MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 74014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48001	NC_011989	GCC	2	6	2424438	2424443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149145
48002	NC_011989	CGC	2	6	2424458	2424463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149145
48003	NC_011989	CGGAA	2	10	2424464	2424473	40 %	0 %	40 %	20 %	222149145
48004	NC_011989	TCG	2	6	2424499	2424504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149145
48005	NC_011989	AAG	2	6	2424513	2424518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222149145
48006	NC_011989	CCG	2	6	2424536	2424541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48007	NC_011989	CA	3	6	2424564	2424569	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48008	NC_011989	AATG	2	8	2424791	2424798	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48009	NC_011989	TTA	2	6	2424800	2424805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48010	NC_011989	AAGC	2	8	2424817	2424824	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48011	NC_011989	TAA	2	6	2424850	2424855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48012	NC_011989	CAAG	2	8	2424925	2424932	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48013	NC_011989	ACCC	2	8	2425055	2425062	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
48014	NC_011989	CAT	2	6	2425433	2425438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149146
48015	NC_011989	CTC	2	6	2425440	2425445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222149146
48016	NC_011989	CGC	3	9	2425509	2425517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149146
48017	NC_011989	GCC	2	6	2425524	2425529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149146
48018	NC_011989	AGG	2	6	2425592	2425597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222149146
48019	NC_011989	AGG	2	6	2425604	2425609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222149146
48020	NC_011989	GC	3	6	2425659	2425664	0 %	0 %	50 %	50 %	222149146
48021	NC_011989	GAT	2	6	2425667	2425672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149146
48022	NC_011989	CG	3	6	2425675	2425680	0 %	0 %	50 %	50 %	222149146
48023	NC_011989	CAT	2	6	2425739	2425744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149146
48024	NC_011989	CGC	2	6	2425751	2425756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149146
48025	NC_011989	GCA	2	6	2425799	2425804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149146
48026	NC_011989	GATA	2	8	2425805	2425812	50 %	25 %	25 %	0 %	222149146
48027	NC_011989	CAG	2	6	2425977	2425982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149146
48028	NC_011989	GCC	2	6	2426004	2426009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149146
48029	NC_011989	ACC	2	6	2426020	2426025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149146
48030	NC_011989	GCC	2	6	2426031	2426036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149146
48031	NC_011989	TCG	2	6	2426038	2426043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149146
48032	NC_011989	AGC	2	6	2426088	2426093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149146
48033	NC_011989	CCA	2	6	2426111	2426116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149146
48034	NC_011989	GC	4	8	2426254	2426261	0 %	0 %	50 %	50 %	222149146
48035	NC_011989	CGA	2	6	2426303	2426308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149146
48036	NC_011989	CTG	2	6	2426346	2426351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149146
48037	NC_011989	TCG	2	6	2426437	2426442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149146
48038	NC_011989	TGGC	2	8	2426446	2426453	0 %	25 %	50 %	25 %	222149146
48039	NC_011989	GCCGC	2	10	2426534	2426543	0 %	0 %	40 %	60 %	222149146
48040	NC_011989	CGC	4	12	2426538	2426549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149146
48041	NC_011989	CAT	2	6	2426553	2426558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149146
48042	NC_011989	CAT	2	6	2426595	2426600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149146
48043	NC_011989	TGAT	2	8	2426663	2426670	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48044	NC_011989	CGC	3	9	2426873	2426881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149147
48045	NC_011989	TGG	2	6	2426887	2426892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149147
48046	NC_011989	TGG	2	6	2426927	2426932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149147
48047	NC_011989	GCGG	2	8	2426976	2426983	0 %	0 %	75 %	25 %	222149147
48048	NC_011989	CG	3	6	2427026	2427031	0 %	0 %	50 %	50 %	222149147
48049	NC_011989	CAC	2	6	2427060	2427065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149147
48050	NC_011989	CAG	2	6	2427140	2427145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149147
48051	NC_011989	ATC	2	6	2427168	2427173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149147
48052	NC_011989	GCC	2	6	2427283	2427288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149147
48053	NC_011989	CAG	2	6	2427302	2427307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149147
48054	NC_011989	ATGC	2	8	2427322	2427329	25 %	25 %	25 %	25 %	222149147
48055	NC_011989	A	6	6	2427358	2427363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48056	NC_011989	GCT	2	6	2427548	2427553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48057	NC_011989	AGAC	2	8	2427557	2427564	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48058	NC_011989	ATGGC	2	10	2427581	2427590	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
48059	NC_011989	GAC	2	6	2427631	2427636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48060	NC_011989	CGC	2	6	2427670	2427675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149148
