MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 74014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23001	NC_011989	GAC	2	6	1159359	1159364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148033
23002	NC_011989	GAT	2	6	1159401	1159406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148033
23003	NC_011989	ACC	2	6	1159424	1159429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222148033
23004	NC_011989	GCA	2	6	1159451	1159456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148033
23005	NC_011989	TCA	2	6	1159463	1159468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222148033
23006	NC_011989	CAT	2	6	1159482	1159487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222148033
23007	NC_011989	CAG	2	6	1159488	1159493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148033
23008	NC_011989	CATGG	2	10	1159536	1159545	20 %	20 %	40 %	20 %	222148033
23009	NC_011989	CGT	2	6	1159776	1159781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23010	NC_011989	CT	3	6	1159888	1159893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23011	NC_011989	ACG	2	6	1159894	1159899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23012	NC_011989	GGATGA	2	12	1159914	1159925	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
23013	NC_011989	ATCA	2	8	1159984	1159991	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23014	NC_011989	ATTG	2	8	1160047	1160054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23015	NC_011989	TGT	2	6	1160071	1160076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23016	NC_011989	A	6	6	1160087	1160092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23017	NC_011989	ATG	2	6	1160096	1160101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23018	NC_011989	TGC	2	6	1160134	1160139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23019	NC_011989	TCC	2	6	1160204	1160209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222148034
23020	NC_011989	GGC	2	6	1160239	1160244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148034
23021	NC_011989	GAT	2	6	1160311	1160316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148034
23022	NC_011989	GCC	2	6	1160324	1160329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148034
23023	NC_011989	TGG	2	6	1160394	1160399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148034
23024	NC_011989	CTATC	2	10	1160462	1160471	20 %	40 %	0 %	40 %	222148034
23025	NC_011989	TGG	2	6	1160593	1160598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148034
23026	NC_011989	GCA	2	6	1160608	1160613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148034
23027	NC_011989	TGA	2	6	1160674	1160679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148034
23028	NC_011989	GTG	2	6	1160733	1160738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148034
23029	NC_011989	GAT	2	6	1160789	1160794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148034
23030	NC_011989	CGGGC	2	10	1160916	1160925	0 %	0 %	60 %	40 %	222148034
23031	NC_011989	CTGG	2	8	1160935	1160942	0 %	25 %	50 %	25 %	222148034
23032	NC_011989	TGGC	2	8	1160972	1160979	0 %	25 %	50 %	25 %	222148034
23033	NC_011989	GC	3	6	1160978	1160983	0 %	0 %	50 %	50 %	222148034
23034	NC_011989	CGC	2	6	1161113	1161118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23035	NC_011989	CCG	2	6	1161159	1161164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23036	NC_011989	CTGC	2	8	1161202	1161209	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23037	NC_011989	GCGG	2	8	1161233	1161240	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23038	NC_011989	CG	3	6	1161253	1161258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23039	NC_011989	CCG	2	6	1161268	1161273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23040	NC_011989	TCC	2	6	1161532	1161537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23041	NC_011989	GCG	2	6	1161547	1161552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23042	NC_011989	AT	3	6	1161594	1161599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23043	NC_011989	ATG	2	6	1161634	1161639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23044	NC_011989	AAC	2	6	1161679	1161684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23045	NC_011989	TG	3	6	1161702	1161707	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23046	NC_011989	TGG	2	6	1161758	1161763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148035
23047	NC_011989	GCA	2	6	1161773	1161778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148035
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23049	NC_011989	GAA	3	9	1161879	1161887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222148035
23050	NC_011989	TC	3	6	1161945	1161950	0 %	50 %	0 %	50 %	222148035
23051	NC_011989	GGC	2	6	1161969	1161974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148035
23052	NC_011989	GGT	2	6	1162023	1162028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148035
23053	NC_011989	AGC	2	6	1162033	1162038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148035
23054	NC_011989	CGA	2	6	1162045	1162050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148035
23055	NC_011989	GCA	2	6	1162060	1162065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148035
23056	NC_011989	GC	3	6	1162082	1162087	0 %	0 %	50 %	50 %	222148035
23057	NC_011989	CCGG	2	8	1162092	1162099	0 %	0 %	50 %	50 %	222148035
23058	NC_011989	ATG	2	6	1162153	1162158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148035
23059	NC_011989	TGG	2	6	1162187	1162192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148035
23060	NC_011989	CAGC	2	8	1162250	1162257	25 %	0 %	25 %	50 %	222148035
23061	NC_011989	CGG	2	6	1162271	1162276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148035
23062	NC_011989	CGT	2	6	1162286	1162291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148035
23063	NC_011989	GCA	2	6	1162330	1162335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148035
23064	NC_011989	AGGGC	2	10	1162363	1162372	20 %	0 %	60 %	20 %	222148035
23065	NC_011989	TGT	2	6	1162459	1162464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222148035
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23068	NC_011989	AGC	2	6	1162605	1162610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148035
