6	1502214	1502219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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39397	NC_013124	CCGA	2	8	1502400	1502407	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39398	NC_013124	CGT	2	6	1502425	1502430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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39421	NC_013124	GCC	2	6	1503160	1503165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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39423	NC_013124	TCG	2	6	1503187	1503192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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39464	NC_013124	GCCG	2	8	1504880	1504887	0 %	0 %	50 %	50 %	256372210
39465	NC_013124	CGA	2	6	1504927	1504932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372210
39466	NC_013124	ACC	2	6	1504938	1504943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372210
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39469	NC_013124	ACC	2	6	1504971	1504976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372210
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