48061	NC_011989	CAG	2	6	2427676	2427681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149148
48062	NC_011989	AAT	2	6	2427705	2427710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222149148
48063	NC_011989	GAC	2	6	2427760	2427765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149148
48064	NC_011989	ATTT	2	8	2427793	2427800	25 %	75 %	0 %	0 %	222149148
48065	NC_011989	AG	3	6	2427816	2427821	50 %	0 %	50 %	0 %	222149148
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48068	NC_011989	GAA	2	6	2427871	2427876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222149148
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48071	NC_011989	CGG	2	6	2428184	2428189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149148
48072	NC_011989	TGC	2	6	2428279	2428284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149148
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48075	NC_011989	GCG	2	6	2428477	2428482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149149
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48081	NC_011989	CGG	2	6	2428887	2428892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149149
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48085	NC_011989	CGA	2	6	2429052	2429057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149149
48086	NC_011989	AGC	2	6	2429092	2429097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149149
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48089	NC_011989	AAG	2	6	2429450	2429455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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48100	NC_011989	TGACC	2	10	2429884	2429893	20 %	20 %	20 %	40 %	222149150
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48118	NC_011989	GGC	2	6	2430596	2430601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149150
48119	NC_011989	CT	3	6	2430614	2430619	0 %	50 %	0 %	50 %	222149150
48120	NC_011989	TCCG	2	8	2430663	2430670	0 %	25 %	25 %	50 %	222149150
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48122	NC_011989	TATT	2	8	2430795	2430802	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48123	NC_011989	GCG	2	6	2430828	2430833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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48125	NC_011989	TGA	2	6	2430875	2430880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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48127	NC_011989	TGT	2	6	2430938	2430943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222149151
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48162	NC_011989	TGG	2	6	2432818	2432823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149152
48163	NC_011989	ACA	2	6	2432830	2432835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149152
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48188	NC_011989	GCA	2	6	2434247	2434252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149153
48189	NC_011989	CGG	2	6	2434257	2434262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149153
48190	NC_011989	GCCA	2	8	2434264	2434271	25 %	0 %	25 %	50 %	222149153
48191	NC_011989	CGA	2	6	2434289	2434294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149153
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48195	NC_011989	TGCA	2	8	2434478	2434485	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48196	NC_011989	CAGCC	2	10	2434552	2434561	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
48197	NC_011989	TCA	2	6	2434580	2434585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48198	NC_011989	GCT	2	6	2434698	2434703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149154
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48200	NC_011989	CTG	2	6	2434753	2434758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149154
48201	NC_011989	GGC	2	6	2434858	2434863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149154
48202	NC_011989	GTC	2	6	2434909	2434914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149154
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48211	NC_011989	CTG	2	6	2435155	2435160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149154
48212	NC_011989	TCA	2	6	2435168	2435173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149154
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48217	NC_011989	GCTG	2	8	2435303	2435310	0 %	25 %	50 %	25 %	222149154
48218	NC_011989	CCG	2	6	2435347	2435352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149154
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48220	NC_011989	ATT	2	6	2435534	2435539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222149154
48221	NC_011989	CCA	2	6	2435577	2435582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149154
48222	NC_011989	CCA	2	6	2435606	2435611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149154
48223	NC_011989	GCAG	2	8	2435617	2435624	25 %	0 %	50 %	25 %	222149154
48224	NC_011989	CGA	2	6	2435667	2435672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149154
48225	NC_011989	A	6	6	2435750	2435755	100 %	0 %	0 %	0 %	222149154
48226	NC_011989	GTCC	2	8	2435817	2435824	0 %	25 %	25 %	50 %	222149154
48227	NC_011989	GCA	2	6	2435936	2435941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48228	NC_011989	CAGC	2	8	2435969	2435976	25 %	0 %	25 %	50 %	222149155
48229	NC_011989	TGACC	2	10	2435987	2435996	20 %	20 %	20 %	40 %	222149155
48230	NC_011989	CTG	2	6	2436063	2436068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149155
48231	NC_011989	CCG	3	9	2436238	2436246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149155
48232	NC_011989	GAT	2	6	2436296	2436301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149155
48233	NC_011989	GCC	2	6	2436336	2436341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149155
