MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Actinosynnema mirum DSM 43827 chromosome

Total Repeats: 259223

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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37502	NC_013093	GGC	2	6	1219902	1219907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256375238
37503	NC_013093	CCTGA	2	10	1219947	1219956	20 %	20 %	20 %	40 %	256375238
37504	NC_013093	GAC	2	6	1219962	1219967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37505	NC_013093	CAC	2	6	1219968	1219973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37506	NC_013093	CAC	2	6	1220004	1220009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37507	NC_013093	CGC	2	6	1220030	1220035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37508	NC_013093	GCC	2	6	1220036	1220041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37509	NC_013093	CGC	2	6	1220124	1220129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37510	NC_013093	TCC	2	6	1220151	1220156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37511	NC_013093	CTCC	3	12	1220209	1220220	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
37512	NC_013093	CCCT	2	8	1220221	1220228	0 %	25 %	0 %	75 %	256375239
37513	NC_013093	CAC	2	6	1220249	1220254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256375239
37514	NC_013093	CGC	2	6	1220261	1220266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256375239
37515	NC_013093	CCG	2	6	1220306	1220311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256375239
37516	NC_013093	CGCC	2	8	1220324	1220331	0 %	0 %	25 %	75 %	256375239
37517	NC_013093	CCG	2	6	1220333	1220338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256375239
37518	NC_013093	CTG	2	6	1220375	1220380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256375239
37519	NC_013093	CAC	2	6	1220381	1220386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256375239
37520	NC_013093	CGC	2	6	1220402	1220407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256375239
37521	NC_013093	CCG	2	6	1220446	1220451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256375239
37522	NC_013093	CCG	2	6	1220524	1220529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256375239
37523	NC_013093	GTCG	2	8	1220660	1220667	0 %	25 %	50 %	25 %	256375239
37524	NC_013093	CG	3	6	1220675	1220680	0 %	0 %	50 %	50 %	256375239
37525	NC_013093	CGC	2	6	1220687	1220692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256375239
37526	NC_013093	TGC	2	6	1220743	1220748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256375239
37527	NC_013093	GCT	2	6	1220749	1220754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256375239
37528	NC_013093	GGCT	2	8	1220837	1220844	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37529	NC_013093	ACT	2	6	1220863	1220868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37530	NC_013093	CCG	2	6	1220880	1220885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37531	NC_013093	ACC	2	6	1220886	1220891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37532	NC_013093	ACA	2	6	1220940	1220945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37533	NC_013093	CGG	2	6	1221003	1221008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37534	NC_013093	CGCGC	2	10	1221056	1221065	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
37535	NC_013093	GGC	2	6	1221216	1221221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37536	NC_013093	GC	3	6	1221220	1221225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37537	NC_013093	CAT	2	6	1221238	1221243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37538	NC_013093	CG	3	6	1221256	1221261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37539	NC_013093	TCG	2	6	1221374	1221379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37540	NC_013093	AAC	2	6	1221437	1221442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256375240
37541	NC_013093	CGG	2	6	1221469	1221474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256375240
37542	NC_013093	AGC	2	6	1221501	1221506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256375240
37543	NC_013093	ACG	2	6	1221546	1221551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256375240
37544	NC_013093	GCT	4	12	1221577	1221588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256375240
37545	NC_013093	CCG	2	6	1221591	1221596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256375240
37546	NC_013093	CGG	2	6	1221637	1221642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256375240
37547	NC_013093	GCATGG	2	12	1221711	1221722	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	256375240
37548	NC_013093	CTG	2	6	1221743	1221748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256375240
37549	NC_013093	CGG	2	6	1221823	1221828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256375240
37550	NC_013093	GCA	2	6	1221901	1221906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256375240
37551	NC_013093	CGACCG	2	12	1221943	1221954	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	256375240
37552	NC_013093	CCG	2	6	1221963	1221968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256375240
37553	NC_013093	GAG	2	6	1222013	1222018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256375240
37554	NC_013093	TCG	2	6	1222028	1222033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256375240
37555	NC_013093	ACC	2	6	1222050	1222055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37556	NC_013093	CGGC	2	8	1222068	1222075	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37557	NC_013093	ACC	2	6	1222108	1222113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256375241
37558	NC_013093	CGT	2	6	1222138	1222143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256375241
