MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 74014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22120	NC_011989	CTGG	2	8	1117830	1117837	0 %	25 %	50 %	25 %	222147998
22121	NC_011989	ATG	2	6	1117866	1117871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147998
22122	NC_011989	GC	3	6	1117905	1117910	0 %	0 %	50 %	50 %	222147998
22123	NC_011989	TGC	2	6	1117921	1117926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147998
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22147	NC_011989	TTG	2	6	1119308	1119313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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22149	NC_011989	CGC	2	6	1119450	1119455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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22203	NC_011989	GC	3	6	1121718	1121723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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22220	NC_011989	GGAT	2	8	1122749	1122756	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22221	NC_011989	ATC	2	6	1122766	1122771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222148003
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22224	NC_011989	CCG	2	6	1122901	1122906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148003
22225	NC_011989	GTC	2	6	1122909	1122914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148003
22226	NC_011989	CAA	2	6	1122938	1122943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222148003
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22228	NC_011989	GGC	2	6	1123061	1123066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148003
22229	NC_011989	CGGCG	2	10	1123083	1123092	0 %	0 %	60 %	40 %	222148003
22230	NC_011989	CGGATG	2	12	1123141	1123152	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222148003
22231	NC_011989	CGC	2	6	1123336	1123341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148003
22232	NC_011989	CTTTC	2	10	1123353	1123362	0 %	60 %	0 %	40 %	222148003
22233	NC_011989	CGC	2	6	1123388	1123393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148003
22234	NC_011989	GCT	2	6	1123403	1123408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148003
22235	NC_011989	GAT	2	6	1123410	1123415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148003
22236	NC_011989	GCT	2	6	1123416	1123421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148003
22237	NC_011989	GGCG	2	8	1123493	1123500	0 %	0 %	75 %	25 %	222148003
22238	NC_011989	GCCTGG	2	12	1123554	1123565	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222148003
22239	NC_011989	TGA	2	6	1123687	1123692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148003
22240	NC_011989	GCC	2	6	1123754	1123759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148003
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22242	NC_011989	TGG	2	6	1123879	1123884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148003
22243	NC_011989	TGC	2	6	1123906	1123911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148003
22244	NC_011989	ACC	2	6	1123950	1123955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222148003
22245	NC_011989	TGG	3	9	1123964	1123972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148003
22246	NC_011989	TGC	2	6	1124009	1124014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148003
22247	NC_011989	C	6	6	1124057	1124062	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
22248	NC_011989	CAC	2	6	1124134	1124139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222148004
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22256	NC_011989	CTG	2	6	1124634	1124639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148004
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22264	NC_011989	GCTGC	2	10	1125084	1125093	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
22265	NC_011989	GCC	2	6	1125111	1125116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22266	NC_011989	GGC	2	6	1125122	1125127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22267	NC_011989	GCGA	2	8	1125144	1125151	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22268	NC_011989	TGA	2	6	1125185	1125190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148006
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22345	NC_011989	ATGC	2	8	1128058	1128065	25 %	25 %	25 %	25 %	222148010
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22350	NC_011989	GGC	2	6	1128395	1128400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148011
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22352	NC_011989	GCG	2	6	1128558	1128563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148011
22353	NC_011989	TGG	2	6	1128592	1128597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148011
22354	NC_011989	GGT	2	6	1128598	1128603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148011
22355	NC_011989	ATGG	2	8	1128626	1128633	25 %	25 %	50 %	0 %	222148011
22356	NC_011989	AGGC	2	8	1128657	1128664	25 %	0 %	50 %	25 %	222148011
22357	NC_011989	CGGA	2	8	1128696	1128703	25 %	0 %	50 %	25 %	222148011
22358	NC_011989	GCG	2	6	1128726	1128731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148011
22359	NC_011989	CTC	2	6	1128733	1128738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222148011
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22361	NC_011989	CTG	2	6	1128815	1128820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148011
22362	NC_011989	GCG	2	6	1128921	1128926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148012
22363	NC_011989	GCG	2	6	1128934	1128939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148012
22364	NC_011989	CGC	2	6	1129001	1129006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148012
22365	NC_011989	ATG	2	6	1129011	1129016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148012
22366	NC_011989	GGC	2	6	1129079	1129084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148012
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22368	NC_011989	GGGC	2	8	1129139	1129146	0 %	0 %	75 %	25 %	222148012
22369	NC_011989	GGC	2	6	1129232	1129237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148012
22370	NC_011989	GCA	2	6	1129245	1129250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148012
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22372	NC_011989	CGGG	2	8	1129382	1129389	0 %	0 %	75 %	25 %	222148012
22373	NC_011989	ACCG	2	8	1129421	1129428	25 %	0 %	25 %	50 %	222148012
22374	NC_011989	AATC	2	8	1129435	1129442	50 %	25 %	0 %	25 %	222148012
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22376	NC_011989	GGCG	2	8	1129533	1129540	0 %	0 %	75 %	25 %	222148013
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22384	NC_011989	CGC	2	6	1129942	1129947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148013
22385	NC_011989	TGG	2	6	1130021	1130026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148013
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22388	NC_011989	AGCATC	2	12	1130230	1130241	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222148013
22389	NC_011989	CGC	2	6	1130286	1130291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148013
22390	NC_011989	GAC	2	6	1130355	1130360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148013