48234	NC_011989	CGG	2	6	2436350	2436355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149155
48235	NC_011989	TCG	2	6	2436367	2436372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149155
48236	NC_011989	CAG	2	6	2436381	2436386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149155
48237	NC_011989	TCACG	2	10	2436440	2436449	20 %	20 %	20 %	40 %	222149155
48238	NC_011989	GAA	2	6	2436468	2436473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222149155
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48241	NC_011989	GAT	2	6	2436653	2436658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48242	NC_011989	ATCGG	2	10	2436697	2436706	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
48243	NC_011989	TGAA	2	8	2436776	2436783	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48244	NC_011989	TTTG	2	8	2436825	2436832	0 %	75 %	25 %	0 %	222149156
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48251	NC_011989	GCC	2	6	2437204	2437209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149156
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48255	NC_011989	CCGGA	2	10	2437603	2437612	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
48256	NC_011989	CTC	2	6	2437641	2437646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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48343	NC_011989	CCCG	2	8	2442186	2442193	0 %	0 %	25 %	75 %	222149161
48344	NC_011989	CG	3	6	2442192	2442197	0 %	0 %	50 %	50 %	222149161
48345	NC_011989	GCCA	2	8	2442237	2442244	25 %	0 %	25 %	50 %	222149161
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48352	NC_011989	GCA	2	6	2442493	2442498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149161
48353	NC_011989	TGA	2	6	2442501	2442506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149161
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48355	NC_011989	CCA	2	6	2442528	2442533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149161
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48357	NC_011989	GCG	2	6	2442804	2442809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149161
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48360	NC_011989	CG	3	6	2442924	2442929	0 %	0 %	50 %	50 %	222149161
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48459	NC_011989	TCA	2	6	2448315	2448320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48460	NC_011989	AAC	2	6	2448325	2448330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48462	NC_011989	A	6	6	2448377	2448382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48463	NC_011989	AAT	2	6	2448398	2448403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48464	NC_011989	GAT	3	9	2448586	2448594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149164
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48466	NC_011989	TCG	2	6	2448668	2448673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149164
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48470	NC_011989	GA	3	6	2448740	2448745	50 %	0 %	50 %	0 %	222149164
48471	NC_011989	CGC	2	6	2448768	2448773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149164
48472	NC_011989	TTGAAG	2	12	2448776	2448787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149164
48473	NC_011989	TGA	2	6	2448831	2448836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149164
48474	NC_011989	TTC	2	6	2448856	2448861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149164
48475	NC_011989	ATC	2	6	2448971	2448976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149164
48476	NC_011989	CGT	2	6	2448985	2448990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149164
48477	NC_011989	GCC	2	6	2449027	2449032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149164
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48479	NC_011989	CAG	2	6	2449063	2449068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149164
48480	NC_011989	ACC	2	6	2449109	2449114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149164
48481	NC_011989	TCGC	2	8	2449123	2449130	0 %	25 %	25 %	50 %	222149164
48482	NC_011989	ATG	2	6	2449139	2449144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149164
48483	NC_011989	GCT	2	6	2449164	2449169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149164
48484	NC_011989	CCA	2	6	2449182	2449187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149164
48485	NC_011989	CG	3	6	2449263	2449268	0 %	0 %	50 %	50 %	222149164
48486	NC_011989	GACGC	2	10	2449281	2449290	20 %	0 %	40 %	40 %	222149164
48487	NC_011989	CTTGGC	2	12	2449318	2449329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149164
48488	NC_011989	GCCACG	2	12	2449366	2449377	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222149164
48489	NC_011989	ATC	2	6	2449433	2449438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149164
48490	NC_011989	CCAG	2	8	2449473	2449480	25 %	0 %	25 %	50 %	222149164
48491	NC_011989	TGGT	3	12	2449502	2449513	0 %	50 %	50 %	0 %	222149164
48492	NC_011989	TCG	2	6	2449514	2449519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149164
48493	NC_011989	AGC	3	9	2449520	2449528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149164
48494	NC_011989	CAG	3	9	2449543	2449551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149164
48495	NC_011989	CGC	2	6	2449571	2449576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149164
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48497	NC_011989	GAT	2	6	2449681	2449686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149164
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48499	NC_011989	CGG	2	6	2449761	2449766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149164
48500	NC_011989	TCT	2	6	2449998	2450003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149164

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