MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331 chromosome

Total Repeats: 56359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36502	NC_013124	CG	3	6	1389252	1389257	0 %	0 %	50 %	50 %	256372109
36503	NC_013124	CGC	3	9	1389321	1389329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372109
36504	NC_013124	CTC	2	6	1389352	1389357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372109
36505	NC_013124	AGC	2	6	1389372	1389377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372109
36506	NC_013124	CGA	2	6	1389405	1389410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372109
36507	NC_013124	TCG	2	6	1389416	1389421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372109
36508	NC_013124	TCG	2	6	1389431	1389436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372109
36509	NC_013124	CGC	2	6	1389486	1389491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372109
36510	NC_013124	GCGG	2	8	1389511	1389518	0 %	0 %	75 %	25 %	256372109
36511	NC_013124	GTC	2	6	1389562	1389567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372109
36512	NC_013124	CGC	2	6	1389591	1389596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372109
36513	NC_013124	CGC	2	6	1389613	1389618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372109
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36518	NC_013124	AC	3	6	1389729	1389734	50 %	0 %	0 %	50 %	256372109
36519	NC_013124	CGC	2	6	1389744	1389749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372109
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36531	NC_013124	CGA	2	6	1390324	1390329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36532	NC_013124	GTCGC	2	10	1390344	1390353	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36533	NC_013124	G	6	6	1390387	1390392	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36534	NC_013124	CGT	2	6	1390406	1390411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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36591	NC_013124	GC	3	6	1393423	1393428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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36597	NC_013124	GC	3	6	1393586	1393591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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36602	NC_013124	CG	3	6	1393740	1393745	0 %	0 %	50 %	50 %	256372113
36603	NC_013124	GC	3	6	1393748	1393753	0 %	0 %	50 %	50 %	256372113
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36607	NC_013124	GCTTCG	2	12	1393885	1393896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372113
36608	NC_013124	GC	3	6	1393901	1393906	0 %	0 %	50 %	50 %	256372113
36609	NC_013124	GGT	2	6	1393911	1393916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256372113
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36612	NC_013124	CGA	2	6	1393976	1393981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372113
36613	NC_013124	GCGA	2	8	1394001	1394008	25 %	0 %	50 %	25 %	256372113
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36618	NC_013124	CTCG	2	8	1394163	1394170	0 %	25 %	25 %	50 %	256372113
36619	NC_013124	ATC	2	6	1394244	1394249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256372113
36620	NC_013124	CGG	2	6	1394304	1394309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372114
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36722	NC_013124	CGAG	2	8	1398341	1398348	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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36735	NC_013124	C	6	6	1398831	1398836	0 %	0 %	0 %	100 %	256372118
36736	NC_013124	CGAC	2	8	1398946	1398953	25 %	0 %	25 %	50 %	256372118
36737	NC_013124	AGC	2	6	1398972	1398977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372118
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36744	NC_013124	CCT	2	6	1399121	1399126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372118
36745	NC_013124	CG	3	6	1399127	1399132	0 %	0 %	50 %	50 %	256372118
36746	NC_013124	GTT	2	6	1399136	1399141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256372118
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36748	NC_013124	CGC	2	6	1399262	1399267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372118
36749	NC_013124	GC	3	6	1399266	1399271	0 %	0 %	50 %	50 %	256372118
36750	NC_013124	GATG	2	8	1399322	1399329	25 %	25 %	50 %	0 %	256372118
36751	NC_013124	C	6	6	1399332	1399337	0 %	0 %	0 %	100 %	256372118
36752	NC_013124	CTCC	2	8	1399442	1399449	0 %	25 %	0 %	75 %	256372118
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36755	NC_013124	GA	3	6	1399506	1399511	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36756	NC_013124	CGA	2	6	1399529	1399534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36757	NC_013124	GTC	2	6	1399604	1399609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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36820	NC_013124	GC	3	6	1402017	1402022	0 %	0 %	50 %	50 %	256372121
36821	NC_013124	CGA	2	6	1402175	1402180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372121
36822	NC_013124	CG	3	6	1402198	1402203	0 %	0 %	50 %	50 %	256372121
