MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 74014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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45002	NC_011989	GCT	2	6	2276648	2276653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149026
45003	NC_011989	CGT	2	6	2276709	2276714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149026
45004	NC_011989	CAT	2	6	2276743	2276748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149026
45005	NC_011989	CTT	2	6	2276862	2276867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149026
45006	NC_011989	AAGG	2	8	2276896	2276903	50 %	0 %	50 %	0 %	222149026
45007	NC_011989	GAAA	2	8	2276909	2276916	75 %	0 %	25 %	0 %	222149026
45008	NC_011989	AGC	2	6	2276959	2276964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149026
45009	NC_011989	TTC	2	6	2277024	2277029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45010	NC_011989	GTC	2	6	2277046	2277051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45011	NC_011989	CGC	3	9	2277056	2277064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45012	NC_011989	CGGA	2	8	2277112	2277119	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45013	NC_011989	GC	3	6	2277193	2277198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45014	NC_011989	CG	4	8	2277278	2277285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45015	NC_011989	CTG	2	6	2277370	2277375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45016	NC_011989	AGC	2	6	2277574	2277579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45017	NC_011989	GTTACC	2	12	2277658	2277669	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222149027
45018	NC_011989	CAG	2	6	2277801	2277806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149027
45019	NC_011989	ATA	2	6	2277891	2277896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222149027
45020	NC_011989	TGG	3	9	2277943	2277951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149027
45021	NC_011989	GGC	2	6	2278046	2278051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149028
45022	NC_011989	GC	3	6	2278130	2278135	0 %	0 %	50 %	50 %	222149028
45023	NC_011989	CTT	2	6	2278138	2278143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149028
45024	NC_011989	GCC	2	6	2278144	2278149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149028
45025	NC_011989	TGG	2	6	2278191	2278196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149028
45026	NC_011989	GAG	2	6	2278208	2278213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222149028
45027	NC_011989	GCT	2	6	2278265	2278270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149028
45028	NC_011989	GC	3	6	2278292	2278297	0 %	0 %	50 %	50 %	222149028
45029	NC_011989	GAC	3	9	2278331	2278339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149028
45030	NC_011989	TCGTAA	2	12	2278410	2278421	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	222149028
45031	NC_011989	GCT	2	6	2278519	2278524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149028
45032	NC_011989	CATC	2	8	2278616	2278623	25 %	25 %	0 %	50 %	222149028
45033	NC_011989	CGG	2	6	2278629	2278634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149028
45034	NC_011989	GCGG	2	8	2278660	2278667	0 %	0 %	75 %	25 %	222149028
45035	NC_011989	CTG	2	6	2278722	2278727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149028
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45039	NC_011989	GC	3	6	2278871	2278876	0 %	0 %	50 %	50 %	222149028
45040	NC_011989	CG	3	6	2278944	2278949	0 %	0 %	50 %	50 %	222149028
45041	NC_011989	GAA	2	6	2279024	2279029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222149028
45042	NC_011989	ACC	2	6	2279053	2279058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149028
45043	NC_011989	GGAAT	2	10	2279071	2279080	40 %	20 %	40 %	0 %	222149028
45044	NC_011989	GC	3	6	2279086	2279091	0 %	0 %	50 %	50 %	222149028
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45049	NC_011989	CAGA	2	8	2279314	2279321	50 %	0 %	25 %	25 %	222149028
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45051	NC_011989	GCA	2	6	2279362	2279367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149028
45052	NC_011989	G	7	7	2279491	2279497	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
45053	NC_011989	CCG	2	6	2279519	2279524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149029
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45055	NC_011989	CCG	2	6	2279610	2279615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149029
45056	NC_011989	CGA	2	6	2279677	2279682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149029
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45085	NC_011989	CCTGA	2	10	2280935	2280944	20 %	20 %	20 %	40 %	222149029
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45117	NC_011989	CGGC	2	8	2282300	2282307	0 %	0 %	50 %	50 %	222149030
45118	NC_011989	TTG	2	6	2282347	2282352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222149030
45119	NC_011989	CGA	2	6	2282393	2282398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149030
45120	NC_011989	GCA	2	6	2282484	2282489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149030
45121	NC_011989	CGG	2	6	2282660	2282665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149030
45122	NC_011989	CG	3	6	2282677	2282682	0 %	0 %	50 %	50 %	222149030
45123	NC_011989	GTC	2	6	2282703	2282708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149030
45124	NC_011989	AGCA	2	8	2282727	2282734	50 %	0 %	25 %	25 %	222149030
45125	NC_011989	GGT	2	6	2282761	2282766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149030
45126	NC_011989	GGA	2	6	2282822	2282827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222149030
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45130	NC_011989	ACG	2	6	2283038	2283043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149030
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45143	NC_011989	GCGAC	2	10	2283519	2283528	20 %	0 %	40 %	40 %	222149030
