MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 74014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_011989	CAG	2	6	645619	645624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147582
12502	NC_011989	CGTT	2	8	645645	645652	0 %	50 %	25 %	25 %	222147582
12503	NC_011989	TGG	2	6	645693	645698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147582
12504	NC_011989	GAG	2	6	645713	645718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147582
12505	NC_011989	GCA	3	9	645745	645753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147582
12506	NC_011989	AGT	2	6	645816	645821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147582
12507	NC_011989	TGCCG	2	10	645859	645868	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12508	NC_011989	TGG	2	6	645884	645889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_011989	CCG	2	6	645965	645970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12510	NC_011989	GCC	2	6	646071	646076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12511	NC_011989	CAT	2	6	646086	646091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12512	NC_011989	GTGTTT	2	12	646099	646110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_011989	GCC	2	6	646131	646136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12514	NC_011989	TGA	2	6	646191	646196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12515	NC_011989	CGA	2	6	646260	646265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12516	NC_011989	ATGAC	2	10	646291	646300	40 %	20 %	20 %	20 %	222147583
12517	NC_011989	CGCT	2	8	646306	646313	0 %	25 %	25 %	50 %	222147583
12518	NC_011989	GGC	2	6	646355	646360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147583
12519	NC_011989	GGC	2	6	646496	646501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147583
12520	NC_011989	CAG	2	6	646617	646622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147583
12521	NC_011989	GGA	2	6	646712	646717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147583
12522	NC_011989	GGAG	2	8	646748	646755	25 %	0 %	75 %	0 %	222147583
12523	NC_011989	AGC	2	6	646798	646803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147583
12524	NC_011989	GGAA	2	8	646817	646824	50 %	0 %	50 %	0 %	222147583
12525	NC_011989	TGA	2	6	646853	646858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147583
12526	NC_011989	GAA	2	6	646928	646933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147583
12527	NC_011989	CAC	3	9	646961	646969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147584
12528	NC_011989	ATC	2	6	646982	646987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147584
12529	NC_011989	GGC	3	9	647003	647011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147584
12530	NC_011989	GGC	2	6	647030	647035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147584
12531	NC_011989	GAT	2	6	647071	647076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147584
12532	NC_011989	CTT	2	6	647080	647085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147584
12533	NC_011989	TGC	2	6	647107	647112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147584
12534	NC_011989	GAC	2	6	647122	647127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147584
12535	NC_011989	CCGA	2	8	647177	647184	25 %	0 %	25 %	50 %	222147584
12536	NC_011989	GGC	3	9	647275	647283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147584
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12538	NC_011989	GCG	2	6	647463	647468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147584
12539	NC_011989	CAG	2	6	647507	647512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147584
12540	NC_011989	GCAAA	2	10	647538	647547	60 %	0 %	20 %	20 %	222147584
12541	NC_011989	AGC	2	6	647556	647561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147584
12542	NC_011989	GGC	3	9	647575	647583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147584
12543	NC_011989	CAG	2	6	647618	647623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147584
12544	NC_011989	GCG	3	9	647630	647638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147584
12545	NC_011989	GCCGCA	2	12	647639	647650	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222147584
12546	NC_011989	CAG	2	6	647723	647728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147584
12547	NC_011989	CAG	2	6	647816	647821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147584
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12550	NC_011989	CTG	2	6	647915	647920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147584
12551	NC_011989	GACC	2	8	647929	647936	25 %	0 %	25 %	50 %	222147584
12552	NC_011989	CCG	2	6	647967	647972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147584
12553	NC_011989	ACGC	2	8	648063	648070	25 %	0 %	25 %	50 %	222147584
12554	NC_011989	GCG	2	6	648147	648152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147584
12555	NC_011989	GGA	2	6	648214	648219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147584
12556	NC_011989	TGA	2	6	648280	648285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147585
12557	NC_011989	CG	3	6	648287	648292	0 %	0 %	50 %	50 %	222147585
12558	NC_011989	TGC	2	6	648343	648348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147585
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12560	NC_011989	GCAA	2	8	648417	648424	50 %	0 %	25 %	25 %	222147585
12561	NC_011989	CTG	3	9	648442	648450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147585
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12564	NC_011989	GTT	2	6	648549	648554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147585
