MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 74014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_011989	CGG	2	6	844460	844465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147752
16503	NC_011989	AGC	2	6	844487	844492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147752
16504	NC_011989	GGC	2	6	844494	844499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147752
16505	NC_011989	GCC	2	6	844519	844524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147752
16506	NC_011989	GC	3	6	844563	844568	0 %	0 %	50 %	50 %	222147752
16507	NC_011989	TGG	2	6	844586	844591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147752
16508	NC_011989	CCA	2	6	844592	844597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147752
16509	NC_011989	GGT	2	6	844626	844631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147752
16510	NC_011989	TCC	2	6	844669	844674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222147752
16511	NC_011989	ATC	2	6	844690	844695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147752
16512	NC_011989	TCT	2	6	844728	844733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147752
16513	NC_011989	AGGC	2	8	844772	844779	25 %	0 %	50 %	25 %	222147752
16514	NC_011989	GCC	2	6	844837	844842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147752
16515	NC_011989	TCC	2	6	844870	844875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222147752
16516	NC_011989	GA	3	6	844907	844912	50 %	0 %	50 %	0 %	222147752
16517	NC_011989	CCG	2	6	844940	844945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147752
16518	NC_011989	TC	3	6	845007	845012	0 %	50 %	0 %	50 %	222147752
16519	NC_011989	CA	3	6	845049	845054	50 %	0 %	0 %	50 %	222147752
16520	NC_011989	CGC	2	6	845061	845066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147752
16521	NC_011989	TGG	2	6	845069	845074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147752
16522	NC_011989	CAGC	2	8	845087	845094	25 %	0 %	25 %	50 %	222147752
16523	NC_011989	GGA	2	6	845151	845156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147752
16524	NC_011989	CGG	2	6	845186	845191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147752
16525	NC_011989	GCTC	2	8	845245	845252	0 %	25 %	25 %	50 %	222147752
16526	NC_011989	GGC	2	6	845284	845289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147752
16527	NC_011989	GCC	2	6	845299	845304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147752
16528	NC_011989	CAA	2	6	845352	845357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16529	NC_011989	CGC	2	6	845359	845364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16530	NC_011989	ACGT	2	8	845460	845467	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16531	NC_011989	CGCTC	2	10	845474	845483	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
16532	NC_011989	CGCCA	2	10	845506	845515	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
16533	NC_011989	CCT	2	6	845609	845614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16534	NC_011989	GCG	2	6	845820	845825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16535	NC_011989	CGA	2	6	845952	845957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16536	NC_011989	GTC	2	6	845974	845979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16537	NC_011989	CT	3	6	846059	846064	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16538	NC_011989	AAT	2	6	846095	846100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16539	NC_011989	CAT	2	6	846152	846157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16540	NC_011989	CAGG	2	8	846223	846230	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16541	NC_011989	AAT	2	6	846231	846236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16542	NC_011989	ATT	2	6	846319	846324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16543	NC_011989	TTC	2	6	846367	846372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16544	NC_011989	GAG	2	6	846396	846401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16545	NC_011989	TAT	3	9	846415	846423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16546	NC_011989	T	6	6	846427	846432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16547	NC_011989	A	6	6	846452	846457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16548	NC_011989	ATG	2	6	846515	846520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16549	NC_011989	ATA	2	6	846630	846635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222147753
16550	NC_011989	CTTG	2	8	846673	846680	0 %	50 %	25 %	25 %	222147753
16551	NC_011989	TTG	2	6	846690	846695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147753
16552	NC_011989	TGGA	2	8	846742	846749	25 %	25 %	50 %	0 %	222147753
16553	NC_011989	TGC	2	6	846768	846773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147753
16554	NC_011989	A	6	6	846774	846779	100 %	0 %	0 %	0 %	222147753
16555	NC_011989	TCT	2	6	846832	846837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147753
16556	NC_011989	TGA	2	6	846847	846852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147753
16557	NC_011989	GGCT	2	8	846874	846881	0 %	25 %	50 %	25 %	222147753
16558	NC_011989	CAG	2	6	846941	846946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147753
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16560	NC_011989	ATGG	2	8	847085	847092	25 %	25 %	50 %	0 %	222147753
16561	NC_011989	GCCAAG	2	12	847100	847111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147753
16562	NC_011989	GC	3	6	847131	847136	0 %	0 %	50 %	50 %	222147753
16563	NC_011989	GCT	2	6	847157	847162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147753
16564	NC_011989	CGC	3	9	847165	847173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147753
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16566	NC_011989	CGC	2	6	847184	847189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147753
16567	NC_011989	CTG	2	6	847196	847201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147753
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16570	NC_011989	GCC	2	6	847341	847346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147753
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16573	NC_011989	CGC	2	6	847585	847590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147753
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16582	NC_011989	GTC	2	6	847877	847882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147753
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16588	NC_011989	CTC	2	6	848119	848124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222147753
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16593	NC_011989	GCC	2	6	848312	848317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147753
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16601	NC_011989	TGG	2	6	848580	848585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16602	NC_011989	ACA	2	6	848593	848598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16603	NC_011989	CGC	2	6	848602	848607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16604	NC_011989	GCG	2	6	848622	848627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16605	NC_011989	GTC	2	6	848654	848659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16606	NC_011989	GCC	2	6	848669	848674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16607	NC_011989	CT	3	6	848679	848684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16608	NC_011989	CG	3	6	848714	848719	0 %	0 %	50 %	50 %	222147754
16609	NC_011989	GCCT	2	8	848763	848770	0 %	25 %	25 %	50 %	222147754