45144	NC_011989	CGG	2	6	2283529	2283534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149030
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45146	NC_011989	GGC	2	6	2283559	2283564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149030
45147	NC_011989	CTT	2	6	2283585	2283590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149030
45148	NC_011989	TGA	2	6	2283649	2283654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149030
45149	NC_011989	CCAGCG	2	12	2283667	2283678	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222149030
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45153	NC_011989	GAT	2	6	2283902	2283907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149031
45154	NC_011989	GGA	2	6	2283935	2283940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222149031
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45178	NC_011989	GCT	2	6	2285160	2285165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149032
45179	NC_011989	ATG	2	6	2285231	2285236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222149032
45180	NC_011989	CGCC	2	8	2285247	2285254	0 %	0 %	25 %	75 %	222149032
45181	NC_011989	CTGC	2	8	2285325	2285332	0 %	25 %	25 %	50 %	222149032
45182	NC_011989	G	6	6	2285358	2285363	0 %	0 %	100 %	0 %	222149032
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45187	NC_011989	GACA	2	8	2285597	2285604	50 %	0 %	25 %	25 %	222149032
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45190	NC_011989	CAG	2	6	2285800	2285805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149032
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45194	NC_011989	GGC	2	6	2285922	2285927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149032
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45201	NC_011989	CGTTC	2	10	2286212	2286221	0 %	40 %	20 %	40 %	222149032
45202	NC_011989	TCGCT	2	10	2286242	2286251	0 %	40 %	20 %	40 %	222149032
45203	NC_011989	TCT	2	6	2286327	2286332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149032
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45209	NC_011989	TGC	2	6	2286596	2286601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149032
45210	NC_011989	GGC	2	6	2286685	2286690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149032
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45213	NC_011989	GA	3	6	2286784	2286789	50 %	0 %	50 %	0 %	222149032
45214	NC_011989	GAAAG	2	10	2286818	2286827	60 %	0 %	40 %	0 %	222149033
45215	NC_011989	GC	3	6	2286904	2286909	0 %	0 %	50 %	50 %	222149033
45216	NC_011989	GCC	2	6	2286942	2286947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149033
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45218	NC_011989	GCT	2	6	2287016	2287021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149033
45219	NC_011989	CTT	2	6	2287025	2287030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149033
45220	NC_011989	GTC	2	6	2287098	2287103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149033
45221	NC_011989	TGC	2	6	2287163	2287168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149033
45222	NC_011989	GCT	2	6	2287248	2287253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149033
45223	NC_011989	CCTC	2	8	2287276	2287283	0 %	25 %	0 %	75 %	222149033
45224	NC_011989	CTA	2	6	2287289	2287294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149033
45225	NC_011989	ATGTCG	2	12	2287360	2287371	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222149033
45226	NC_011989	CG	3	6	2287370	2287375	0 %	0 %	50 %	50 %	222149033
45227	NC_011989	GCA	2	6	2287390	2287395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149033
45228	NC_011989	ACG	2	6	2287513	2287518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149033
45229	NC_011989	GTC	2	6	2287521	2287526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149033
45230	NC_011989	CAA	2	6	2287565	2287570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149033
45231	NC_011989	AGG	3	9	2287588	2287596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222149033
45232	NC_011989	GCG	2	6	2287773	2287778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149034
45233	NC_011989	TGC	2	6	2287930	2287935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149034
45234	NC_011989	TCT	2	6	2287957	2287962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149034
45235	NC_011989	CCG	2	6	2288001	2288006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149034
45236	NC_011989	GTT	2	6	2288036	2288041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222149034
45237	NC_011989	TCC	2	6	2288142	2288147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222149034
45238	NC_011989	CAA	2	6	2288154	2288159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222149034
45239	NC_011989	CT	4	8	2288171	2288178	0 %	50 %	0 %	50 %	222149034
45240	NC_011989	TCA	2	6	2288210	2288215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149034
45241	NC_011989	GATCGC	2	12	2288221	2288232	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222149034
45242	NC_011989	CAGG	2	8	2288278	2288285	25 %	0 %	50 %	25 %	222149034
45243	NC_011989	C	6	6	2288387	2288392	0 %	0 %	0 %	100 %	222149034
45244	NC_011989	TCA	2	6	2288442	2288447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149034
45245	NC_011989	GCG	2	6	2288450	2288455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149034
45246	NC_011989	CCG	2	6	2288495	2288500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149034
45247	NC_011989	ATTCA	2	10	2288504	2288513	40 %	40 %	0 %	20 %	222149034
45248	NC_011989	CGGC	2	8	2288619	2288626	0 %	0 %	50 %	50 %	222149034
45249	NC_011989	TCA	2	6	2288658	2288663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149034
45250	NC_011989	CTGG	2	8	2288665	2288672	0 %	25 %	50 %	25 %	222149034
45251	NC_011989	GAC	2	6	2288693	2288698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149034
45252	NC_011989	GCC	2	6	2288727	2288732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149034
45253	NC_011989	CAT	3	9	2288785	2288793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149034
