MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331 chromosome

Total Repeats: 56359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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50002	NC_013124	CA	3	6	1913846	1913851	50 %	0 %	0 %	50 %	256372592
50003	NC_013124	ACG	2	6	1913854	1913859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372592
50004	NC_013124	TGC	2	6	1913860	1913865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372592
50005	NC_013124	TCGC	2	8	1913867	1913874	0 %	25 %	25 %	50 %	256372592
50006	NC_013124	GCC	2	6	1913923	1913928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372592
50007	NC_013124	C	6	6	1914034	1914039	0 %	0 %	0 %	100 %	256372592
50008	NC_013124	CGAG	2	8	1914112	1914119	25 %	0 %	50 %	25 %	256372592
50009	NC_013124	TCG	2	6	1914148	1914153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372592
50010	NC_013124	GCGA	2	8	1914231	1914238	25 %	0 %	50 %	25 %	256372592
50011	NC_013124	GCGA	2	8	1914260	1914267	25 %	0 %	50 %	25 %	256372592
50012	NC_013124	GCT	2	6	1914281	1914286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372592
50013	NC_013124	GCT	2	6	1914311	1914316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372592
50014	NC_013124	C	6	6	1914341	1914346	0 %	0 %	0 %	100 %	256372592
50015	NC_013124	CGA	2	6	1914374	1914379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372592
50016	NC_013124	GCC	2	6	1914401	1914406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372592
50017	NC_013124	TCG	2	6	1914448	1914453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372592
50018	NC_013124	ACG	2	6	1914457	1914462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372592
50019	NC_013124	TCG	2	6	1914508	1914513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372592
50020	NC_013124	AGC	2	6	1914514	1914519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372592
50021	NC_013124	TCC	2	6	1914556	1914561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372592
50022	NC_013124	AGC	2	6	1914582	1914587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372592
50023	NC_013124	TCG	2	6	1914589	1914594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372592
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50025	NC_013124	CG	4	8	1914637	1914644	0 %	0 %	50 %	50 %	256372592
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50030	NC_013124	GAG	2	6	1914885	1914890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372592
50031	NC_013124	CGC	2	6	1914910	1914915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372592
50032	NC_013124	CG	3	6	1914954	1914959	0 %	0 %	50 %	50 %	256372592
50033	NC_013124	GCGGA	2	10	1915020	1915029	20 %	0 %	60 %	20 %	256372592
50034	NC_013124	GC	3	6	1915090	1915095	0 %	0 %	50 %	50 %	256372592
50035	NC_013124	CAA	2	6	1915121	1915126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256372592
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50049	NC_013124	CGA	3	9	1915616	1915624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372592
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50052	NC_013124	GTC	2	6	1915694	1915699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372592
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50060	NC_013124	CCT	2	6	1915927	1915932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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50106	NC_013124	CGT	2	6	1917789	1917794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372594
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50115	NC_013124	TCG	2	6	1918112	1918117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372594
50116	NC_013124	CCGAGG	2	12	1918118	1918129	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256372594
50117	NC_013124	ATCTCG	2	12	1918211	1918222	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	256372594
50118	NC_013124	ATCG	2	8	1918231	1918238	25 %	25 %	25 %	25 %	256372594
50119	NC_013124	GACGC	2	10	1918325	1918334	20 %	0 %	40 %	40 %	256372594
50120	NC_013124	CGA	2	6	1918343	1918348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372594
50121	NC_013124	GC	3	6	1918434	1918439	0 %	0 %	50 %	50 %	256372595
50122	NC_013124	GCC	2	6	1918537	1918542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372595
50123	NC_013124	CGAT	2	8	1918560	1918567	25 %	25 %	25 %	25 %	256372595
50124	NC_013124	GCC	2	6	1918588	1918593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372595
50125	NC_013124	AGCG	2	8	1918626	1918633	25 %	0 %	50 %	25 %	256372595
50126	NC_013124	ACC	3	9	1918648	1918656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372595
50127	NC_013124	CATC	2	8	1918667	1918674	25 %	25 %	0 %	50 %	256372595
50128	NC_013124	CCG	2	6	1918714	1918719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372595
50129	NC_013124	GGGC	2	8	1918749	1918756	0 %	0 %	75 %	25 %	256372595
50130	NC_013124	TCG	2	6	1918810	1918815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372595
50131	NC_013124	CGT	2	6	1918887	1918892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372595
50132	NC_013124	GC	3	6	1918958	1918963	0 %	0 %	50 %	50 %	256372595
50133	NC_013124	ATCGAG	2	12	1918992	1919003	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	256372595
50134	NC_013124	CTT	2	6	1919009	1919014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256372595
50135	NC_013124	CGT	2	6	1919038	1919043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372595
50136	NC_013124	GAG	2	6	1919052	1919057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372595
50137	NC_013124	CCA	4	12	1919096	1919107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372595
50138	NC_013124	CG	3	6	1919123	1919128	0 %	0 %	50 %	50 %	256372595
50139	NC_013124	TCG	2	6	1919212	1919217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372595
50140	NC_013124	ACG	2	6	1919218	1919223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372595
50141	NC_013124	CGC	2	6	1919235	1919240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372595
50142	NC_013124	GAC	2	6	1919241	1919246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372595
50143	NC_013124	CGG	2	6	1919268	1919273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372595
50144	NC_013124	G	6	6	1919272	1919277	0 %	0 %	100 %	0 %	256372595