36823	NC_013124	CTC	2	6	1402230	1402235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372121
36824	NC_013124	CTC	2	6	1402308	1402313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36825	NC_013124	CATC	2	8	1402358	1402365	25 %	25 %	0 %	50 %	256372122
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36832	NC_013124	CGC	2	6	1402604	1402609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372122
36833	NC_013124	ACG	3	9	1402729	1402737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372122
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36837	NC_013124	GCG	2	6	1402896	1402901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372122
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36839	NC_013124	CGA	2	6	1402949	1402954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372122
36840	NC_013124	GCC	2	6	1403054	1403059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372122
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36842	NC_013124	CTC	2	6	1403103	1403108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372122
36843	NC_013124	CGC	2	6	1403109	1403114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372122
36844	NC_013124	AGC	2	6	1403146	1403151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372122
36845	NC_013124	ACCGGC	2	12	1403182	1403193	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	256372122
36846	NC_013124	CGA	2	6	1403261	1403266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372122
36847	NC_013124	GGCGC	2	10	1403283	1403292	0 %	0 %	60 %	40 %	256372122
36848	NC_013124	TCC	2	6	1403314	1403319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372122
36849	NC_013124	G	6	6	1403325	1403330	0 %	0 %	100 %	0 %	256372122
36850	NC_013124	CGA	2	6	1403342	1403347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372122
36851	NC_013124	CCGC	2	8	1403363	1403370	0 %	0 %	25 %	75 %	256372122
36852	NC_013124	GCC	2	6	1403377	1403382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372122
36853	NC_013124	GCA	2	6	1403401	1403406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372122
36854	NC_013124	GCC	2	6	1403433	1403438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372122
36855	NC_013124	CGA	2	6	1403444	1403449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372122
36856	NC_013124	GCG	2	6	1403456	1403461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372122
36857	NC_013124	CCT	2	6	1403483	1403488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372122
36858	NC_013124	ACC	2	6	1403521	1403526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372122
36859	NC_013124	TCG	2	6	1403532	1403537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372122
36860	NC_013124	CAC	2	6	1403541	1403546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372122
36861	NC_013124	CGA	2	6	1403585	1403590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372122
36862	NC_013124	ACG	2	6	1403593	1403598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372122
36863	NC_013124	TGC	2	6	1403606	1403611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372122
36864	NC_013124	GC	3	6	1403638	1403643	0 %	0 %	50 %	50 %	256372123
36865	NC_013124	TCG	2	6	1403650	1403655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372123
36866	NC_013124	CGA	2	6	1403656	1403661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372123
36867	NC_013124	GACA	2	8	1403718	1403725	50 %	0 %	25 %	25 %	256372123
36868	NC_013124	GCA	2	6	1403734	1403739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372123
36869	NC_013124	GAG	2	6	1403792	1403797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372123
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36871	NC_013124	CGA	2	6	1403842	1403847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372123
36872	NC_013124	GAG	2	6	1403876	1403881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372123
36873	NC_013124	GCA	2	6	1403887	1403892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372123
36874	NC_013124	GCT	2	6	1403895	1403900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372123
36875	NC_013124	GAC	2	6	1403915	1403920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372123
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36878	NC_013124	CG	3	6	1403962	1403967	0 %	0 %	50 %	50 %	256372123
36879	NC_013124	GCG	2	6	1404124	1404129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372123
36880	NC_013124	C	7	7	1404139	1404145	0 %	0 %	0 %	100 %	256372123
36881	NC_013124	TCG	2	6	1404159	1404164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372123
36882	NC_013124	GAT	2	6	1404218	1404223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372123
36883	NC_013124	TCG	2	6	1404243	1404248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372123
36884	NC_013124	GAG	2	6	1404329	1404334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372123
36885	NC_013124	CGT	2	6	1404370	1404375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372123
36886	NC_013124	GCACGA	2	12	1404385	1404396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372123
36887	NC_013124	CGCC	2	8	1404415	1404422	0 %	0 %	25 %	75 %	256372123