45254	NC_011989	GCC	2	6	2288805	2288810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149034
45255	NC_011989	CG	3	6	2288857	2288862	0 %	0 %	50 %	50 %	222149034
45256	NC_011989	AGACG	2	10	2288883	2288892	40 %	0 %	40 %	20 %	222149034
45257	NC_011989	TCGA	2	8	2288894	2288901	25 %	25 %	25 %	25 %	222149034
45258	NC_011989	GCT	2	6	2288942	2288947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149034
45259	NC_011989	AG	3	6	2288963	2288968	50 %	0 %	50 %	0 %	222149034
45260	NC_011989	GCAG	2	8	2289085	2289092	25 %	0 %	50 %	25 %	222149034
45261	NC_011989	AGC	2	6	2289104	2289109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149034
45262	NC_011989	TTG	2	6	2289162	2289167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222149034
45263	NC_011989	GAG	2	6	2289232	2289237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222149034
45264	NC_011989	CG	4	8	2289301	2289308	0 %	0 %	50 %	50 %	222149034
45265	NC_011989	GTG	2	6	2289563	2289568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222149034
45266	NC_011989	CTGG	2	8	2289586	2289593	0 %	25 %	50 %	25 %	222149034
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45270	NC_011989	TGC	2	6	2289835	2289840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149034
45271	NC_011989	T	6	6	2289923	2289928	0 %	100 %	0 %	0 %	222149034
45272	NC_011989	GTT	2	6	2289970	2289975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222149034
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45279	NC_011989	GCAA	2	8	2290292	2290299	50 %	0 %	25 %	25 %	222149034
45280	NC_011989	GC	3	6	2290337	2290342	0 %	0 %	50 %	50 %	222149034
45281	NC_011989	GCT	2	6	2290368	2290373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45282	NC_011989	CGA	2	6	2290397	2290402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45283	NC_011989	TAT	2	6	2290500	2290505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45284	NC_011989	CTT	2	6	2290760	2290765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45285	NC_011989	GTT	2	6	2290773	2290778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45286	NC_011989	CGC	2	6	2290792	2290797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45287	NC_011989	AT	3	6	2290818	2290823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45288	NC_011989	TCG	3	9	2290850	2290858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45289	NC_011989	TTC	2	6	2290925	2290930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45290	NC_011989	GTT	2	6	2290931	2290936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45291	NC_011989	A	8	8	2290977	2290984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45292	NC_011989	TCGT	2	8	2290998	2291005	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45293	NC_011989	ACG	2	6	2291023	2291028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45294	NC_011989	GAG	2	6	2291050	2291055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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45296	NC_011989	CAAC	2	8	2291153	2291160	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45297	NC_011989	AGC	2	6	2291184	2291189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45298	NC_011989	ATCC	2	8	2291225	2291232	25 %	25 %	0 %	50 %	222149035
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45300	NC_011989	ATT	2	6	2291433	2291438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222149035
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45302	NC_011989	CGA	2	6	2291573	2291578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149035
45303	NC_011989	CAT	2	6	2291614	2291619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149035
45304	NC_011989	CT	3	6	2291629	2291634	0 %	50 %	0 %	50 %	222149035
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45310	NC_011989	GCCC	2	8	2291869	2291876	0 %	0 %	25 %	75 %	222149035
45311	NC_011989	GCG	2	6	2291956	2291961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149035
45312	NC_011989	TGC	2	6	2292003	2292008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149035
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45323	NC_011989	GTC	2	6	2292800	2292805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222149035
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45331	NC_011989	GAA	2	6	2293047	2293052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45332	NC_011989	GTT	2	6	2293117	2293122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45333	NC_011989	GCG	2	6	2293133	2293138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45334	NC_011989	AGC	2	6	2293215	2293220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45335	NC_011989	TCG	2	6	2293234	2293239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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45337	NC_011989	CTG	2	6	2293288	2293293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45338	NC_011989	GAA	2	6	2293354	2293359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222149036
45339	NC_011989	GGC	2	6	2293427	2293432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149036
45340	NC_011989	AGC	2	6	2293534	2293539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222149036
45341	NC_011989	A	6	6	2293598	2293603	100 %	0 %	0 %	0 %	222149036
45342	NC_011989	GCC	3	9	2293605	2293613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222149036
45343	NC_011989	TC	3	6	2293704	2293709	0 %	50 %	0 %	50 %	222149037
45344	NC_011989	CCA	2	6	2293747	2293752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222149037
45345	NC_011989	TCT	2	6	2293843	2293848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222149037
45346	NC_011989	CAT	2	6	2293874	2293879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149037
45347	NC_011989	TCA	2	6	2293962	2293967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222149037
45348	NC_011989	GCG	2	6	2293994	2293999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222149037
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