23069	NC_011989	TCG	2	6	1162697	1162702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148036
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23071	NC_011989	GCC	2	6	1162819	1162824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148036
23072	NC_011989	GCCT	2	8	1162849	1162856	0 %	25 %	25 %	50 %	222148036
23073	NC_011989	CAT	2	6	1162878	1162883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222148036
23074	NC_011989	TCG	2	6	1162910	1162915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148036
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23079	NC_011989	GAT	2	6	1163272	1163277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148036
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23083	NC_011989	GTC	2	6	1163423	1163428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148036
23084	NC_011989	AGCCG	2	10	1163490	1163499	20 %	0 %	40 %	40 %	222148036
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23088	NC_011989	GGC	2	6	1163707	1163712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148036
23089	NC_011989	GGC	2	6	1163773	1163778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148036
23090	NC_011989	CG	3	6	1163804	1163809	0 %	0 %	50 %	50 %	222148036
23091	NC_011989	GGT	2	6	1163857	1163862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148036
23092	NC_011989	GTG	2	6	1163894	1163899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148036
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23094	NC_011989	GCT	3	9	1163969	1163977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23095	NC_011989	GC	3	6	1164021	1164026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23096	NC_011989	TGA	2	6	1164063	1164068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23097	NC_011989	GC	3	6	1164120	1164125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23098	NC_011989	C	7	7	1164260	1164266	0 %	0 %	0 %	100 %	222148037
23099	NC_011989	GAT	2	6	1164268	1164273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148037
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23101	NC_011989	GTG	2	6	1164471	1164476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148038
23102	NC_011989	TGA	2	6	1164548	1164553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148038
23103	NC_011989	GCC	2	6	1164582	1164587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148038
23104	NC_011989	GC	3	6	1164665	1164670	0 %	0 %	50 %	50 %	222148038
23105	NC_011989	GGT	2	6	1164675	1164680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148038
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23108	NC_011989	ATC	2	6	1164775	1164780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222148038
23109	NC_011989	ATCAGC	2	12	1164808	1164819	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222148038
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23112	NC_011989	GA	3	6	1164904	1164909	50 %	0 %	50 %	0 %	222148038
23113	NC_011989	GGAT	2	8	1164919	1164926	25 %	25 %	50 %	0 %	222148038
23114	NC_011989	ACA	2	6	1164938	1164943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222148038
23115	NC_011989	CAC	2	6	1164951	1164956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222148038
23116	NC_011989	CAG	2	6	1164984	1164989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148038
23117	NC_011989	CTG	2	6	1165008	1165013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148038
23118	NC_011989	CGC	2	6	1165020	1165025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148038
23119	NC_011989	AGG	2	6	1165037	1165042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222148038
23120	NC_011989	TGATC	2	10	1165076	1165085	20 %	40 %	20 %	20 %	222148038
23121	NC_011989	TGACAG	2	12	1165169	1165180	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222148038
23122	NC_011989	GAA	2	6	1165237	1165242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222148038
23123	NC_011989	TCG	2	6	1165270	1165275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148038
23124	NC_011989	CGA	2	6	1165301	1165306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148038
23125	NC_011989	GCA	2	6	1165342	1165347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148038
23126	NC_011989	AGC	2	6	1165407	1165412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148038
23127	NC_011989	GCA	2	6	1165441	1165446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148038
23128	NC_011989	AAC	2	6	1165483	1165488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222148038
23129	NC_011989	GAC	2	6	1165557	1165562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148038
23130	NC_011989	CTGG	2	8	1165572	1165579	0 %	25 %	50 %	25 %	222148038
23131	NC_011989	TGC	2	6	1165583	1165588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148038
23132	NC_011989	CTG	2	6	1165608	1165613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148038
23133	NC_011989	GTC	2	6	1165695	1165700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148038
23134	NC_011989	GTT	2	6	1165731	1165736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222148038
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23137	NC_011989	GAA	2	6	1165902	1165907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222148038
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23139	NC_011989	CAT	2	6	1165965	1165970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222148038
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23142	NC_011989	GCT	2	6	1166073	1166078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148038
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23144	NC_011989	GAC	2	6	1166154	1166159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148038
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23149	NC_011989	GGC	2	6	1166283	1166288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148038
23150	NC_011989	GCG	2	6	1166294	1166299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148038
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23153	NC_011989	GCC	2	6	1166427	1166432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148038
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23165	NC_011989	CG	3	6	1166963	1166968	0 %	0 %	50 %	50 %	222148038