36888	NC_013124	CGA	2	6	1404424	1404429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372123
36889	NC_013124	CCAG	2	8	1404436	1404443	25 %	0 %	25 %	50 %	256372123
36890	NC_013124	GCA	2	6	1404472	1404477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372123
36891	NC_013124	GAC	2	6	1404542	1404547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372123
36892	NC_013124	CGT	2	6	1404581	1404586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372123
36893	NC_013124	GTC	3	9	1404617	1404625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372123
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36896	NC_013124	AG	3	6	1404725	1404730	50 %	0 %	50 %	0 %	256372123
36897	NC_013124	CGC	2	6	1404752	1404757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372123
36898	NC_013124	AC	3	6	1404781	1404786	50 %	0 %	0 %	50 %	256372123
36899	NC_013124	CTCG	2	8	1404790	1404797	0 %	25 %	25 %	50 %	256372123
36900	NC_013124	CGT	2	6	1404817	1404822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372123
36901	NC_013124	CGA	2	6	1404928	1404933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372123
36902	NC_013124	CGC	2	6	1405038	1405043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372124
36903	NC_013124	TGC	2	6	1405097	1405102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372124
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36911	NC_013124	TCG	3	9	1405292	1405300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372124
36912	NC_013124	CCA	2	6	1405329	1405334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372124
36913	NC_013124	GAG	2	6	1405396	1405401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372124
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36915	NC_013124	TCG	2	6	1405442	1405447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372124
36916	NC_013124	AGG	2	6	1405457	1405462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372124
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36922	NC_013124	GGC	2	6	1405623	1405628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372124
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36930	NC_013124	CGC	2	6	1405853	1405858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372124
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36932	NC_013124	GAG	2	6	1405888	1405893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372124
36933	NC_013124	TTC	2	6	1405900	1405905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256372124
36934	NC_013124	CTCC	2	8	1405909	1405916	0 %	25 %	0 %	75 %	256372124
36935	NC_013124	CGT	2	6	1405950	1405955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372124
36936	NC_013124	CGAG	2	8	1405995	1406002	25 %	0 %	50 %	25 %	256372124
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36939	NC_013124	GTCG	2	8	1406060	1406067	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36940	NC_013124	GGAG	2	8	1406119	1406126	25 %	0 %	75 %	0 %	256372125
36941	NC_013124	CGC	2	6	1406158	1406163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372125
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36946	NC_013124	CGCC	2	8	1406408	1406415	0 %	0 %	25 %	75 %	256372125
36947	NC_013124	CTCC	2	8	1406435	1406442	0 %	25 %	0 %	75 %	256372125
36948	NC_013124	CGC	2	6	1406462	1406467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372125
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36950	NC_013124	CGCGAG	2	12	1406520	1406531	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256372125
36951	NC_013124	AGC	2	6	1406581	1406586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372125
36952	NC_013124	GC	3	6	1406594	1406599	0 %	0 %	50 %	50 %	256372125
36953	NC_013124	CCT	2	6	1406732	1406737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372125
36954	NC_013124	CG	4	8	1406789	1406796	0 %	0 %	50 %	50 %	256372125
36955	NC_013124	GCC	2	6	1406859	1406864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372126
36956	NC_013124	TGC	2	6	1406891	1406896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372126
36957	NC_013124	CGA	3	9	1406917	1406925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372126
36958	NC_013124	CGG	2	6	1406932	1406937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372126
36959	NC_013124	GCG	2	6	1406960	1406965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372126
36960	NC_013124	CG	3	6	1406982	1406987	0 %	0 %	50 %	50 %	256372126
36961	NC_013124	TCG	2	6	1407003	1407008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372126
36962	NC_013124	CG	3	6	1407036	1407041	0 %	0 %	50 %	50 %	256372126
36963	NC_013124	ACG	2	6	1407072	1407077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372126
36964	NC_013124	CGA	2	6	1407100	1407105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372126
36965	NC_013124	CCG	2	6	1407106	1407111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372126
36966	NC_013124	GCTC	2	8	1407132	1407139	0 %	25 %	25 %	50 %	256372126
36967	NC_013124	GC	4	8	1407218	1407225	0 %	0 %	50 %	50 %	256372126
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