37559	NC_013093	TCG	2	6	1222144	1222149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256375241
37560	NC_013093	ACA	2	6	1222186	1222191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256375241
37561	NC_013093	GAG	2	6	1222200	1222205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256375241
37562	NC_013093	CAT	2	6	1222208	1222213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256375241
37563	NC_013093	GAC	2	6	1222233	1222238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256375241
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37565	NC_013093	GCT	2	6	1222265	1222270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256375241
37566	NC_013093	GAC	2	6	1222284	1222289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256375241
37567	NC_013093	CGG	4	12	1222417	1222428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256375241
37568	NC_013093	CTG	2	6	1222431	1222436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256375241
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37570	NC_013093	CG	4	8	1222475	1222482	0 %	0 %	50 %	50 %	256375241
37571	NC_013093	TGA	2	6	1222483	1222488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256375241
37572	NC_013093	CCA	2	6	1222490	1222495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256375241
37573	NC_013093	GCG	2	6	1222507	1222512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256375241
37574	NC_013093	GGC	2	6	1222544	1222549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256375241
37575	NC_013093	CGACCG	2	12	1222634	1222645	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	256375241
37576	NC_013093	ATC	2	6	1222680	1222685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256375241
37577	NC_013093	CTC	2	6	1222760	1222765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37578	NC_013093	GCCG	2	8	1222769	1222776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37579	NC_013093	CGC	3	9	1222805	1222813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37580	NC_013093	GTCCG	2	10	1222871	1222880	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
37581	NC_013093	ACC	2	6	1222902	1222907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37582	NC_013093	CGG	2	6	1223019	1223024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37583	NC_013093	CGA	2	6	1223064	1223069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37584	NC_013093	CTG	2	6	1223111	1223116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37585	NC_013093	CAC	2	6	1223119	1223124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37586	NC_013093	CCCG	2	8	1223161	1223168	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
37587	NC_013093	CG	3	6	1223177	1223182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37588	NC_013093	ACT	2	6	1223195	1223200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256375242
37589	NC_013093	CCA	2	6	1223250	1223255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256375242
37590	NC_013093	GGCC	2	8	1223269	1223276	0 %	0 %	50 %	50 %	256375242
37591	NC_013093	GT	3	6	1223453	1223458	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37592	NC_013093	CGT	2	6	1223541	1223546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37593	NC_013093	GCC	2	6	1223613	1223618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37594	NC_013093	ACG	2	6	1223664	1223669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37595	NC_013093	GAT	2	6	1223713	1223718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37596	NC_013093	CTG	2	6	1223811	1223816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256375243
37597	NC_013093	AGCG	2	8	1223834	1223841	25 %	0 %	50 %	25 %	256375243
37598	NC_013093	AC	3	6	1223870	1223875	50 %	0 %	0 %	50 %	256375243
37599	NC_013093	AGG	2	6	1223879	1223884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256375243
37600	NC_013093	AAG	2	6	1223997	1224002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256375243
37601	NC_013093	CG	3	6	1224049	1224054	0 %	0 %	50 %	50 %	256375243
37602	NC_013093	CCT	2	6	1224134	1224139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256375243
37603	NC_013093	AGCA	2	8	1224188	1224195	50 %	0 %	25 %	25 %	256375243
37604	NC_013093	GAT	2	6	1224264	1224269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256375243
37605	NC_013093	ACG	2	6	1224271	1224276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256375243
37606	NC_013093	AAG	2	6	1224283	1224288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256375243
37607	NC_013093	TAA	2	6	1224289	1224294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256375243
37608	NC_013093	CTG	2	6	1224327	1224332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256375243
37609	NC_013093	CTG	2	6	1224472	1224477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256375243
37610	NC_013093	TCCC	2	8	1224484	1224491	0 %	25 %	0 %	75 %	256375243
37611	NC_013093	GAA	2	6	1224543	1224548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256375243
37612	NC_013093	CTA	2	6	1224550	1224555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256375243
37613	NC_013093	ATCC	2	8	1224603	1224610	25 %	25 %	0 %	50 %	256375243
37614	NC_013093	CTG	2	6	1224642	1224647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256375243
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37616	NC_013093	ATA	2	6	1224718	1224723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256375243
37617	NC_013093	TAC	2	6	1224732	1224737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256375243
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37619	NC_013093	TGG	2	6	1224847	1224852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256375243
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