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23173	NC_011989	TGG	2	6	1167512	1167517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148038
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23184	NC_011989	GTCC	2	8	1168444	1168451	0 %	25 %	25 %	50 %	222148039
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23188	NC_011989	TCCTG	2	10	1168671	1168680	0 %	40 %	20 %	40 %	222148039
23189	NC_011989	CTGG	2	8	1168739	1168746	0 %	25 %	50 %	25 %	222148039
23190	NC_011989	AT	3	6	1168793	1168798	50 %	50 %	0 %	0 %	222148039
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23194	NC_011989	ATT	2	6	1168899	1168904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23195	NC_011989	TAA	2	6	1168979	1168984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23196	NC_011989	TTCG	2	8	1169008	1169015	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23197	NC_011989	CGG	2	6	1169026	1169031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23198	NC_011989	GGC	2	6	1169058	1169063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148040
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23200	NC_011989	GCA	2	6	1169078	1169083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148040
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23217	NC_011989	GCG	2	6	1169788	1169793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148040
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23219	NC_011989	CA	3	6	1169939	1169944	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23220	NC_011989	CAG	2	6	1170009	1170014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23221	NC_011989	TTTGA	2	10	1170060	1170069	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23222	NC_011989	AAC	2	6	1170108	1170113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23223	NC_011989	GTG	2	6	1170160	1170165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148041
23224	NC_011989	TTG	2	6	1170167	1170172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222148041
23225	NC_011989	ATC	2	6	1170344	1170349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222148041
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23227	NC_011989	GCC	2	6	1170429	1170434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148041
23228	NC_011989	TGA	2	6	1170437	1170442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148041
23229	NC_011989	TGTC	2	8	1170477	1170484	0 %	50 %	25 %	25 %	222148041
23230	NC_011989	TGGC	2	8	1170487	1170494	0 %	25 %	50 %	25 %	222148041
23231	NC_011989	GCC	2	6	1170538	1170543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148041
23232	NC_011989	GAA	2	6	1170609	1170614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222148041
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23234	NC_011989	TTG	2	6	1170652	1170657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222148041
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23294	NC_011989	TCGT	2	8	1173583	1173590	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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23350	NC_011989	CGCAG	2	10	1176006	1176015	20 %	0 %	40 %	40 %	222148045
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23469	NC_011989	TCA	2	6	1181224	1181229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222148049
23470	NC_011989	ATC	2	6	1181254	1181259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222148049
23471	NC_011989	ACGCTG	2	12	1181277	1181288	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222148049
23472	NC_011989	GCC	2	6	1181289	1181294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148049
23473	NC_011989	CTTC	2	8	1181342	1181349	0 %	50 %	0 %	50 %	222148049
23474	NC_011989	GGC	2	6	1181352	1181357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148049
23475	NC_011989	TGA	2	6	1181420	1181425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148049
23476	NC_011989	GAGC	2	8	1181451	1181458	25 %	0 %	50 %	25 %	222148049
23477	NC_011989	GAC	2	6	1181489	1181494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148049
23478	NC_011989	CGG	2	6	1181561	1181566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148049
23479	NC_011989	AGC	2	6	1181578	1181583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148049
23480	NC_011989	CCA	2	6	1181726	1181731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222148049
23481	NC_011989	CGG	2	6	1181798	1181803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148049
23482	NC_011989	CAG	2	6	1181805	1181810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148049
23483	NC_011989	GCGG	2	8	1181831	1181838	0 %	0 %	75 %	25 %	222148049
23484	NC_011989	CGC	2	6	1181876	1181881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148049
23485	NC_011989	TCGG	2	8	1181898	1181905	0 %	25 %	50 %	25 %	222148049
23486	NC_011989	TCG	2	6	1182031	1182036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148049
23487	NC_011989	CAG	2	6	1182042	1182047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148049
23488	NC_011989	ATC	2	6	1182076	1182081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222148049
23489	NC_011989	CGCTGG	2	12	1182085	1182096	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222148049
23490	NC_011989	CCG	2	6	1182097	1182102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148049
23491	NC_011989	GC	4	8	1182181	1182188	0 %	0 %	50 %	50 %	222148049
23492	NC_011989	GCG	2	6	1182204	1182209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148049
23493	NC_011989	CGT	2	6	1182311	1182316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148049
23494	NC_011989	CGAGC	2	10	1182361	1182370	20 %	0 %	40 %	40 %	222148049
23495	NC_011989	CAT	2	6	1182411	1182416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222148049
23496	NC_011989	GCCGGA	2	12	1182429	1182440	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222148049
23497	NC_011989	CGA	2	6	1182446	1182451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148049
23498	NC_011989	GTG	2	6	1182520	1182525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148049
23499	NC_011989	GAA	2	6	1182656	1182661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222148050
23500	NC_011989	CAG	2	6	1182677	1182682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148050

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