50145	NC_013124	CGC	2	6	1919370	1919375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372595
50146	NC_013124	TCG	2	6	1919389	1919394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372595
50147	NC_013124	TCGG	2	8	1919434	1919441	0 %	25 %	50 %	25 %	256372595
50148	NC_013124	CG	3	6	1919442	1919447	0 %	0 %	50 %	50 %	256372595
50149	NC_013124	ACG	2	6	1919523	1919528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372596
50150	NC_013124	CGA	2	6	1919536	1919541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372596
50151	NC_013124	TGA	2	6	1919554	1919559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372596
50152	NC_013124	GCC	2	6	1919589	1919594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372596
50153	NC_013124	TCGA	2	8	1919625	1919632	25 %	25 %	25 %	25 %	256372596
50154	NC_013124	CCT	2	6	1919674	1919679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372596
50155	NC_013124	AGG	2	6	1919682	1919687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372596
50156	NC_013124	GTA	2	6	1919729	1919734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372596
50157	NC_013124	CGG	2	6	1919779	1919784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372596
50158	NC_013124	CGT	2	6	1919955	1919960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50159	NC_013124	ATCG	2	8	1919980	1919987	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50160	NC_013124	AGG	2	6	1920087	1920092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372597
50161	NC_013124	CGG	2	6	1920109	1920114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372597
50162	NC_013124	TGC	2	6	1920121	1920126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372597
50163	NC_013124	TCG	2	6	1920135	1920140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372597
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50167	NC_013124	CGT	2	6	1920321	1920326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372597
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50170	NC_013124	CCGAG	2	10	1920499	1920508	20 %	0 %	40 %	40 %	256372597
50171	NC_013124	CGA	2	6	1920562	1920567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372597
50172	NC_013124	TGC	2	6	1920573	1920578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372597
50173	NC_013124	GCT	2	6	1920613	1920618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372597
50174	NC_013124	CTCG	2	8	1920676	1920683	0 %	25 %	25 %	50 %	256372597
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50177	NC_013124	CG	3	6	1920867	1920872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50178	NC_013124	GCT	2	6	1920893	1920898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372598
50179	NC_013124	GTTC	2	8	1920977	1920984	0 %	50 %	25 %	25 %	256372598
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50183	NC_013124	CGT	2	6	1921193	1921198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372598
50184	NC_013124	TGA	2	6	1921211	1921216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372598
50185	NC_013124	GC	4	8	1921218	1921225	0 %	0 %	50 %	50 %	256372598
50186	NC_013124	GGA	2	6	1921265	1921270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372598
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50196	NC_013124	CGT	2	6	1921778	1921783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372598
50197	NC_013124	GTG	2	6	1921833	1921838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256372598
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50200	NC_013124	AGC	2	6	1921894	1921899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372598
50201	NC_013124	GCT	2	6	1921937	1921942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372598
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50203	NC_013124	ACCGT	2	10	1922083	1922092	20 %	20 %	20 %	40 %	256372598
50204	NC_013124	C	6	6	1922223	1922228	0 %	0 %	0 %	100 %	256372599
50205	NC_013124	CGAC	2	8	1922269	1922276	25 %	0 %	25 %	50 %	256372599
50206	NC_013124	GGT	2	6	1922327	1922332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256372599
50207	NC_013124	CCT	2	6	1922341	1922346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372599
50208	NC_013124	GC	3	6	1922374	1922379	0 %	0 %	50 %	50 %	256372599
50209	NC_013124	CTCG	2	8	1922401	1922408	0 %	25 %	25 %	50 %	256372599
50210	NC_013124	ACG	2	6	1922415	1922420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372599
50211	NC_013124	GAT	2	6	1922426	1922431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372599
50212	NC_013124	CGA	2	6	1922479	1922484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372599
50213	NC_013124	AGG	2	6	1922505	1922510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372599
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50215	NC_013124	GGT	2	6	1922627	1922632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256372599
50216	NC_013124	ACG	2	6	1922646	1922651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372599
50217	NC_013124	ATC	2	6	1922667	1922672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256372599
50218	NC_013124	GCC	2	6	1922673	1922678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50219	NC_013124	GAC	2	6	1922722	1922727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50220	NC_013124	TGG	2	6	1922743	1922748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256372600
50221	NC_013124	CCG	2	6	1922762	1922767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372600
50222	NC_013124	GCG	2	6	1922790	1922795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372600
50223	NC_013124	CGA	2	6	1922903	1922908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372600
50224	NC_013124	TCG	2	6	1922938	1922943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372600
50225	NC_013124	CGA	2	6	1922948	1922953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372600
50226	NC_013124	TCC	2	6	1922989	1922994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372600
50227	NC_013124	TCT	2	6	1923025	1923030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256372600
50228	NC_013124	CCGGA	2	10	1923037	1923046	20 %	0 %	40 %	40 %	256372600
50229	NC_013124	GCCA	2	8	1923072	1923079	25 %	0 %	25 %	50 %	256372600
50230	NC_013124	CA	3	6	1923151	1923156	50 %	0 %	0 %	50 %	256372600
50231	NC_013124	CTG	2	6	1923216	1923221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372600