12565	NC_011989	CAG	2	6	648568	648573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147585
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12568	NC_011989	G	6	6	648687	648692	0 %	0 %	100 %	0 %	222147585
12569	NC_011989	TGG	2	6	648796	648801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147585
12570	NC_011989	GGTCG	2	10	648840	648849	0 %	20 %	60 %	20 %	222147585
12571	NC_011989	TGG	2	6	648865	648870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147585
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12574	NC_011989	TTG	2	6	648934	648939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147585
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12579	NC_011989	CTG	2	6	649086	649091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147585
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12581	NC_011989	CG	3	6	649203	649208	0 %	0 %	50 %	50 %	222147585
12582	NC_011989	CCAG	2	8	649246	649253	25 %	0 %	25 %	50 %	222147585
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12586	NC_011989	ACC	2	6	649329	649334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147585
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12591	NC_011989	CAG	2	6	649542	649547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147585
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12597	NC_011989	TCG	2	6	649934	649939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147586
12598	NC_011989	TGA	3	9	650035	650043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147586
12599	NC_011989	GCT	2	6	650105	650110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147586
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12601	NC_011989	TCC	2	6	650222	650227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222147586
12602	NC_011989	TTG	2	6	650265	650270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147586
12603	NC_011989	CAG	2	6	650282	650287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147586
12604	NC_011989	GAT	2	6	650288	650293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147586
12605	NC_011989	GCT	2	6	650306	650311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147586
12606	NC_011989	CTG	2	6	650313	650318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147586
12607	NC_011989	AGA	2	6	650329	650334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147586
12608	NC_011989	GAT	2	6	650366	650371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147586
12609	NC_011989	CGG	3	9	650472	650480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147586
12610	NC_011989	TCAG	2	8	650482	650489	25 %	25 %	25 %	25 %	222147586
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12617	NC_011989	GTCC	2	8	650809	650816	0 %	25 %	25 %	50 %	222147586
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12733	NC_011989	CTG	2	6	657541	657546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147593
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12736	NC_011989	GAT	2	6	657697	657702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147593
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12857	NC_011989	TGCGCA	2	12	664400	664411	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222147602
12858	NC_011989	TCCT	2	8	664416	664423	0 %	50 %	0 %	50 %	222147602
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12976	NC_011989	TGG	2	6	670448	670453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147607
12977	NC_011989	GCC	2	6	670462	670467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147607
12978	NC_011989	CT	4	8	670500	670507	0 %	50 %	0 %	50 %	222147607
12979	NC_011989	CTG	2	6	670528	670533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147607
12980	NC_011989	ATG	2	6	670580	670585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147607
12981	NC_011989	T	6	6	670594	670599	0 %	100 %	0 %	0 %	222147607
12982	NC_011989	CTGG	2	8	670629	670636	0 %	25 %	50 %	25 %	222147607
12983	NC_011989	ATCT	2	8	670666	670673	25 %	50 %	0 %	25 %	222147607
12984	NC_011989	CG	3	6	670719	670724	0 %	0 %	50 %	50 %	222147607
12985	NC_011989	TCA	2	6	670754	670759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147607
12986	NC_011989	TGC	2	6	670766	670771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147607
12987	NC_011989	CTG	2	6	670834	670839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147607
12988	NC_011989	GCC	2	6	670889	670894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147607
12989	NC_011989	GCTCG	2	10	670905	670914	0 %	20 %	40 %	40 %	222147607
12990	NC_011989	GTG	2	6	670916	670921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147607
12991	NC_011989	TCA	2	6	670952	670957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147607
12992	NC_011989	TGC	2	6	670988	670993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147607
12993	NC_011989	TCCT	2	8	671067	671074	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12994	NC_011989	CTG	2	6	671124	671129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147608
12995	NC_011989	TGG	2	6	671162	671167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147608
12996	NC_011989	CGCGG	2	10	671168	671177	0 %	0 %	60 %	40 %	222147608
12997	NC_011989	CCGC	2	8	671250	671257	0 %	0 %	25 %	75 %	222147608
12998	NC_011989	ATG	2	6	671337	671342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147608
12999	NC_011989	GTCGAT	2	12	671354	671365	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222147608
13000	NC_011989	TGA	2	6	671433	671438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147608

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