16610	NC_011989	ATCC	2	8	848799	848806	25 %	25 %	0 %	50 %	222147754
16611	NC_011989	CCG	2	6	848896	848901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147754
16612	NC_011989	TGG	2	6	848935	848940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147754
16613	NC_011989	CGG	2	6	849014	849019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147754
16614	NC_011989	TCT	2	6	849028	849033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147754
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16617	NC_011989	CCTT	2	8	849091	849098	0 %	50 %	0 %	50 %	222147754
16618	NC_011989	GAT	2	6	849099	849104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147754
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16621	NC_011989	GGAA	2	8	849179	849186	50 %	0 %	50 %	0 %	222147754
16622	NC_011989	TCA	2	6	849196	849201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147754
16623	NC_011989	GGC	3	9	849204	849212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147754
16624	NC_011989	TCA	2	6	849241	849246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147754
16625	NC_011989	GCC	3	9	849247	849255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147754
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16627	NC_011989	CGA	2	6	849329	849334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147754
16628	NC_011989	GC	3	6	849431	849436	0 %	0 %	50 %	50 %	222147754
16629	NC_011989	CGG	2	6	849455	849460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147754
16630	NC_011989	ATGGC	2	10	849560	849569	20 %	20 %	40 %	20 %	222147754
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16632	NC_011989	GTC	2	6	849591	849596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147754
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16636	NC_011989	CTTGGC	2	12	849657	849668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147754
16637	NC_011989	TGA	2	6	849680	849685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147754
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16639	NC_011989	CGG	2	6	849728	849733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147754
16640	NC_011989	CAC	2	6	849759	849764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147754
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16643	NC_011989	GCC	2	6	849885	849890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147754
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16647	NC_011989	GC	3	6	850100	850105	0 %	0 %	50 %	50 %	222147754
16648	NC_011989	GTT	2	6	850110	850115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147754
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16650	NC_011989	CGGT	2	8	850177	850184	0 %	25 %	50 %	25 %	222147754
16651	NC_011989	GGA	2	6	850236	850241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147754
16652	NC_011989	CGC	2	6	850333	850338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147754
16653	NC_011989	CCA	2	6	850436	850441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147754
16654	NC_011989	ATC	2	6	850489	850494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147754
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16658	NC_011989	TCC	2	6	850654	850659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16659	NC_011989	TGTT	2	8	850736	850743	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16660	NC_011989	ACA	2	6	850980	850985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147755
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16662	NC_011989	TCG	2	6	851039	851044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147755
16663	NC_011989	CGC	2	6	851055	851060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147755
16664	NC_011989	GGC	2	6	851131	851136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147755
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16672	NC_011989	GCG	2	6	851453	851458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147756
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16677	NC_011989	TGCCGT	2	12	851576	851587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147756
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16686	NC_011989	CGG	2	6	851771	851776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147756
16687	NC_011989	GTC	2	6	851859	851864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147756
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16690	NC_011989	AGCG	2	8	851998	852005	25 %	0 %	50 %	25 %	222147756
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16692	NC_011989	TCC	2	6	852093	852098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16693	NC_011989	AGGGCA	2	12	852158	852169	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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16697	NC_011989	GGCCC	2	10	852298	852307	0 %	0 %	40 %	60 %	222147757
16698	NC_011989	AGA	2	6	852310	852315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147757
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16706	NC_011989	CAG	2	6	852841	852846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147758
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16710	NC_011989	CGA	2	6	853110	853115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147758
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16712	NC_011989	GC	3	6	853287	853292	0 %	0 %	50 %	50 %	222147758
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16717	NC_011989	ATG	2	6	853492	853497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16718	NC_011989	GCA	2	6	853520	853525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147759
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16737	NC_011989	TCAGCG	2	12	854421	854432	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222147760
16738	NC_011989	GCC	2	6	854519	854524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147760
16739	NC_011989	GC	3	6	854553	854558	0 %	0 %	50 %	50 %	222147760
16740	NC_011989	AAGGC	2	10	854603	854612	40 %	0 %	40 %	20 %	222147760
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16983	NC_011989	GGCGG	2	10	868300	868309	0 %	0 %	80 %	20 %	222147773
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16985	NC_011989	CGG	2	6	868326	868331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147773
16986	NC_011989	GGC	2	6	868453	868458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147773
16987	NC_011989	GC	3	6	868476	868481	0 %	0 %	50 %	50 %	222147773
16988	NC_011989	GGC	2	6	868489	868494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147773
16989	NC_011989	CGG	2	6	868518	868523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147773
16990	NC_011989	GC	3	6	868555	868560	0 %	0 %	50 %	50 %	222147773
16991	NC_011989	TTGGCC	2	12	868586	868597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147773
16992	NC_011989	GC	3	6	868604	868609	0 %	0 %	50 %	50 %	222147773
16993	NC_011989	CGG	2	6	868611	868616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147773
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16995	NC_011989	CAT	2	6	868725	868730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147773
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16997	NC_011989	ACC	2	6	868888	868893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16998	NC_011989	ATG	2	6	868961	868966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16999	NC_011989	AAT	2	6	869142	869147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17000	NC_011989	TGC	2	6	869191	869196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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