50232	NC_013124	TGC	2	6	1923271	1923276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372600
50233	NC_013124	CGG	2	6	1923349	1923354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372600
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50236	NC_013124	CG	3	6	1923431	1923436	0 %	0 %	50 %	50 %	256372600
50237	NC_013124	CGG	2	6	1923439	1923444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372600
50238	NC_013124	CGA	2	6	1923467	1923472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372600
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50244	NC_013124	GC	3	6	1923677	1923682	0 %	0 %	50 %	50 %	256372601
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50263	NC_013124	GC	3	6	1924421	1924426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50264	NC_013124	GGGT	2	8	1924493	1924500	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
50265	NC_013124	CGA	2	6	1924541	1924546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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50302	NC_013124	CCT	2	6	1926270	1926275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50303	NC_013124	GAG	3	9	1926283	1926291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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50331	NC_013124	CGAG	2	8	1927938	1927945	25 %	0 %	50 %	25 %	256372606
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50340	NC_013124	GGCC	2	8	1928386	1928393	0 %	0 %	50 %	50 %	256372606
50341	NC_013124	TGG	2	6	1928421	1928426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256372606
50342	NC_013124	TCA	2	6	1928473	1928478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256372606
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50345	NC_013124	GCA	2	6	1928563	1928568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372606
50346	NC_013124	GCC	2	6	1928594	1928599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372606
50347	NC_013124	CAT	2	6	1928649	1928654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256372607
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50349	NC_013124	CGT	2	6	1928790	1928795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372607
50350	NC_013124	GTC	2	6	1928887	1928892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372607
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50424	NC_013124	AGC	2	6	1931893	1931898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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50449	NC_013124	GCG	2	6	1932768	1932773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372609
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50451	NC_013124	GAT	2	6	1932873	1932878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372609
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50453	NC_013124	CGA	2	6	1932936	1932941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372609
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50456	NC_013124	TCGGTG	2	12	1932997	1933008	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	256372609
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50459	NC_013124	CCT	2	6	1933253	1933258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372609
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50462	NC_013124	TCT	2	6	1933379	1933384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256372609
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50464	NC_013124	CTC	2	6	1933428	1933433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372609
50465	NC_013124	CTT	2	6	1933491	1933496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256372609
50466	NC_013124	GAC	2	6	1933503	1933508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372609
50467	NC_013124	TCG	2	6	1933591	1933596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372609
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50469	NC_013124	AGC	2	6	1933640	1933645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50470	NC_013124	CAC	2	6	1933651	1933656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50471	NC_013124	CT	3	6	1933668	1933673	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50472	NC_013124	GCC	2	6	1933676	1933681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50473	NC_013124	CGC	2	6	1933732	1933737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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50477	NC_013124	TCG	2	6	1933826	1933831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372610
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50483	NC_013124	ACC	2	6	1934176	1934181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372611
50484	NC_013124	CGA	2	6	1934255	1934260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372611
50485	NC_013124	GC	3	6	1934274	1934279	0 %	0 %	50 %	50 %	256372611
50486	NC_013124	TCG	2	6	1934305	1934310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372611
50487	NC_013124	CGC	2	6	1934330	1934335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372611
50488	NC_013124	CGG	2	6	1934505	1934510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372611
50489	NC_013124	CTC	2	6	1934538	1934543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372611
50490	NC_013124	GATG	2	8	1934552	1934559	25 %	25 %	50 %	0 %	256372611
50491	NC_013124	ACG	3	9	1934590	1934598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372611
50492	NC_013124	CGT	3	9	1934741	1934749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372611
50493	NC_013124	CGA	2	6	1934765	1934770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372611
50494	NC_013124	AGC	2	6	1934856	1934861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372611
50495	NC_013124	CCA	2	6	1934951	1934956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372611
50496	NC_013124	GGGC	2	8	1935041	1935048	0 %	0 %	75 %	25 %	256372611
50497	NC_013124	TCG	2	6	1935088	1935093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372611
50498	NC_013124	AGC	2	6	1935106	1935111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372611
50499	NC_013124	CG	3	6	1935155	1935160	0 %	0 %	50 %	50 %	256372611
50500	NC_013124	TCGTAG	2	12	1935181	1935192	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	256372611

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