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22392	NC_011989	CCA	2	6	1130472	1130477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222148014
22393	NC_011989	GCCT	2	8	1130554	1130561	0 %	25 %	25 %	50 %	222148014
22394	NC_011989	GGC	2	6	1130608	1130613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148014
22395	NC_011989	GCG	2	6	1130614	1130619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148014
22396	NC_011989	CGC	2	6	1130695	1130700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148014
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22398	NC_011989	GGC	2	6	1130755	1130760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22399	NC_011989	CGCTC	2	10	1130768	1130777	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
22400	NC_011989	GGC	3	9	1130790	1130798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22401	NC_011989	GCA	2	6	1130877	1130882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22402	NC_011989	CCA	2	6	1130970	1130975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222148015
22403	NC_011989	GTC	2	6	1130992	1130997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148015
22404	NC_011989	CGG	2	6	1131007	1131012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148015
22405	NC_011989	CGG	2	6	1131061	1131066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148015
22406	NC_011989	ACC	3	9	1131101	1131109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222148015
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22419	NC_011989	GT	3	6	1131608	1131613	0 %	50 %	50 %	0 %	222148015
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22422	NC_011989	GAG	2	6	1131716	1131721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222148015
22423	NC_011989	GCG	3	9	1131780	1131788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148015
22424	NC_011989	GGC	2	6	1131800	1131805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148015
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22429	NC_011989	CAT	2	6	1132030	1132035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222148015
22430	NC_011989	GAT	2	6	1132064	1132069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148015
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22434	NC_011989	TGC	2	6	1132143	1132148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148015
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22438	NC_011989	ATC	2	6	1132353	1132358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222148015
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22440	NC_011989	TTC	2	6	1132382	1132387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222148015
22441	NC_011989	ACG	2	6	1132464	1132469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148015
22442	NC_011989	GCC	2	6	1132520	1132525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148015
22443	NC_011989	GCC	2	6	1132580	1132585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148015
22444	NC_011989	GCC	2	6	1132604	1132609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148015
22445	NC_011989	TGG	2	6	1132667	1132672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148015
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22451	NC_011989	GCG	2	6	1132879	1132884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148015
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22453	NC_011989	GCG	2	6	1133067	1133072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148015
22454	NC_011989	CCG	2	6	1133136	1133141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148015
22455	NC_011989	TC	3	6	1133152	1133157	0 %	50 %	0 %	50 %	222148015
22456	NC_011989	TGC	2	6	1133250	1133255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148015
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22459	NC_011989	CGC	2	6	1133432	1133437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148015
22460	NC_011989	GTG	2	6	1133438	1133443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148015
22461	NC_011989	CTGC	2	8	1133474	1133481	0 %	25 %	25 %	50 %	222148015
22462	NC_011989	GCG	2	6	1133545	1133550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148015
22463	NC_011989	CCGG	2	8	1133628	1133635	0 %	0 %	50 %	50 %	222148015
22464	NC_011989	CAG	2	6	1133659	1133664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148015
22465	NC_011989	CAG	2	6	1133725	1133730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222148015
22466	NC_011989	CGGG	2	8	1133731	1133738	0 %	0 %	75 %	25 %	222148015
22467	NC_011989	GCGG	2	8	1133745	1133752	0 %	0 %	75 %	25 %	222148015
22468	NC_011989	GGC	2	6	1133778	1133783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148015
22469	NC_011989	TGA	2	6	1133803	1133808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222148015
22470	NC_011989	GC	4	8	1133828	1133835	0 %	0 %	50 %	50 %	222148015
22471	NC_011989	GGC	2	6	1133836	1133841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148015
22472	NC_011989	GTC	2	6	1133872	1133877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148015
22473	NC_011989	CCG	2	6	1133880	1133885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148015
22474	NC_011989	GTG	2	6	1133912	1133917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148015
22475	NC_011989	GT	3	6	1133964	1133969	0 %	50 %	50 %	0 %	222148015
22476	NC_011989	TCC	2	6	1134026	1134031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222148015
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22482	NC_011989	GGT	2	6	1134220	1134225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148015
22483	NC_011989	GC	3	6	1134388	1134393	0 %	0 %	50 %	50 %	222148015
22484	NC_011989	CG	3	6	1134398	1134403	0 %	0 %	50 %	50 %	222148015
22485	NC_011989	GCG	2	6	1134408	1134413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148015
22486	NC_011989	TGC	2	6	1134537	1134542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148015
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22489	NC_011989	TGG	2	6	1134868	1134873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148016
22490	NC_011989	GGGC	2	8	1134890	1134897	0 %	0 %	75 %	25 %	222148016
22491	NC_011989	TGG	2	6	1134898	1134903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148016
22492	NC_011989	TGG	2	6	1134919	1134924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222148016
22493	NC_011989	GCC	2	6	1134956	1134961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222148016
22494	NC_011989	AAT	2	6	1135007	1135012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22495	NC_011989	CATT	2	8	1135084	1135091	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22496	NC_011989	TGT	2	6	1135260	1135265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222148017
22497	NC_011989	GTC	2	6	1135279	1135284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222148017
22498	NC_011989	AAC	2	6	1135322	1135327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222148017
22499	NC_011989	CGG	2	6	1135380	1135385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148017
22500	NC_011989	GGC	2	6	1135439	1135444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222148017

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